陳 林,曹振強(qiáng),梁肇均,何曉明,王 敏,劉文睿,彭慶務(wù),林毓娥
(廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所/廣東省蔬菜新技術(shù)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東 廣州 510640)
【研究意義】黃瓜(Cucumis sativusL.)屬于葫蘆科黃瓜屬蔬菜,是世界上重要蔬菜之一。我國是黃瓜主要生產(chǎn)國,種植規(guī)模和產(chǎn)量都位居世界第一。據(jù)聯(lián)合國糧食及農(nóng)業(yè)組織(FAO)統(tǒng)計(jì),2019 年我國黃瓜總產(chǎn)量達(dá)7 034 萬t,占世界總產(chǎn)量的70%以上。黃瓜根據(jù)地理分布區(qū)域和生態(tài)學(xué)特性,一般可分為華北型黃瓜、華南型黃瓜、歐洲溫室型黃瓜、歐洲露地型黃瓜、野生型黃瓜以及加工型黃瓜等6 個(gè)生態(tài)類型[1-2]。在黃瓜長期育種過程中,黃瓜種質(zhì)資源的擴(kuò)展以及遺傳多樣性的研究一直是改善其品種的重要基礎(chǔ)[3-4]。廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所自20 世紀(jì)60 年代起就開展黃瓜種質(zhì)資源收集、鑒定、保存和利用工作,至今已有50 多年,對本課題組收集的黃瓜種質(zhì)資源開展深度資源評價(jià)顯得尤為重要?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】黃瓜種質(zhì)資源關(guān)于農(nóng)藝性狀遺傳多樣性的研究報(bào)道較多。于婭等[5]對43 份黃瓜種質(zhì)資源的葉片、果實(shí)、風(fēng)味、產(chǎn)量等性狀進(jìn)行評價(jià),分析得出12 份豐產(chǎn)類型的黃瓜種質(zhì)資源、6 份風(fēng)味較好的黃瓜種質(zhì)資源、5 份可溶性糖較高的黃瓜種質(zhì)資源、6 份維生素C 含量較高的黃瓜種質(zhì)資源,為黃瓜多樣化育種的親本篩選提供參考依據(jù)。李錫香[6]基于對黃瓜種質(zhì)34 個(gè)形態(tài)性狀的數(shù)據(jù)聚類分析鑒定,將70 份種質(zhì)分為五大類群,聚類結(jié)果較好地反映了黃瓜種質(zhì)間的形態(tài)相似性及其與地理區(qū)域之間的關(guān)系。史建磊等[7]以69份華南型黃瓜為材料發(fā)現(xiàn),24 個(gè)農(nóng)藝性狀的變異系數(shù)在6.19%~73.89%之間,進(jìn)一步系統(tǒng)聚類分為4 大類群,為華南型黃瓜優(yōu)異資源的挖掘提供了一定價(jià)值。種質(zhì)資源遺傳多樣性分析中普遍運(yùn)用的分析方法包括相關(guān)性、主成分、聚類分析等。目前這些方法在水稻[8]、棉花[9]、綠豆[10]、梨[11]、番茄[12]、茶[13]、兜蘭[14]、花生[15]等植物種質(zhì)資源中均有廣泛利用。于婭等[16]通過對43 份黃瓜種質(zhì)資源農(nóng)藝性狀的遺傳多樣性進(jìn)行主成分和聚類分析,結(jié)果表明12 個(gè)性狀可以劃分為4 個(gè)主要成分,包括果實(shí)因子、葉片因子、顏色因子、產(chǎn)量因子;聚類分析將43 份種質(zhì)資源劃分為3 個(gè)類群,分別為歐洲溫室型黃瓜、華北型黃瓜、華南型黃瓜?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】根據(jù)廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所前期種質(zhì)資源收集的工作,加強(qiáng)種質(zhì)資源利用、開展種質(zhì)資源評價(jià)將會對黃瓜育種工作有直接推動作用。【擬解決的關(guān)鍵問題】對本課題組收集到的197 份黃瓜種質(zhì)資源的10 個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行調(diào)查,再結(jié)合主成分分析和聚類分析方法研究遺傳多樣性,明確本團(tuán)隊(duì)收集的黃瓜種質(zhì)資源變異豐富程度,為黃瓜育種提供一定參考和理論依據(jù)。
試驗(yàn)材料為197 份從全國各地收集的黃瓜種質(zhì)資源。試驗(yàn)在廣州市國家農(nóng)業(yè)科技園區(qū)廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所基地進(jìn)行。
2018年9月4日育苗、9月11日調(diào)查幼苗性狀、9 月12 日移栽,設(shè)3 個(gè)重復(fù),每個(gè)重復(fù)定植30 株。種植管理按常規(guī)田間栽培管理。調(diào)查197 份黃瓜種質(zhì)資源的10 個(gè)性狀,每個(gè)重復(fù)調(diào)查10 株,包括下胚軸長、子葉長、子葉寬、葉片長、葉片寬、葉柄長、主蔓粗、葉色、第一分支節(jié)位和第一雌花節(jié)位。數(shù)據(jù)采集、測量的方法和標(biāo)準(zhǔn)參照《黃瓜種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)》。其中,下胚軸長、子葉長、子葉寬在直播7 d 后調(diào)查;葉片長、葉片寬、葉柄長、主蔓粗、葉色在結(jié)果盛期調(diào)查,選取植株主蔓中部最大葉片測量葉片長、葉片寬、葉柄長;葉色采用目測方法,賦值分為4 級(淺綠=l、黃綠=2、綠=3、深綠=4)。
本研究調(diào)查的黃瓜農(nóng)藝性狀數(shù)據(jù)采用Excel進(jìn)行原始數(shù)據(jù)整理,分析性狀的平均值、最小值、最大值、極差、標(biāo)準(zhǔn)差和變異系數(shù)。利用SPSS 22.0 軟件進(jìn)行10 個(gè)性狀之間的相關(guān)性和主成分分析,同時(shí)采用離差平方和法(Ward’ s method)對種質(zhì)資源性狀進(jìn)行聚類分析。
由表1 可知,197 份黃瓜資源的變異幅度較大,介于10.03%~48.35%之間,平均變異系數(shù)為22.59%,其中變異幅度最大的是第一雌花節(jié)位,表明第一雌花節(jié)位的遺傳多樣性較豐富,變異幅度最小的是子葉寬。
表1 黃瓜種質(zhì)資源10 個(gè)農(nóng)藝性狀的多樣性分析Table 1 Diversity analysis of 10 agronomic traits in cucumber germplasm resources
在子葉性狀中,下胚軸長、子葉長、子葉寬的平均值分別為7.21、3.71、2.15 cm,其中變異系數(shù)最大的是下胚軸長、為24.30%,子葉長和子葉寬的變異系數(shù)分別為11.04%和10.03%。下胚軸長最長為PE161(11.63 cm),最短為PE130(3.61 cm);子葉長最長為PE52(4.87 cm),最短為PE184(2.77 cm);子葉寬最大為PE131(3.50 cm),最小為PE184 和PE198(1.49 cm)。
在葉片性狀中,葉長、葉寬、葉柄長和葉色分別為17.53 cm、20.87 cm、17.18 cm 和2.77,其中變異系數(shù)最大為葉色(34.18%),葉長、葉寬和葉柄長的變異系數(shù)分別為12.06%、11.24%和22.11%。葉片顏色表現(xiàn)深綠的材料有35 份,表現(xiàn)淺綠的材料35 份;葉片最長為PE59(22.91 cm),最短為PE54(8.01 cm);葉片最寬為PE156(26.76 cm),最短為PE54(9.37);葉柄最長為PE119(27.48 cm),最小為PE64(5.63 cm)。
在枝條性狀中,主蔓粗、第一雌花節(jié)位和第一分支節(jié)位的平均值分別為5.55 cm、15.41和3.30,變異系數(shù)最大的是第一雌花節(jié)位(48.35%),主蔓粗和第一分支節(jié)位的變異系數(shù)分別為11.74%和40.84%。主蔓粗最粗為PE144(7.68 mm),最細(xì)為PE135(4.07 mm);第一雌花節(jié)位最高為PE55,最低為PE40;第一分支節(jié)位最高為PE112,最低有17 份,為PE63、PE64、PE81、PE83、PE85、PE86、PE87、PE89、PE91、PE93、PE99、PE105、PE108、PE116、PE177、PE183 和PE184。
對197 份黃瓜種質(zhì)資源的10 個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行相關(guān)性分析,結(jié)果(表2)顯示,呈極顯著相關(guān)的性狀有20 對,其中正相關(guān)17 對、負(fù)相關(guān)3 對;呈顯著相關(guān)的性狀有5 對,其中正相關(guān)3 對、負(fù)相關(guān)2 對。下胚軸長、子葉長和子葉寬間兩兩呈極顯著相關(guān),葉長、葉寬和葉柄長兩兩呈極顯著相關(guān)。第一雌花節(jié)位與葉長、葉寬、葉柄長、主蔓粗呈顯著或極顯著負(fù)相關(guān)。第一分支節(jié)位與葉長、葉寬、葉柄長、主蔓粗呈顯著或極顯著相關(guān)。葉色只與葉柄長呈顯著相關(guān)。
表2 黃瓜種質(zhì)資源農(nóng)藝性狀的相關(guān)性分析Table 2 Correlation analysis of agronomic traits in cucumber germplasm resources
對197 份黃瓜種質(zhì)資源的10 個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行主成分分析,結(jié)果見表3。從表3 可以看出,以特征值大于1 為標(biāo)準(zhǔn)提取主成分,前3 個(gè)主成分累計(jì)貢獻(xiàn)率為63.17%。其中,第1 主成分的特征值為3.19、貢獻(xiàn)率為31.91%,主要反映葉片長寬、主蔓粗、第一分支節(jié)位的影響;第2 主成分的特征值為2.03、貢獻(xiàn)率為20.30%,主要反映幼苗期下胚軸和子葉的影響;第3 主成分的特征值為1.10、貢獻(xiàn)率為10.97%,主要反映第一雌花節(jié)位和葉色的影響(表3、表4)。
表3 主成分方差因子的貢獻(xiàn)率Table 3 Contribution rate of principal component variance factors
表4 黃瓜種質(zhì)資源農(nóng)藝性狀的主成分分析Table 4 Principal component analysis of agronomic traits in cucumber germplasm resources
利用第1 主成分和第2 主成分做成散點(diǎn)圖(圖1),結(jié)果展示了不同性狀之間的關(guān)系。10 個(gè)農(nóng)藝性狀可以較明顯地區(qū)分成3 類:第1 類為葉片長、葉片寬、葉柄長、主蔓粗以及第一分支節(jié)位;第2類為子葉長、子葉寬和下胚軸長;第3 類為第一雌花節(jié)位和葉色。以上分析結(jié)果與10 個(gè)性狀相關(guān)性分析結(jié)果基本一致,說明性狀間存在明顯相關(guān)性。
圖1 黃瓜種質(zhì)資源農(nóng)藝性狀主成分二維坐標(biāo)散點(diǎn)圖Fig.1 Two-dimension coordinate scatter diagram for principal components of agronomic traits in cucumber germplasm resources
黃瓜種質(zhì)資源的聚類分析如圖2 所示,在歐式距離為10 時(shí),可以將197 份黃瓜種質(zhì)資源分為4 大類群,不同類群之間存在一定差異。第Ⅰ類群包括67 份種質(zhì)材料,占總種質(zhì)資源的34.01%,主要特征是下胚軸較長,平均下胚軸長為7.46 cm;第Ⅱ類群包括47 份材料,占總種質(zhì)資源的23.86%,主要特征是葉片較大及主蔓較粗,平均葉片長19.49 cm、葉片寬 22.99 cm、葉柄長20.74 cm、莖粗6.03 cm;第Ⅲ類群包括33份種質(zhì)資源材料,占總種質(zhì)資源的16.75%,主要特征是子葉較大(平均子葉長3.86 cm、子葉寬2.25 cm)以及第一雌花節(jié)位較低(平均9.69);第Ⅳ類群包括50 份種質(zhì)資源材料,占總種質(zhì)資源的25.38%,主要特征是子葉和葉片較小,平均子葉長為3.59cm、子葉寬為2.04 cm,平均葉片長15.60 cm、葉片寬18.79 cm(表5)。
表5 黃瓜種質(zhì)資源不同類群農(nóng)藝性狀的平均值和變異系數(shù)Table 5 Mean value and coefficient of variation of agronomic traits in different groups of cucumber germplasm resources
圖2 黃瓜種質(zhì)資源的聚類分析Fig.2 Cluster dendrogram based on traits of cucumber germplasm resources
種質(zhì)資源是育種的關(guān)鍵基礎(chǔ),充分了解種質(zhì)資源的遺傳多樣性、研究種質(zhì)資源的遺傳變異和背景,可以為植物新品種的選育提供參考。本研究對197 份黃瓜種質(zhì)資源的10 個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行了調(diào)查分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)10 個(gè)農(nóng)藝性狀中變異系數(shù)最大達(dá)10.03%、最小為48.35%,平均22.59%,說明197 份種質(zhì)資源的農(nóng)藝性狀差異明顯,遺傳多樣性較豐富。本研究中黃瓜子葉長、子葉寬、葉長、葉寬的變異系數(shù)在10.03%~12.06%之間,變異系數(shù)較小,表明黃瓜葉片和子葉的性狀能夠穩(wěn)定遺傳,這與于婭等[5]研究結(jié)果基本一致。第一雌花節(jié)位和第一分支節(jié)位變異系數(shù)較大(均>30%),均具有較大的選擇潛力,這些數(shù)據(jù)對早熟品種的選育有較好的參考依據(jù)。
通過對197 份黃瓜種質(zhì)資源10 個(gè)主要農(nóng)藝性狀的相關(guān)性分析,發(fā)現(xiàn)各農(nóng)藝性狀至少與一個(gè)農(nóng)藝性狀呈顯著或極顯著相關(guān)。下胚軸長、子葉長和子葉寬兩兩呈極顯著相關(guān),表明可以通過下胚軸的長短初步判斷子葉的長寬。葉片長、葉片寬和葉柄長兩兩呈極顯著相關(guān),這與于婭等[16]研究結(jié)果一致。
主成分分析是考察多個(gè)變量間相關(guān)性的一種多元統(tǒng)計(jì)方法,在種質(zhì)資源評價(jià)和鑒定中可以將絕大部分信息進(jìn)行簡化。近年來,運(yùn)用主成分分析方法開展種質(zhì)資源評價(jià)已在番茄[17]、茶[13]、花生[15]上已有大量報(bào)道。本研究對197 份黃瓜種質(zhì)資源10 個(gè)農(nóng)藝性狀的主成分分析結(jié)果表明,前3 個(gè)主成分的累積貢獻(xiàn)率為63.17%,能夠代表10 個(gè)性狀指標(biāo)63.17%的原始信息,分別為葉片大小因子、幼苗期因子、早熟因子。第1 主分成主要反映葉片長寬、主蔓粗、第一分支節(jié)位的影響;第2 主成分主要反映幼苗期下胚軸和子葉的影響;第3 主成分反映第一雌花節(jié)位和葉色的影響。因而,在黃瓜育種工作中,可以根據(jù)育種目標(biāo)由主成分分析的因子排序,全面評價(jià)各個(gè)種質(zhì)資源的優(yōu)劣,從而為黃瓜育種服務(wù)。
聚類分析可分析不同目標(biāo)性狀以及不同種質(zhì)資源之間的關(guān)系,了解種質(zhì)資源的親緣性,為育種方案的設(shè)定提供一定的理論依據(jù)[18]。近年來,不少研究者提出采用聚類分析對不同目標(biāo)性狀進(jìn)行相對應(yīng)的親本選擇,如李[19]、番茄[20]、綠豆[10]、辣椒[21]等作物上已有應(yīng)用。本研究對197 份黃瓜種質(zhì)資源的10 個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行聚類分析,得到4 個(gè)類群,初步明確各個(gè)類群之間的特征,其中第Ⅰ類群的種質(zhì)資源可用于篩選下胚軸長的品種,第Ⅱ類群可用于選育葉片較大的品種,第Ⅲ類群可用于選育子葉較大的品種,第Ⅳ類群可用于選育子葉和葉片較小的品種。
由于種質(zhì)資源農(nóng)藝性狀的農(nóng)藝調(diào)查和鑒定比較容易受到環(huán)境因素的影響,特別是光照、溫度、濕度等對調(diào)查結(jié)果影響較大,因此后續(xù)對種質(zhì)資源的評價(jià)還應(yīng)結(jié)合DNA 分子鑒定的方法以及多年多點(diǎn)的研究方法,這樣對種質(zhì)資源的鑒定評價(jià)才會更加全面和系統(tǒng)。
本研究對本課題組收集的197 份黃瓜種質(zhì)資源的農(nóng)藝性狀進(jìn)行了多樣性、相關(guān)性、主成分和聚類分析,多樣性及相關(guān)性結(jié)果表明這197 份種質(zhì)資源具有豐富的遺傳多樣性,且各農(nóng)藝性狀之間存在不同的相關(guān)性。主成分分析結(jié)果表明前3個(gè)主成分的累計(jì)貢獻(xiàn)率為63.17%,能夠代表10個(gè)性狀指標(biāo)63.17%的原始信息,分別是葉片大小因子、幼苗期因子、早熟因子。聚類分析結(jié)果顯示將197 份黃瓜種質(zhì)資源分為4 大類群,各個(gè)類群差異主要表現(xiàn)在下胚軸長短、葉片大小、子葉大小等特征上。本研究為黃瓜育種親本的選配和性狀改良奠定了一定的研究基礎(chǔ)。