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葡萄VvIQD10果形相關(guān)基因定位及其互作研究

2021-07-28 02:13農(nóng)慧蘭陶建敏
西北植物學(xué)報(bào) 2021年6期
關(guān)鍵詞:果形微管結(jié)構(gòu)域

余 欣,董 陽(yáng),劉 靜,農(nóng)慧蘭,鄭 煥,陶建敏

(南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 園藝學(xué)院, 南京 210095)

葡萄(VitisL.)是一種被廣泛種植的水果作物[1],可以為人類的日常飲食提供纖維素、維生素和抗氧化劑等豐富的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)[2]。這些豐富的營(yíng)養(yǎng)成分是葡萄的內(nèi)在品質(zhì),而葡萄的外在品質(zhì)對(duì)于水果作物葡萄來(lái)說(shuō)也格外重要,果實(shí)形狀就是葡萄重要的外在品質(zhì)之一。多種多樣的葡萄果形,在一定程度上影響了葡萄的經(jīng)濟(jì)價(jià)值及消費(fèi)選擇[3]。根據(jù)葡萄不同果形特性,將葡萄果粒形狀分為11種:扁圓形(obloid)、圓形(round)、近圓形(nearly round)、橢圓形(broad lipsoid)、長(zhǎng)橢圓形(narrow lipsoid)、卵圓形(ovoid)、倒卵圓形(obovoid)、雞心形(heart-shape)、束腰形(waist shape)、彎形(curved shape)和圓柱形(cylindric)[4]。其中,彎形和束腰形品種屈指可數(shù)[4],如‘美人指’為束腰形,‘金手指’為彎形[5];而長(zhǎng)橢圓形、倒卵圓形、扁圓形和雞心形等果形的品種數(shù)量較少,最為常見(jiàn)的是橢圓形[4]。果實(shí)是植物器官之一,而植物器官的形狀主要受單個(gè)細(xì)胞的幾何形狀及其細(xì)胞分裂和生長(zhǎng)軸的方向控制,所有這些過(guò)程都高度依賴于微管(microtubules, MT)動(dòng)力[6]。

IQ67結(jié)構(gòu)域(IQ67 domain, IQD)蛋白家族是一種古老的鈣調(diào)素結(jié)合蛋白(calmodulin binding proteins, CaMBPs),起源于陸地植物的早期進(jìn)化過(guò)程[7]。擬南芥和水稻的IQD基因系統(tǒng)發(fā)育分析表明,主要的IQD基因譜系起源于單子葉和雙子葉植物分化之前[8]。IQD蛋白的顯著特征是具有較高的等電點(diǎn)和絲氨酸殘基頻率[8],且編碼的IQD蛋白中包含67個(gè)保守氨基酸殘基的植物特異性結(jié)構(gòu)域——IQ67結(jié)構(gòu)域。IQ67結(jié)構(gòu)域的特征是3種不同鈣調(diào)素募集基序(IQ、1-5-10和1-8-14)的獨(dú)特和重復(fù)排列。IQD蛋白家族被認(rèn)為是潛在的控制微管動(dòng)態(tài)性、穩(wěn)定性和組織性的微管相關(guān)網(wǎng)絡(luò)蛋白(microtubule-associated network protein, MAP)家族,對(duì)環(huán)境的適應(yīng)性和植物的發(fā)育起重要作用。微管是細(xì)胞骨架的重要組成部分,微管相關(guān)蛋白網(wǎng)絡(luò)控制微管的動(dòng)態(tài)性、穩(wěn)定性和組織性以生成各種微管陣列[9-10],從而使細(xì)胞骨架形成一個(gè)高度動(dòng)態(tài)的網(wǎng)絡(luò)。微管陣列作為結(jié)構(gòu)支撐附著在質(zhì)膜(plasma membrane, PM)上[11],并通過(guò)引導(dǎo)纖維素合成酶復(fù)合物(cellulose synthase complex, CSCs)來(lái)確定細(xì)胞擴(kuò)張的方向[12]。微管細(xì)胞骨架還介導(dǎo)了不同物質(zhì)的胞內(nèi)運(yùn)輸[13-14],并且有助于胞吐作用[15-18]。研究表明,Ca2+信號(hào)的傳導(dǎo)可以激活細(xì)胞骨架組織相關(guān)蛋白鈣調(diào)蛋白/鈣調(diào)蛋白類蛋白(calmodulin/calmodulin-like proteins, CaM/CML)從而調(diào)節(jié)翻譯后的IQD功能[19]。Ca2+-CaM/CML信號(hào)參與了對(duì)細(xì)胞骨架組織的控制過(guò)程[20]。IQD蛋白可以在發(fā)育中的植物組織中根據(jù)環(huán)境變化解析相應(yīng)激素(如生長(zhǎng)素)水平和Ca2+水平變化,從而使微管分支和細(xì)胞骨架結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,指導(dǎo)細(xì)胞的伸長(zhǎng)和擴(kuò)張,最終驅(qū)動(dòng)器官形狀變化[21]。在葡萄中,通過(guò)研究微管相關(guān)蛋白以解析果形變化分子機(jī)制的相關(guān)研究較少。

迄今為止,已經(jīng)在多個(gè)物種(擬南芥、水稻和番茄等)中鑒定出IQD基因家族,并報(bào)道了IQD基因家族中多個(gè)成員的功能[8, 22-28]。IQD家族基因不僅在果實(shí)等器官形狀的調(diào)控中起作用[29-32],還在干旱和鹽脅迫等逆境響應(yīng)[26-27]、赤霉素反應(yīng)的負(fù)反饋調(diào)節(jié)[33]以及通過(guò)脫落酸信號(hào)通路調(diào)節(jié)種子的萌發(fā)[34]中起著重要作用,AtIQD1基因還被報(bào)道可以影響與硫代葡萄糖酸鹽代謝相關(guān)的多個(gè)基因的表達(dá),起到對(duì)生物攻擊進(jìn)行防御反應(yīng)的作用[35]。據(jù)報(bào)道,在擬南芥和水稻中,IQD家族成員可以與CaM、CML和微管結(jié)合蛋白(KLCR1)及微管相關(guān)蛋白SPIRAL2(SPR2)相互作用,根據(jù)外源生長(zhǎng)素和鈣離子轉(zhuǎn)運(yùn)來(lái)調(diào)節(jié)微管結(jié)構(gòu)[29, 36-37]。

番茄SUN/SlIQD12是IQ67結(jié)構(gòu)域(IQD)蛋白質(zhì)家族成員[31, 38]。SUN/SlIQD12是控制番茄(Solanumlycopersicum)果實(shí)伸長(zhǎng)的主要基因之一[30],對(duì)果形的影響比OVATE基因要顯著[39]。張亞光等[3]利用番茄SUN基因,在美國(guó)國(guó)家生物信息中心(NCBI)中查找葡萄基因組中序列相似性最高的同源序列,命名為VvSUN。本研究在前人研究[31-32]基礎(chǔ)上,選擇葡萄IQD基因家族中與葡萄VvSUN基因以及番茄SUN基因具有較高同源性的VvIQD10基因,通過(guò)比較6個(gè)不同葡萄果形品種VvIQD10基因的表達(dá)量推測(cè)該基因可能和葡萄果形相關(guān),從橢圓形品種葡萄‘天山’中克隆出VvIQD10基因,對(duì)其進(jìn)行序列分析,并利用煙草瞬時(shí)表達(dá)技術(shù)對(duì)VvIQD10蛋白進(jìn)行亞細(xì)胞定位,對(duì)VvIQD10蛋白及其靶蛋白鈣調(diào)素類蛋白(VvCML)互作關(guān)系進(jìn)行研究,以期能夠從基因角度解析VvIQD10基因促進(jìn)細(xì)胞伸長(zhǎng),進(jìn)而導(dǎo)致葡萄果形變化的分子機(jī)理。

1 材料和方法

1.1 試驗(yàn)材料

試驗(yàn)材料采于南京農(nóng)業(yè)大學(xué)湯山葡萄試驗(yàn)基地,以束腰形品種葡萄‘美人指’、彎腰形品種葡萄‘金手指’、長(zhǎng)橢圓形品種葡萄‘天山’和‘魏可’、近圓形品種葡萄‘陽(yáng)光玫瑰’和‘紅環(huán)’(圖1)開(kāi)花期花序?yàn)樵囼?yàn)材料,采用平棚架避雨栽培,常規(guī)田間管理,以圓錐花序穗肩頂端小穗上一半的花開(kāi)放為盛花期,分別在盛花期采集小穗,液氮速凍后-80 ℃保存?zhèn)溆?;煙草為本氏煙草,生長(zhǎng)于22~24 ℃長(zhǎng)日照條件(光照16 h/黑暗8 h)的溫室中。

圖1 不同果形的葡萄品種Fig.1 Grape varieties with different fruit shapes

實(shí)驗(yàn)所需pCAMBIA1302-GFP植物表達(dá)載體、pGBKT7和pGADT7酵母載體、nEYFP和cEYFP雙分子熒光互補(bǔ)試驗(yàn)(bimolecular fluorescence complementation test, BiFC)載體均為南京農(nóng)業(yè)大學(xué)果樹(shù)生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室現(xiàn)有保存材料;酵母菌株誘餌菌株Y2H Gold和捕獲菌株Y187購(gòu)自南京酶普利斯生物公司;大腸桿菌DH5α和根癌農(nóng)桿菌菌株EHA105購(gòu)于上海吐露港生物科技有限公司;中間載體pClone007 Blunt Simple購(gòu)于北京擎科生物科技有限公司;DNA凝膠回收試劑盒和重組克隆試劑盒(ClonExpress?UltraOne Step Cloning Kit)購(gòu)自南京諾唯贊生物科技股份有限公司;金擔(dān)子素A(AbA)和α-半乳糖苷酶顯色底物(X-α-gal)購(gòu)自翊圣生物科技(上海)有限公司。

1.2 試驗(yàn)方法

1.2.1VvIQD10基因表達(dá)分析利用植物總RNA提取試劑盒(TIANGEN)分別提取‘美人指’、‘金手指’、‘天山’、‘魏可’、‘陽(yáng)光玫瑰’和‘紅環(huán)’葡萄盛花期花序總RNA,用反轉(zhuǎn)錄試劑盒(TaKaRa)進(jìn)行cDNA合成。以cDNA為模板,使用Beacon Designer 7.0軟件(Premier Biosoft Internaition, USA)設(shè)計(jì)的引物(表1)進(jìn)行熒光定量PCR分析。反應(yīng)體系按SYBR Green PCR Master Mix (TaKaRa)說(shuō)明書進(jìn)行。以VvUbiquitin為內(nèi)參,由ABI 7300 system軟件完成試驗(yàn)程序的操作和數(shù)據(jù)的導(dǎo)出,試驗(yàn)數(shù)據(jù)采用2-ΔΔCt方法進(jìn)行分析[40],用Excel 2010和SPPSS 20.0軟件進(jìn)行作圖和顯著性分析。

表1 本研究中的引物序列

1.2.2VvIQD10基因及VvCML基因的克隆在NCBI中查找與番茄SUN(SlIQD12)基因和葡萄VvSUN(VvIQD7)進(jìn)化關(guān)系較近的葡萄基因組IQD家族成員VvIQD10(XM_010647400)序列[31-32];查找相關(guān)文獻(xiàn)[36],在NCBI中檢索與水稻基因組IQD家族中SUN同源基因OsIQD14的靶基因OsCaM1(XM_015766855.2)在葡萄中的同源基因VvCML(XM_003632182.3)。用‘天山’葡萄花期花序cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后,回收目的條帶,連接到pClone007 Blunt Simple載體,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α后進(jìn)行鑒定并測(cè)序。

1.2.3VvIQD10基因的生物信息學(xué)分析利用BioXM軟件和ProtParam(https://web.expasy.org/prot param/)在線軟件對(duì)VvIQD10基因所編碼的蛋白質(zhì)理化性質(zhì)進(jìn)行分析;ProtScale(https://web. expasy.org/protscale/)和SignalP 4.0(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-4.0/)分別分析蛋白質(zhì)的疏水性和信號(hào)肽;TMHMM Server v. 2.0(http://www.cbs.dtu.dk/ services/TMHMM/)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)跨膜區(qū)域;SOPMA(https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page= npsa_sopma.html)和SWISS-MODEL(https:// swissmodel.expasy.org/)在線軟件分別預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)二、三級(jí)結(jié)構(gòu);Pfam數(shù)據(jù)庫(kù)(http://pfam.xfam.org/)分析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域;MEGA 10.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù);ClustalX軟件比對(duì)不同物種的氨基酸序列。

1.2.4VvIQD10基因的亞細(xì)胞定位分析使用pCAMBIA 1302-GFP植物表達(dá)載體,用DNA連接酶(TaKaRa)連接目的基因和載體,構(gòu)建pCAMBIA 1302-GFP-VvIQD10瞬時(shí)表達(dá)載體。以空載體為陰性對(duì)照,通過(guò)熱擊法將所得質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至根癌農(nóng)桿菌菌株EHA105中。將PCR檢測(cè)為陽(yáng)性的菌液過(guò)夜培養(yǎng)至OD600為0.6后收集菌體。用含有10 mmol·L-1MES、10 mmol·L-1MgCl2、100 μmol·L-1乙酰丁香酮(As)的懸浮液重懸菌體至OD600為0.3,室溫避光孵育4 h。選擇長(zhǎng)勢(shì)一致的4周齡本氏煙草,用無(wú)菌注射器吸取菌液注射,置于25 ℃的環(huán)境中(黑暗48 h/光照12 h)培養(yǎng)60 h,在Zeiss LSM 700激光共聚焦顯微鏡下觀察綠色熒光蛋白信號(hào)分布。

1.2.5 酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)根據(jù)重組克隆試劑盒說(shuō)明書,構(gòu)建誘餌載體pGBKT7-VvIQD10/VvCML、獵物載體pGADT7-VvIQD10/VvCML。將重組載體質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)化Y2H Gold和Y187酵母菌株,30 ℃暗培養(yǎng)3~5 d,觀察菌落生長(zhǎng)狀況,檢測(cè)重組質(zhì)粒對(duì)酵母的毒性作用;觀察Y2H Gold[pGBKT7-VvIQD10/VvCML]在不同濃度(0、50、100、150和200 μL/mL)AbA的SD/-Trp固體培養(yǎng)基上的生長(zhǎng)狀況進(jìn)行誘餌載體的抗性篩選;將Y2H Gold[pGBKT7-VvIQD10/VvCML]涂布在SD/-Trp、SD/-Trp-Leu、SD/-Trp/X-α-gal、SD/-Trp/X-α-gal/AbA固體培養(yǎng)基上,Y187[pGADT7-VvIQD10/VvCML]涂布在SD/-Leu、SD/-Trp-Leu、SD/-Leu/X-α-gal、SD/-Leu/X-α-gal/AbA固體培養(yǎng)基上,觀察菌落生長(zhǎng)狀況以判斷重組質(zhì)粒是否具有轉(zhuǎn)錄自激活活性。在雙雜交實(shí)驗(yàn)中,將誘餌質(zhì)粒和獵物質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化進(jìn)Y2H Gold酵母菌株,涂布于SD/-Trp-Leu固體培養(yǎng)基,30 ℃暗培養(yǎng)3~5 d。待菌落長(zhǎng)出后,將共轉(zhuǎn)化成功的陽(yáng)性單菌落挑出,加入SD/-Trp-Leu液體培養(yǎng)基中,在30 ℃、200 r·min-1條件下振蕩培養(yǎng)12~15 h,稀釋至OD600為0.2時(shí)再依次稀釋5倍、50倍,取2 μL點(diǎn)到SD/-Trp-Leu-His-Ade、SD/-Trp-Leu-His-Ade/AbA/X-α-gal培養(yǎng)基上,30 ℃暗培養(yǎng)3~5 d,觀察菌落生長(zhǎng)情況。

1.2.6 雙分子熒光互補(bǔ)試驗(yàn)構(gòu)建雙分子熒光瞬時(shí)表達(dá)載體VvIQD10/VvCML-cEYFP和VvIQD10/VvCML-nEYFP。將構(gòu)建好的載體與空載兩兩組合瞬時(shí)侵染煙草表皮細(xì)胞,農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化、侵染方法及觀察同VvIQD10基因的亞細(xì)胞定位實(shí)驗(yàn)。

2 結(jié)果與分析

2.1 不同葡萄品種的VvIQD10基因PCR分析

以‘美人指’、‘金手指’、‘天山’、‘魏可’、‘紅環(huán)’和‘陽(yáng)光玫瑰’葡萄盛花期花序cDNA為模板,分別進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析。結(jié)果(圖2)顯示,VvIQD10基因在不同果形葡萄品種中均有表達(dá)。果形相對(duì)較長(zhǎng)的‘美人指’、‘金手指’、‘天山’和‘魏可’表達(dá)量較高,近圓形品種‘陽(yáng)光玫瑰’和‘紅環(huán)’的基因表達(dá)量明顯較低。

Sm.陽(yáng)光玫瑰;Rr.紅環(huán);Gf.金手指;Wi.魏可;Ti.天山;Mf.美人指。不同字母表示品種間差異顯著(P<0.05)圖2 不同葡萄品種中VvIQD10基因的表達(dá)Sm. Shine muscat; Rr. Red ring; Gf. Gold finger; Wi. Wink; Ti. Tianshan; Mf. Manicure finger. Different letters mean significant differences in different grape varieties at 0.05 levelFig.2 Expression of VvIQD10 gene in different grape varieties

2.2 葡萄VvIQD10、VvCML基因的克隆和VvIQD10基因序列分析

以‘天山’葡萄為材料,擴(kuò)增出VvCML,片段長(zhǎng)度為450 bp(圖3,A)。進(jìn)一步克隆出了VvIQD10(圖3,B),測(cè)序并通過(guò)DNAMAN 8.0軟件將得到的序列與預(yù)測(cè)序列(XM_010655617.1)進(jìn)行比對(duì),結(jié)果顯示CDS區(qū)序列長(zhǎng)度一致,長(zhǎng)度為1 401 bp。起始密碼子為ATG,終止密碼子為TAG(圖4)。與NCBI中相比,第354位、510位、799位、814位核苷酸發(fā)生突變,分別由CAT、AGT、ATC、GAA突變成AAT、GGT、GTC、CAA,前兩者編碼的氨基酸并沒(méi)有發(fā)生變化,而后兩者編碼的氨基酸分別由異亮氨酸、谷氨酸轉(zhuǎn)變成纈氨酸和谷氨酰胺(圖4)。

M.DL2000;1. VvIQD10;2-4. VvCML 圖3 VvCML基因和VvIQD10基因克隆結(jié)果Fig.3 The result of VvCML and VvIQD10 gene cloning

ATG. 起始密碼子;TAG. 終止密碼子;方框內(nèi)為突變位點(diǎn)圖4 VvIQD10基因的核苷酸序列及其編碼的氨基酸序列ATG. Start codon;TAG. Stop codon;The mutation sites are in the boxFig.4 Nucleotide sequence and amino acid sequence of VvIQD10 gene

2.3 葡萄VvIQD10蛋白分析

VvIQD10基因編碼蛋白質(zhì)由466個(gè)氨基酸組成,其中酸性氨基酸有56個(gè),堿性氨基酸有85個(gè)。預(yù)測(cè)編碼產(chǎn)物分子量為52.94 kD,等電點(diǎn)為10.64,不穩(wěn)定系數(shù)為80.25,為不穩(wěn)定親水性蛋白。SignalP 4.0預(yù)測(cè)結(jié)果顯示該蛋白無(wú)信號(hào)肽。用TMHMM Server V. 2.0在線軟件對(duì)跨膜結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)該蛋白不具有跨膜區(qū)域。Pfam數(shù)據(jù)庫(kù)分析顯示,VvIQD10蛋白第136~154、160~174氨基酸位點(diǎn)為IQ基序,第354~428位點(diǎn)為未知功能的DUF4005結(jié)構(gòu)域,第381~426位點(diǎn)和第236~326位點(diǎn)分別為具有類IQ基序的融合蛋白IQCJ-SCHIP1 和NADH泛醌氧化還原酶亞單位NDUFA12。結(jié)合相關(guān)文獻(xiàn)[3,8]查找分析相關(guān)基序,發(fā)現(xiàn)其具有包含2個(gè)IQ基序、3個(gè)1-5-10基序以及2個(gè)1-8-14基序的IQ67結(jié)構(gòu)域(圖6)。二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示VvIQD10蛋白由46.78%的α螺旋,50.21%的隨機(jī)卷曲,2.58%的β折疊和0.43%的β轉(zhuǎn)角組成。三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)顯示該蛋白由一個(gè)PDB號(hào)為2dfs.1.A的結(jié)構(gòu)為模板建立,序列的相似性為0.3,范圍為134~194 aa,在IQ67結(jié)構(gòu)域所包含的區(qū)域內(nèi)。

圖5 葡萄和其他物種IQD蛋白的氨基酸序列系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Fig.5 Phylogenetic tree of amino acid sequences of IQD protein in grape and other species

圖6 VvIQD10基因中IQ67基序分析Fig.6 Analysis of IQ67 motif in VvIQD10 gene

用MEGA 10.0制作進(jìn)化樹(shù),將VvIQD10蛋白和其他物種的IQD蛋白進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)該蛋白與獼猴桃同源蛋白的親緣關(guān)系最近,和擬南芥、豌豆及甜橙等植物的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)(圖5)。ClustalX比對(duì)分析后得出VvIQD10編碼的氨基酸序列與多種植物的相似度在43.29%~62.34%之間,IQ67結(jié)構(gòu)域在不同物種間較為保守(圖7)。

XP_030962527.1. 大葉櫟;XP_004229688.1. 番茄;XP_035545843.1. 胡桃;XP_017984100.1. 可可;XP_008231519.1. 梅;PSS09955.1. 獼猴桃;NP_196850.1. 擬南芥;KDO83249.1. 甜橙;KAF3653480.1. 甜椒;XP_029125524.1. 木豆;XP_016482094.1. 煙草;XP_015881920.1. 棗;黑色方框內(nèi)為IQ67結(jié)構(gòu)域圖7 葡萄VvIQD10蛋白和其他物種IQD蛋白的氨基酸序列比對(duì)XP_030962527.1. Quercus lobata; XP_004229688.1. Solanum lycopersicum; XP_035545843.1. Juglans regia; XP_017984100.1. Theobroma cacao; XP_008231519.1. Prunus mume; PSS09955.1. Actinidia chinensis var. chinensis; NP_196850.1. Arabidopsis thaliana; KDO83249.1. Citrus sinensis; KAF3653480.1. Capsicum annuum; XP_029125524.1. Cajanus cajan;XP_016482094.1. Nicotiana tabacum; XP_015881920.1. Ziziphus jujuba; In the box is the IQ67 domainFig.7 Amino acid sequence alignment of grape VvIQD10 protein and other IQD proteins

Bar = 35 μm,下同圖8 VvIQD10蛋白在煙草葉片表皮細(xì)胞中的亞細(xì)胞定位Bar = 35 μm, the same as belowFig.8 Subcellular localization of VvIQD10 protein in tobacco leaf cells

2.4 VvIQD10蛋白亞細(xì)胞定位

為研究VvIQD10蛋白在細(xì)胞中的分布情況,在煙草表皮細(xì)胞中進(jìn)行亞細(xì)胞定位實(shí)驗(yàn)。構(gòu)建表達(dá)載體pCAMBIA 1302-GFP-VvIQD10,瞬時(shí)轉(zhuǎn)化煙草。結(jié)果表明,VvIQD10蛋白在煙草表皮細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞膜中都有分布,在細(xì)胞中可見(jiàn)微管清晰的絲狀結(jié)構(gòu)。而在以pCAMBIA 1302空載體轉(zhuǎn)化的對(duì)照組中,綠色熒光蛋白在細(xì)胞的各個(gè)部位都有分布(圖8)。由此可初步判定,VvIQD10蛋白主要定位于微管和質(zhì)膜。

2.5 VvIQD10和VvCML蛋白互作驗(yàn)證

為驗(yàn)證VvIQD10基因在植物細(xì)胞中所起的作用,構(gòu)建了誘餌載體pGBKT7-VvIQD10/VvCML、獵物載體pGADT7-VvIQD10/VvCML。將重組載體質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)化酵母菌株后進(jìn)行重組質(zhì)粒的毒性檢測(cè)和自激活檢測(cè),證明重組誘餌質(zhì)粒和獵物質(zhì)粒均對(duì)酵母沒(méi)有毒性作用,且pGADT7-VvIQD10、pGADT7-VvCML不具有轉(zhuǎn)錄激活活性;為抑制誘餌載體酵母生長(zhǎng),通過(guò)抗性篩選后選擇150 μL/mL AbA濃度為抑制誘餌載體pGBKT7-VvCML酵母生長(zhǎng)最佳濃度,200 μL/mL AbA濃度為抑制誘餌載體pGBKT7-VvIQD10酵母生長(zhǎng)最佳濃度。雙雜交實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,誘餌載體和獵物載體共轉(zhuǎn)化的Y2H Gold酵母菌株能在SD/-Trp-Leu培養(yǎng)基上長(zhǎng)出白色單菌落;Y2H Gold [pGADT7-VvIQD10+pGBKT7-VvCML]、Y2H Gold [pGADT7-VvCML+pGBKT7-VvIQD10]和陽(yáng)性對(duì)照在SD/-Leu/-Trp/-Ade/-His、SD/-Leu/-Trp/-Ade/-His/X-a-gal/AbA培養(yǎng)基上能夠生長(zhǎng),且在SD/-Leu/-Trp/-Ade/-His/X-a-gal/AbA培養(yǎng)基上長(zhǎng)出藍(lán)色單菌落,而陰性對(duì)照在這兩種培養(yǎng)基上不能夠生長(zhǎng)。說(shuō)明蛋白VvIQD10與蛋白VvCML之間存在互作(圖9)。

2.6 雙分子熒光互補(bǔ)試驗(yàn)

為驗(yàn)證酵母雙雜交的蛋白質(zhì)互作結(jié)果,構(gòu)建重組載體VvIQD10/VvCML-cEYFP和VvIQD10/VvCML-nEYFP以進(jìn)行雙分子熒光互補(bǔ)試驗(yàn)。將重組載體和空載體兩兩組合共轉(zhuǎn)化煙草表皮細(xì)胞,利用共聚焦顯微鏡觀察黃色熒光蛋白(yellow fluorescent protein, YFP)熒光圖像,分別在光、明場(chǎng)和融合場(chǎng)中拍攝黃色熒光部位(圖10)。結(jié)果表明,VvIQD10和VvCML蛋白間存在互作,此結(jié)果與酵母雙雜交結(jié)果一致。并且,VvIQD10蛋白和VvCML蛋白主要在微管和質(zhì)膜中互作,這和VvIQD10基因的亞細(xì)胞定位結(jié)果相吻合。

圖10 煙草表皮細(xì)胞中VvCML蛋白與VvIQD10蛋白相互作用的BiFC分析Fig.10 BiFC analysis of the interactions among VvCML protein and VvIQD10 in tobacco epidermal cells

3 討 論

本試驗(yàn)選取和葡萄VvSUN基因以及番茄SUN基因相似性較高的基因VvIQD10,通過(guò)比較6個(gè)不同葡萄果形品種VvIQD10基因的表達(dá)量推測(cè)該基因可能和葡萄果形相關(guān),并在橢圓形葡萄品種‘天山’中克隆出該序列。與NCBI中預(yù)測(cè)基因相比,克隆出的VvIQD10基因發(fā)生了點(diǎn)突變,但突變位點(diǎn)不在功能結(jié)構(gòu)域內(nèi),這可能是由于測(cè)序品種和試驗(yàn)品種不同造成的。通過(guò)分析VvIQD10蛋白的理化特性,發(fā)現(xiàn)其具有較高等電點(diǎn),這和IQD家族蛋白的性質(zhì)相吻合,其具有較高等電點(diǎn)可能是IQD蛋白與微管和質(zhì)膜通過(guò)靜電相互作用所必須具備的條件[29]。對(duì)VvIQD10蛋白的功能域IQ67結(jié)構(gòu)域分析發(fā)現(xiàn),其所含的基序種類和數(shù)目與VvSUN相同[3],但基序所包含的部分氨基酸種類發(fā)生了變化,這一變化可能影響蛋白的表達(dá)途徑和作用強(qiáng)度。多序列比對(duì)和系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析結(jié)果顯示,在葡萄、獼猴桃、煙草、番茄、甜椒、擬南芥、可可、梅、棗、胡桃和甜橙等十多種植物中,VvIQD10基因與獼猴桃同源基因親緣關(guān)系最近,并且在13種植物中具有相似的保守結(jié)構(gòu)域,說(shuō)明IQD基因功能是相對(duì)保守的。

農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)化煙草細(xì)胞瞬時(shí)表達(dá)結(jié)果顯示,VvIQD10蛋白同時(shí)定位于微管(MT)和質(zhì)膜(PM),說(shuō)明此基因編碼的產(chǎn)物不僅在MT上有功能,而且在PM上起作用。前人研究表明,IQD蛋白是植物中PM子結(jié)構(gòu)域的組成部分,它們可能將CaM/CML介導(dǎo)的Ca2+信號(hào)局部限制在PM中的特定位置,并在空間上將功能不同的CaM/CML信號(hào)模塊分開(kāi)[29]。

為進(jìn)一步驗(yàn)證VvIQD10蛋白在微管和質(zhì)膜上的作用,對(duì)其進(jìn)行蛋白質(zhì)互作實(shí)驗(yàn)。酵母雙雜交和雙分子熒光互補(bǔ)試驗(yàn)表明,VvIQD10蛋白可以和細(xì)胞骨架組織相關(guān)蛋白VvCML在微管和質(zhì)膜中發(fā)生互作。IQD蛋白可能通過(guò)S-?;饔酶街赑M上,將IQD-CaM/CML復(fù)合物錨定在Ca2+通道入口處來(lái)激活通道。通道被激活后,在通道入口處附近產(chǎn)生陡峭的游離Ca2+濃度梯度,引起Ca2+傳感器蛋白(CaM/CML)的激活。相關(guān)研究推測(cè),與被激活的IQD信號(hào)復(fù)合物相結(jié)合的蛋白可能是驅(qū)動(dòng)蛋白輕鏈相關(guān)(kinesin light chain-related, KLCR)/纖維素-微管解偶聯(lián)(cellulose-microtubule uncoupling, CMU)蛋白家族的成員[7, 41-42]。KLCR / CMU可以在MT和PM的連接處通過(guò)抵抗MT對(duì)纖維素合酶復(fù)合物(CSCs)的推動(dòng)力來(lái)增加MT的穩(wěn)定性[43],并可能間接影響纖維素沉積。

由此可以推出,葡萄VvIQD10蛋白在特定的PM子結(jié)構(gòu)域中和鈣調(diào)蛋白類蛋白(CML)結(jié)合,形成VvIQD10-VvCML復(fù)合物,激活Ca2+通道后形成的Ca2+濃度梯度使VvCML被激活。隨后,VvIQD10-VvCML復(fù)合物與微管結(jié)合蛋白結(jié)合(KLCR/CMU),來(lái)參與對(duì)細(xì)胞骨架組織的控制,從而改變微管分支和細(xì)胞骨架結(jié)構(gòu),指導(dǎo)細(xì)胞的伸長(zhǎng)和擴(kuò)張,最終使植物器官形狀發(fā)生變化。根據(jù)前人對(duì)葡萄VvSUN基因超表達(dá)促進(jìn)番茄果形變長(zhǎng)的研究[32],再根據(jù)本試驗(yàn)中對(duì)與VvSUN基因同一家族中同源性較高的VvIQD10基因功能的研究結(jié)果,推測(cè)VvIQD10可能也在葡萄果實(shí)形狀變化中起著至關(guān)重要的作用,但具體功能還需進(jìn)行超表達(dá)和基因沉默來(lái)進(jìn)一步驗(yàn)證。

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