任珊珊
(國家圖書館,北京 100081)
空氣微生物廣泛存在于環(huán)境中,主要包括細(xì)菌、真菌、病毒等生命體,其中已發(fā)現(xiàn)的真菌有4萬余種,主要粒徑分布在3~100μm[1]。它們的存在不僅威脅人類健康,更會對古籍、檔案和文物等造成不可逆轉(zhuǎn)的損壞。近年來,針對空氣中真菌的研究已經(jīng)成為圖書館、檔案和文博行業(yè)的基礎(chǔ)研究內(nèi)容之一。故宮博物院采用平皿沉降法在各個庫房采樣,其中書畫組存放的東西司庫等8個庫房主要有枝孢霉,黃曲霉等霉菌[2]。三峽博物館文物庫房中空氣真菌主要種屬為曲霉屬(70%)和青霉屬(13%)[3]。放線菌、枝孢屬、青霉屬和鏈格孢屬等大量存在于魏晉五號壁畫墓的墓室空氣中,成為威脅磚壁畫保存的重要污染源[4]。中國農(nóng)業(yè)大學(xué)圖書館空氣中霉菌主要為青霉屬和曲霉屬[5]。
北京明杰藍(lán)天FA-1六級篩孔式空氣微生物采樣器,德國MEMMERT IPP200培養(yǎng)箱,上海博迅YXQ-LS-100G立式壓力蒸汽滅菌器,蘇州凈化SW-CJ-2FD雙人超凈臺,太倉強(qiáng)樂THZ-C型空氣恒溫振蕩器,德國SIGMA 3-30k離心機(jī),日本Nikon 90i顯微鏡,美國Bio-Rad MyCylerPCR儀,北京六一DYY-6C電泳儀電源,上海精科WFH-201B紫外透射反射儀和四川優(yōu)普UPT-30L純水機(jī)等。
瓊脂糖、瓊脂、葡萄糖、Tris-硼酸和無水乙醇等(國藥試劑);上樣緩沖液、DNA ladder和GoldView核酸染色劑(Solarbio);乳酸酚棉藍(lán)染色劑(青島海博);Taq聚合酶(Apexbio);通用型基因組提取試劑盒、為世紀(jì)瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(康為世紀(jì))等。
2019年4月在國家圖書館古籍書庫進(jìn)行采樣。書庫配備有恒溫恒濕空調(diào)機(jī)組,用于控制書庫內(nèi)的溫度和相對濕度。采樣期間,書庫溫度為24℃,相對濕度為48%。采用撞擊式采樣法,參數(shù)設(shè)置為采樣速度28.3L/min,采樣2.5min。采樣時(shí)使用PDA培養(yǎng)基。培養(yǎng)基倒置放入生物培養(yǎng)箱。培養(yǎng)條件為28℃±1℃,培養(yǎng) 7d。
平板點(diǎn)植接種培養(yǎng),每皿三點(diǎn)。新接種的培養(yǎng)基倒置于生物培養(yǎng)箱中,28℃±1℃,培養(yǎng)7d。培養(yǎng)結(jié)束后記錄菌落形態(tài)。取小塊真菌培養(yǎng)物置于載玻片,乳酸酚棉藍(lán)染色法染色后置于顯微鏡下觀察真菌菌絲和孢子的形態(tài)特征。
提取樣品總DNA。使用通用型基因組DNA提取試劑盒,根據(jù)操作說明提取篩選出的真菌基因組DNA。提取后的DNA于-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>
目標(biāo)片段擴(kuò)增(PCR)。使用真菌ITS PCR通用引物。ITS1:5’-CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA-3’;ITS4:5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’。配置PCR 反應(yīng)體系。2XTaq-pcr MIX:25μL;ITS1(10μM):2μL;ITS4(10μM):2μL; 基因組 DNA:2μL;ddH2O:19μL, 總計(jì)50μL。反應(yīng)程序?yàn)椋?5℃預(yù)變性5min;94℃變性 30s;55℃退火 30s;72℃延伸 1min;設(shè)定儀器后開始PCR擴(kuò)增試驗(yàn),循環(huán)35次;72℃延伸10min。獲得PCR產(chǎn)物。
目標(biāo)片段的確定與回收。取PCR產(chǎn)物進(jìn)行2%瓊脂糖凝膠電泳試驗(yàn),待DNA Marker各條帶跑開顯示清晰后,結(jié)束電泳。紫外燈下觀察凝膠中的DNA條帶,并切出含有目標(biāo)DNA的凝膠。根據(jù)回收試劑盒提供的方法進(jìn)行DNA回收。
基因測序及序列分析。將回收產(chǎn)物送至北京睿博興科公司進(jìn)行測序。利用BLAST方式將測序所得序列在GenBank數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行比對,獲得和測序DNA序列同源性最高的真菌ITS序列,確認(rèn)樣品的種屬信息。
采集得到的樣品根據(jù)形態(tài)特征可歸類為5種真菌,分別編號為 F-01、F-02、F-03、F-04 和 F-05。對它們進(jìn)行純化培養(yǎng),觀察其菌落及菌體形態(tài),并進(jìn)行后續(xù)的分子鑒定工作。
將選出的5種真菌進(jìn)行點(diǎn)種純化培養(yǎng)7d后,觀察其真菌菌落形態(tài),可發(fā)現(xiàn)不同真菌產(chǎn)生的色素各不相同,菌落質(zhì)地也有很大區(qū)別,具體特征見表1。
表1 真菌菌落形態(tài)特征
用乳酸酚棉藍(lán)染色法挑菌制片,鏡檢觀察真菌菌體形態(tài),放大倍數(shù)均為400×,結(jié)果如圖1所示??梢钥闯觯篎-01菌絲分隔,分生孢子梗較短,分生孢子呈棒狀;F-02菌絲不分隔,分生孢子梗較長。分生孢子球形或橢圓形;F-03菌絲分隔,孢子呈卵圓形;F-04細(xì)胞個體為圓形或卵圓形,有明顯的壓制現(xiàn)象;F-05分生孢子頭近球形,小梗雙層,放射狀排列,頂端有鏈形孢子。
圖1 真菌顯微形態(tài)特征
提取5種優(yōu)勢真菌的基因組DNA,利用真菌ITS PCR擴(kuò)增通用引物對基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到目標(biāo)基因,即真菌ITS基因。瓊脂糖凝膠電泳確認(rèn)后回收DNA,結(jié)果如圖2所示。將獲得的產(chǎn)物測序后,得到其序列信息。在GenBank中比對得到同源性最高的DNA片段的GenBank登錄號,確定優(yōu)勢真菌的種屬信息,見表2。得到結(jié)果:古籍書庫空氣中的優(yōu)勢真菌有鏈格孢屬的極細(xì)鏈格孢霉,擬青霉屬的擬青霉SL95,枝孢霉屬的枝孢樣枝孢霉,隱球酵母屬的大隱球酵母和曲霉屬的雜色曲霉。
圖2 優(yōu)勢真菌ITS基因凝膠電泳
表2 菌種鑒定信息
在古籍書庫中進(jìn)行空氣真菌采樣,篩選出5種優(yōu)勢真菌,結(jié)合形態(tài)學(xué)和分子鑒定結(jié)果,發(fā)現(xiàn)這五種真菌分別為鏈格孢屬的極細(xì)鏈格孢霉,擬青霉屬的擬青霉SL95,枝孢霉屬的枝孢樣枝孢霉,隱球酵母屬的大隱球酵母和曲霉屬的雜色曲霉。這與2013年所作調(diào)查北京市居家環(huán)境空氣中主要真菌種類青霉屬、枝孢屬、曲霉屬、鏈格孢屬和莖點(diǎn)霉屬接近[6]。本次研究明確了古籍書庫中優(yōu)勢空氣真菌種類,可為書庫的日常有害生物預(yù)防和真菌爆發(fā)性增長時(shí)的治理提供必要的技術(shù)支持。