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潰瘍性結(jié)腸炎的關(guān)鍵致病基因及治療中藥活性成分篩選

2021-01-11 02:24劉濤陳新怡朱曉彤楊燾陳小娟仇婧玥劉恒銘馮瑤宋厚盼湖南中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)學(xué)院長沙4008湖南中醫(yī)藥大學(xué)醫(yī)學(xué)院
山東醫(yī)藥 2021年18期
關(guān)鍵詞:趨化因子潰瘍性結(jié)腸炎

劉濤,陳新怡,朱曉彤,楊燾,陳小娟,仇婧玥,劉恒銘,馮瑤,宋厚盼 湖南中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)學(xué)院,長沙 4008;湖南中醫(yī)藥大學(xué)醫(yī)學(xué)院

潰瘍性結(jié)腸炎(ulcerative colitis,UC)是一種可發(fā)生在結(jié)、直腸任何部位的慢性、彌漫性非特異性炎癥性病變。UC最常見于直腸和乙狀結(jié)腸,少數(shù)可累及回腸末端。UC的主要病理特征為結(jié)腸黏膜的炎癥反應(yīng),多局限于黏膜層和黏膜下層,腸壁無明顯增厚,主要表現(xiàn)為黏膜的大片水腫、充血、糜爛和潰瘍形成。臨床上最常見的UC癥狀為血性腹瀉,多為膿血便,常伴有痙攣性腹痛,少數(shù)嚴(yán)重患者因直腸受累而有里急后重感。截至目前,UC的病因病機(jī)尚不明確,可能與遺傳、環(huán)境、微生物等因素和腸道免疫系統(tǒng)有關(guān)。UC發(fā)病的病理反應(yīng)可見炎性介質(zhì)釋放、氧化應(yīng)激、腸道微環(huán)境紊亂、腸道通透性增加等[1]。5-氨基水楊酸、糖皮質(zhì)激素、免疫抑制劑是現(xiàn)代醫(yī)學(xué)治療UC的主要藥物,臨床實踐發(fā)現(xiàn)部分患者療效欠佳,且長期使用可產(chǎn)生嚴(yán)重不良反應(yīng)[2]。因此,尋找與UC發(fā)病密切相關(guān)的基因?qū)γ鞔_UC的發(fā)病機(jī)制及探索潛在的防治UC藥物具有重要意義。隨著人類基因組計劃的完成,以高通量測序/芯片分析為主的組學(xué)技術(shù)及生物信息學(xué)分析技術(shù)逐漸興起,為研究復(fù)雜疾病的病理機(jī)制提供了重要的技術(shù)支持[3]。本研究采用生物信息學(xué)方法,通過提取NCBI(National Center for Biotechnology)基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫GEO(https//:www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)中與UC發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)的基因芯片數(shù)據(jù),并對正常人和UC患者的結(jié)腸黏膜差異表達(dá)基因進(jìn)行分析,旨在闡明與UC發(fā)病緊密相關(guān)的信號通路以及關(guān)鍵基因靶點,挖掘潛在的可用于治療UC的中藥活性成分?,F(xiàn)報告如下。

1 資料與方法

1.1 數(shù)據(jù)來源 在GEO數(shù)據(jù)庫中下載UC患者和正常人的結(jié)腸黏膜組織轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。本研究所采用的UC相關(guān)基因芯片數(shù)據(jù)集為GSE87466,該數(shù)據(jù)集基于GPL13158平臺[4],采用[HT_HG-U133_Plus_PM]Affymetrix HT HG-U133+PM Array Plate陣列芯片檢測獲得。最終納入87例UC患者結(jié)腸黏膜組織標(biāo)本(包括27例廣泛性UC樣本和60例局限性UC樣本)和21例健康成人結(jié)腸黏膜組織標(biāo)本。納入著年齡>18歲。本研究經(jīng)湖南中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)學(xué)院倫理委員會批準(zhǔn)同意。

1.2 UC患者及正常成人結(jié)腸黏膜組織顯著性差異表達(dá)基因(DEGs)篩選

1.2.1 芯片數(shù)據(jù)質(zhì)量評估 收集21例健康成人腸黏膜組織和27例廣泛性UC患者腸黏膜組織標(biāo)本的數(shù)據(jù)。下載成人UC基因芯片GSE87466的CEL探針文件及數(shù)據(jù)包。運用R-Project(www.r-project.org)Bioconductor 3.5.0軟件的affyPLM數(shù)據(jù)包對芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量控制,對數(shù)據(jù)進(jìn)行背景校正和log2轉(zhuǎn)化,運用RMA算法對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理,通過繪制小提琴圖對處理后的數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量評估。將GSE87466芯片數(shù)據(jù)的質(zhì)量評估與均一性結(jié)果繪制成小提琴圖,橫坐標(biāo)為48個樣本編號,縱坐標(biāo)為芯片數(shù)據(jù)相對對數(shù)表達(dá)值(Relative Log Expression,RLE),小提琴的中心白色點表示RLE值中位數(shù),小提琴頂端和底端分別表示RLE值四分位點。所有小提琴的中心白色點基本位于一條直線上,48個樣本的RLE平均值均在5.7~5.8之間,提示數(shù)據(jù)均一性良好,該芯片數(shù)據(jù)可用于后續(xù)分析。

1.2.2 UC患者及正常成人結(jié)腸黏膜組織DEGs篩選 通過R軟件limma數(shù)據(jù)包篩選出P<0.05且|log-FC(fold-change)|>2的基因為差異表達(dá)基因探針,把探針轉(zhuǎn)化為標(biāo)準(zhǔn)基因名。通過分析logFC,(“FC”表示UC病例組受試芯片熒光信號強度與對照組相比的差異倍數(shù))[5]、P值、基因符號(gene symbol)等得到UC患者較正常組的上調(diào)和下調(diào)表達(dá)基因,采用GraphPad Prism 5在線軟件(https://www.graphpad.com/scientific-software/prism)繪制DEGs火山圖,獲得上調(diào)、下調(diào)表達(dá)基因的整體分布趨勢。以P<0.01且|logFC|>2為篩選條件獲UC患者及正常成人結(jié)腸黏膜組織差異表達(dá)基因,并對DEGs進(jìn)行層次聚類分析,繪制聚類熱圖。以Log2(Fold change)的絕對值≥1及-Log10(Pvalue)值>2為條件進(jìn)行篩選并繪圖,一個點代表一個基因,紅色點代表基因表達(dá)上調(diào),綠色點代表基因表達(dá)下調(diào),黑色小方塊表示基因沒有顯著差異變化;橫坐標(biāo)為納入樣本,縱坐標(biāo)為具體的差異表達(dá)基因名稱,上部樹狀結(jié)構(gòu)表示樣本間顯著性差異基因表達(dá)譜的分類模式,左側(cè)樹狀結(jié)構(gòu)表示樣本間DEGs表達(dá)值的聚集模式。

1.3 UC患者及正常成人結(jié)腸黏膜組織差異表達(dá)基因基因本體(Gene Ontology,GO)和信號通路富集分析 GO分析[6]主要涵蓋注釋基因及其表達(dá)產(chǎn)物分析,包括細(xì)胞組成(CC)、生物過程(BP)和分子功能(MF)。KEGG是系統(tǒng)分析基因功能和酶途徑,并將基因組信息與高階功能信息連接起來的知識庫[7]。DAVID(http://david.abcc.ncifcrf.gov/)是一個集基因注釋、可視化和綜合挖掘功能的數(shù)據(jù)平臺,它包含一套全面的功能注釋工具,可用于理解差異表達(dá)基因的生物學(xué)意義[8]。我們采用DAVID 6.8生物信息資源數(shù)據(jù)庫對所獲得的差異表達(dá)基因進(jìn)行GO和KEGG分析。將P<0.05和FDR(False Discovery Rate)<0.05設(shè)為顯著性基因富集臨界,選取20條顯著富集的信號通路。

1.4 UC患者及正常成人結(jié)腸黏膜組織DEGs蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析和關(guān)鍵靶點篩選 采用String在線分析數(shù)據(jù)庫(http://string-db.org)探索差異表達(dá)蛋白質(zhì)間的相互作用、信號通路間的交互作用、靶點之間的調(diào)控關(guān)系。將“1.4”中差異表達(dá)基因?qū)隨tring進(jìn)行蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)(protein-protein interaction,PPI)分析,設(shè)置可信度(Confidence)為0.7,得到差異表達(dá)基因的PPI。在PPI網(wǎng)絡(luò)圖中,節(jié)點表示基因或信號通路,邊線表示基因或通路之間的相互作用關(guān)系。節(jié)點的大小用“度”值表示,該值越大,節(jié)點面積越大,顏色越深,位置越靠近網(wǎng)絡(luò)中心。采用Cytoscape(http://www.cytoscape.org/)直觀描述生物分子間相互作用關(guān)系,其中節(jié)點表示基因、分子或蛋白質(zhì),連線表示生物分子之間的相互作用。通過其插件“cytoHubba”篩出UC患者及正常成人結(jié)腸黏膜組織差異表達(dá)基因網(wǎng)絡(luò)中的核心基因。將獲得的蛋白相互作用數(shù)據(jù)導(dǎo)入cytoscape 3.7.1軟件進(jìn)行可視化分析,分別采用Degree、Closeness、EPC算法,篩選得分排名前10的基因,再取交集獲得3種算法中均存在的基因,即為UC患者和正常人結(jié)腸黏膜關(guān)鍵DEGs。

1.5 靶向治療UC的相關(guān)中藥成分篩選 采用比較毒理基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(CTD,http://ctdbase.org/)中有關(guān)化學(xué)物質(zhì)和基因產(chǎn)物之間相互作用及其與疾病關(guān)系的信息和數(shù)據(jù),進(jìn)行基因跨物種比較研究,提供手動策劃的化學(xué)成分-基因、化學(xué)成分-疾病和基因-疾病相互作用、彼此集成以及與選定的外部數(shù)據(jù)集集成資料,以生成擴(kuò)展的網(wǎng)絡(luò)并預(yù)測新的關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)。將“1.4”中分析的核心基因?qū)隒TD中,獲取與核心基因有相互作用的化學(xué)物質(zhì),以交互作用值>1為篩選條件對涉及的中藥活性成分(藥物)進(jìn)行分析。

2 結(jié)果

2.1 UC患者的核心致病基因

2.1.1 UC患者及正常成人結(jié)腸黏膜組織差異表達(dá)基因分析結(jié)果 UC患者及正常成人結(jié)腸黏膜組織差異表達(dá)基因54 716個。其中表達(dá)上調(diào)基因2 756個(5.04%,2 756/54 716)、表達(dá)下調(diào)基因12 844個(23.47%,12 844/54 716)。

以P<0.01,|logFC|>2為條件,最終篩選UC患者及正常成人結(jié)腸黏膜組織顯著性差異表達(dá)基因279個。與正常成人結(jié)腸黏膜比較,UC患者結(jié)腸黏膜組織中表達(dá)顯著上調(diào)基因177個、表達(dá)顯著下調(diào)基因102個。

2.1.2 UC患者及正常成人結(jié)腸黏膜組織DEGs GO功能分析結(jié)果 顯著差異表達(dá)基因主要涉及炎癥反應(yīng)、趨化性、免疫反應(yīng)、趨化因子介導(dǎo)信號通路、中性粒細(xì)胞趨化性、對脂多糖的反應(yīng)、膠原蛋白分解代謝過程、細(xì)胞間信號、先天免疫反應(yīng)、細(xì)胞趨化作用等生物學(xué)過程;涉及的分子功能主要包括趨化因子活性、肝素結(jié)合、CXCR趨化因子受體結(jié)合、金屬內(nèi)肽酶活性、絲氨酸型內(nèi)肽酶活性、CXCR3趨化因子受體結(jié)合、運輸活性、RAGE受體結(jié)合、鈣離子結(jié)合、水通道活性等;主要富集于細(xì)胞外空隙、細(xì)胞外區(qū)域、蛋白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)、質(zhì)膜、細(xì)胞外泌體、細(xì)胞外基質(zhì)、質(zhì)膜組成部分、基底膜、質(zhì)膜外側(cè)及頂端質(zhì)膜等區(qū)域。

2.1.3 UC患者及正常成人結(jié)腸黏膜組織DEGs KEGG通路富集分析結(jié)果 顯著差異表達(dá)基因主要涉及趨化因子信號通路、細(xì)胞因子與細(xì)胞因子受體相互作用通路、軍團(tuán)菌病、腫瘤壞死因子信號通路、補體和凝血級聯(lián)、金黃色葡萄球菌感染、風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、膽汁分泌、百日咳、瘧疾、造血細(xì)胞譜系、細(xì)胞黏附分子(CAMS)、Toll樣受體信號通路、利什曼病、沙門氏菌感染、NOD樣受體信號通路、花生四烯酸代謝、視黃醇代謝、藥物代謝細(xì)胞色素P450等。其中最顯著的5條信號通路分別為趨化因子信號通路、細(xì)胞因子與細(xì)胞因子受體相互作用通路、軍團(tuán)菌病、腫瘤壞死因子信號通路、補體和凝血級聯(lián);涉及基因數(shù)量最多的五條信號通路分別為細(xì)胞因子與細(xì)胞因子受體的相互作用、趨化因子信號通路、腫瘤壞死因子信號通路、軍團(tuán)菌病、補體和凝血級聯(lián)。

2.1.4 UC患者與正常成人結(jié)腸黏膜組織DEGs PPI網(wǎng)絡(luò)及關(guān)鍵靶點分析結(jié)果 PPI網(wǎng)絡(luò)圖得到267個節(jié)點及1 367個相互作用關(guān)系。最終得到白細(xì)胞介素-8(CXCL8)、基質(zhì)金屬蛋白酶9(MMP9)、表皮生長因子(EGF)、白介素1β(IL1B)、趨化因子2(CCL2)、白細(xì)胞介素-1(CXCL1)、白細(xì)胞介素-10(CXCL10)及白細(xì)胞介素2(CXCL2)等8個關(guān)鍵靶點,度值和緊密度最大基因為CXCL8,平均最短路徑長度值最大基因為CXCL2。

2.2 靶向治療UC的中藥成分篩選結(jié)果 靶向作用于CXCL8用于潰瘍性結(jié)腸炎防治的中藥活性成分包括白藜蘆醇、槲皮素、姜黃素、辣椒素、肉桂醛、丁香酚、金雀異黃素、異丁香酚、棕櫚酸等;通過靶向作用于MMP9用于潰瘍性結(jié)腸炎防治的中藥活性成分包括異甘草素、野百合堿、木犀草素、柚皮苷、紫檀芪等;通過靶向作用于IL1B用于潰瘍性結(jié)腸炎防治的中藥活性成分包括兒茶素、魚藤酮、香葉醇、芹菜素、鹿角菜膠、山奈酚、桔梗皂苷D、大蒜素、三七皂苷R1、橙皮素、洋地黃毒苷等;通過作用于EGF用于潰瘍性結(jié)腸炎防治的中藥活性成分包括沒食子酸、柳杉堿、異槲皮素、人參皂苷Rg3等;通過靶向作用于CCL2用于潰瘍性結(jié)腸炎防治的中藥活性成分包括虎杖苷、桑色素、蘿卜硫素、藤黃酚、薯蕷皂素等;通過靶向作用于CXCL1用于潰瘍性結(jié)腸炎防治的中藥活性成分包括迷迭香酸、雷公藤內(nèi)酯醇、香芹酚、綠原酸、巴豆油等;通過靶向作用于CXCL10用于潰瘍性結(jié)腸炎防治的中藥活性成分包括白楊素、新菊粉、紫杉醇等;通過靶向作用于CXCL2用于潰瘍性結(jié)腸炎防治的中藥活性成分包括?;悄懰帷⒓夯夤鹑?、齊墩果酸、熊去氧膽酸、爬山虎內(nèi)酯等。

3 討論

UC為炎癥性腸?。↖BD)的主要亞型之一,UC可增加結(jié)直腸癌的風(fēng)險,其特征是慢性腸道炎癥和由促炎細(xì)胞因子和趨化因子介導(dǎo)的白細(xì)胞持續(xù)流入,病變主要位于結(jié)腸黏膜和黏膜下層,臨床表現(xiàn)為腹痛、腹瀉和黏液膿血便等。UC多見于青壯年發(fā)病,其病理機(jī)制復(fù)雜,涉及遺傳、免疫、環(huán)境等多種因素[9,20]。5-氨基水楊酸、糖皮質(zhì)激素、免疫抑制劑等現(xiàn)代醫(yī)學(xué)藥物治療本病對部分患者療效欠佳且可出現(xiàn)嚴(yán)重的不良反應(yīng)。本文利用基因芯片技術(shù)與生物信息學(xué)方法,旨在宏觀、整體地考察與潰瘍性結(jié)腸炎發(fā)病密切相關(guān)的基因,探尋可能用于潰瘍性結(jié)腸炎防治的中藥活性成分,從而為潰瘍性結(jié)腸炎的臨床診斷與治療提供理論基礎(chǔ)。

DEGs分析結(jié)果顯示,與正常成人結(jié)腸黏膜相比,UC患者結(jié)腸組織存在明顯的差異表達(dá)基因279個,其中上調(diào)基因177個,下調(diào)基因102個。差異倍數(shù)最大的為幾丁質(zhì)酶3樣蛋白1(CHI3L1),CHI3L1為類幾丁質(zhì)酶,屬于哺乳動物幾丁質(zhì)酶基因家族成員[10],雖然無幾丁質(zhì)酶活性,但可與幾丁質(zhì)或殼聚糖結(jié)合。研究[11]表明,分泌的CHI3L1蛋白可參與細(xì)胞對不利刺激的保護(hù)性反應(yīng)。CHI3L1在多種急慢性炎癥性疾病如潰瘍性結(jié)腸炎、消化性潰瘍中均呈高表達(dá),可作為一種新型炎癥標(biāo)志物[12]。

本研究GO分析結(jié)果顯示,UC與正常人結(jié)腸組織顯著性差異表達(dá)基因與炎癥反應(yīng)、趨化性、免疫反應(yīng)、趨化因子介導(dǎo)信號通路、中性粒細(xì)胞趨化性等密切相關(guān)。該結(jié)果與KEGG分析顯示的趨化因子信號通路、細(xì)胞因子與細(xì)胞因子受體的相互作用、腫瘤壞死因子信號通路、細(xì)胞黏附分子(CAMS)、Toll樣受體信號通路相對應(yīng)。這些研究結(jié)果亦與其他學(xué)者的研究結(jié)果相吻合,如有研究顯示免疫因素是潰瘍性結(jié)腸炎發(fā)生的重要因素之一。抗炎細(xì)胞因子IL-4等使腸道發(fā)揮正常免疫功能;促炎細(xì)胞因子IL-1、TNF-α等參與細(xì)胞免疫反應(yīng),激發(fā)腸道炎癥反應(yīng),介導(dǎo)UC發(fā)病。Toll樣受體信號通路為影響UC發(fā)病的核心通路之一。Toll樣受體信號參與激活先天免疫和適應(yīng)性免疫反應(yīng),在炎癥性疾病中起著關(guān)鍵作用,此信號通路的失調(diào)可導(dǎo)致結(jié)腸上皮層止血障礙、過度修復(fù)反應(yīng)、慢性炎癥以及結(jié)直腸癌的發(fā)展[13]。結(jié)腸炎microRNA表達(dá)譜研究[14]顯示,Toll樣受體通路在結(jié)腸炎中與microRNA聯(lián)系緊密,在調(diào)控結(jié)腸炎癥反應(yīng)中發(fā)揮重要作用。

通過構(gòu)建UC患者與正常人顯著性差異表達(dá)基因的PPI網(wǎng)絡(luò),運用cytoHubba中Degree、Closeness、EPC 3種算法分別篩選出基因節(jié)點中心度排名前10的基因,再運用韋恩圖取交集得到3種算法中均存在的8個核心靶點。其中CXCL8、MMP9處于網(wǎng)絡(luò)核心位置。促炎細(xì)胞因子在免疫調(diào)節(jié)方面發(fā)揮重要作用,已被充分證明參與了UC發(fā)病過程炎癥反應(yīng)[15]。CXCL8是CXC趨化因子家族的成員,是炎性反應(yīng)的關(guān)鍵介質(zhì)。CXCL8是誘導(dǎo)中性粒細(xì)胞趨化性和脫粒相關(guān)的促炎性趨化因子。CXCL8蛋白由多種細(xì)胞類型分泌,包括腸上皮細(xì)胞(IEC)。CXCL8 mRNA表達(dá)僅限于具有炎癥活動和黏膜破壞組織學(xué)跡象的區(qū)域[16]。在結(jié)腸炎和結(jié)腸癌中,微環(huán)境成纖維細(xì)胞表現(xiàn)出一種活化的炎癥表型,有助于腫瘤的發(fā)生,并伴有趨化因子CXCL8的過度分泌[17]。

MMPs是一類參與細(xì)胞外基質(zhì)降解和重塑的酶。MMPs已被證實在實驗性炎癥性腸?。↖BD)動物模型、腸細(xì)胞系以及炎性改變組織培養(yǎng)中均參與炎癥過程[18-19]。MMP9是參與IBD發(fā)展有關(guān)的主要金屬蛋白酶。對MMP9缺陷小鼠的研究表明,MMP9可參與IBD發(fā)展的早期階段[18]。雖然MMP9在UC中引發(fā)炎癥的確切機(jī)制尚不清楚,但有研究證明它可參與減少細(xì)胞黏附和中性粒細(xì)胞對損傷部位的吸引。在細(xì)胞系和動物模型的研究中,應(yīng)用金屬蛋白酶抑制劑可減少UC的發(fā)生[20]。本文研究發(fā)現(xiàn)MMP9和CXCL8都集中在網(wǎng)絡(luò)中心,且在三中算法中排名前二。此外,上述兩個基因之間存在直接和間接的相互作用。因此,本文推測MMP9和CXCL8之間的相互作用在UC的發(fā)病機(jī)制中發(fā)揮了重要作用。

CTD結(jié)果顯示,白藜蘆醇、槲皮素、姜黃素對潰瘍性結(jié)腸炎作用強烈,研究價值較高。白藜蘆醇是一種存在于葡萄和葡萄酒中的多酚類化合物,具有多種藥理作用,主要有抗炎、抗氧化、抗癌和免疫調(diào)節(jié)等。它被認(rèn)為是預(yù)防和治療慢性炎癥和自身免疫性疾病中最有前途的天然分子之一。有研究[21]顯示,白藜蘆醇是一種有效的、無毒的、互補的、可替代的治療結(jié)腸炎和潛在結(jié)腸癌的藥物。另有動物實驗研究[22]表明,白藜蘆醇能明顯減輕大鼠體重下降、腹瀉、直腸出血等臨床癥狀,改善疾病活動指數(shù)和炎癥評分。此外,白藜蘆醇喂養(yǎng)的潰瘍性結(jié)腸炎動物可存活并完成治療,而標(biāo)準(zhǔn)飲食喂養(yǎng)的潰瘍性結(jié)腸炎動物死亡率為40%。白藜蘆醇可下調(diào)UC發(fā)病過程p38表達(dá),降低前列腺素E合成酶-1(PGES-1)、環(huán)氧化酶-2(COX-2)和誘導(dǎo)型一氧化氮合酶(iNOS)蛋白的表達(dá),提示白藜蘆醇膳食可能是治療慢性腸道炎癥的一種新方法。

槲皮素(3,3',4',5-7-五羥基黃酮)是一種與山奈酚有相關(guān)性的黃烷醇,通過清除氧自由基、抑制黃嘌呤氧化酶、脂質(zhì)過氧化和螯合金屬離子等多種機(jī)制,防止氧化損傷和細(xì)胞死亡。黃酮類化合物由于其良好的抗氧化和抗輻射特性,越來越被視為有益的膳食成分。此外,黃酮類化合物還具有多種生物學(xué)效應(yīng),包括酶(脂氧合酶、環(huán)氧化酶、一氧化氮合酶)抑制、免疫細(xì)胞調(diào)節(jié)等。研究表明,槲皮素和其他黃酮類化合物能能顯著降低IBD患者和健康人淋巴細(xì)胞的體外氧化應(yīng)激[23]。此外,槲皮素及其衍生物被發(fā)現(xiàn)是幽門螺桿菌刺激的中性粒細(xì)胞呼吸爆發(fā)的抑制劑和非競爭性尿素酶抑制劑,這表明它們可能在治療幽門螺桿菌誘導(dǎo)的胃潰瘍或其他胃腸疾病中具有潛在的應(yīng)用價值[24-25]。另有相關(guān)實驗表明,槲皮素對TNBS(三硝基苯磺酸)誘導(dǎo)的結(jié)腸炎的保護(hù)作用可能與其抗氧化作用有關(guān),提示槲皮素對TNBS誘導(dǎo)的潰瘍性結(jié)腸炎具有治療作用。

姜黃素是一種存在于姜黃中的具有較強生物活性的植物化學(xué)物質(zhì),具有抗炎作用,其藥理作用已在潰瘍性結(jié)腸炎實驗?zāi)P椭斜蛔C實。報道表明,姜黃素對緩解潰瘍性結(jié)腸炎患者的病情有效,是一種安全有效的治療靜止期UC的藥物。實驗[26]表明,姜黃素聯(lián)合美沙拉秦治療輕中度活動期UC的臨床效果優(yōu)于安慰劑和美沙拉秦聯(lián)合治療,且無明顯不良反應(yīng)。提示姜黃素可能是一種安全、有前途的治療UC的藥物。

綜上,本文通過生物信息學(xué)方法深入挖掘潰瘍性結(jié)腸炎芯片數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)了279個顯著性差異表達(dá)基因及其相關(guān)通路,最終結(jié)果發(fā)現(xiàn),UC差異基因涉及炎癥反應(yīng)、趨化性、免疫反應(yīng)、中性粒細(xì)胞趨化性、趨化因子活性、CXCR趨化因子受體結(jié)合、RAGE受體結(jié)合、鈣離子結(jié)合等多個生物學(xué)過程和分子功能,參與了趨化因子信號通路、腫瘤壞死因子信號通路、Toll樣受體信號通路、NOD樣受體信號通路等經(jīng)典的與炎癥和免疫相關(guān)的信號通路。CXCL8、MMP9、EGF、IL1B、CCL2、CXCL1、CXCL10及CXCL2異常表達(dá)可能在UC發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮關(guān)鍵作用。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),白藜蘆醇、槲皮素、姜黃素、兒茶素、魚藤酮、香葉醇、芹菜素等中藥活性成分可能是有效的治療UC的靶向藥物。本文研究結(jié)果可為探究UC的發(fā)病機(jī)制及其早期診斷與治療提供新的思路與方法。

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