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不同樹種林下套種金花茶土壤微生物多樣性分析

2021-05-14 02:18伍思宇李寶財(cái)李紀(jì)元廖健明韋曉娟傅鏡遠(yuǎn)李開祥
廣西林業(yè)科學(xué) 2021年2期
關(guān)鍵詞:金花菌門套種

伍思宇,李寶財(cái),李紀(jì)元,廖健明,韋曉娟,傅鏡遠(yuǎn),李開祥

(1.廣西壯族自治區(qū)林業(yè)科學(xué)研究院 廣西特色經(jīng)濟(jì)林培育與利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣西南寧530002;2.中國林業(yè)科學(xué)研究院亞熱帶林業(yè)研究所,浙江杭州 311400;3.合浦佳永金花茶開發(fā)有限公司,廣西合浦 536100)

金花茶(Camellia nitidissima)屬小喬木或常綠灌木,高度為2 ~6 m[1],主要分布在中國廣西南部和越南北部[2],原始生境的伴生植物主要有白櫟(Quer?cus fabri)、水冬哥(Saurauia tristyla)和白顏樹(Giron?niera subaequalis)等[3]。金花茶是山茶屬稀有的黃色種質(zhì)資源,含有豐富的黃酮類、多糖和茶多酚等化學(xué)活性成分以及鍺(Ge)和砷(Se)等微量元素[4-5],具有極高的觀賞和科研價(jià)值[6]。

土壤微生物是森林生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分,在養(yǎng)分轉(zhuǎn)化和循環(huán)上發(fā)揮重要的作用[7],其多樣性受林分、枯落物和土壤因子等因素共同影響[8-10]。Waid[11]指出植被類型和數(shù)量不同,林下凋落物及根系分泌物也不同,使土壤微生物發(fā)生變化。宋賢沖等[12]研究表明,土壤有機(jī)質(zhì)、全磷(P)和全鉀(K)含量等土壤理化性質(zhì)可能是造成不同季節(jié)常綠闊葉林土壤微生物群落功能多樣性差異的主要原因。

林下套種是通過空間將目標(biāo)樹種與其他植物組合在一起的栽培模式,不僅能充分利用林地空間,增加森林單產(chǎn),還能促進(jìn)養(yǎng)分循環(huán),提高土壤肥力和土壤微生物數(shù)量[13]。吉艷芝等[14]研究表明與落葉松(Larix gmelinii)純林相比,落葉松混交林的土壤養(yǎng)分、微生物多樣性和酶活性均得到了顯著提高。由于金花茶耐陰的特性[3],研究人員采取林下套種金花茶的栽培模式,研究金花茶的生長和光合特性[15-16],但鮮少關(guān)注林下的土壤特性。本研究對不同樹種林下套種金花茶的土壤微生物多樣性進(jìn)行研究,探討土壤微生物群落結(jié)構(gòu)的差異,以及枯落物和土壤理化性質(zhì)對土壤微生物多樣性的影響,以期為林下套種金花茶選擇適宜的上層樹種提供理論依據(jù)和指導(dǎo)。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)地概況

試驗(yàn)地位于廣西合浦縣佳永金花茶開發(fā)有限公司龍門江基地(109°21'E,21°67'N),海拔12 m,屬亞熱帶海洋季節(jié)性氣候,年均氣溫22.4 ℃,年均降水量1 667 mm,年均相對濕度75% ~86%。選擇造林時(shí)間相近的3 種樹種套種金花茶,對枯落物和土壤進(jìn)行調(diào)查研究。3 種樹種分別為印度紫檀(Ptero?carpus indicus)、荔 枝(Litchi chinensis)和 濕 地 松(Pinus elliottii)(表1)。印度紫檀為高大落葉喬木[17],林下透光度在春季、夏季、秋季和冬季分別為20%、12.5%、44.8%和100%;荔枝為常綠喬木[18],林下透光度常年為5%左右;濕地松為常綠針葉喬木[19],林下透光度常年為60%左右。

表1 不同套種模式基本概況Tab.1 General situation of different interplanting models

1.2 樣品采集

2018年12月—2019年12月,每3 個(gè)月采集1次枯落物。收集面積為1 m2的枯枝落葉,風(fēng)干后稱重,用于測定枯落物蓄積量,另取部分枯枝落葉樣品帶回室內(nèi)測定養(yǎng)分。

2019年6月采集土壤,測定土壤理化性質(zhì)和微生物。在3 種樹種的林地分別隨機(jī)選取3 個(gè)采樣點(diǎn),清除表層雜質(zhì)后,用環(huán)刀取出深度為0 ~10 cm的土壤,用于土壤物理性質(zhì)分析。于平行斷面下鏟取土樣,剔除石礫和植物殘根等雜物后,將采集的土壤分別混合均勻,采用四分法,將一部分裝入15 mL 無菌離心管中冷藏,用于土壤微生物分析;另一部分置于自封袋中,用于土壤化學(xué)性質(zhì)分析。

1.3 樣品測定和數(shù)據(jù)分析

用稱重法測枯落物蓄積量[20];凱氏定氮法測全氮(N)含量,鉬銻抗比色法測全P 含量,火焰原子分光光度法測全K 含量[21]。用烘干法測土壤含水量,環(huán)刀法測土壤容重和土壤孔隙度[22];用電位法測土壤pH 值;用重鉻酸鉀-硫酸消化法測土壤有機(jī)質(zhì)含量,用凱氏定氮法測土壤全N含量,用鉬銻抗比色法測土壤全P 含量,用酸溶-火焰光度法法測土壤全K含量[23]。采用Excel和SPSS 19.0軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理。

用Illumina-MiSeq 高通量測序技術(shù)(上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司)進(jìn)行土壤微生物群落基因組測序。采用E.Z.N.A.?soil DNA Kit 提取試劑盒(Omega Bio-Tek,Norcross,GA,U.S.)提取土壤總DNA。細(xì)菌V3 ~V4可變區(qū)采用338F(5’-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3’)和806R(5’-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3’)引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,真菌18S rDNA 的V5 ~V7區(qū)采用SSU0817F(5’-TTAGCATGGAATAATRRAATAGGA-3’)和1196R(5’-TCTGGACCTGGTGAGTTTCC-3’)引物進(jìn)行擴(kuò)增。將PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測,使用AxyPrepDNA 凝膠回收試劑盒(AXYGEN 公司)切膠回收PCR 產(chǎn)物,Tris-HCl 洗脫,1%瓊脂糖電泳檢測。再將PCR 回收產(chǎn)物用QuantiFluor?-ST 藍(lán)色熒光定量系統(tǒng)(Promega公司)進(jìn)行檢測定量,之后按照測序量,進(jìn)行相應(yīng)比例的混合。先連接“Y”字形連接器,再用磁珠過濾,自連接片段,然后通過PCR 擴(kuò)增文庫模板,對NaOH變性,產(chǎn)生單鏈DNA片段。利用測序公司MiseqPE300平臺(tái)進(jìn)行測序(上海美吉生物制藥有限公司)。將原始數(shù)據(jù)上傳至NCBI數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,并在美吉I-Sanger 云數(shù)據(jù)分析平臺(tái)上進(jìn)行在線數(shù)據(jù)分析(www.majorbio.com)。

2 結(jié)果與分析

2.1 不同套種模式枯落物蓄積量和養(yǎng)分分析

枯落物累計(jì)年限相近時(shí),不同林分枯落物蓄積量主要與枯落物的輸入量和分解速率有關(guān)[20]。3 種套種處理的枯落物單位面積蓄積量均呈先減少后增加的趨勢,說明枯落物隨著時(shí)間的推移會(huì)逐步分解,待到新一輪落葉期時(shí),枯落物又會(huì)再次累積(圖1a)。在枯落物分解的過程中,枯落物的養(yǎng)分貯量也會(huì)隨之變化。PI-C 枯落物的全N、全P 和全K 含量隨時(shí)間呈波動(dòng)變化(圖1b ~d),LC-C 和PE-C 全年變化趨勢均不太明顯。PI-C枯落物全N含量呈先增多后減少再增多的趨勢,年變化量為16.36 g/kg,全年均高于LC-C和PE-C,PI-C、LC-C和PE-C凋落物全N含量 分別 為13.39 ~29.75、10.68 ~14.36 和4.90 ~8.38 g/kg。PI-C 枯落物全P 含量呈先增多后減少的趨勢,年變化量為0.51 g/kg。PI-C、LC-C 和PE-C 枯落物全P含量分別為0.55 ~1.06、0.49 ~0.68和0.20 ~0.31 g/kg,PI-C 枯落物全P 含量存在明顯優(yōu)勢。PIC 枯落物全K 含量呈先減少后增多的趨勢,年變化量為3.52 g/kg,全K 含量最大值為5.15 g/kg,分別為LC-C和PE-C全K含量最大值的1.40和2.83倍。

圖1 不同套種模式的枯落物蓄積量和養(yǎng)分貯量動(dòng)態(tài)變化Fig.1 Dynamic changes of litter volume and nutrient storage of different interplanting models

2.2 不同套種模式土壤理化性質(zhì)分析

不同套種模式對土壤的最小持水量、毛管持水量、非毛管孔隙、毛管孔隙、總孔隙度、pH、全P 和全K 含量影響顯著(P< 0.05),對土壤容重、最大持水量、有機(jī)質(zhì)和全N含量影響不顯著(表2)。土壤孔隙度能反映出土壤透水通氣性能是否良好[24],PI-C 土壤總孔隙度最大,與LC-C 和PE-C 差異顯著(P<0.05),說明PI-C 土壤透水通氣性最好。3 種土壤均為酸性土壤,其中PE-C 土壤pH 為4.70,與PI-C 和LC-C 差異顯著(P<0.05)。LC-C 土壤全P 含量最高(1.08 g/kg),與PE-C差異顯著(P<0.05),與PI-C差異不顯著;LC-C 土壤全K 含量最高(2.99 g/kg),與PI-C和LC-C均差異顯著(P<0.05)。

表2 不同套種模式的土壤理化性質(zhì)Tab.2 Soil physical and chemical properties of different interplanting models

2.3 不同套種模式土壤微生物多樣性分析

PI-C、LC-C 和PE-C 土壤細(xì)菌群落各獲得4 471、4 310 和2 897 個(gè)OTU,真菌群落各獲得243、300 和259 個(gè)OTU,真菌細(xì)菌比分別為0.054、0.070 和0.089。對0.97%相似水平的OTU 代表序列進(jìn)行分類學(xué)分析,PI-C、LC-C 和PE-C 土壤細(xì)菌群落分別歸為32 個(gè)門734 個(gè)屬、28 個(gè)門638 個(gè)屬和26個(gè)門465個(gè)屬,真菌群落分別歸為36個(gè)門124個(gè)屬、39個(gè)門136個(gè)屬和32個(gè)門117個(gè)屬。

2.3.1 不同套種模式土壤微生物Alpha多樣性分析

Chao1和Ace指數(shù)越大,說明樣本中微生物豐富度越高;Shannon 指數(shù)越大,Simpson 指數(shù)越小,說明樣本中微生物群落多樣性越高[25];Coverage 指數(shù)越高,說明樣本中序列被測出的概率越高。PI-C 和LC-C土壤細(xì)菌的Chao1、Ace和Shannon指數(shù)顯著大于PE-C(P< 0.05),且Simpson 指數(shù)顯著小于PE-C(P<0.05),說明PI-C 和LC-C 土壤細(xì)菌豐富度和多樣性明顯優(yōu)于PE-C,PI-C 與LC-C 差異不顯著;PIC、LC-C 和PE-C 土壤真菌的Chao1、Ace、Shannon和Simpson 指數(shù)差異不顯著,說明3 種土壤真菌豐富度和多樣性差異不大(表3)。

表3 不同樹種套種模式的土壤微生物多樣性指數(shù)Tab.3 Soil microbial diversity index of different interplanting models

續(xù)表3Continued

2.3.2 不同套種模式土壤微生物群落組成分析

PI-C、LC-C 和PE-C 土壤優(yōu)勢細(xì)菌門分別為13、13 和12 個(gè),其中變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、酸桿菌門(Acidobacteria)和綠彎菌門(Chloroflexi)在3 種土壤中均為優(yōu)勢菌群,變形菌門在3 種土壤中占比為LC-C(34.67%)>PE-C(28.35%)>PI-C(22.40%);放線菌門為PE-C(30.50%)>LC-C(23.39%)>PI-C(11.52%);酸桿菌 門 為PE-C(23.31%)>PI-C(16.07%)>LC-C(12.16%);綠彎菌門為PI-C(29.81%)>LC-C(13.48%)>PE-C(6.81%)(圖2a)。在屬分類水平上,PI-C 土壤中細(xì)菌占比最多的3 個(gè)群落分別為norank_c_AD3(19.78%)、norank_f_Xanthobacterace?ae(5.73%)和norank_o_Subgroup_2(5.04%);LC-C土壤中細(xì)菌占比最多的3個(gè)群落分別為norank_f_Xan?thobacteraceae (9.97%) 、 norank_c_Subgroup_6(4.17%)和norank_c_AD3(3.99%);PE-C 土壤中細(xì)菌占比最多的3 個(gè)群落分別為熱酸菌屬(Acidother?mus,10.95%)、norank_f_Xanthobacteraceae(8.49%)和norank_o_Acidobacteriales(6.46%)(圖2b)。

PI-C、LC-C 和PE-C 土壤優(yōu)勢真菌為子囊菌門(Ascomycota)、擔(dān)子菌門(Basidiomycota)、毛霉門(Mucoromycota)和纖毛門(Ciliophora)。子囊菌門在3 種土壤中占比為PI-C(77.61%)>LC-C(62.19%)>PE-C(28.45%);擔(dān)子菌門為PE-C(63.55%)>LC-C(26.35%)>PI-C(11.91%);毛霉門 為 PI-C (5.22%) >LC-C (4.80%) >PE-C(2.49%);纖毛門為PI-C(1.46%)>LC-C(1.10%)>PE-C(0.79%)(圖2c)。PI-C、LC-C 和PE-C 土壤中占比最多的細(xì)菌和真菌群落分別為綠彎菌門和子囊菌門、變形菌門和子囊菌門、放線菌門和擔(dān)子菌門。PI-C 真菌占比最多的3 個(gè)群落為unclassi?fied_f_Aspergillaceae(16.46%)、unclassified_f_Hypo?creaceae(14.12%)和毛殼菌屬(Chaetomium,13.57%);LC-C 真菌占比最多的3 個(gè)群落為unclas?sified_f_Aspergillaceae(17.45%)、Saitozyma(15.42%)和unclassified_f_Hypocreaceae(7.75%);PE-C 真菌占比最多的3 個(gè)群落為Saitozyma(55.68%)、unclas?sified_f_Hypocreaceae(8.26%)和毛殼菌屬(6.10%)(圖2d)。

圖2 不同套種模式土壤微生物群落(a和b:細(xì)菌;c和d:真菌)Fig.2 Soil microbial community of different interplanting models(a and b:bacteria;c and d:fungi)

3 種套種模式土壤中共有的細(xì)菌屬和真菌屬分別為351個(gè)和82個(gè)(圖3)。PI-C 土壤中特有的細(xì)菌屬為176 個(gè),多于LC-C(25 個(gè))和PE-C(14 個(gè))(圖3a)。PI-C、LC-C 和PE-C 土壤中特有的真菌屬分別為17個(gè)、25個(gè)和11個(gè)(圖3b)。

圖3 不同套種模式土壤微生物屬分類水平上Venn圖(a:細(xì)菌;b:真菌)Fig.3 Venn diagram of soil microbe of different interplanting models at the genus level(a:bacteria;b:fungi)

2.3.3 不同套種模式土壤微生物與環(huán)境因子關(guān)聯(lián)分析

冗余分析(RDA)是環(huán)境因子約束化的PCA 分析,反映樣本分布和環(huán)境因子間的關(guān)系[26]。細(xì)菌群落多樣性與pH、有機(jī)質(zhì)呈顯著正相關(guān)(P<0.05),與全P 含量呈極顯著正相關(guān)關(guān)系(P<0.01),說明pH、有機(jī)質(zhì)和全P 含量共同影響土壤細(xì)菌多樣性(圖4a);真菌群落多樣性與毛管持水量呈顯著正相關(guān)(P< 0.05),說明毛管持水量影響土壤真菌多樣性(圖4b)。

圖4 不同套種模式土壤微生物群落結(jié)構(gòu)與環(huán)境因子的RDA分析(a:細(xì)菌;b:真菌)Fig.4 RDA analysis of soil microbial community structure and environmental factors of different interplanting models(a:bacteria;b:fungi)

通過計(jì)算環(huán)境因子和菌群之前的Spearman 等級(jí)相關(guān)系數(shù)發(fā)現(xiàn),細(xì)菌的pH 與赭黃嗜鹽囊菌屬(Haliangium)、Gaiella、硝化螺旋菌屬(Nitrospira)、unclassified_o_Acidobacteriales、芽孢桿菌屬(Bacil?lus)、Luedemannella、土微菌屬(Pedomicrobium)呈現(xiàn)極顯著極強(qiáng)正相關(guān)(P<0.01;P<0.001;R ≥0.8);全P 含量與赭黃嗜鹽囊菌屬、Gaiella、硝化螺旋菌屬、unclassified_o_Acidobacteriales、芽孢桿菌屬、鏈霉菌屬(Streptomyces)呈極顯著極強(qiáng)正相關(guān)(P<0.01;P<0.001;R ≥0.8),與norank_p_WPS-2 呈極顯著極強(qiáng)負(fù)相關(guān)(P<0.01;R ≤-0.8);全K 含量與芽孢桿菌屬呈極顯著極強(qiáng)正相關(guān)(P<0.01;R ≥0.8);有機(jī)質(zhì)與norank_p_GAL15 呈極顯著極強(qiáng)負(fù)相關(guān)(P<0.01;R ≤-0.8)(圖5a)。

真菌的容重與norank_f_Stenostomidae、有機(jī)質(zhì)含量與Nuclearia均呈極顯著極強(qiáng)負(fù)相關(guān)(P<0.01;R ≥0.8);全鉀含量與Plectosphaerella和枝孢屬(Cladosporium)呈極顯著極強(qiáng)正相關(guān)(P<0.01;R ≥0.8),與乳菇屬(Lactarius)呈極顯著極強(qiáng)負(fù)相關(guān)(P<0.01;R ≥0.8);毛管持水量與unclassified_o_Peziza?les、unclassified_o_Eurotiales 呈極顯著極強(qiáng)正相關(guān)(P<0.01;R ≤-0.8),與Saitozyma、unclassified_p_As?comycota 和雙擔(dān)菌屬(Geminibasidium)呈極顯著極強(qiáng)負(fù)相關(guān)(P<0.01;R ≤-0.8);pH 與Arthrobotryss、全P含量與unclassified_o_Pezizales 均呈極顯著極強(qiáng)正相關(guān)(P<0.01;R ≤-0.8)(圖5b)。

圖5 屬分類水平上土壤微生物相對豐度與環(huán)境因子相關(guān)性(a:細(xì)菌;b:真菌)Fig.5 Correlation between relative abundance of soil microbes and environmental factors at genus level(a:bacteria;b:fungi)

3 討論與結(jié)論

3.1 不同套種模式枯落物對土壤微生物多樣性的影響

不同植物的凋落物理化性質(zhì)不同,分解時(shí)釋放的養(yǎng)分也具有差異性,對土壤微生物生長具有選擇性刺激作用,進(jìn)而影響微生物群落結(jié)構(gòu)和功能及其多樣性[27]。本研究表明印度紫檀×金花茶林、荔枝×金花茶林土壤細(xì)菌豐富度和多樣性明顯優(yōu)于濕地松× 金花茶林,這與Klimek 等[28]研究結(jié)果相似,闊葉樹種較針葉樹種具有更高的土壤微生物活性和功能多樣性,亦與張信思[3]調(diào)查發(fā)現(xiàn)的野生金花茶原生生境的伴生植物多為闊葉林的特性相一致。

土壤細(xì)菌真菌比可反映細(xì)菌和真菌的相對豐富度[29]。在本研究中,印度紫檀×金花茶林的細(xì)菌真菌比明顯高于荔枝× 金花茶林和濕地松× 金花茶林,可能是因?yàn)橛《茸咸础两鸹ú枇挚萋湮锏娜玁 和全P年變化量均明顯高于其他兩種林地,有研究表明枯落物中的N、P 元素釋放量越高,越有利于細(xì)菌的生長[30]。在后續(xù)研究中,還需進(jìn)行枯落物礦化速率試驗(yàn)進(jìn)一步闡明不同金花茶套種模式的枯落物對微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性的影響。

3.2 不同套種模式土壤理化性質(zhì)對微生物多樣性的影響

土壤微生物對環(huán)境極為敏感,森林類型和土壤理化性質(zhì)是影響其多樣性的重要因素[31-32]。RDA 結(jié)果表明,pH、有機(jī)質(zhì)和全P 含量對土壤細(xì)菌多樣性的影響較大,其中,全P 含量的影響最大,呈極顯著相關(guān);毛管持水量則影響土壤真菌多樣性。宋賢沖等[12]研究發(fā)現(xiàn)全P 含量與土壤微生物多樣性指數(shù)極顯著相關(guān),有機(jī)質(zhì)與土壤微生物多樣性表現(xiàn)為顯著相關(guān);邵穎等[33]研究表明pH 值與土壤細(xì)菌群落多樣性有關(guān),與本研究的發(fā)現(xiàn)一致??紫抖取⑷玁和全K 含量對土壤微生物多樣性貢獻(xiàn)不大,這與趙春梅等[34]的研究結(jié)果不一致,可能是收獲金花茶花朵和葉片時(shí)人為活動(dòng)較多所致,且孔隙度、全N和全K并不能影響所有土壤微生物群落。根據(jù)相關(guān)性Heat?map 分析結(jié)果可知,pH、有機(jī)質(zhì)、全P 和全K 含量可與部分細(xì)菌屬種類呈極顯著極強(qiáng)相關(guān)性,容重、毛管持水量、pH、全P含量和全K含量可與部分真菌屬呈極顯著極強(qiáng)相關(guān)性。

土壤生境不同,主要菌群的豐度和結(jié)構(gòu)不同[35]。由于3 種套種模式土壤的孔隙度、pH、全P 和全K 含量均差異顯著,使土壤生境具有差異。3 種套種模式土壤中的優(yōu)勢微生物均為變形菌門、放線菌門、酸桿菌門、綠彎菌門4個(gè)細(xì)菌菌群和子囊菌門、擔(dān)子菌門2 個(gè)真菌菌群,研究結(jié)果與張勝男等[35]和Han?son 等[36]的基本一致。有研究認(rèn)為綠彎菌門和富營養(yǎng)化程度有關(guān)[37],酸桿菌門與貧瘠的土壤環(huán)境有關(guān)[38],子囊菌門能利用環(huán)境中多種養(yǎng)分供其生長[39],擔(dān)子菌門可作為土壤擾動(dòng)強(qiáng)弱的指示真菌[40]。印度紫檀×金花茶林土壤微生物豐富度和多樣性最高,占比最多的是綠彎菌門和子囊菌門,特有的細(xì)菌屬種類也遠(yuǎn)遠(yuǎn)多于其他兩種模式的土壤,可能原因是印度紫檀×金花茶林枯落物代謝較快,更多養(yǎng)分流入土壤。荔枝× 金花茶林土壤中占比最多的是變形菌門和子囊菌門,濕地松×金花茶林土壤中占比最多的是放線菌門和擔(dān)子菌門。

本研究結(jié)果表明,枯落物蓄積量、全N 和全P年變化量以及土壤pH、有機(jī)質(zhì)、全P 含量和毛管持水量能影響土壤微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性。綜合考慮土壤理化性質(zhì)和微生物多樣性,在林下套種金花茶栽培模式中,宜選擇落葉闊葉林作為上層林樹種。

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