2021年10月，在中國知網(wǎng)發(fā)布的《中國學(xué)術(shù)期刊影響因子年報(bào)(自然科學(xué)與工程技術(shù)·2021版)》中，《長江科學(xué)院院報(bào)》復(fù)合影響因子實(shí)現(xiàn)六連升，由2014年的0.637增長至2020年的1.321。影響力指數(shù)(CI, Clout Index)較2019年提前4名，在水利工程學(xué)科76種期刊中排名第8，基礎(chǔ)研究類影響因子學(xué)科排名第6；基金論文比一直呈上升趨勢，2019年和2020年度基金論文比均保持在0.9左右；Web即年下載率由2019年的58%提升至2020年的99%。

《中國學(xué)術(shù)期刊影響因子年報(bào)(自然科學(xué)與工程技術(shù))》由中國知網(wǎng)、中國科學(xué)文獻(xiàn)計(jì)量評(píng)價(jià)研究中心和清華大學(xué)圖書館共同編制，是國內(nèi)期刊界權(quán)威的統(tǒng)計(jì)源。通過對(duì)中國學(xué)術(shù)期刊進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析和定量評(píng)價(jià)，形成《年報(bào)》，并以電子期刊的形式按年度連續(xù)出版。《長江科學(xué)院院報(bào)》近年來通過加強(qiáng)約稿組稿、嚴(yán)把審稿關(guān)、打擊學(xué)術(shù)不端行為等多項(xiàng)舉措提升稿件學(xué)術(shù)質(zhì)量；同時(shí)堅(jiān)持精細(xì)編校的傳統(tǒng)，提高出版質(zhì)量，發(fā)展期刊新媒體等，使期刊的學(xué)術(shù)地位和影響力持續(xù)攀升。