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通過合成生物學(xué)可改造非豆科植物進(jìn)行固氮(2020.8.8 iPlants)

2020-08-25 07:45
三農(nóng)資訊半月報(bào) 2020年15期
關(guān)鍵詞:賴氨酸結(jié)構(gòu)域突變體

植物通過編碼賴氨酸基序(LysM)受體以識(shí)別微生物激發(fā)子近而驅(qū)動(dòng)細(xì)胞內(nèi)信號(hào)傳導(dǎo)調(diào)控微生物的定植。2020年8月7日,《Science》雜志在線發(fā)表了來自丹麥奧爾胡斯大學(xué)Simona Radutoiu和Kasper R.Andersen研究組題為“Ligand-recognizing motifs in plant LysM receptors are major determinants of specificity”的研究論文。

該研究以豆科模式植物百脈根為研究材料在關(guān)于賴氨酸基序(LysM)受體如何特意識(shí)別特意配體的研究中取得重大進(jìn)展。該研究為在非豆科植物中進(jìn)行受體改造從而使其能識(shí)別根瘤菌提供了重要的理論指導(dǎo)。

在病原菌侵染過程中幾丁質(zhì)(Chitin)往往作為信號(hào)分子被賴氨酸基序(LysM)受體所(例如CERK1)識(shí)別從而激活植物免疫反應(yīng)。在根瘤菌與豆科植物建立共生關(guān)系的過程中根瘤菌分泌的信號(hào)分子(結(jié)瘤因子)同樣被被賴氨酸基序(LysM)受體(結(jié)瘤因子受體)所識(shí)別。例如在百脈根中識(shí)別幾丁質(zhì)參與免疫反應(yīng)的受體是CERK6,識(shí)別結(jié)瘤因子參與固氮共生信號(hào)受體是NFR1,而且二者的蛋白結(jié)構(gòu)極為相似。那么植物是怎么通過不同的受體精確的識(shí)別各自的配體的呢?賴氨酸基序(LysM)受體通常在胞外存在3個(gè)串聯(lián)賴氨酸基序,本研究中發(fā)現(xiàn)其第一個(gè)賴氨酸基序(LysM1)中的識(shí)別基序是受體特異性的主要決定因素。

首先作者通過在CERK6與NFR1兩個(gè)受體之間進(jìn)行胞外結(jié)構(gòu)域(賴氨酸基序)與胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域(蛋白激酶結(jié)構(gòu)域)互換?;Q后用相應(yīng)的嵌合體蛋白(chimeras protein)其互補(bǔ)nfr1突變體的結(jié)瘤表型(根瘤數(shù)目,nfr1突變體不能結(jié)瘤)與cerk6突變體的免疫表型(活性氧水平)。結(jié)果發(fā)現(xiàn)只要是嵌合體蛋白的胞外域來自NFR1其就能互補(bǔ)nfr1突變體不結(jié)瘤的表型。但是要完全互補(bǔ)cerk6突變體的免疫表型不僅需要其胞外結(jié)構(gòu)域,其激酶域同樣重要??傊?,LysM胞外域?qū)τ诮Y(jié)瘤和免疫是至關(guān)重要。

因?yàn)橘嚢彼峄颍↙ysM)受體通常在胞外存在3個(gè)串聯(lián)賴氨酸基序(LysM1,LysM2,LysM3),在確定了LysM胞外域?qū)τ诮Y(jié)瘤和免疫是至關(guān)重要后。作者近一步在三個(gè)賴氨酸基序之間進(jìn)行相互調(diào)換發(fā)現(xiàn)對(duì)結(jié)瘤因子和幾丁質(zhì)的選擇性是由LysM1域所決定。為了近一步剖析LysM1中哪些元素對(duì)于NFR1和CERK6功能很重要,作者確定了四個(gè)具有實(shí)質(zhì)性序列差異的結(jié)構(gòu)區(qū)域(I to IV),并再次對(duì)不同區(qū)域進(jìn)行了調(diào)換。實(shí)驗(yàn)結(jié)構(gòu)表明第II區(qū)和第IV區(qū)是受體功能所必需的。為近一步證實(shí)這個(gè)結(jié)果作者同時(shí)在不同來源的結(jié)瘤因子受體(百脈根的NFR1域苜蓿的LYK3)之間同樣同樣進(jìn)行了分析,實(shí)驗(yàn)結(jié)果同樣表明了受體LysM1第II區(qū)和第IV區(qū)的必須性。為了更加清楚的在分子水平解析賴氨酸基序識(shí)別配體的特異性,作者獲得了LYK3蛋白胞外域的晶體結(jié)構(gòu)對(duì)重要保守氨基酸進(jìn)行了分析。

近一步作者通過對(duì)不同受體(NFR1與LYK3)進(jìn)行工程改造近而改變受體識(shí)別結(jié)瘤因子的特異性,在該實(shí)驗(yàn)過程中發(fā)現(xiàn)LysM1中的第III在不同豆科作物中是變化的可能起到建立物種特異性的作用。最終作者嘗試重新編程CERK6受體以識(shí)別結(jié)瘤因子介導(dǎo)結(jié)瘤過程。

綜上所述,該研究以豆科模式植物百脈根為研究材料在關(guān)于賴氨酸基序(LysM)受體如何特意識(shí)別特意配體的研究中取得重大進(jìn)展。該研究為在非豆科植物中進(jìn)行受體改造從而使其能識(shí)別根瘤菌提供了重要的理論指導(dǎo)。

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