王煜

研究人員在上海市重大傳染病和生物安全研究院的加強(qiáng)型生物安全二級(jí)（BSL-2+）實(shí)驗(yàn)室。

響應(yīng)疫情帶來(lái)的現(xiàn)實(shí)需求、落實(shí)上?！肮l(wèi)20條”的部署，上海市重大傳染病和生物安全研究院（簡(jiǎn)稱“傳研院”）自2020年11月在復(fù)旦大學(xué)揭牌成立以來(lái)的一年間，勤懇探索，邊建邊研，始終不忘肩負(fù)的特殊使命。

研究院為每一次上?？茖W(xué)精準(zhǔn)防控提供關(guān)鍵建議;為疫苗接種策略、陸路口岸管理等國(guó)家疫情防控重大決策的制定，提供了重要的科學(xué)建議。

傳研院院長(zhǎng)、復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院副院長(zhǎng)吳凡表示：研究院正加速攻關(guān)傳染病防控關(guān)鍵技術(shù)，為保障人民健康和城市公共衛(wèi)生安全貢獻(xiàn)上海力量。

助力決策，精準(zhǔn)抗疫

傳研院是由上海市人民政府和復(fù)旦大學(xué)共同建設(shè)的獨(dú)立法人事業(yè)單位，整合上海市在傳染病和生物安全領(lǐng)域的優(yōu)勢(shì)單位，旨在為上海和國(guó)家公共衛(wèi)生安全體系提供人才、技術(shù)支持以及政策建議。

在新冠疫情這一特殊的時(shí)期建立，傳研院的一大重要使命就是為國(guó)家的疫情防控策略提供基于科學(xué)依據(jù)的建議。例如，傳研院雙聘PI（Principle Investigator，學(xué)術(shù)帶頭人）、復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院羅力教授帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)承接上海市政協(xié)《公共衛(wèi)生應(yīng)急管理體系建設(shè)》重大調(diào)研課題，自2021年3月以來(lái)，走訪了上海市衛(wèi)健委、徐匯區(qū)政府、浦東新區(qū)政府、復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院等單位，邀請(qǐng)政協(xié)委員、相關(guān)政府部門(mén)負(fù)責(zé)人、資深專家等召開(kāi)專題座談會(huì)16次，300多人次參與座談。此外，課題組認(rèn)真研究了美國(guó)、日本、新加坡等國(guó)家的應(yīng)急管理體系建設(shè)經(jīng)驗(yàn)，以及北京市、湖北省、武漢市等省市應(yīng)急管理體制機(jī)制的改革實(shí)例。

運(yùn)用公共衛(wèi)生與應(yīng)急管理科學(xué)的交叉學(xué)科研究方法，課題組得出的調(diào)查結(jié)果顯示：上海市開(kāi)展疫情防控基本實(shí)現(xiàn)了“統(tǒng)一指揮、專常兼?zhèn)?、上下?lián)動(dòng)、反應(yīng)靈敏”。在實(shí)施常態(tài)化防控后，上海應(yīng)對(duì)歷次疫情，做到了快速響應(yīng)、精準(zhǔn)防控，體現(xiàn)了“上海速度”和“上海精度”。同時(shí)，課題組提出了強(qiáng)化上海市公共衛(wèi)生應(yīng)急管理體系建設(shè)需要關(guān)注的主要問(wèn)題，并給出了相應(yīng)解決建議。

實(shí)際上，在2020年新冠疫情暴發(fā)初期，羅力團(tuán)隊(duì)就為上海和全國(guó)疫情防控的決策貢獻(xiàn)了智慧。例如，2020年2月，團(tuán)隊(duì)向中央提交專報(bào)，提出“疫情防控應(yīng)該逐步進(jìn)入常態(tài)化”;2020年4月，上海出臺(tái)的“公衛(wèi)20條”政策中，也體現(xiàn)了團(tuán)隊(duì)的關(guān)鍵貢獻(xiàn)。

2020年4月，上海出臺(tái)的“公衛(wèi)20 條”政策中，也體現(xiàn)了羅力團(tuán)隊(duì)的關(guān)鍵貢獻(xiàn)。

“當(dāng)前我們防止境外疫情輸入獲得了較好成果，限制入境人數(shù)、降低防控成本是很關(guān)鍵的一點(diǎn)?！绷_力向《新民周刊》表示。數(shù)據(jù)顯示：2019年從上海入境人次超過(guò)2000萬(wàn)，而2021年截至當(dāng)前只有100萬(wàn)人次左右。他認(rèn)為，當(dāng)下防控策略的成效是明顯的，效果大于成本;但這并非長(zhǎng)久之計(jì)。他帶領(lǐng)的團(tuán)隊(duì)正在抓緊研究，希望為國(guó)家提出“疫情防控新常態(tài)”的策略，來(lái)解決當(dāng)前面臨的新情況、新問(wèn)題，使得將來(lái)我們的國(guó)門(mén)可以安全地打開(kāi)。

左圖：加強(qiáng)型生物安全二級(jí)（BSL-2+）實(shí)驗(yàn)室動(dòng)物實(shí)驗(yàn)區(qū)域。右上圖：病原樣本庫(kù)平臺(tái)。右下圖：病原樣本庫(kù)平臺(tái)監(jiān)控室。

疫苗的接種是抗擊新冠肺炎的關(guān)鍵策略，在此領(lǐng)域，傳研院雙聘PI、復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院余宏杰教授帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)開(kāi)展了“新冠肺炎的流行病學(xué)、干預(yù)措施效果及疫苗接種策略研究”。團(tuán)隊(duì)積極將科研成果轉(zhuǎn)化為公共衛(wèi)生政策，向上海市政府、國(guó)家衛(wèi)健委、中國(guó)疾控中心等部門(mén)遞交了13份政策報(bào)告，助力制定新冠肺炎的防控方案及疫苗接種策略。

2021年3月，團(tuán)隊(duì)提交了新冠病毒變異毒株研究報(bào)告;7月，團(tuán)隊(duì)提出“通過(guò)疫苗接種建立群體免疫以控制新冠病毒原型株和變異株在中國(guó)的流行”;8月，團(tuán)隊(duì)先后提交了“新冠病毒Delta變異株引入中國(guó)導(dǎo)致流行的疾病負(fù)擔(dān)估計(jì)”和“新冠病毒Lambda變異株的流行趨勢(shì)和主要特點(diǎn)”研究報(bào)告。

在上海和全國(guó)防控新冠疫情的策略中，凝聚著大量傳研院研究者團(tuán)隊(duì)的真知灼見(jiàn)，他們是默默守衛(wèi)人民群眾生命健康安全的幕后英雄。

抗擊新冠需要全球合作，傳研院研究者同樣為世界貢獻(xiàn)了抗疫智慧。傳研院雙聘PI、復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院王偉炳教授帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)在輸入性風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)、全球性疫情防控干預(yù)措施效果等研究領(lǐng)域取得系列成果。

新冠疫情暴發(fā)初期，人們關(guān)心的一個(gè)問(wèn)題是：新冠病毒是否會(huì)像SARS病毒一樣在夏天消失？2020年春季，王偉炳團(tuán)隊(duì)從全球水平層面探究了8個(gè)國(guó)家202個(gè)地區(qū)的平均氣溫、平均最高氣溫、平均最低氣溫、相對(duì)濕度和紫外線與累計(jì)報(bào)告病例數(shù)和新冠病毒基本再生數(shù)的關(guān)系。研究成果最終報(bào)送上海市政府并建議：不能依靠天氣回暖來(lái)抑制病毒的傳播，建議繼續(xù)執(zhí)行適度嚴(yán)格的疫情防控措施。這項(xiàng)成果發(fā)表在《歐洲呼吸學(xué)雜志》上，成為向全球貢獻(xiàn)的抗疫“中國(guó)智慧”。

針對(duì)嚴(yán)重威脅全球公共衛(wèi)生安全的新發(fā)、重大傳染病，包括新冠肺炎、季節(jié)性流感和禽流感、艾滋病、結(jié)核、手足口病、肺炎鏈球菌病等，傳研院正在進(jìn)行高質(zhì)量、智能化的生物安全樣本庫(kù)建設(shè)。

搭建平臺(tái)，服務(wù)一線

在為抗疫提供決策建議之外，傳研院也直接為應(yīng)對(duì)疫情的一線研制出了可運(yùn)用的工具。

新冠疫情以來(lái)，人們對(duì)核酸檢測(cè)變得熟悉。實(shí)際上，除了新冠病毒以外，很多呼吸道疾病的病原體都可以通過(guò)熒光PCR方法來(lái)檢測(cè)。在同時(shí)檢測(cè)多種呼吸道疾病的臨床需求面前，當(dāng)前市場(chǎng)上常見(jiàn)的檢測(cè)試劑盒有不少缺陷：要么檢測(cè)時(shí)間長(zhǎng)，要么價(jià)格高，或者多重PCR只能檢測(cè)少數(shù)臨床常見(jiàn)病原微生物。

針對(duì)這樣的問(wèn)題，傳研院雙聘PI、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院呼吸科與危重醫(yī)學(xué)科主任宋元林與中山醫(yī)院檢驗(yàn)科郭瑋主任團(tuán)隊(duì)聯(lián)合，并與生產(chǎn)企業(yè)合作，研發(fā)出38聯(lián)檢測(cè)PCR試劑盒。該試劑盒可以在4小時(shí)內(nèi)完成對(duì)既定38種呼吸道病原體的檢測(cè)，涵蓋臨床常見(jiàn)的99.9%的真菌、結(jié)核、細(xì)菌、病毒等病原微生物，靈敏度和特異性符合臨床呼吸道感染科的應(yīng)用需求。它不僅適用于臨床檢測(cè)，也可進(jìn)行大規(guī)模流行病學(xué)調(diào)查。

上海市重大傳染病和生物安全研究院院長(zhǎng)、復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院副院長(zhǎng)吳凡。

“這個(gè)研究項(xiàng)目之前已經(jīng)開(kāi)展了幾年時(shí)間，納入傳研院的框架后，獲得了快速的進(jìn)展。”宋元林告訴《新民周刊》，以前各個(gè)學(xué)科的研究者在自己的領(lǐng)域深耕，平時(shí)可能連見(jiàn)面都不容易;共同進(jìn)入傳研院這個(gè)平臺(tái)后，不同領(lǐng)域的專家有了近距離溝通交流的機(jī)會(huì)，“1+1>2”的合作更容易實(shí)現(xiàn)。

在傳研院，基礎(chǔ)研究與臨床研究也有了緊密聯(lián)結(jié)。他舉例說(shuō)：當(dāng)前他的多個(gè)在研課題如建設(shè)重癥肺炎標(biāo)本庫(kù)、耐藥菌感染免疫分型研究等，就是和公衛(wèi)學(xué)院、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院等學(xué)院的教授團(tuán)隊(duì)合作開(kāi)展。

羅力團(tuán)隊(duì)在新冠疫情初期的另一項(xiàng)成果也能很好地闡釋傳研院的平臺(tái)功能：2020年初，突如其來(lái)的疫情使得口罩供應(yīng)不足，生活在上海的很多人都有到居委會(huì)報(bào)備口罩需求，幾天后再到指定藥店按配額統(tǒng)一購(gòu)買(mǎi)的經(jīng)歷。支撐這套體系運(yùn)作的，就是羅力團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)的“口罩應(yīng)急調(diào)配信息系統(tǒng)”。該系統(tǒng)連接起居民、居委會(huì)、民政部門(mén)、商委、口罩生產(chǎn)企業(yè)、配送企業(yè)、藥店，運(yùn)行到2020年3月底，保證了總計(jì)1.38億只口罩的有序流轉(zhuǎn)。

在這個(gè)團(tuán)隊(duì)里，不僅有公共衛(wèi)生與計(jì)算機(jī)信息團(tuán)隊(duì)的合作，還有臨床醫(yī)學(xué)、經(jīng)濟(jì)、新聞傳播、國(guó)際關(guān)系等多個(gè)專業(yè)的人員。

共同研究不僅跨學(xué)科，還涵蓋不同地域。王偉炳透露，依托傳研院的平臺(tái)，他帶領(lǐng)的團(tuán)隊(duì)正與江蘇、浙江、安徽三省聯(lián)動(dòng)，打造基于長(zhǎng)三角區(qū)域的呼吸道綜合征監(jiān)測(cè)系統(tǒng);與全國(guó)各大醫(yī)院共同探索傳染病癥候群隊(duì)列研究，以盡早發(fā)現(xiàn)“苗子事件”，守護(hù)公眾健康。

2021年10月，上海市重大傳染病和生物安全研究院主辦“2021上海傳染病論壇暨申江健康論壇”，探討“新冠肺炎的研究進(jìn)展”。

成立之初，傳研院就定下五大核心任務(wù)：構(gòu)建“全鏈?zhǔn)健笨蒲衅脚_(tái);建立一支國(guó)際一流、長(zhǎng)期從事傳染病和生物安全的研究隊(duì)伍;形成科研聯(lián)合攻關(guān)新模式;建設(shè)重大傳染病和生物安全創(chuàng)新型人才培養(yǎng)基地;構(gòu)建直通國(guó)內(nèi)外開(kāi)放的合作體系。如今，這五大任務(wù)，都在逐步推進(jìn)落實(shí)。

配備“神器”，科學(xué)共享

工欲善其事，必先利其器。傳研院擁有先進(jìn)的硬件基礎(chǔ)設(shè)施，為前沿的科研提供保障。

傳研院的加強(qiáng)型生物安全二級(jí)（BSL-2+）實(shí)驗(yàn)室平臺(tái)位于復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院，用于新發(fā)傳染病傳播與防控以及突發(fā)公共衛(wèi)生應(yīng)急領(lǐng)域的相關(guān)研究。BSL-2+實(shí)驗(yàn)室中，有不少設(shè)備的能力位于國(guó)際領(lǐng)先水平。實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)人蔡啟良介紹：動(dòng)物活體成像設(shè)備就是實(shí)驗(yàn)室擁有的“神器”之一。以往，進(jìn)行病原體的動(dòng)物感染實(shí)驗(yàn)時(shí)，只能在感染了病原體的動(dòng)物死亡后從其身體提取病理組織進(jìn)行觀測(cè)，觀測(cè)的時(shí)間和空間維度都受到明顯限制。有了動(dòng)物活體成像設(shè)備后，觀測(cè)可以變得三維立體化，而且可以涵蓋感染的前、中、后全部時(shí)間段;如此一來(lái)，研究的可行性、研究的精準(zhǔn)性和研發(fā)對(duì)應(yīng)藥物的有效性都能得到顯著提升。

第二代和第三代高通量測(cè)序平臺(tái)的結(jié)合，為疑難疾病病原體發(fā)現(xiàn)和鑒定、精準(zhǔn)多維度的疫苗全過(guò)程評(píng)價(jià)與免疫學(xué)分析等功能提供了技術(shù)支撐。這使得傳研院在面對(duì)重大新發(fā)傳染病疫情時(shí)，具備快速響應(yīng)能力和應(yīng)急保障能力。

這樣的能力得到了實(shí)戰(zhàn)的檢驗(yàn)。2020年下半年上海黃浦區(qū)的一次疫情中，有一個(gè)密接者是出租車(chē)司機(jī)。傳研院生物安全實(shí)驗(yàn)室在此之前對(duì)新冠病毒在木頭、塑料、鋼材等十幾種固體材質(zhì)表面的存活期開(kāi)展過(guò)檢測(cè)，得出的結(jié)論是：病毒在當(dāng)時(shí)的氣候條件下，在這些地方的存活期為2-3天。根據(jù)這樣的結(jié)論，上海對(duì)進(jìn)入過(guò)該出租車(chē)的人員的排查時(shí)間范圍就定在3天。為精準(zhǔn)抗疫做出貢獻(xiàn)，是傳研院生物實(shí)驗(yàn)室眾多“優(yōu)秀戰(zhàn)績(jī)”的代表?！拔覀兊腜3實(shí)驗(yàn)室是全國(guó)利用率最高、最有成效的P3實(shí)驗(yàn)室之一?！辈虇⒘颊f(shuō)。

針對(duì)嚴(yán)重威脅全球公共衛(wèi)生安全的新發(fā)、重大傳染病，包括新冠肺炎、季節(jié)性流感和禽流感、艾滋病、結(jié)核、手足口病、肺炎鏈球菌病等，傳研院正在進(jìn)行高質(zhì)量、智能化的生物安全樣本庫(kù)建設(shè)。

樣本庫(kù)由傳研院統(tǒng)一布局和管理，將來(lái)自各個(gè)渠道的生物標(biāo)本，統(tǒng)一在生物樣本庫(kù)中保藏和管理。樣本庫(kù)具備自動(dòng)化與智能化特征，從而實(shí)現(xiàn)系統(tǒng)化、標(biāo)準(zhǔn)化、規(guī)范化、智能化的樣本管理與共享機(jī)制。

目前傳研院在建設(shè)中的“基于傳染病病例的隊(duì)列生物樣本庫(kù)”與“基于生命全周期的自然人群隊(duì)列生物樣本庫(kù)”，均布局配備了-80℃全自動(dòng)樣本存取系統(tǒng)，可存儲(chǔ)百萬(wàn)級(jí)的樣本量;-196℃氣相液氮深低溫自動(dòng)化存儲(chǔ)系統(tǒng)以及備份系統(tǒng)可存儲(chǔ)約十萬(wàn)級(jí)的樣本量。

“樣本庫(kù)不僅保存樣本本身，還同步保存和管理與樣本有關(guān)的臨床診療、倫理審批、知情同意等健康相關(guān)信息?！辈虇⒘颊f(shuō)。未來(lái)新的傳染病出現(xiàn)時(shí)，樣本庫(kù)中的樣本與信息，將為制定傳染病精準(zhǔn)防控措施提供科學(xué)依據(jù)。

傳研院運(yùn)行一年以來(lái)，對(duì)上述硬件設(shè)施與配套人才隊(duì)伍的建設(shè)大力投入，希望整合基礎(chǔ)、臨床及公共衛(wèi)生的科研資源，建立有效合作共享機(jī)制，為重大傳染病和生物安全研究打造具備先進(jìn)性、科學(xué)性和共享性的公共服務(wù)平臺(tái)。