杜 瑤 綜述,禹 莉 審校
(蚌埠醫(yī)學(xué)院腫瘤基礎(chǔ)研究與臨床檢驗診斷重點實驗室/慢性疾病免疫學(xué)基礎(chǔ)與臨床安徽省重點實驗室,安徽 蚌埠 233030)
最近幾年,在國內(nèi)外的生命科學(xué)研究中,長鏈非編碼RNA(LncRNA)的熱度可謂是高居不下。根據(jù)基因組測序顯示,30億個堿基對組成了人的基因組,其中98.5%的核酸序列為非編碼RNA(non-coding RNA),用于參與蛋白質(zhì)編碼的序列僅僅只有1.5%。
胃癌是一種常見的惡性腫瘤,早期癥狀不明顯,致使胃癌死亡率居于所有癌癥死亡率的前列。因此,尋找可靠的胃癌標志物,提高胃癌早期診斷率,對于癌癥患者生存期的延長特別重要?;蚪M中轉(zhuǎn)錄的LncRNA便表現(xiàn)出了潛在作用。本綜述將試圖闡述LncRNA與胃癌之間的相關(guān)關(guān)系。
流行病學(xué)研究表明,全世界癌癥死亡率中排名第二的胃癌,是一種最常見的威脅人類生命健康的惡性腫瘤[1-2],全世界每年新增胃癌患者約100萬例,死亡率達75%[3]。韓國、日本和中國等東亞國家是胃癌高發(fā)地區(qū),據(jù)統(tǒng)計,至2012年,胃癌患者人數(shù)已占全球總病例數(shù)的近50%[4]。胃癌患者的總體預(yù)后較差,明確診斷后5年生存率僅為20%~30%。造成胃癌預(yù)后不良的主要原因是惡性侵襲和轉(zhuǎn)移,傳統(tǒng)治療胃癌的方式是以手術(shù)為主,輔以放化療,在改善預(yù)后不明顯的情況下,探究胃癌的發(fā)病機制,阻斷胃癌的侵襲和轉(zhuǎn)移就顯得尤其重要。目前,胃癌的早期診斷主要依靠電子胃鏡加上病理學(xué)檢查的方法,糖類抗原199(CA199)、血清學(xué)癌胚抗原(CEA) 和糖類抗原724(CA724)指標,但存在特異性及敏感性不高的缺點,難以發(fā)現(xiàn)早期胃癌,不能完全替代活組織檢查。作為探索熱門的基因檢測,其在判斷腫瘤的產(chǎn)生、進展、遷移及預(yù)后等方面擁有一定的優(yōu)勢。研究發(fā)現(xiàn),在腫瘤的診斷和預(yù)后上,LncRNA可作為新型的腫瘤標志物發(fā)揮積極作用[5]。LncRNA在胃癌中的重要影響也被廣泛研究并報道。
LncRNA 是長度超過200個核苷酸的RNA分子[5-6]。LncRNA沒有典型開放閱讀框架(ORF),不編碼任何蛋白質(zhì),但在基因調(diào)控中能以 RNA 形式在轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后、外遺傳學(xué)等眾多方面發(fā)揮作用[6-7]。目前認為LncRNA的來源和進化可能存在以下作用機制:(1)非編碼RNA中鄰近重復(fù)序列可能是由于其中一個序列的兩次隨機復(fù)制的結(jié)果;(2) 有功能的非編碼逆轉(zhuǎn)錄基因或者是無功能的非編碼逆轉(zhuǎn)錄假基因,均可由非編碼基因通過逆轉(zhuǎn)錄移位形成; (3) 隨著重排染色體,由2個遠距離分離且不轉(zhuǎn)錄的序列區(qū)域發(fā)生合并可形成一個多外顯子的非編碼RNA; (4) 由于轉(zhuǎn)座子的插入,形成一個有功能的非編碼RNA;(5) 一個有功能的非編碼基因能與先前編碼序列連接,可因蛋白質(zhì)編碼基因的閱讀框架的破壞而被轉(zhuǎn)換生成。按照基因組上的相關(guān)蛋白對應(yīng)編碼基因的特點和位置,LncRNA可以分為五類,即(1) 正義LncRNA(sense LncRNA): 同一條鏈上蛋白對應(yīng)基因編碼的轉(zhuǎn)錄方向即為正義LncRNA的轉(zhuǎn)錄方向; (2) 內(nèi)含子LncRNA(intronic LncRNA):主要由基因的內(nèi)含子區(qū)域轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生; (3) 反義LncRNA(anti-sense LncRNA):轉(zhuǎn)錄方向與鄰近的蛋白對應(yīng)的編碼基因其轉(zhuǎn)錄方向相反;(4) 基因間LncRNA(intergenic LncRNA):產(chǎn)生于2個基因間的區(qū)域,即為lincRNA[8];(5) 雙向LncRNA(bidirectional LncRNA):可同時從同一條鏈上蛋白質(zhì)對應(yīng)的編碼基因相反的轉(zhuǎn)錄方向或相同的轉(zhuǎn)錄方向[9]。
2010-2020年,LncRNA 在多種腫瘤中的研究與日俱增,關(guān)于LncRNA與胃癌的相關(guān)研究已經(jīng)取得了卓越的成果,對了解胃癌的分子生物學(xué)越來越重要。研究顯示,多種LncRNA在胃癌細胞中異常表達[8,10-11]。腫瘤的發(fā)生與生物遺傳信息的改變有關(guān),而異常表達的LncRNA恰恰可引起遺傳信息的變化。目前,還沒有明確了解LncRNA的致癌機制,但研究發(fā)現(xiàn)在Notch、mTOR、NF-Κb和Wnt等多條腫瘤信號通路中均有LncRNA的表達,參與調(diào)節(jié)細胞浸潤、轉(zhuǎn)移、凋亡及增殖,密切與腫瘤產(chǎn)生、進展和遷移等相關(guān)[12-15]。
許多國內(nèi)外研究發(fā)現(xiàn),TNM 分期、腫瘤大小、分化、遷移、浸潤、預(yù)后等胃癌患者的臨床病理參數(shù),均與LncRNA的非正常表達相關(guān)[16-17],其在胃癌的診斷中擁有重要的臨床意義。絕大多數(shù)的LncRNA都參與了胃癌細胞的侵襲和遷移,胃癌相關(guān)的LncRNA可以作為生物學(xué)標志物來預(yù)測胃癌的遷移。LncRNA可以通過參與一些microRNA(miRNA)的信號傳導(dǎo)通路,成為抑癌基因或致癌基因,從而影響胃癌細胞的增殖、遷移和侵襲[18]。在將來的臨床診治和預(yù)后監(jiān)測中,LncRNA 可作為腫瘤治療的靶點和新型標志物發(fā)揮重要作用。
3.1結(jié)腸癌癥相關(guān)轉(zhuǎn)錄本1(CCAT1) CCAT1是近年在結(jié)腸癌中被新發(fā)現(xiàn)的LncRNA,其在結(jié)腸癌中為上調(diào)狀態(tài)。CCAT1 的長度為2 628個核苷酸,定位于8q24.21。雖然具有3個ORF,但是無法翻譯蛋白質(zhì)。CCAT1與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展有關(guān),其高表達于多種腫瘤細胞中。有研究檢測到胃癌細胞中存在CCAT1上調(diào),并已經(jīng)明確CCAT1在胃癌中具有促進作用[19]。在多種腫瘤組織中,包括胃癌,發(fā)現(xiàn)C-Myc癌基因可以直接結(jié)合其啟動子E-box,激活CCAT1,影響腫瘤的增殖和遷移。在胃癌細胞中CCAT1還參與調(diào)節(jié)miR490,二者呈負相關(guān),據(jù)此信息可以推斷miR490的結(jié)合位點存在于CCAT1上,刺激miR490可以激活CCAT1,導(dǎo)致胃癌細胞發(fā)生轉(zhuǎn)移,所以若想抑制胃癌細胞的轉(zhuǎn)移,便可通過抑制miR490來達到目的。hnRNPA1與CCAT1呈正相關(guān),與miR490呈負相關(guān),說明胃癌細胞的轉(zhuǎn)移可通過CCAT1-miR490-hnRNPA1軸實現(xiàn)促進。CCAT1 可成為早期胃癌診斷及隨訪的指標。
3.2H19 H19是最早被鑒定的LncRNA分子之一,位于染色體11p15.5上,擁有ORF,但是不能翻譯對應(yīng)的蛋白質(zhì)。是食管癌、肝癌、膀胱癌、結(jié)腸癌及肝轉(zhuǎn)移的生物標志物。啟動子區(qū)域甲基化缺失,會導(dǎo)致LncRNA的顯著上調(diào),預(yù)測腫瘤的出現(xiàn)。
在胚胎期高表達,出生之后就會被滅活的H19基因,會再次于腫瘤發(fā)生時表達,影響著腫瘤的進展。研究顯示,在不同腫瘤中H19具有不同的作用,例如致癌、抑癌。但是有研究明確指出在胃癌的癌變過程中存在H19的參與。H19作為miR-657的前體,其誘導(dǎo)產(chǎn)生的miR-657是促進胃癌發(fā)生的重要介質(zhì),LI等[20]發(fā)現(xiàn)H19除了可以加工形成微小RNA,還可以在胃癌中上調(diào)ISM1蛋白,此蛋白可以間接下調(diào)負性靶基因miR-675的表達。研究顯示,p53作為抑制腫瘤基因?qū)19有負調(diào)控作用,當H19與p53結(jié)合后,可以通過抑制P53的活性,來促使胃癌細胞的增殖和逃逸凋亡[21]。而癌基因c-Myc對H19有正調(diào)控作用,可以誘導(dǎo)胃癌細胞表達H19,通過一定數(shù)量的胃癌標本發(fā)現(xiàn),c-Myc水平與H19的表達呈正相關(guān)。有研究表明,胃癌細胞中過表達的H19與生存率和TNM分期晚期具有相關(guān)性[22];有研究通過受試者工作特征曲線(ROC)分析發(fā)現(xiàn),胃癌患者的外周血較健康人高表達H19,在患者手術(shù)后的血漿樣本中的表達呈現(xiàn)明顯下調(diào)。體外試驗顯示H19過表達可以促使胃癌細胞的增殖,敲除可促進癌變細胞發(fā)生凋亡[23]。這說明H19可作為早期胃癌篩選和診斷的潛在指標。
3.3肺腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)轉(zhuǎn)錄體1(MALAT1) MALAT1于肺癌中被首次發(fā)現(xiàn),其位于染色體11p13上。MALAT1在多種腫瘤中高表達。研究顯示,胃癌中的MALAT1在遠處轉(zhuǎn)移組織中表達水平要明顯高于正常和沒有轉(zhuǎn)移的組織,在外周血中也是同樣的結(jié)果[24]。核內(nèi)mRNA前剪接因子2(SF2)/替代剪接因子(ASF)在MALAT1的誘導(dǎo)下可以過表達,但是SF2/ASF的高表達對細胞的增殖卻無影響,通過敲低MALAT1可以抑制SF2/ASF的表達,表明通過調(diào)節(jié)SF2/ASF可以實現(xiàn)對MALAT1在胃癌細胞增殖方面的調(diào)控。通過RNA免疫共沉淀測序(RIP seq)發(fā)現(xiàn)MALAT1與EZH2連接后,可以對PCDH10(腫瘤抑制因子之一)起到抑制作用,進而對胃癌細胞的轉(zhuǎn)移產(chǎn)生積極影響[2]。通過比例風險回歸模型(COX)分析顯示,高表達的MALAT1還與腫瘤的不良預(yù)后相關(guān),二者呈正相關(guān)。
3.4母系印記基因3(MEG3) MEG 3在2000年被發(fā)現(xiàn),位于基因的14q32.3 上,長約1.6 kb,沒有完整的ORF[7]。MEG3是具有抑癌作用的LncRNA,在多種腫瘤中缺失表達或降低[22]。MEG3可以通過刺激P53抑癌基因的表達,抑制胃癌細胞增殖,促使細胞凋亡,而沉默MEG3則可促進胃癌細胞增殖。MEG3調(diào)節(jié)胃癌細胞的生物學(xué)行為,主要是通過與miRNA相互作用實現(xiàn)的。MEG3的下調(diào)與腫瘤的病理分期、瘤體大小、有無轉(zhuǎn)移、無病生存率和總生存率密切相關(guān),其表達水平越低,預(yù)后情況越差。在胃癌細胞中MEG3可被miR148a、miR-141抑制出現(xiàn)表達下調(diào),也可因為DNA甲基化抑制其在胃癌細胞中的表達。與人胃黏膜細胞(GES 1)正常細胞系相比,在BGC-823、SGC-7910、MGC-803和AGS-GC胃癌細胞系中,LncRNA MEG3被下調(diào)。MSP結(jié)果顯示,與正常組織相比,LncRNA-MEG3在腫瘤組織中高甲基化,與GES 1正常細胞系相比,在BGC-823、SGC-7910、MGC-803和AGS-GC胃癌細胞系中LncRNA MEG3也表現(xiàn)為高甲基化。MEG3與miR-181a-5p呈負相關(guān),并且發(fā)現(xiàn)MEG3在體內(nèi)的上調(diào)可以抑制腫瘤生長[23]。
3.5生長阻滯特異性轉(zhuǎn)錄本5(GAS5) GAS5是首個在潛在的抑癌基因的篩選中發(fā)現(xiàn)的生長停滯期處于過表達的Lnc RNA,其大小約為650 bp,具有12個外顯子。GAS5在多種腫瘤中表現(xiàn)為下調(diào)。高表達的GAS5 通過細胞周期的調(diào)節(jié),促使細胞凋亡,從而使腫瘤細胞的增殖受到抑制[24-25]。在胃癌研究中,通過檢測胃癌和癌旁正常細胞中GAS5的產(chǎn)生量,發(fā)現(xiàn)腫瘤組織中的GAS5越低表達,其腫瘤進展越快,預(yù)后越不良。胃癌組織中GAS5的表達明顯下降,其與腫瘤大小、TNM分期、整體生存率和無病生存率相關(guān)[25]。GAS5 的抑癌作用可通過調(diào)節(jié)P21和E2F1達成。Y盒結(jié)合蛋白1(YBX1)和p21 的下調(diào)表達,可被GAS5的低表達引起,從而解除 G1 期的阻滯,表明GAS5 可以通過調(diào)節(jié)p21和YBX1的表達來抑制胃癌細胞的增殖。
3.6鋅指蛋白反義鏈1 ( ZFAS1) ZFAS1 是最近幾年發(fā)現(xiàn)的LncRNA,其位于20q13上,ZFAS1為ZNFX1的反義RNA,ZFAS1在細胞質(zhì)和細胞核中均有表達,而ZNFX1只在細胞核中高度表達。有研究表明,ZFAS1的高表達與腎細胞癌預(yù)后差、病程短呈正相關(guān),敲除ZFAS1可顯著抑制腎癌細胞的增殖、遷移和侵襲[26]。此外,miR-10a被確定為ZFAS1的靶向標志物。沉默miR-10a可減弱ZFAS1促進腎癌細胞增殖和轉(zhuǎn)移的能力。SKA1作為miR-10a的一個關(guān)鍵下游靶蛋白,與ZFAS1的生物學(xué)特性有關(guān),ZFAS1通過miR-10a正調(diào)控SKA1的表達。目前在胃癌中針對兩者的研究均不多。研究發(fā)現(xiàn),在胃癌細胞系、組織及血清中ZFAS1為過表達,患者較差的生存率和預(yù)后不良與其表達水平相關(guān)[27-29]。敲除ZFAS1后可抑制胃癌細胞的增殖,誘導(dǎo)其凋亡,抑制上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化[28]。外泌體參與ZFAS1的運輸,從而加快胃癌細胞增殖及侵襲轉(zhuǎn)移[29]。ZFAS1 可以與LSD1/CoREST 和EZH2 發(fā)生作用,通過抑制 NKD2和KLF2 的轉(zhuǎn)錄,以達到促進胃癌細胞增殖的目的[30]。
本文主要總結(jié)了近幾年來與胃癌相關(guān)的、重要的LncRNA,回顧了LncRNA 對胃癌細胞復(fù)雜的作用機制。體內(nèi)和體外試驗均可顯示部分LncRNA在早期和癌前病變中過低表達、不表達或過表達,而這些表達異常的LncRNA對細胞的增殖、凋亡和遷移產(chǎn)生影響,從而發(fā)揮對胃癌的抑制或刺激作用。這些都表明LncRNA可以作為胃癌早期診斷和療效觀察的潛在指標。但如今很多 LncRNA 在胃癌組織及細胞中的具體作用機制仍不十分明確,尚需進行深入研究。進一步研究與胃癌相關(guān)LncRNA在胃癌發(fā)生、發(fā)展過程中的作用機制,努力將相關(guān)LncRNA作為指標,用于臨床早期診斷及預(yù)后判斷,可能會為胃癌的臨床診治研究提供新方向,甚至有可能改變當前胃癌的診療模式。