王曉紅
江西省上饒市第二人民醫(yī)院檢驗(yàn)科,江西上饒 334000
肺結(jié)核是臨床呼吸內(nèi)科常見的一類慢性傳染性疾病,主要是由于結(jié)核分枝桿菌感染肺部而引起,主要癥狀包括發(fā)熱、咳痰、疲乏無力、血液系統(tǒng)異常等,此病亦是中青年人群的重要死因之一,對患者的生命健康造成嚴(yán)重威脅[1-2]。目前對于肺結(jié)核的診斷,多采用醫(yī)生詢問體征及有無病史結(jié)合痰結(jié)核分枝桿菌檢查,以及影像學(xué)檢查等[3]。肺結(jié)核發(fā)病率居高不下,引起國內(nèi)外廣泛關(guān)注,以往通過傳統(tǒng)痰涂片痰培養(yǎng)診斷肺結(jié)核,但此種方法存在檢測陽性率低,所需時(shí)間長等不足之處,為臨床診治帶來了難度,因此提高肺結(jié)核的診斷陽性率以及診治速度尤為關(guān)鍵[4-5]。本研究主要探究PCR熒光探針法聯(lián)合DNA微陣列芯片法檢測在肺結(jié)核診斷和治療中的應(yīng)用效果,旨在尋找臨床診斷肺結(jié)核及耐藥鑒定快速準(zhǔn)確的實(shí)驗(yàn)指標(biāo)。
選取2020年1月至10月上饒市第二人民醫(yī)院收治的128例肺結(jié)核患者為觀察組,另外選取同期40例非肺結(jié)核患者為對照組。對照組中,男30例,女10 例;年齡 24~80 歲,平均(52.15±5.02)歲。觀察組中,男 96例,女 32例;年齡 23~81歲,平均(54.05±4.85)歲。兩組的一般資料比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),具有可比性。本研究經(jīng)上饒市第二人民醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。納入標(biāo)準(zhǔn):①觀察組患者經(jīng)臨床診斷并結(jié)合影像學(xué)資料、實(shí)驗(yàn)室檢查,確診為肺結(jié)核患者;②所有對象均留取晨痰、血清標(biāo)本進(jìn)行痰涂片抗酸染色結(jié)核抗體PCR熒光探針法及DNA微陣列芯片法檢測;③患者及其家屬知曉本次研究,并簽署知情同意書。排除標(biāo)準(zhǔn):①患有惡性腫瘤者;②合并心、肝、腎等重要器官功能障礙者;③合并患有其他傳染疾病者。
(1)痰涂片抗酸染色法:取痰液標(biāo)本涂在載玻片上,使用抗酸染色液(珠海貝索生物技術(shù)有限公司,生產(chǎn)批號(hào):20191021)進(jìn)行染色,染色完成后置于顯微鏡下觀察,連續(xù)觀察300個(gè)不同視野,未發(fā)現(xiàn)抗酸桿菌為抗酸桿菌陰性(-),否則為抗酸桿菌陽性(+)。(2)PCR熒光探針法:①收集患者痰液標(biāo)本,加入等量4%NaOH溶液于離心管中震蕩搖勻,室溫下液化30 min后放入離心機(jī)(1200 r/min)中離心5 min,棄上清液后加入1 ml生理鹽水后離心,重復(fù)以上操作,棄上清液后加入核酸提取液50 μl,混勻后放入DNA提取儀震蕩5 min,取出放在95℃水浴鍋中加熱5 min;將提取好的核酸加入反應(yīng)體系中,進(jìn)行PCR擴(kuò)增程序,分別為37℃,30 s;94℃,180 s;94℃,15 s;60℃,30 s; 檢測時(shí)選擇FAM、VIC通道,采集熒光點(diǎn)在60℃,30 s。當(dāng)Ct值<40為陽性,擴(kuò)增曲線非S型或者Ct值為40(或者無數(shù)值)則為陰性[6]。(3)結(jié)核抗體檢測:采用結(jié)核抗體檢測試劑盒(上海奧普生物醫(yī)藥股份有限公司,生產(chǎn)批號(hào):20190915)進(jìn)行檢測,在反應(yīng)板的反應(yīng)孔中間,依次加入2滴封閉液、40 μl血清標(biāo)本、6滴洗滌液、2滴金標(biāo)液、6滴洗滌液,等待薄膜吸入。結(jié)果讀?。罕∧ぶ虚g有紅圓點(diǎn)為陽性,否則為陰性。(4)DNA微陣列芯片法:對PCR擴(kuò)增出結(jié)核分枝桿菌的提取液和結(jié)核基因芯片反應(yīng)液進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行芯片雜交,之后采用結(jié)核分枝桿菌耐藥基因盒(成都博奧晶芯生物科技有限公司,生產(chǎn)批號(hào):20191102)進(jìn)行利福平和異煙肼耐藥性檢測[7],洗板使用微陣列掃描儀和相應(yīng)軟件進(jìn)行信號(hào)的讀取及結(jié)果判讀,所有操作過程都嚴(yán)格按照說明書執(zhí)行。
①比較痰涂片抗酸染色、血清結(jié)核抗體及PCR熒光探針法檢測結(jié)果及診斷效能,a、b、c、d分別表示真陽性、假陽性、假陰性、真陰性,靈敏度=a/(a+c),特異度=d/(b+d),陽性預(yù)測值=a/(a+b),陰性預(yù)測值=d(c+d),準(zhǔn)確度=(a+d)/(a+b+c+d)。②統(tǒng)計(jì) DNA 微陣列芯片法檢測利福平和異煙肼耐藥性結(jié)果。
采用SPSS 20.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,計(jì)量資料采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,組間比較采用t檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料用率表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn),以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
PCR熒光探針法診斷肺結(jié)核的靈敏度、特異度、陽性預(yù)測值、準(zhǔn)確度高于痰涂片抗酸染色和血清結(jié)核抗體,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)(表 1~4)。
表1 痰涂片抗酸染色檢測結(jié)果(例)
表2 血清結(jié)核抗體檢測結(jié)果(例)
表3 PCR熒光探針法檢測結(jié)果(例)
表4 三種檢測方法檢測診斷效能比較(%)
128例肺結(jié)核患者中,DNA微陣列芯片法檢出利福平敏感45例,耐藥11例;異煙肼敏感44例,耐藥12例;雙重耐藥5例。其中11例利福平耐藥標(biāo)本中,利福平rpoB基因耐藥位點(diǎn)分布為531(TCG→TTG)位點(diǎn) 6例,526 (CAC→TAC) 位點(diǎn) 2例,526 (CAC→CTC)位點(diǎn) 1 例,516(GAC→GGC)位點(diǎn) 1 例,511(CTG→CCG)位點(diǎn)1例;12例異煙肼耐藥標(biāo)本中異煙肼katG基因耐藥位點(diǎn)分布為315(AGC→ACC)位點(diǎn)11例,315(AGC→AAC)位點(diǎn) 1 例。
肺結(jié)核是嚴(yán)重威脅公共衛(wèi)生安全的傳染病之一,兼具感染率高、死亡率高、控制進(jìn)程緩慢等特點(diǎn),因此早期診斷及盡早制定治療方案對治療肺結(jié)核尤為重要[8]。肺結(jié)核是由結(jié)核分枝桿菌所引起,因此目前臨床上對于發(fā)現(xiàn)結(jié)核病傳染源的主要手段是對患者痰液中的結(jié)核分枝桿菌進(jìn)行檢測,常用方法有改良羅氏法、結(jié)合抗體檢測等,但這些方法在檢測陽性率、檢測周期等方法存在不足之處[9-10]。近些年來,由于分子生物技術(shù)的快速發(fā)展,相關(guān)檢測技術(shù)應(yīng)用于肺結(jié)核臨床診斷中,PCR熒光探針具有檢測周期短、敏感度高等優(yōu)勢,可精準(zhǔn)檢測患者痰液中的結(jié)核分枝桿菌;DNA微陣列芯片法操作簡單且可以同時(shí)檢測多種分枝桿菌多種耐藥情況,可有效減少患者診斷和治療時(shí)間[11-12]。
PCR熒光探針法診斷肺結(jié)核的靈敏度、特異度、陽性預(yù)測值、準(zhǔn)確度高于痰涂片抗酸染色和血清結(jié)核抗體,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),提示PCR熒光探針法可作為臨床分枝桿菌感染診斷的重要檢測手段。PCR熒光探針法主要是將雙重PCR技術(shù)和Taqman探針技術(shù)相結(jié)合,再根據(jù)結(jié)核分枝桿菌的特異性序列,設(shè)計(jì)引物以及探針;探針標(biāo)記不同的熒光發(fā)光基因,根據(jù)不同的熒光通道的熒光信號(hào)變化,判定是否感染結(jié)核分枝桿菌,操作簡便、快速,且準(zhǔn)確率高[13]。本研究結(jié)果顯示,實(shí)驗(yàn)組應(yīng)用DNA微陣列芯片法檢出利福平敏感45例,耐藥11例;異煙肼敏感44例,耐藥12例;雙重耐藥5例,提示DNA微陣列芯片法可快速檢測結(jié)核分枝桿菌對利福平異煙肼耐的耐藥性,具有較高的檢測效能。DNA微陣列芯片法是通過檢測抗結(jié)核藥物利福平和異煙肼的耐藥基因的野生型、不同突變型來判斷是否耐藥;同時(shí)可快速檢測標(biāo)本中的分枝桿菌利福平基因和耐異煙肼基因突變的變位點(diǎn),特異性高[14-15];此外設(shè)計(jì)PCR擴(kuò)增引物與核苷酸探針,在芯片上固定,并經(jīng)與針對性擴(kuò)增受檢樣本的DNA片段雜交,通過芯片掃描儀對雜交后的芯片熒光信號(hào)進(jìn)行掃描獲取菌種信息[16-17]。DNA微陣列芯片法檢測結(jié)核分枝桿菌的耐藥與傳統(tǒng)藥物敏感法有較高的一致性,較為可靠且檢測所需時(shí)間短,可以作為臨床肺結(jié)核耐藥性的快速篩查方法[12]。
綜上所述,PCR熒光探針法聯(lián)合DNA微陣列芯片法既能提高結(jié)核分枝桿菌的陽性率,也能快速檢測結(jié)核分枝桿菌的耐藥性,48 h即可獲得診斷及耐藥結(jié)果,可以協(xié)助早期診斷,制定有效的治療方案,對改善肺結(jié)核患者預(yù)后具有重要意義,臨床價(jià)值高。