周娜
(新疆第八師石河子市疾控中心檢驗科,新疆 石河子)
新型冠狀肺炎是近年來出現的一種新型疾病,在患上此病后,患者主要出現的臨床癥狀為:高熱、咳嗽、疲勞乏力等,威脅著患者的身心健康,需要對其進行及時檢測[1]。目前在臨床中有幾種常用的檢測方法,那么本次研究就對當前常用的SARS-COV-2 基因測序、熒光RT-PCR 核酸檢測、血清特異性抗體檢測這幾種檢測方法的相關情況進行綜述。
基因組指的是生物機體內所有遺傳信息的和,應用高通量測序平臺分析病毒基因組序列,可以成為診斷新冠肺炎的準確依據。經過數據分析結果顯示:SARS-COV-2和SARS-COV 中絕大多數的全基因組序列是十分相近的[2],與蝙蝠具有較高的同源性。但SARS-COV-2 基因組ORF1ab 區(qū)域中的RNA 聚合酶基因(RdRp)與SARSCOV 具有明顯的差異性,它是一種新型的β 群冠狀病毒[3]。
通過創(chuàng)設的研究筆者選取了華南海鮮市場接觸史的2 例急性呼吸癥患者作為研究資料,對研究資料應用基于RNA 的宏基因組下一代測序檢測方式實施檢測,通過檢測,能夠在短時間內檢測出新型冠狀病毒,這是樣本中唯一的病毒。采用的高通量測序檢測方法具有準確性高、敏感性強的特點,通過檢測可以獲得病毒全基因組序列的準確結果,這樣就能夠顯著提升病毒的檢測準確性,且對及時明確疾病病機也有促進作用;同時對變異性病毒的監(jiān)測有指導意義,對于繼續(xù)開發(fā)診斷試劑盒有促進作用。和其他的檢測方法進行比較,基因測序方法的優(yōu)勢較高,但是這種檢測方法的成本較高,對操作人員的要求也很高,從開始檢驗一直到得到檢驗結果需要較長的時間,不能滿足COVID-19 爆發(fā)時的檢測需求。所以,在疫情期間這種檢測方式不太適合,需要結合其他的檢測方式使用。
實時熒光RT-PCR 技術是WHO 推薦的MERS-COV檢測方法之一,目前在我國已經將檢測患者的呼吸道分泌物、血液標本病毒核酸陽性作為COVID-19 的診斷標準之一了[4]。在疫情剛剛出現的時候,我國的相關部門對SARS-COV-2 確認了序列并予以公布,確認了在基因檢測中核酸檢測的保守序列區(qū)域內容,主要包括:開放讀碼框、核衣殼蛋白N 基因。SARS-COV-2 屬于一類RNA 病毒,其是先將RNA 逆轉錄為DNA,若樣本中有靶序列存在,那么TaqMan 探針與模板相結合,DNA 鏈擴增就會有熒光顯示,在熒光達到閾值時即可得到Ct 結果,病毒核酸濃度與Ct 值是成反比例的[5]。此外,對一些弱陽性標本,要將具有更高敏感度的檢測方法開發(fā)出來并應用要檢測中。張鋒教授團隊開發(fā)了一種基于QRISPR 的SHERLOCK 技術的新方法,能夠對SARS-COV-2 的特異性RNA 在短時間內檢測出來。雖然取得了一定的成效,但有一些領域還沒有涉及到,仍然需要繼續(xù)去探索。
此種方法主要是應用膠體金作為示蹤標記物或顯色劑來開展檢測。其基本原理為:將金標抗原包被在硝酸纖維素膜上,如果受檢血液標本中含有SARS-COV-2 特異性抗體的時候,就會形成SARS-COV-2 特異性抗體-金標抗原復合物,借助層析的作用復合物會流向檢測區(qū)域內,由此金標抗原SARS-COV-2 特異性抗體-第二抗體復合物形成,進而出現顯色反應;剩余的那些金標抗原會繼續(xù)發(fā)生擴散,流向質控區(qū)域中,顯色表示結果在控[6]。膠體金法操作簡單,短時間內即可出結果,且樣本不需要離心,在檢測大數量人群中比較適用比較適用[7]。
這種檢測方法主要是指把發(fā)光分析與免疫反應進行結合來實施的檢測方法,此種檢測方法能夠對未知的抗體進行定量檢測,當前在臨床中應用十分廣泛。其基本原理為:如果樣本中含有SARS-COV-2 抗體與熒光素標記抗原結合,將包被抗熒光素抗體的磁微粒添加進入,那么即可得到SARS-COV-2 抗體-熒光標記抗原-磁微粒復合物1,然后將其放于特定環(huán)境中進行沉淀、去上清,將酶標二抗加入其中,得到酶標二抗-復合物1 結合體,將其上清去掉,然后加入酶促底物,底物受到酶催化進而會產生發(fā)光現象,之后通過計算機的處理得到待測抗體的濃度[8,9]。
相關研究結果顯示,應用化學發(fā)光法檢測了確診組患者、疑似組患者與對照組人員(共計102 例的血漿標本),通過檢測得到的結果為:SARS-COV-2IgM/IgG 抗體檢測靈敏度為96.0%,特異度為100%。另有相關研究結果顯示:應用化學發(fā)光微粒子免疫檢測法對血清SARS-COV-2 總抗體實施定量檢測,得到的結果為:此種檢測方法的靈敏度為93.5%,特異度為100%,準確度96.8%。檢測結果顯示:化學發(fā)光法檢測SARS-COV-2 總抗體的效果要顯著好于膠體金檢測法[10],在SARS-COV-2 感染的檢測中具有較好的實用價值。
酶聯(lián)免疫吸附試驗(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)主要是應用酶的催化作用所實施的檢驗。ELISA 需要實施離心操作,操作程序復雜,檢測需要較長時間,而且當前還沒有此種方法用于檢測新冠病毒檢測產品的出現。
血清學抗體檢測方式的優(yōu)點為:(1)操作方法簡單,對于條件簡陋的醫(yī)院也可以開展,比較適合用于大量樣本的篩檢過程中。(2)有助于提升熒光RT-PCR 核酸檢測的檢測準確性。(3)對患者體內抗體含量的變化情況能夠進行實時監(jiān)測出來,為疾病的及時檢測提供準確依據。(4)用于傳染病既往感染規(guī)律的流行病學研究,對于促進SARSCOV-2 等病毒的感染防治和疫苗研發(fā)有重要依據[11]。
SARS-COV-2 的傳染性是比較強的、傳播速度快,要及時發(fā)現、及時隔離、盡早治療。但是所采取的基因測序檢測方法的時間較長,PCR 核酸檢測的全覆蓋率較高,并且因為SARS-COV-2 與其他冠狀病毒的同源性較高,應用血清抗體檢測方法容易發(fā)生N蛋白和S 蛋白的抗原交叉反應現象[12,13],因此,如果只是用單一的檢測方法往往不能達到理想的檢測效果,要采取兩種甚至兩種以上的檢測方式實施檢測,才能不斷提高檢測工作質量與效率[14,15]。