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天然產(chǎn)物中的橋頭雙鍵結(jié)構(gòu)特征

2021-11-10 03:24:35劉錕
科學與生活 2021年21期
關(guān)鍵詞:規(guī)則

劉錕

摘要:天然產(chǎn)物是藥物開發(fā)的寶庫,天然產(chǎn)物分子的分子結(jié)構(gòu)研究對藥物活性與結(jié)構(gòu)修飾有重要意義。本文綜述了含有橋頭雙鍵的核心骨架的天然產(chǎn)物結(jié)構(gòu)特征取得的一些進展。

關(guān)鍵詞:Anti-Bredt 規(guī)則;橋頭雙鍵;天然產(chǎn)物;

近幾十年從植物中提取到化學結(jié)構(gòu)特殊的天然產(chǎn)物分子,有較好生理活性的天然分子Taxol(紫杉醇)[1,2]、phomactins[3]、抗生素abyssomicins B–D [4]等。其化學結(jié)構(gòu)如圖1所示,這些分子不僅化學結(jié)構(gòu)獨特,而且在化學全合成也極具有挑戰(zhàn)性,主要難點在于構(gòu)建分子中橋頭雙鍵(Bridgehead Double Bonds)。

根據(jù)Bredt 規(guī)則[5]橋頭雙鍵是不可能存在的,橋頭雙鍵存在會引起一定的烯烴張力(olefin strain)[6]。雙鍵碳原子軌道雜化為sp2雜化屬于平面型的軌道覆蓋會對橋環(huán)施加較大的形變張力。已有實驗數(shù)據(jù)證實天然產(chǎn)物中是存在Anti-Bredt規(guī)則[7]的橋頭雙鍵的結(jié)構(gòu)的存在,雖然在雙環(huán)分子中橋頭雙鍵X-ray圖譜不能直接看出雙鍵軌道覆蓋扭曲夾角(τ),但可以直接得到扭曲角φ1WC1C2Y和φ2 XC1C2Z,因為在雙環(huán)體系中的扭曲所以φ1 ≠ φ2,則扭曲夾角τ = (φ1+φ2) / 2。其橋頭雙鍵通式和軌道模型如圖2所示,

含橋頭雙鍵的天然產(chǎn)物分子的化學穩(wěn)定性與張力大小密切相關(guān),上世紀80年代,Schleyer 提出基于分子力場理論方法計算含有橋頭雙鍵的雙環(huán)烯烴分子的張力從而判斷分子的穩(wěn)定性 [8]。通過計算機模擬將分子中成鍵原子的相互作用(Bond Stretching)、鍵角(Angle Bending)、扭曲勢能(Torsion)和非鍵作用(No-bonded interactions)計算出分子張力。他們利用MM系列分子力場計算出54個含有橋頭烯烴的分子[9],其實驗結(jié)果與Fawcett提出S經(jīng)驗值判定化學橋頭雙鍵骨架穩(wěn)定性比較吻合[8][10]。

目前有該類天然產(chǎn)物通過單晶衍射圖譜完成了分子橋頭雙鍵鍵長(?)和扭轉(zhuǎn)夾角(τ)研究工作對化合物穩(wěn)定性判定和結(jié)構(gòu)鑒定有重要意義[8]。實驗數(shù)據(jù)表明,隨著橋頭雙鍵環(huán)系的增加橋頭烯烴的扭轉(zhuǎn)夾角在減小,說明橋頭雙鍵的P軌道可以更好地覆蓋,繼而增加分子的穩(wěn)定性。同時在對比Taxol和crispolide[11]在同樣具有雙環(huán)[5.3.1]橋頭雙鍵核心骨架,由于雙鍵的位置異構(gòu),通過分子力場模擬計算結(jié)果也是不同的,如表1所示。

總結(jié) 隨著新的天然產(chǎn)物不斷發(fā)現(xiàn)和新的分離方法的應(yīng)用,一些結(jié)構(gòu)新穎的分子也被相應(yīng)的發(fā)現(xiàn),雖然利用現(xiàn)有儀器高效的完成分離和鑒定工作,但是在含有橋頭雙鍵的天然產(chǎn)物的提取分離和結(jié)構(gòu)鑒定仍然存在一定的挑戰(zhàn),主要是因為該類化合物的化學性質(zhì)較活潑而結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定,容易發(fā)生氧化或者重排反應(yīng),在化學合成上也存在一定的困難。同時也期待這類天然產(chǎn)物中發(fā)現(xiàn)同紫杉醇(Taxol)類似優(yōu)秀的天然藥物。

參考文獻

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