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蓮霧果實采后木質(zhì)素合成相關(guān)MYB基因家族及其作用分析

2022-02-12 08:14:06匡鳳元吳光斌陳發(fā)河
保鮮與加工 2022年1期
關(guān)鍵詞:蓮霧木質(zhì)素擬南芥

聶 珂,匡鳳元,張 珅,吳光斌,陳發(fā)河

(集美大學食品與生物工程學院,福建 廈門 361000)

蓮霧(Syzygium samarangense[Blume]Merrill&L.M.Perry)又名洋蒲桃、水蒲桃、爪蒲桃等,是桃金娘科蒲桃屬喬本植物,起源于馬來半島、安達曼和尼科巴群島[1],由我國臺灣省最早引入種植[2]。蓮霧果實營養(yǎng)豐富,藥用價值高,具有保健功效,鮮食生津解渴,深受消費者的喜愛[3]。但由于蓮霧果實采后生命活動旺盛,其果肉易發(fā)生絮狀綿軟等癥狀,使其食用品質(zhì)發(fā)生劣變[4]。蓮霧采后木質(zhì)素代謝是造成果實絮狀綿軟癥狀發(fā)展的重要因素[5]。

MYB轉(zhuǎn)錄因子是植物中最大的一類轉(zhuǎn)錄因子家族,其N端含有一段約51~52個氨基酸組成的能夠結(jié)合DNA的MYB結(jié)構(gòu)域。相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),影響木質(zhì)素生物合成的關(guān)鍵基因大多受到MYB轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控[6-7]。MYB轉(zhuǎn)錄因子參與植物的生長發(fā)育[8]、應(yīng)激反應(yīng)[9]、苯丙烷代謝[10]等多種過程。MYB基因在次生代謝中對木質(zhì)素生物合成有重要作用。研究發(fā)現(xiàn),棉花GhMYB43蛋白、紅肉蜜柚CmMYB330蛋白和荷花NnMYB4蛋白對擬南芥木質(zhì)素合成均起負調(diào)控作用[11-13]。采后蓮霧果實中心絮狀綿軟的發(fā)展與木質(zhì)素合成密切相關(guān),目前對于蓮霧果實的研究重點多集中于細胞壁代謝[14]和木質(zhì)素代謝與果肉絮狀綿軟的生理機制方面[15],對于轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控木質(zhì)素代謝影響蓮霧果實絮狀綿軟的機制尚不清楚。

本文對蓮霧果實木質(zhì)素合成相關(guān)的MYB轉(zhuǎn)錄因子家族進行生物信息學分析及表達研究,選擇在蓮霧果實中與MYB330、MYB4基因關(guān)系相近并具有顯著性差異基因的MYB48克隆,考察擬南芥根、莖、葉處木質(zhì)素合成關(guān)鍵酶基因的表達量差異,從分子水平上分析蓮霧果實MYB家族的相關(guān)性質(zhì),并確定差異蓮霧MYB基因?qū)Σ珊笊忟F果實木質(zhì)素合成的調(diào)控作用,為進一步探討SsMYBs蛋白的功能和解析蓮霧果實絮狀綿軟調(diào)控的分子機制提供基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 材料與設(shè)備

1.1.1 材料與試劑

以當日抵達廈門市臺灣水果集散中心的臺灣“蜜風鈴”蓮霧果實為試材。

大腸桿菌(DH5α)和農(nóng)桿菌(EHA105):購自唯地生物科技(上海)有限公司;PMD19-Simple載體:購自寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司;PCAMBIA2301載體:購于北京鼎國昌盛生物技術(shù)有限公司;T4連接酶、限制性核酸內(nèi)切酶KpnI/Hind III、克隆載體pMD19-T、DNA marker:購自TaKaRa。

RNA提取試劑盒(Omega Plant RNA Kit:R6827-01):Omega公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒(Prime-ScriptTMII 1st Strand cDNA Synthesis Kit:6210A):TaKaRa寶生物工程(大連)有限公司;DNA純化回收試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒:天根生化科技(北京)。

1.1.2 儀器與設(shè)備

DW-86L338(J)超低溫冰箱:海爾生物醫(yī)療股份有限公司;LE204E型電子分析天平:梅特勒-托利多儀器(上海)有限公司;Sigma3K18型高速冷凍離心機:德國Sigma公司;WH-2型微型漩渦混合儀:上海滬西分析儀器廠有限公司;SW-CJ-ZD型超凈工作臺:蘇州凈化設(shè)備有限公司;SYG-1220型恒溫水浴鍋:美國精騏有限公司;MJ-78A型高壓滅菌鍋:施都凱儀器設(shè)備(上海)有限公司;A600型PCR擴增儀:杭州朗基科學儀器有限公司;Nanodrop 1000型微量蛋白核酸測定儀:賽默飛世爾科技公司;C150型凝膠成像系統(tǒng):美國UVP公司;OSE-470型切膠儀:天根生化科技(北京)有限公司。

1.2 方法

1.2.1 蓮霧果實MYB轉(zhuǎn)錄因子基因(MYB基因)家族成員的數(shù)據(jù)篩選

所采用數(shù)據(jù)源自本研究室前期測序得到的蓮霧轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,已上傳至NCBI(SRA數(shù)據(jù)庫[16](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA284092),在KEGG通路中選擇苯丙烷類代謝通路(KO09422通路)。用“MYB”和詞進行篩選,選擇基因的功能注釋為“預(yù)測其與木質(zhì)素合成相關(guān)的MYB蛋白”的基因,應(yīng)用ORF finder(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/orfig.cgi)在線預(yù)測其開放閱讀框,并推導(dǎo)出可編碼蛋白序列。

1.2.2 蓮霧MYB基因家族成員的生物信息學分析

利用Ex PASy的Prot Param和Prot Scale對SsMYBs蛋白進行基本理化性質(zhì)和親/疏水性分析;通過Net Phos 3.1 Server在線對SsMYBs蛋白的潛在磷酸化位點進行預(yù)測;通過NCBI served Domains數(shù)據(jù)庫,在線分析MYB蛋白保守結(jié)構(gòu)域;登錄SignalP 5.0 Server查看SsMYBs蛋白的信號肽;利用Cell-PLoc 2.0對SsMYBs蛋白進行亞細胞定位預(yù)測,利用在線軟件TMHMM Server v.2.0預(yù)測蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)。利用SOPMA在線數(shù)據(jù)庫和SWISS-MODEL數(shù)據(jù)庫分別進行SsMYBs蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測和三維結(jié)構(gòu)的同源建模預(yù)測。

1.2.3 蓮霧果實MYB基因家族成員的系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建

利用MEGA7.0軟件對篩選得到的20個MYB基因進行多序列比對,選擇鄰近結(jié)合法(Neighbor-Joining,NJ)算法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,Pariwise Deletion處理缺失數(shù)據(jù),P-distance模型,Bootstrap檢測次數(shù)設(shè)為1 000;再利用NCBI的基本局部比對搜索工具(BLAST,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/)對蓮霧MYB蛋白分別進行相似性比對,構(gòu)建蓮霧MYB基因家族與其他物種間的系統(tǒng)發(fā)育樹。

1.2.4 SsMYBs基因總RNA的提取及cDNA的合成

選擇貯藏期間差異表達的comp_46078序列。通過ORF finder(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/)在線預(yù)測該序列的開放閱讀框,根據(jù)同源性分析將其命名為SsMYB48。用Omega試劑盒提取RNA,利用TaKaRa反轉(zhuǎn)錄試劑盒合成第1鏈cDNA,于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2.5 SsMYB48基因的克隆及植物表達載體構(gòu)建

以RNA反轉(zhuǎn)錄合成的cDNA為模板,利用Primer Premier 5.0軟件設(shè)計全長引物,正向引物(F):5′-ATGACCCCTCAAGAAGAGA-3′,反向引物(R):5′-CCTTACCAGGAAGAGTAATGA-3′;PCR擴增蓮霧SsMYB48序列全長,設(shè)置3個生物學重復(fù)和3次技術(shù)重復(fù)。PCR擴增后,將產(chǎn)物進行回收純化,連接pMD19-T載體(TaKaRa),轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞,進行陽性克隆篩選,送測序進行驗證,提交NCBI GenBank獲得登錄號。選擇北京鼎國公司生產(chǎn)的植物過表達載體pCAMBIA2301,構(gòu)建pCAMBIA2301-SsMYB48重組質(zhì)粒。

1.2.6 SsMYB48基因的組織表達

構(gòu)建pCAMBIA2301-SsMYB48重組載體,在擬南芥中進行過表達。分別取成熟的野生型和SsMYB48基因過表達擬南芥植株的根、莖和葉作為材料,選擇AtIRX8作為內(nèi)參基因,參考李針針[17]的引物設(shè)計(如表1所示),熒光定量PCR進行反應(yīng)。每個樣本設(shè)置3個生物學重復(fù)和3次技術(shù)重復(fù)。設(shè)定0 d的蓮霧果實基因表達量為1.0(對照),其他均為處理組,根據(jù)2-△△Ct法計算相對表達量。

2 結(jié)果與分析

2.1 蓮霧MYB基因家族成員的命名

選取合適的開放閱讀框中的蛋白序列,通過美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI,https://www.ncbi.nlm.nih.gov)數(shù)據(jù)庫中進行蛋白序列比對(Blastp),篩選出具有MYB或者MYB-like的蛋白序列,并根據(jù)同源性比對結(jié)果對SsMYBs基因家族成員進行命名,如表2所示,得到20個MYB基因。

表2 蓮霧MYB基因家族成員的基因名稱Table 2 Gene names of MYB gene family members in wax apple

2.2 蓮霧MYB基因家族成員的基本理化性質(zhì)及疏水性分析

如表3所示,該家族蛋白的氨基酸序列長度在91~591個氨基酸之間,蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量介于9.98~64.91 kD,理論等電點(pI)介于4.92~9.73,其中SsMYB4、SsMYB5、SsMYB6、SsMYB39、SsMYB44、SsMYB77、SsMYB114、SsMYB308和SsMYB330蛋白呈堿性(pI>7),剩余基因成員呈酸性(pI<7)。SsMYBs蛋白的脂肪系數(shù)為41.81~94.29,不穩(wěn)定指數(shù)為30.34~67.98,平均親水指數(shù)為-0.672 9。除SsMYBs39為穩(wěn)定性蛋白外,剩余蛋白成員表現(xiàn)為不穩(wěn)定蛋白(不穩(wěn)定指數(shù)>40),故SsMYBs蛋白為親水性蛋白。

表3 蓮霧MYB基因家族成員的基本理化性質(zhì)分析Table 3 Analysis of basic physical and chemical properties of MYB family gene members in wax apple

如圖1所示,圖形的高峰值(正值)區(qū)域表示疏水區(qū)域,而負值的“低谷”區(qū)域是親水區(qū)域,SsMYB1蛋白和SsMYB4蛋白的親水區(qū)大于疏水區(qū),說明SsMYB1蛋白和SsMYB4蛋白為親水性蛋白;分析其余蛋白家族成員,發(fā)現(xiàn)有相似的結(jié)果,表明蓮霧MYB蛋白家族均為親水性蛋白。

圖1 SsMYBs蛋白序列的親/疏水性的預(yù)測分析Fig.1 Hydrophilic/hydrophobic prediction analysis of SsMYBs protein sequence

2.3 蓮霧MYB基因家族成員的磷酸化位點分析

如圖2所示,SsMYB1和SsMYB4中絲氨酸(S)磷酸化位點幾乎分布在整條多肽鏈上,蘇氨酸(T)和酪氨酸(Y)分布在多肽鏈的中后段。由表4可知:20個蓮霧MYB蛋白氨基酸中,絲氨酸數(shù)目均為最高,其次是蘇氨酸;在三者中,酪氨酸含量為最低;在蓮霧SsMYBs蛋白中,SsMYB33蛋白具有的潛在磷酸化位點數(shù)最多,SsMYB114蛋白含有的潛在磷酸化位點數(shù)最少。

表4 蓮霧MYB蛋白磷酸化位點分析Table 4 The phosphorylation site analysis of MYB proteins in wax apple 單位:個

圖2 蓮霧MYB蛋白磷酸化位點分析Fig.2 The phosphorylation site analysis of MYB proteins in wax apple

2.4 蓮霧MYB基因家族成員的蛋白性質(zhì)分析

20個SsMYBs均無信號肽,沒有剪切位點,不屬于分泌蛋白;亞細胞定位都定位于細胞核上;無明顯跨膜區(qū)。SsMYB1的信號肽和跨膜區(qū)分析結(jié)果如圖3所示。MYB基因主要作用于細胞核,不應(yīng)該含有信號肽區(qū)域和跨膜結(jié)構(gòu),這與預(yù)測結(jié)果一致,符合基因與細胞核順式元件相結(jié)合并發(fā)揮調(diào)控作用的特點。

圖3 SsMYB1信號肽分析及跨膜結(jié)構(gòu)分析Fig.3 Analysis of signal peptide and transmembrane structure of SsMYB1

2.5 蓮霧MYB基因家族成員的二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)預(yù)測

如表5所示,SsMYBs蛋白均由α-螺旋(Alpha helix)、β-轉(zhuǎn)角(Beta turn)、延伸鏈(Extended strand)和隨機卷曲(Random coil)4種構(gòu)型組成,其所占比例分別為33.99%、6.47%、4.61%和54.92%。由以上分析可知,SsMYBs蛋白主要構(gòu)型為α-螺旋和隨機卷曲。

表5 SsMYBs的蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)對比分析Table 5 Comparative analysis of secondary structures of SsMYBs proteins

MYB蛋白的三級結(jié)構(gòu)通常與其二級結(jié)構(gòu)具有一定的聯(lián)系,可以通過三級結(jié)構(gòu)的結(jié)果來判斷二級結(jié)構(gòu)結(jié)果的正確性。如圖4所示,在三級結(jié)構(gòu)中,α-螺旋和無規(guī)卷曲是SsMYBs蛋白的主要結(jié)構(gòu)元件,分布于整個蛋白質(zhì)中,這與SOPMA預(yù)測SsMYBs蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)結(jié)果一致。

圖4 蓮霧MYB基因家族蛋白的三級結(jié)構(gòu)分析Fig.4 Tertiary structure analysis of MYB gene family proteins in wax apple

2.6 蓮霧MYB基因家族成員的多序列比對

如圖5所示,根據(jù)序列同源性分析結(jié)果,蓮霧MYB基因家族中可分為2個類群。其中SsMYB77與SsMYB44的同源性最高,為100%。SsMYB3、SsMYB10、SsMYB20與SsMYB86成員之間的相似性較高,SsMYB10、SsMYB20與SsMYB308之間的相似性較高;有研究表明MYB330與MYB4與木質(zhì)素的合成有關(guān)[12-13],選擇與SsMYB330和SsMYB4相似性較高的SsMYB48和SsMYB54的蛋白序列,在NCBI上進行BLAST比對,進一步研究蓮霧MYB蛋白與其他物種MYBs蛋白之間的進化關(guān)系。

圖5 SsMYBs的mRNA序列同源性分析結(jié)果Fig.5 Results of homology analysis of mRNA sequences of SsMYBs

2.7 蓮霧MYB基因家族成員的系統(tǒng)發(fā)育樹

如圖6所示,利用4個蓮霧MYB蛋白(SsMYB330、SsMYB4、SsMYB48和SsMYB54)與木豆(Cajanus cajan,CcaMYBs)、大麻(Cannabis sativa,CsMYBs)、番木瓜(Carica papaya,CpMYBs)、柑 橘(Citrus clementina,CcMYBs)、小果咖啡(Coffea arabica,CaMYBs)、榴蓮(Durio zibethinus,DzMYBs)、巨桉(Eucalyptus grandis,EgrMYBs)、大 豆(Glycine max,GmMYBs)、野 大 豆(Glycine soja,GsMYBs)、樹棉(Gossypium arboretum,GarMYBs)、南方棉(Gossypium austral,GaMYBs)、陸地棉(Gossypium hirsutum,GhMYBs)、木槿(Hibiscus syriacus,HsMYBs)、鼠尾草(Herrania umbratical,HuMYBs)、橡膠樹(Hevea brasiliensis,HbMYBs)、麻風樹(Jatropha curcas,JcMYBs)、核桃(Juglans regia,JrMYBs)、木薯(Manihot esculenta,MeMYBs)、楊梅(Morella rubra,MrMYBs)、開心果(Pistacia vera,PvMYBs)、銀白楊(Populus alba,PaMYBs)、胡楊(Populus euphratica,PeMYBs)、毛果楊(Populus trichocarpa,PtMYBs)、石榴(Punica granatum,PgMYBs)、美洲櫟(Quercus lobata,QlMYBs)、栓皮櫟(Quercus suber,QsMYBs)、玫瑰木(Rhodamnia argentea,RaMYBs)、蓖麻(Ricinus communis,RcMYBs)、密花豆(Spatholobus suberectus,SsuMYBs)、番櫻桃(Syzygium oleosum,ScMYBs)、可可樹(Theobroma cacao,TcMYBs)、葡萄(Vitis vinifera,VvMYBs)、棗(Ziziphus jujuba,ZjMYBs)共33個物種的MYB蛋白構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,發(fā)現(xiàn)4個蓮霧MYB蛋白與番櫻桃、玫瑰木和巨桉均在同一進化亞枝上,說明它們之間的同源性較高,故推測蓮霧MYB基因與番櫻桃、巨桉、玫瑰木的親緣性較近,其可能是由于蓮霧與番櫻桃、巨桉、玫瑰木同屬于桃金娘科和桃金娘目。

圖6 蓮霧MYB基因家族系統(tǒng)發(fā)生樹Fig.6 Phylogenetic tree of MYB gene family in wax apple

2.8 SsMYB48基因的克隆及植物表達載體的構(gòu)建

如圖7所示,因MYB330和MYB4兩個基因與木質(zhì)素的合成有關(guān)[12-13],選擇與SsMYB330和SsMYB4相似性較高的氨基酸序列且在蓮霧轉(zhuǎn)錄組貯藏期間差異表達的SsMYB48基因進行克隆和表達。

如圖7A所示,以蓮霧cDNA為模板,得到的SsMYB48基因擴增產(chǎn)物條帶大小在500~750 bp之間。測序結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中序列一致,SsMYB48編碼的氨基酸序列全長549 bp,編碼182個氨基酸殘基和一個終止密碼子TAA(圖8)。在NCBI上傳序列comp_46078,獲得登錄號:MK204557.1。選擇pCAMBIA2301植物表達載體,分子量大小為11 633 bp,插入目的基因后,pCAMBIA2301-SsMYB48重組質(zhì)粒條帶大小為12 182 bp,如圖7B所示,電泳檢測顯示條帶在蛋白marker 12 000 bp附近,與預(yù)期大小相似,且沒有其他雜帶,說明目的條帶插入成功,且重組質(zhì)粒質(zhì)量良好。如圖7C所示,用KpnI/Hind III對重組質(zhì)粒進行雙酶切驗證,在蛋白Marker 12 000 bp附近及549 bp處分別出現(xiàn)預(yù)期的目的條帶,表明植物表達載體構(gòu)建成功。

圖7 SsMYB48基因克隆電泳圖Fig.7 Electrophoresis results of SsMYB48 PCR products

圖8 SsMYB48基因cDNA及推測的氨基酸序列Fig.8 Sequence of SsMYB48 cDNA and the deduced amino acids

2.9 SsMYB48在擬南芥上的組織表達

如圖9所示,轉(zhuǎn)SsMYB48基因的擬南芥根、莖和葉中木質(zhì)素合成途徑關(guān)鍵酶基因的表達量均較野生型擬南芥植株有所下降,在擬南芥各個組織中的表達豐度差異性較大。從基因表達趨勢來看:SsMYB48基因在擬南芥的根、莖、葉中均有表達,且在莖、葉片中SsMYB48過表達型植株木質(zhì)素合成關(guān)鍵酶基因的表達量較野生型植株明顯下降。比較轉(zhuǎn)SsMYB48基因型和野生型中木質(zhì)素合成關(guān)鍵酶基因的相對表達量發(fā)現(xiàn):在擬南芥的根中,木質(zhì)素合成關(guān)鍵酶基因At4CL、AtF5H和AtPOD的差異較明顯;在莖中,AtC4H、AtF5H、AtC3H和AtPOD的差異較明顯;在葉片中,AtPAL、AtC4H、AtF5H、AtC3H和AtPOD的差異較明顯;綜合得在擬南芥的根、莖、葉中,木質(zhì)素合成關(guān)鍵酶基因AtF5H和AtPOD受SsMYB48基因的影響較大。

圖9 SsMYB48木質(zhì)素合成關(guān)鍵酶基因在擬南芥不同組織中的表達分析Fig.9 Expression analysis of key enzyme genes of SsMYB48 lignin synthesis in different tissues of Arabidopsis thaliana

3 討論與結(jié)論

蓮霧果實采后果肉易發(fā)生絮狀綿軟癥狀,通過轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn)蓮霧果實絮狀綿軟癥狀的發(fā)生與木質(zhì)素合成含量有關(guān)[16]。MYB基因作為目前在植物中研究發(fā)現(xiàn)的數(shù)量最大、功能最多樣的基因之一[18],其表達物可參與調(diào)控植物次生代謝中的苯丙烷代謝[19]。目前在枇杷[20]、石榴[21]和柑橘[22]等果實中均克隆得到調(diào)控木質(zhì)素合成的MYB蛋白。

本文利用蓮霧轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫篩選出20個與木質(zhì)素合成相關(guān)的MYB基因,對其進行生物信息學分析。研究結(jié)果表明,MYB基因表達的MYB蛋白多為不穩(wěn)定親水性蛋白;具有多個潛在的磷酸化位點,均為非分泌蛋白,不含跨膜結(jié)構(gòu)。MYB基因常在細胞核內(nèi)與靶標基因的啟動子區(qū)域結(jié)合,發(fā)揮其激活或抑制該基因表達的功能。因此,基因一般被定位于細胞核中,起著調(diào)控表達的作用[23]。Zhao等[24]對大豆GmMYBJ3進行氨基酸序列特征及亞細胞定位分析,發(fā)現(xiàn)GmMYBJ3定位在細胞核中。研究人員通過構(gòu)建載體pCAMBIA1301-MYB10-GFP,侵染煙草細胞后,發(fā)現(xiàn)杏PaMYB10基因定位于細胞核中[25]。這與本文預(yù)測的SsMYBs蛋白的亞細胞定位于細胞核的結(jié)果一致。二級結(jié)構(gòu)分析和三級結(jié)構(gòu)建模預(yù)測表明:SsMYBs蛋白空間結(jié)構(gòu)主要是由α-螺旋和隨機卷曲組成,所占比例分別為34.30%和55.03%,符合一般MYB蛋白特征[26-27]。

系統(tǒng)進化樹結(jié)果表明:相鄰或較近進化關(guān)系上可能具有相同或相似的功能[28],多序列比對結(jié)果發(fā)現(xiàn)SsMYB77與SsMYB44的同源性最高,SsMYB3、SsMYB10、SsMYB20與SsMYB86成員之間的相似性較高,通過構(gòu)建蓮霧MYB與不同物種間的進化樹,推測相似性較高的家族成員間功能可能存在相似性。分析發(fā)現(xiàn):蓮霧與番櫻桃、巨桉、玫瑰木的親緣性較高,屬同一分支,其可能是由于蓮霧與番櫻桃、巨桉、玫瑰木同屬于桃金娘科和桃金娘目。蓮霧作為木本植物,它的基因組數(shù)據(jù)庫非常大而且復(fù)雜,在短時間內(nèi)難以對其進行全基因組測序,現(xiàn)在已知它與番櫻桃、巨桉、玫瑰木的親緣性很高;SsMYB48基因在擬南芥的根、莖、葉中的過表達對木質(zhì)素合成均起抑制作用,在莖、葉中木質(zhì)素合成關(guān)鍵酶基因的表達量較野生型植株明顯下降,說明SsMYB48基因在擬南芥根中的表達水平較低,在莖、葉中表達水平較高;木質(zhì)素合成關(guān)鍵酶基因AtF5H和AtPOD受SsMYB48基因的影響較大。以上結(jié)果表明,蓮霧MYB基因?qū)δ举|(zhì)素的合成可能起抑制作用,在今后對蓮霧MYB基因的進一步研究中,可以借助番櫻桃、巨桉、玫瑰木的基因組作為蓮霧基因分析的參考和驗證基礎(chǔ)。

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