周潛,歐宜貴,鄧新春,黃振,黃玉蘭
(1.湖南工業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院基礎(chǔ)課部,湖南 長(zhǎng)沙 410000;2.海南大學(xué)理學(xué)院,海南 海口 570228)
當(dāng)前,我國處在對(duì)新冠肺炎疫情內(nèi)防擴(kuò)散、外防輸入的重要階段。因我國新冠肺炎疫情較早出現(xiàn)在湖北省,文章研究湖北省的新冠肺炎疫情相關(guān)數(shù)據(jù),評(píng)估其發(fā)展進(jìn)程和不同防控措施的效果,對(duì)未來有針對(duì)性地確定防控措施及資源調(diào)配提供參考。
目前,眾多學(xué)者針對(duì)各類疫情展開了廣泛的研究,其主要研究方法可分為四類。第一,基于確定性SIR 動(dòng)力學(xué)模型思想的應(yīng)用研究。喻孜等對(duì)經(jīng)典SIR 模型進(jìn)行修正,利用時(shí)變參數(shù)對(duì)新冠肺炎疫情發(fā)展進(jìn)行預(yù)測(cè),并分析了防控措施對(duì)疫情發(fā)展的影響[1];Yang et al.應(yīng)用SEIR 模型,采用多重?cái)M合確定模型參數(shù),對(duì)新冠肺炎疫情發(fā)展進(jìn)行了綜合預(yù)測(cè)[2];Tang et al.基于新型冠狀病毒的臨床特征、傳染性特征以及相關(guān)干預(yù)措施,對(duì)倉室模型進(jìn)行了拓展,證明強(qiáng)化密切接觸者的追蹤、隔離可有效降低新冠肺炎疫情的傳播風(fēng)險(xiǎn)[3];Jia et al.基于SEIR 模型,針對(duì)我國對(duì)新冠肺炎疫情的群體隔離政策進(jìn)行了建模,說明了隔離措施的有效性和必要性,同時(shí)分析了疫苗介入對(duì)疫情控制的影響[4]。第二,基于隨機(jī)性傳染病模型思想的應(yīng)用研究。Gray et al.基于感染者數(shù)量建立隨機(jī)微分方程,將經(jīng)典的SIS 模型拓展到了隨機(jī)模型[5];Clancy 基于感染周期非指數(shù)分布的前提假設(shè),構(gòu)建了一個(gè)分段馬爾可夫鏈模型,并用鞅推斷出了傳染病幸存者數(shù)量和感染者軌跡下的聯(lián)合分布[6];徐寶春以SARS 為研究對(duì)象,對(duì)比研究了確定性SIR 模型和隨機(jī)性SIR模型[7]。第三,基于指數(shù)增長(zhǎng)模型的應(yīng)用研究。各學(xué)者采用指數(shù)增長(zhǎng)模型分析新冠肺炎疫情發(fā)展及防控工作進(jìn)展[8-10]。第四,基于統(tǒng)計(jì)學(xué)模型的應(yīng)用研究。各學(xué)者挖掘新冠肺炎疫情的小樣本數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)評(píng)估總體[11-12]。
確定性SIR 動(dòng)力學(xué)模型邏輯清晰,在實(shí)際中被廣泛應(yīng)用,但其忽略了病毒傳播過程中的隨機(jī)因素,僅探究整體發(fā)展規(guī)律,而實(shí)際情況中,新型冠狀病毒的傳播存在一定的隨機(jī)性,且病毒感染、恢復(fù)或死亡數(shù)量都是以人員個(gè)體為單位,并非確定性SIR 動(dòng)力學(xué)模型所假設(shè)的各群體數(shù)量連續(xù)性變化,同時(shí),基于隨機(jī)性傳染病模型思想的新冠肺炎疫情應(yīng)用研究較少。文章沿用經(jīng)典SIR 倉室模型的理念,各群體數(shù)量的變化以人員個(gè)體為單位,將各類人群的數(shù)量視為隨機(jī)變量,應(yīng)用馬爾可夫鏈蒙特卡羅方法(MCMC)[7,13]模擬新型冠狀病毒在不同倉室進(jìn)行轉(zhuǎn)移的可能性,記為SIR-MCMC方法,以此評(píng)估湖北省新冠肺炎疫情發(fā)展進(jìn)程和防控措施效果。
經(jīng)典SIR 倉室模型[14]116-117將人群分為易感者、感染者和移出者三類,并假設(shè)疾病傳播期內(nèi),所考察地區(qū)的總?cè)丝诓蛔儯僭O(shè)β為單位時(shí)間內(nèi)感染者傳染易感者的概率,簡(jiǎn)稱感染強(qiáng)度,γ為單位時(shí)間內(nèi)從感染者變?yōu)橐瞥稣叩母怕?,即移除率?/p>
在以下三種假設(shè)條件下,文章沿用SIR 倉室模型來研究新型冠狀病毒的傳播:新型冠狀病毒傳播期內(nèi),我國政府及時(shí)采取管控措施,有效地控制了人員流動(dòng),故在忽略自然死亡及出生等因素的前提下,假設(shè)傳播期內(nèi)湖北省總?cè)丝诓蛔儯浑m一旦成為疑似或確診人員,就會(huì)被政府迅速隔離,但考慮到管控期間的大范圍人際流動(dòng)少,多為家庭內(nèi)或小范圍內(nèi)的人際頻繁流動(dòng),故假設(shè)新增確診病例均由已確診病例感染;考慮到新型冠狀病毒二次感染情形相對(duì)較少,為了便于研究,這里假設(shè)患者康復(fù)后再次被感染的概率為0。
文章記S(t)為t時(shí)刻正常且易感的總?cè)藬?shù),I(t)為t時(shí)刻現(xiàn)有確診人數(shù),R(t)為t時(shí)刻已經(jīng)治愈和治療過程中死亡的總?cè)藬?shù),對(duì)應(yīng)SIR 模型的三類人群。將S(t)、I(t)、R(t)當(dāng)作取值為非負(fù)整數(shù)的隨機(jī)變量,沿用經(jīng)典SIR 模型的基本假設(shè),假定S(t)+I(t)+R(t)=N,只研究其中兩個(gè)隨機(jī)變量即可,那么可將{S(t),I(t),t≥0} 視為二元隨機(jī)過程來研究,設(shè)該隨機(jī)過程是時(shí)齊的馬爾可夫鏈[13],其聯(lián)合概率函數(shù)記為:
由經(jīng)典SIR 模型的假設(shè)可知,當(dāng)時(shí)間間隔Δt足夠小時(shí),至多發(fā)生一次狀態(tài)轉(zhuǎn)移,故轉(zhuǎn)移概率的具體形式如下:
自2020 年1 月21 日開始,國家衛(wèi)生健康委員會(huì)公布每日全國新冠肺炎疫情數(shù)據(jù)。文章樣本數(shù)據(jù)選自2020 年1 月21 日至4 月26 日的湖北省新冠肺炎疫情數(shù)據(jù),主要采集累計(jì)確診人數(shù)、新增確診人數(shù)、累計(jì)治愈人數(shù)、累計(jì)死亡人數(shù)等信息,數(shù)據(jù)來源于國家衛(wèi)生健康委員會(huì)及湖北省衛(wèi)生健康委員會(huì)官方網(wǎng)站①中華人民共和國國家衛(wèi)生健康委員會(huì)官網(wǎng):http://www.nhc.gov.cn;湖北省衛(wèi)生健康委員會(huì)官網(wǎng):http://wjw.hubei.gov.cn。。
對(duì)模型進(jìn)行求解,首先確定參數(shù)取值,湖北省人口約6 000 萬,因衛(wèi)生管控措施影響,感染者真正能接觸到的易感者人數(shù)未知,即S(0)未知,將2020 年1 月21 日定義為初始日,則確診人數(shù)的初始值I(0)=338,假定R(0)=0,則三個(gè)待估參數(shù)分別是移除率γ,感染強(qiáng)度β和易感者初值S(0)。
1.2.1 估計(jì)移除率
圖1 不同β 與S(0)組合下的SSE
圖2 對(duì)比了確診人數(shù)模型擬合值與實(shí)際觀測(cè)值,不難發(fā)現(xiàn),基于SIR-MCMC 的隨機(jī)模型較好地?cái)M合了確診人數(shù)的發(fā)展變化。
圖2 確診人數(shù)擬合值與實(shí)際觀測(cè)值對(duì)比
為評(píng)估新冠肺炎疫情發(fā)展進(jìn)程及不同防控措施的效果,文章結(jié)合上文的已估計(jì)參數(shù),分別從基礎(chǔ)再生數(shù)、t時(shí)刻現(xiàn)有確診人數(shù)可靠性、感染強(qiáng)度β、移除率γ和疫苗介入這五個(gè)方面來分析。
發(fā)展初期,基礎(chǔ)再生數(shù)是用于預(yù)估新冠肺炎疫情是否可能暴發(fā)的重要指標(biāo),據(jù)SIR-MCMC 方法計(jì)算的參數(shù)估計(jì)值β=0.000 003,S(0)=114 000,結(jié)合γ=0.077,不難得出樣本所屬疫情階段的基礎(chǔ)再生數(shù)R0:
這表明每個(gè)感染者在其患病期內(nèi)有可能感染4.441 6 個(gè)易感者,政府綜合管控的壓力較大,必須采取嚴(yán)格的綜合防控措施。
為刻畫新冠肺炎疫情發(fā)展進(jìn)程及防控措施效果,結(jié)合已估計(jì)參數(shù),基于SIR-MCMC 模擬出S(t)序列,同理可根據(jù)如下公式,計(jì)算新冠肺炎疫情發(fā)展過程中的有效再生數(shù)Rt:
據(jù)模型假設(shè)可知,易感者人數(shù)隨時(shí)間增加而減少,故有效再生數(shù)呈下降趨勢(shì),具體趨勢(shì)如圖3 所示。2020 年2 月17 日、18 日的有效再生數(shù)分別為1.018 3、0.875 5,即2020 年1 月21 日至2 月17 日,有效再生數(shù)大于1,表明新冠肺炎疫情規(guī)模持續(xù)擴(kuò)大;自2020年2 月18 日開始,有效再生數(shù)小于1,即每個(gè)感染者在之后預(yù)期感染的平均易感者人數(shù)小于1,表明我國政府嚴(yán)格的防控措施效果逐漸顯現(xiàn),疫情逐步得到控制,較好地吻合了實(shí)際觀測(cè)值的變化。
圖3 有效再生數(shù)
文章為便于掌握疫情觀測(cè)數(shù)據(jù)的可靠性,采用SIR-MCMC 方法,結(jié)合已估計(jì)參數(shù),模擬1 000 條I(t)散點(diǎn)圖,易得I(t)的均值、標(biāo)準(zhǔn)差、頻率分布等統(tǒng)計(jì)信息。因確診人數(shù)的觀測(cè)數(shù)據(jù)受諸多因素影響,離散程度偏大,不宜采用基于置信度的置信區(qū)間來衡量,故采用偏離均值n倍標(biāo)準(zhǔn)差的形式來描述I(t)。表1 截取了2020年3 月1 日—9 日的確診人數(shù)相關(guān)指標(biāo),據(jù)此可知,I(t)的實(shí)際觀測(cè)值均處在偏離均值2 倍標(biāo)準(zhǔn)差的區(qū)間內(nèi),其中大部分處在偏離均值1 倍標(biāo)準(zhǔn)差的區(qū)間內(nèi),說明實(shí)際觀測(cè)值的可靠性較好。
表1 t 時(shí)刻現(xiàn)有確診人數(shù)相關(guān)指標(biāo)
感染強(qiáng)度β是影響病毒傳播的重要因素,現(xiàn)有確診人數(shù)是防疫措施制定及醫(yī)療資源調(diào)配的重要參考指標(biāo),為衡量β改變對(duì)確診人數(shù)影響的數(shù)量化程度,假定其他參數(shù)均不變,僅將β分別降低20%、50%,分別對(duì)其采用SIR-MCMC 模擬1 000 條I(t)散點(diǎn)圖,并取t時(shí)刻的均值作為確診人數(shù)的擬合值,對(duì)比不同β下,確診人數(shù)隨時(shí)間的變化情況。如圖4所示,相比原模型,且β降低20%、50%時(shí),確診人數(shù)峰值分別下降了17.56%、56.39%,抑制效果均較明顯,同時(shí)推遲了峰值時(shí)間,緩解了衛(wèi)生防疫壓力,而β降低時(shí),基礎(chǔ)再生數(shù)變小,新冠肺炎疫情也更易得到控制。這表明降低感染強(qiáng)度β的措施有利于對(duì)新冠肺炎疫情的控制,也有利于對(duì)醫(yī)療壓力的緩解,具體措施包括重點(diǎn)提高衛(wèi)生防疫水平,提高篩查率,早隔離、早治療,保護(hù)一線醫(yī)務(wù)人員等高危易感群體。
圖4 β 改變下的確診人數(shù)動(dòng)態(tài)
為衡量γ改變對(duì)確診人數(shù)影響的數(shù)量化程度,同樣假定其他參數(shù)均不變,僅對(duì)γ分別增大20%、50%,對(duì)比不同γ下,確診人數(shù)隨時(shí)間推移的變化情況。如圖5 所示,相比原模型,當(dāng)γ增大20%、50%時(shí),確診人數(shù)峰值分別下降了14.28%、32.48%,抑制均較明顯,峰值時(shí)間變化不大,且γ增大時(shí),基礎(chǔ)再生數(shù)變小,新冠肺炎疫情更易得到控制。這表明增大γ的措施,同樣有利于對(duì)新冠肺炎疫情的控制,也有利于對(duì)醫(yī)療壓力的緩解,具體措施包括重點(diǎn)提高治療水平,同時(shí)防治并發(fā)癥。
圖5 γ 改變下的確診人數(shù)動(dòng)態(tài)
為衡量疫苗介入對(duì)確診人數(shù)影響的數(shù)量化程度,同樣假定其他參數(shù)均不變,將疫苗保護(hù)率從0%分別提高到20%、50%,即易感人群分別下降20%、50%,對(duì)比不同疫苗保護(hù)率下,確診人數(shù)隨時(shí)間的變化情況。如圖6 所示,相比原模型,當(dāng)疫苗保護(hù)率為20%、50%時(shí),確診人數(shù)峰值分別下降了33.94%、77.82%,抑制非常明顯,同時(shí)推遲了峰值時(shí)間。這表明較大面積接種疫苗,對(duì)防控新冠肺炎疫情是非常有效的。
圖6 不同疫苗保護(hù)率下的確診人數(shù)動(dòng)態(tài)
文章基于SIR-MCMC 方法,采用實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)擬合得出湖北省新型冠狀病毒感染強(qiáng)度β=0.000 003,易感者初值S(0)=114 000,較好地吻合了實(shí)際數(shù)據(jù),同時(shí)從五個(gè)方面研究了湖北省的新冠肺炎疫情發(fā)展和不同防控措施的效果,得出如下結(jié)論及建議。
(1)湖北省新型冠狀病毒的基礎(chǔ)再生數(shù)為4.441 6,必須對(duì)其采取嚴(yán)格的綜合防控措施。自2020 年2 月18 日開始,有效再生數(shù)小于1,政府嚴(yán)格的防控措施效果逐漸顯現(xiàn),疫情逐步得到控制。
(2)通過模型仿真數(shù)據(jù)驗(yàn)證了t時(shí)刻現(xiàn)有確診人數(shù)的可靠性,此方法亦可用于預(yù)測(cè)。
(3)降低感染強(qiáng)度β、增大移除率γ以及疫苗介入的措施,均有利于對(duì)新冠肺炎疫情的控制,有利于對(duì)醫(yī)療壓力的緩解。當(dāng)β降低20%、50%時(shí),確診人數(shù)峰值分別下降了17.56%、56.39%;當(dāng)γ增大20%、50%時(shí),確診人數(shù)峰值分別下降了14.28%、32.48%;當(dāng)疫苗保護(hù)率為20%、50%時(shí),確診人數(shù)峰值分別下降了33.94%、77.82%。