KeyGene是一家專注于提高作物產(chǎn)量和質(zhì)量跨國(guó)農(nóng)業(yè)生物技術(shù)公司，該公司的科學(xué)家們于近期首次報(bào)道了適應(yīng)性DNA測(cè)序（adaptive DNA sequencing）在植物中的成功應(yīng)用，利用Oxford Nanopore Technologies公司的MinION測(cè)序設(shè)備（具有強(qiáng)大的GPU配置和讀取軟件），研究小組成功地將瓜類基因組中的800個(gè)區(qū)域進(jìn)行了8倍擴(kuò)增，并對(duì)這些區(qū)域進(jìn)行了選擇性測(cè)序。

這項(xiàng)突破性發(fā)現(xiàn)將進(jìn)一步減少勘測(cè)基因組中已知的、與重要植物性狀有關(guān)的區(qū)域（如果實(shí)的顏色、味道或?qū)Σ≡w的抵抗力）所需的時(shí)間和資金。通過對(duì)這些區(qū)域的詳細(xì)測(cè)序和分析，可以解釋變異的原因并將其應(yīng)用于育種。于此，改良品種可以更快地被推向市場(chǎng)。

適應(yīng)性測(cè)序允許對(duì)選擇出的DNA區(qū)域進(jìn)行測(cè)序。當(dāng)DNA片段穿過測(cè)序器的小孔時(shí)，該設(shè)備將產(chǎn)生一系列核苷酸。一臺(tái)功能強(qiáng)大的計(jì)算機(jī)將生成的序列與研究人員研究的區(qū)域的信息進(jìn)行比較。當(dāng)計(jì)算機(jī)斷定該片段不屬于目標(biāo)區(qū)域時(shí)，小孔將收到信號(hào)，在對(duì)DNA片段進(jìn)行完全測(cè)序之前將其推出該區(qū)域。然后這個(gè)小孔將再次作用于樣本中的下一個(gè)DNA片段。

這一切都在不到一秒的時(shí)間內(nèi)發(fā)生，并且需要實(shí)時(shí)比較測(cè)序器中通過512個(gè)小孔的DNA片段的序列，以及植物DNA選定區(qū)域的所有序列。

來源：KeyGene