溫度是影響水稻品種形成和地域分布的主要環(huán)境因子。亞洲栽培稻分為秈稻和粳稻兩個亞種，秈稻低溫耐受性較弱，主要分布在我國華南和淮河以南的熱帶/亞熱帶地區(qū)；粳稻低溫耐受性較強，主要分布于我國北部和東北部。目前，學界對秈、粳稻低溫耐受性差異的分子基礎已有一定的了解，低溫感受器編碼基因COLD1在秈、粳稻之間存在明顯差異，COLD1中單個核苷酸變化能夠明顯改變水稻的耐寒性。低溫感受器下游信號通路眾多，但哪些調(diào)控途徑在秈/粳稻耐寒性差異形成中發(fā)揮關鍵作用尚不清楚。

中國科學院院士、中科院植物研究所研究員種康課題組繼發(fā)現(xiàn)水稻低溫感受器COLD1之后，致力于解析其下游調(diào)控途徑。研究人員通過多組學分析發(fā)現(xiàn)，維生素E-維生素K1亞網(wǎng)絡是COLD1下游低溫應答通路，也是秈、粳稻低溫耐受性差異形成的關鍵調(diào)控點。研究人員從粳稻日本晴為供體的秈稻93-11單片段代換系入手，選取低溫耐受性提升至近粳稻水平的代換系，基因組序列分析表明COLD1位于代換片段區(qū)域；轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn)，代換系與日本晴中低溫應答變化規(guī)律相似的通路集中于泛醌/萜醌代謝網(wǎng)絡（包括維生素合成途徑）；代謝組分析進一步聚焦到葉綠體中維生素E和維生素K1代謝途徑；轉(zhuǎn)錄/代謝雙組學相關性網(wǎng)絡分析表明，維生素E-維生素K1亞網(wǎng)絡是代換系低溫耐受性提升的核心調(diào)控點。轉(zhuǎn)基因材料分析驗證此亞網(wǎng)絡確為COLD1下游途徑。研究人員通過多組學與遺傳材料相結合的分析手段，揭示了低溫信號被植物感知后的下游傳導途徑，挖掘了秈粳不同低溫耐受性形成的關鍵調(diào)控點，為水稻耐寒分子育種奠定了理論基礎并供可操作的靶點和材料。

該研究成果于7月20日在線發(fā)表于Cell Reports。該研究得到中科院戰(zhàn)略性先導科技專項和國家自然科學基金委員會的資助。