国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

環(huán)狀RNA及其對腫瘤作用的研究進展

2020-12-29 11:36:52劉建林趙小蓉汪萍劉康別俊
山東醫(yī)藥 2020年25期
關鍵詞:內(nèi)含子大腸癌外顯子

劉建林,趙小蓉,汪萍,劉康,別俊

1川北醫(yī)學院,四川南充 637000;2南充市中心醫(yī)院

環(huán)狀RNA(circRNA)是一類由mRNA 3′及5′末端首尾相連形成的無蛋白編碼功能的RNA分子,主要由內(nèi)含子或外顯子通過反向拼接或套索內(nèi)含子的方式產(chǎn)生[1]。長期以來,限于檢測技術的制約,circRNA被認為是轉(zhuǎn)錄后加工過程中的錯誤產(chǎn)物,并未引起重視。隨著測序技術的發(fā)展,發(fā)現(xiàn)circRNA廣泛存在于真核細胞中,且穩(wěn)定表達,在人類細胞基因表達調(diào)控中起重要作用[2]。目前研究表明,circRNA在很多腫瘤中存在異常表達,且與腫瘤分期及類型存在相關性[3],提示其在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮重要的調(diào)控作用,有望為腫瘤的診斷、治療提供新的思路。circRNA在腫瘤中的作用已成為非編碼RNA家族中新的研究熱點?,F(xiàn)對circRNA的形成機制、生物學特征、功能及其在腫瘤中作用等方面進行闡述。

1 circRNA

1.1 形成分類及特征 circRNA主要有內(nèi)含子環(huán)化和外顯子環(huán)化兩類形成方式。根據(jù)生成合成機制circRNA可以分為三種類型:外顯子circRNA、內(nèi)含子circRNA和外顯子—內(nèi)含子circRNA。目前成環(huán)機制有:在mRNA前體上,連續(xù)的組裝小核糖體蛋白催化外顯子下游的5′供體位點連接到上游的3′受體位點,首尾插接形成環(huán)化,通過剪切形成circRNA;部分circRNA外顯子兩側(cè)內(nèi)含子中含有反向互補序列,在剪切位點上形成RNA雙鏈,通過可變剪切形成帶內(nèi)含子和不帶內(nèi)含子兩種circRNA;RNA結(jié)合蛋白(RBPs)是一類涉及基因轉(zhuǎn)錄和翻譯的蛋白,是circRNA的基本功能元素,通過將RPBs結(jié)合到外顯子側(cè)翼的內(nèi)含子上,促進circRNA的形成。不同于線性RNA,circRNA是共價閉合的單鏈環(huán)狀RNA分子,無5′帽和3′poly(A)尾巴。這種結(jié)構(gòu)特征使得circRNA對核糖核酸酶[如核糖核酸外切酶R(RNase R)和核酸外切酶]的消化具有抗性,相比線性mRNA的穩(wěn)定性更高、半衰期更長[4]。此外,研究還發(fā)現(xiàn),circRNA多由外顯子組成,少數(shù)由內(nèi)含子環(huán)化形成,在物種間進化上具有高度保守性[5];且在一定組織細胞來源及不同發(fā)育階段中具有時序特異性[6]。

1.2 功能 研究發(fā)現(xiàn)circRNA可充當miRNA海綿,從而發(fā)揮生物學作用[7]。circRNAs是一類競爭性內(nèi)源RNAs,可以與miRNA結(jié)合而在轉(zhuǎn)錄后水平上影響miRNAs的穩(wěn)定性和轉(zhuǎn)錄,導致miRNA相關靶基因表達水平發(fā)生改變[8,9]。同時circRNAs通過多種途徑參與調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄。研究發(fā)現(xiàn),部分外顯子—內(nèi)含子circRNA可以與U1小核糖核蛋白(snRNP)相互作用,通過與RNA聚合酶Ⅱ結(jié)合,促進親本基因轉(zhuǎn)錄[10]。剪接因子外顯子可以環(huán)化形成circRNA,它與前體mRNA的線性剪接競爭,影響線性RNA的形成,起到調(diào)節(jié)相關基因表達的作用。此外,circRNA作為非編碼RNA,被認為無法依靠帽子相關翻譯機制進行翻譯,并且,先前的多核糖體梯度分析和核糖體譜分析表明,大多數(shù)circRNA與多核糖體無關。然而最近一些研究通過構(gòu)建了一個包含無限閱讀框的環(huán)狀RNA,證明這種circRNA可以模仿原核生物中RNA翻譯進行DNA滾環(huán)擴增(RCA)[11],這提示circRNA可以編碼蛋白質(zhì),具有翻譯功能。

近來研究發(fā)現(xiàn),circRNA參與細胞信號傳導途徑,例如促分裂原激活蛋白激酶/細胞外調(diào)節(jié)蛋白激酶、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B和Wnt/β-catenin途徑[12,13]。作為上游的調(diào)節(jié)分子,circRNA通過與miRNA競爭釋放下游分子而發(fā)揮作用。目前已發(fā)現(xiàn)circRNA參與腫瘤發(fā)生、增殖、凋亡和侵襲等過程,有望通過干預circRNA水平來達到治療腫瘤的目的。腫瘤細胞具有免疫原性,但腫瘤可以逃避免疫監(jiān)視。實際上,在腫瘤發(fā)展的整個過程中,細胞必須克服內(nèi)部和外部免疫的障礙才能成為腫瘤,只有癌細胞逃脫免疫監(jiān)視并通過各種免疫逃逸機制克服免疫功能時,腫瘤才能進展或殺死宿主?,F(xiàn)有報道指出,circRNA可以用作競爭性內(nèi)源RNA來幫助腫瘤逃避免疫監(jiān)視,且在免疫檢查點治療期間,circRNA表達的變化可能會影響治療的效果[14],但具體機制尚不明確。

2 circRNA對各類腫瘤的作用

2.1 乳腺癌 Fang等[15]通過微陣列分析了人類乳腺癌和良性組織中circRNA的水平,發(fā)現(xiàn)circRNA circ-Ccnb1在癌癥樣品中被下調(diào)。Chen等[16]通過實驗表明,三陰性乳腺癌(TNBC)細胞系中的circEPSTI1(hsa_ circRNA_000479)水平上升,是TNBC患者生存的獨立預后指標。上述研究提示異常表達的circRNR有助于TNBC的早期診斷及預后判斷。此外,Chen等[16]研究還發(fā)現(xiàn),circEPSTI1作為miRNA海綿,可與miR-4753和miR-6809結(jié)合,調(diào)節(jié)B細胞淋巴瘤/白血病11A基因表達,影響TNBC細胞增殖和凋亡。Gao等[17]研究發(fā)現(xiàn),circ_0006528在TNBC組織和細胞系中過度表達,且與晚期腫瘤淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和預后不良密切相關。circ_0006528作為競爭性內(nèi)源RNA,可通過miR-7-5p海綿作用并激活絲分裂原活化蛋白激酶/細胞外信號調(diào)節(jié)激酶信號轉(zhuǎn)導通路來促進TNBC進展。表明circRNA可通過其miRNA海綿作用,影響TNBC相關靶基因的表達及其信號通路,參與TNBC的發(fā)生發(fā)展。

2.2 肺癌 Dai等[18]發(fā)現(xiàn),circ0006916在惡性轉(zhuǎn)化細胞以及肺癌細胞和組織中下調(diào),其通過與miR-522-3p結(jié)合并抑制PH結(jié)構(gòu)域富含亮氨酸重復序列的蛋白磷酸酶1活性而成為肺癌的腫瘤抑制因子,通過減緩細胞周期進程來抑制細胞增殖。Zhu等[19]報道,hsa_circ_0013958在肺腺癌組織中明顯上調(diào),同時被鑒定為miR-134的海綿,能夠上調(diào)癌基因細胞周期蛋白D1,在非小細胞肺癌(NSCLC)的發(fā)生發(fā)展中起著關鍵作用,與TNM分期和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關。表明circRNA可通過其miRNA海綿作用,參與肺癌的發(fā)生發(fā)展,并對肺癌的嚴重程度起預測作用。融合基因是由染色體異常易位引起的兩個分離基因的雜交。融合基因棘皮微管相關蛋白樣4(EML4)—間變性淋巴瘤激酶(ALK)存在于4%~5%的NSCLC病例中,并通過激活ALK產(chǎn)生致癌活性[20]。融合基因不僅編碼與腫瘤發(fā)生有關的融合蛋白,而且產(chǎn)生非編碼RNA,從而促進腫瘤的發(fā)展[20]。例如,混合譜系白血病(MLL)/AF9融合基因(f-circM9)產(chǎn)生的circRNA(F-circEA)就具有促增殖和促癌活性。值得注意的是,F(xiàn)-circEA主要存在于EML4-ALK陽性NSCLC患者血漿中,表明F-circEA可能是診斷EML4-ALK陽性NSCLC患者的潛在生物標志物。

2.3 結(jié)直腸癌 circRNR表達譜在結(jié)直腸癌細胞系和組織中有顯著的豐度變化,與結(jié)直腸癌的轉(zhuǎn)移、侵襲、預后等密切相關。Hsiao等[21]研究發(fā)現(xiàn),circCCDC66在結(jié)直腸癌中表達升高,并與結(jié)直腸癌的不良預后有關。circCCDC66可通過與miR-33b、miR-93和miR-185結(jié)合來調(diào)節(jié)癌基因C-myc的表達。Zeng等[22]研究報道,circHIPK3在大腸癌組織和細胞系中顯著上調(diào),并且與轉(zhuǎn)移和晚期臨床分期呈正相關。circHIPK3基因敲除可顯著抑制大腸癌細胞的增殖、遷移、侵襲,并可誘導細胞凋亡,抑制大腸癌的生長和體內(nèi)轉(zhuǎn)移。上調(diào)的circHIPK3可通過增加miR-7靶向原癌基因胰島素樣生長因子1受體(IGF1R)、表皮生長因子受體(EGFR)、陰陽因子1(YY1)的表達,有效逆轉(zhuǎn)miR-7誘導的大腸癌細胞惡性表型的衰減。Li等[23]研究指出,circITGA7在大腸癌中具有腫瘤抑制作用,通過抑制Ras信號通路并促進ITGA7的轉(zhuǎn)錄來抑制大腸癌細胞的增殖和轉(zhuǎn)移。

2.4 食管癌 Wang等[24]研究發(fā)現(xiàn),circ-TTC17在食管鱗狀細胞癌(ESCC)細胞和組織中明顯過表達,共有20個miRNAs(如miR-153、miR-217、miR-224和miR-370)和相應的靶mRNA與circ-TTC17發(fā)生相互作用,并且體外實驗表明,circ-TTC17促進了ESCC細胞的增殖和遷移。上調(diào)的circ-TTC17有可能成為將來ESCC診斷、治療和預后的新生物標記物。放療期間獲得的放射抵抗被認為是局部腫瘤復發(fā)或治療失敗的最重要原因。Su等[25]調(diào)查circRNA在食管癌放射抵抗中的作用,結(jié)果發(fā)現(xiàn),與人類親代細胞系KYSE-150相比,人類抗輻射食管癌細胞系KYSE-150R中有57個circRNA顯著上調(diào),而17個circRNA則下調(diào),這些失調(diào)的circRNA可能參與了放射抗性的發(fā)展。隨后的circRNAmiR共表達網(wǎng)絡分析表明,circRNA_001059和circRNA_000167是潛在circRNA/miRNA網(wǎng)絡中最重要的因素。這些結(jié)果提示,異常表達的circRNA與食管癌細胞的抗輻射性有關。

2.5 其他腫瘤 circRNA不僅在實體腫瘤中發(fā)揮作用,而且可參與血液系統(tǒng)腫瘤發(fā)生發(fā)展。Guarnerio等[26]研究發(fā)現(xiàn),在急性早幼粒細胞白血病細胞中,PML-RARa融合基因不僅可以翻譯融合蛋白,還可以形成circRNA f-circM9融合蛋白。功能增強測定和功能喪失測定表明,f-circM9發(fā)揮原癌基因作用,有助于急性早幼粒細胞白血病中的細胞轉(zhuǎn)化。另外,f-circRNA賦予了體內(nèi)治療抗性,并與其他致癌因子(如融合蛋白)協(xié)同作用,從而促進癌癥的發(fā)展。2020年,Wu等[27]首次報道線粒體circRNA促癌功能研究,結(jié)果顯示mc-COX2是在慢性淋巴細胞白血病(CLL)血漿中高度表達的重要mt-circRNA(線粒體基因組衍生的circRNA),且在CLL患者的血漿外泌體中高表達。其生物學和臨床特征也提示mc-COX2的上調(diào)與白血病的發(fā)生和CLL患者的生存率呈正相關;功能研究發(fā)現(xiàn),通過沉默CLL細胞中的mc-COX2基因,可以增強抗腫瘤作用。這提示mt-circRNA在CLL中具有促癌作用,且在血漿中表達,為液體活檢方面提供了可能。雖然在血液系統(tǒng)腫瘤中circRNA報道較少,但已初步成為血液腫瘤領域研究熱點。

綜上所述,circRNA通過miRNA海綿作用、蛋白質(zhì)結(jié)合分子、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)物、參與腫瘤逃逸及免疫等生物學功能參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展,并與腫瘤預后轉(zhuǎn)歸有著密切關系。血漿和組織樣品中存在大量的circRNA,circRNA有望成為癌癥篩查及臨床診斷、治療和預后評估的生物標志物;未來circRNA在腫瘤早期篩查、腫瘤治療等領域具有巨大潛力。

猜你喜歡
內(nèi)含子大腸癌外顯子
外顯子跳躍模式中組蛋白修飾的組合模式分析
線粒體核糖體蛋白基因中內(nèi)含子序列間匹配特性分析
外顯子組測序助力產(chǎn)前診斷胎兒骨骼發(fā)育不良
不同方向內(nèi)含子對重組CHO細胞中神經(jīng)生長因子表達的影響
更 正
生物學通報(2019年1期)2019-02-15 16:33:43
外顯子組測序助力產(chǎn)前診斷胎兒骨骼發(fā)育不良
內(nèi)含子的特異性識別與選擇性剪切*
大腸癌組織中EGFR蛋白的表達及臨床意義
FAP與E-cadherinN-cadherin在大腸癌中的表達及相關性研究
人類組成型和可變外顯子的密碼子偏性及聚類分析
浦北县| 西安市| 红原县| 仁布县| 工布江达县| 普陀区| 清河县| 平乐县| 石家庄市| 新源县| 鄂州市| 专栏| 即墨市| 屏东市| 郯城县| 新竹市| 自贡市| 高邑县| 兴城市| 石城县| 兖州市| 岐山县| 资阳市| 新化县| 景德镇市| 连云港市| 呼玛县| 齐齐哈尔市| 庐江县| 怀来县| 凌云县| 应城市| 如东县| 内丘县| 当阳市| 乌审旗| 广汉市| 会昌县| 麟游县| 台北县| 印江|