于佳印,趙庭,劉中美,周麗,周哲敏
(江南大學(xué) 生物工程學(xué)院,江蘇 無錫,214122)
L-天冬氨酸-β-脫羧酶(L-aspartate-β-decarboxylase, EC 4.1.1.12 Asd)又稱L-天冬氨酸-4-脫羧酶,以5′-磷酸吡哆醛(pyridoxal5-phosphatemonohydrate,PLP)為輔酶因子[1-2],是目前為止自然界中發(fā)現(xiàn)的唯一的氨基酸-β-脫羧酶,可以催化底物L(fēng)-天冬氨酸脫去β位羧基生成L-丙氨酸和CO2,α-酮戊二酸對(duì)其脫羧反應(yīng)具有激活作用[3]。同時(shí),L-天冬氨酸-β-脫羧酶是一個(gè)多功能酶,具有較低的轉(zhuǎn)氨活性以及β-消除活性[4]。L-天冬氨酸-β-脫羧酶一般以同型十二聚體形式存在,單亞基分子質(zhì)量均為60 kDa左右[5]。已有研究報(bào)道,L-天冬氨酸-β-脫羧酶存在于哺乳動(dòng)物細(xì)胞[6]以及多種微生物中,如假單胞菌[7]、糞產(chǎn)堿菌[8]、糞腸球菌[9]、放線菌[10]以及真菌[11],目前已用來生產(chǎn)L-丙氨酸和拆分DL-天冬氨酸生產(chǎn)D-天冬氨酸[12]。關(guān)于L-天冬氨酸-β-脫羧酶來源與性質(zhì)的研究始于20世紀(jì)50年代,主要集中在20世紀(jì)70年代至21世紀(jì)初。
L-丙氨酸具有重要的生理功能,如參與糖代謝、在轉(zhuǎn)氨反應(yīng)中提供氨基,并且參與體內(nèi)氨基酸循環(huán)、氨基酸與糖原轉(zhuǎn)換等過程。同時(shí),L-丙氨酸在日化、醫(yī)藥、食品等領(lǐng)域均有廣泛用途[13]。在日化領(lǐng)域,L-丙氨酸是合成氨基酸表面活性劑的原料[14];在醫(yī)藥應(yīng)用方面,L-丙氨酸是合成VB6和L-氨基丙醇[15](鹽酸左氧氟沙星合成前體)的主要原料;同時(shí),L-丙氨酸是復(fù)合氨基酸注射液和輸液的主要成分,也是心肌功能增強(qiáng)劑。它可以用于配制組織培養(yǎng)基和生化試劑,也可用于肝功能檢測(cè)。在食品領(lǐng)域,L-丙氨酸具有甜味和鮮味,能與谷氨酸鈉制成混合調(diào)味品,可調(diào)制并明顯改善食品風(fēng)味,而不破壞食品原有的風(fēng)格[16]。
目前,L-丙氨酸的制備方法主要包括化學(xué)合成法、蛋白質(zhì)水解法、發(fā)酵生產(chǎn)法與酶轉(zhuǎn)化法。酶促反應(yīng)具有催化效率高、反應(yīng)條件溫和、立體選擇性強(qiáng)、綠色環(huán)保節(jié)能減排等優(yōu)點(diǎn),已經(jīng)被投入到了大規(guī)模的工業(yè)生產(chǎn)當(dāng)中,是如今工業(yè)生產(chǎn)上應(yīng)用最廣泛的合成L-丙氨酸的工藝[17]。2000年,CHEN等[8]首次克隆了AlcaligenesfaecalisCCRC 11585來源的Asd酶,并在大腸桿菌中實(shí)現(xiàn)異源表達(dá),在45 ℃、pH 5.0條件下該酶具有最高比酶活力215 U/mg。2006年,WANG等[7]克隆并異源表達(dá)了Pseudomonassp.來源的Asd酶,測(cè)得其最適反應(yīng)溫度為45 ℃,40 ℃保溫40 min酶活力剩余為92%,最適反應(yīng)pH值4.5,在pH 4.0~7.0有較好的穩(wěn)定性,比酶活為280 U/mg;2015年,吳四平等[18]對(duì)Alcaligenesfaecalis來源Asd酶在大腸桿菌中進(jìn)行重組表達(dá),測(cè)得其最適反應(yīng)溫度為45 ℃,在35、40 ℃穩(wěn)定性較好,保溫3 h酶活力幾乎沒有損失;最適反應(yīng)pH值為6.0,同時(shí)在pH 6.0條件下穩(wěn)定性最好。2018年,汪芳[19]將Pseudomonasdacunhae中編碼Asd酶的基因克隆至大腸桿菌中進(jìn)行異源表達(dá),針對(duì)該酶在低pH條件下酶活力降低的情況進(jìn)行改造,獲得穩(wěn)定性提高的突變體N34D/L484M,比酶活力為116.27 U/mg,比野生型提高76.3%。本文在大腸桿菌中首次重組表達(dá)了不動(dòng)桿菌來源的Asd酶,對(duì)其酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行了研究,擴(kuò)充了Asd酶家族,同時(shí)也為生物轉(zhuǎn)化生產(chǎn)L-丙氨酸的工業(yè)應(yīng)用提供了參考。
1.1.1 菌株及質(zhì)粒
菌株E.coliBL21 (DE3)、E.coliJM109與質(zhì)粒pMD 19-T、pET-28a(+),安徽通用生物系統(tǒng)有限公司;菌株Acinetobacterradioresistens,本實(shí)驗(yàn)室保藏。
1.1.2 試劑及培養(yǎng)基
L-天冬氨酸鈉、L-丙氨酸、異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(isopropyl-beta-D-thiogalactopyranoside,IPTG)、卡那霉素,上海生工生物工程有限公司;PrimeSTAR?Max DNA 聚合酶、限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ、XhoⅠ和T4 DNA連接酶,TaKaRa寶日醫(yī)生物技術(shù)有限公司;細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒、膠回收試劑盒和PCR產(chǎn)物純化試劑盒,Axygen產(chǎn)品;其他試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
E.coli的種子培養(yǎng)基為L(zhǎng)uria-Bertani(LB)培養(yǎng)基,誘導(dǎo)蛋白表達(dá)培養(yǎng)基為Terrific-Broth(TB)培養(yǎng)基。
1.1.3 引物設(shè)計(jì)及合成
根據(jù)GenBank檢索所得的不動(dòng)桿菌(Acinetobacterradioresistens)的L-天冬氨酸-β-脫羧酶基因序列(GeneBank登錄號(hào)為AP019740.1)設(shè)計(jì)引物,分別在引物5′和3′端加入EcoRⅠ、XhoⅠ酶切位點(diǎn)及保護(hù)堿基。引物序列如表1所示。
表1 本研究所用引物序列Table 1 Primers used in this study
注:下劃線部分為限制性內(nèi)切酶酶切位點(diǎn)
1.2.1 不動(dòng)桿菌Acinetobacterradioresistens基因組提取
Acinetobacterradioresistens基因組提取方法參考細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒的使用說明。
1.2.2 基因工程菌E.coliBL21/pET28a(+)-ArAsd構(gòu)建
以Acinetobacterradioresistens基因組為模板,以上述引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。將獲得帶有限制性酶切位點(diǎn)的目的基因ArAsd連接載體pMD19T,獲得pMD19T-ArAsd。提取pMD19T-ArAsd用EcoRⅠ、XhoⅠ雙酶切,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定、回收、純化后,用T4 DNA連接酶連接到同樣經(jīng)過EcoRⅠ、XhoⅠ雙酶切的pET-28a(+)載體上,獲得重組質(zhì)粒pET28a-ArAsd。將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到E.coliBL21 (DE3)感受態(tài)細(xì)胞中,選取含有卡那抗性平板上陽性轉(zhuǎn)化子提取質(zhì)粒酶切驗(yàn)證,得到重組菌E.coliBL21/pET28a(+)-ArAsd,并保存于甘油管中。
1.2.3 重組ArAsd蛋白誘導(dǎo)表達(dá)
將保存于甘油管中的重組菌劃線于帶有卡那抗性的LB平板上,于37 ℃培養(yǎng)12 h;在平板上挑取單菌落接種于5 mL含100 μg/L卡那霉素的LB培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min培養(yǎng)8 h,以1%接種量轉(zhuǎn)接至含有50 mL TB培養(yǎng)基的250 mL三角瓶中,培養(yǎng)基中加入終質(zhì)量濃度為100 μg/L的卡那霉素,37 ℃、200 r/min搖床培養(yǎng)至菌體OD600為0.6~0.8,添加終質(zhì)量濃度為0.2 mmol/L的IPTG,30 ℃誘導(dǎo)培養(yǎng)12 h。誘導(dǎo)結(jié)束后,6 000 r/min離心10 min收集菌體,超聲破碎,通過聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)分析鑒定重組蛋白表達(dá)情況。
1.2.4 重組ArAsd蛋白純化
用結(jié)合緩沖液A(20 mmol/L Na2HPO4、20 mmol/L NaH2PO4、500 mmol/L NaCl、10 mmol/L 咪唑、pH 7.4)懸浮誘導(dǎo)表達(dá)后的菌體,冰浴超聲破碎(功率300 W,破碎3 s,間歇7 s,破碎30 min),12 000 r/min離心20 min,取上清,用0.22 μm濾膜過濾,即粗酶液。Sepharose His Trap HP用5倍柱體積結(jié)合緩沖液A平衡后,取10 mL上樣,繼續(xù)平衡洗去雜蛋白。使用洗脫緩沖液B(20 mmol/L Na2HPO4、20 mmol/L NaH2PO4、500 mmol/L NaCl、500 mmol/L 咪唑、pH 7.4)梯度洗脫,收集的洗脫液即為純化得到的純酶液,用SDS-PAGE方法分析純化情況,采用Bradford法測(cè)定純化所得蛋白濃度。
1.2.5 Asd酶活力的測(cè)定方法
酶活力定義為在37 ℃,pH 4.5條件下,1 min轉(zhuǎn)化底物生成1 μmolL-丙氨酸所需的酶量為一個(gè)酶活力單位U。
酶活力檢測(cè)反應(yīng)體系:1 mL反應(yīng)體系中,將適量Asd酶液與磷酸緩沖液(50 mmol/L,pH 4.5)混合,并加入終濃度為0.5 mmol/L的PLP、終濃度為1 mmol/L的α-酮戊二酸,混勻后于37 ℃預(yù)熱10 min,后加入終濃度為40 mmol/L的底物L(fēng)-天冬氨酸鈉激活反應(yīng),于37 ℃水浴反應(yīng)20 min后,煮沸10 min滅活反應(yīng)。
液相檢測(cè)方法[20]:反應(yīng)液于12 000 r/min離心10 min后,取上清通過0.22 μm濾膜過濾,隨后采用異硫腈酸苯酯(phenyl isothiocyanate,PITC)衍生,具體步驟為:取500 μL反應(yīng)液于2 mL離心管中,加入250 μL 1mol/L三乙胺乙腈溶液與250 μL 0.1 mol/L PITC乙腈溶液,充分均勻混合,于室溫避光反應(yīng)衍生45~60 min,加入750 mL正己烷溶液終止反應(yīng),渦旋振蕩1 min后靜置10 min待溶液分層,吸取下層溶液,經(jīng)0.22 μm有機(jī)濾膜過濾。使用高效液相色譜法檢測(cè)衍生后L-丙氨酸含量。
1.2.6 Asd酶學(xué)性質(zhì)研究
最適反應(yīng)溫度測(cè)定:分別在35、40、45、50、55、60、65、70 ℃條件下測(cè)定Asd的酶活力,將最高酶活力定義為100%,檢測(cè)結(jié)果以Asd相對(duì)酶活力對(duì)溫度作圖呈現(xiàn)。
最適反應(yīng)pH測(cè)定:保持其他反應(yīng)條件不變,反應(yīng)體系中加入相同體積的pH值為3.0、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、7.0、8.0、9.0的緩沖液,于37 ℃條件下反應(yīng)10 min后滅活,檢測(cè)結(jié)果以Asd相對(duì)酶活力對(duì)pH作圖呈現(xiàn)。pH值3.0~8.0采用磷酸氫二鈉-檸檬酸緩沖溶液,pH值7.0~9.0采用Tris緩沖溶液。
熱穩(wěn)定性測(cè)定:取等量純酶液置于0、40、45、50 ℃水浴鍋中溫育,每隔30 min取樣,于冰上冷卻5 min,保持其他反應(yīng)條件不變,按照1.2.4所述方法檢測(cè)酶活力,檢測(cè)結(jié)果以不同溫度下相對(duì)酶活力對(duì)處理時(shí)間作圖呈現(xiàn)。
pH穩(wěn)定性檢測(cè):取等量純酶液用相同體積的pH值為3.0、3.5、4.0、4.5、5.0、6.0、7.0、8.0、的緩沖溶液懸浮,于冰上放置12 h,保持其他反應(yīng)條件不變,隨后按照1.2.4所述方法檢測(cè)酶活力,檢測(cè)結(jié)果以不同pH下相對(duì)酶活力對(duì)處理時(shí)間作圖呈現(xiàn)。
動(dòng)力學(xué)常數(shù)測(cè)定:1 mL反應(yīng)體系中,將適量Asd酶液與磷酸緩沖液(50 mmol/L,pH 4.5)混合,并加入終濃度為0.5 mmol/L的PLP、終濃度為1 mmol/L的α-酮戊二酸,混勻后于37 ℃預(yù)熱10 min,后加入終濃度為5、10、15、20、30、40 mmol/L的底物L(fēng)-天冬氨酸鈉,于37 ℃水浴反應(yīng)2 min后,煮沸10 min滅活反應(yīng)。檢測(cè)L-丙氨酸產(chǎn)量,測(cè)定初始反應(yīng)速率。采用GraphPad Prism擬合曲線,測(cè)定酶的Km,kcat,Vmax,kcat/Km。
1.2.7 底物與產(chǎn)物對(duì)重組菌的影響
將重組菌懸浮于50 mmol/L的;磷酸氫二鈉-檸檬酸緩沖液(pH 4.5)中,菌體OD600調(diào)至10,加入終濃度為0.3、0.5、1 mol/L的底物或產(chǎn)物,于37 ℃處理1 h后,離心收集菌體并使用去離子水洗滌2遍,然后測(cè)定菌體的剩余酶活力。對(duì)照組底物、產(chǎn)物的濃度為0 mol/L。
以不動(dòng)桿菌(Acinetobacterradioresistens)的基因組為模版,通過PCR擴(kuò)增,獲得大小約為1 602 bp的核酸條帶,與Asd基因理論大小相符,如圖1所示。重組質(zhì)粒pET28a-ArAsd使用EcoRⅠ和XhoⅠ限制性內(nèi)切酶對(duì)重組質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,結(jié)果如圖1泳道3所示,獲得大小約為5 500 bp和1 602 bp的條帶,長(zhǎng)度分別與pET-28a載體和ArAsd基因大小相符,重組質(zhì)粒中的Asd基因以pET28a載體通用引物進(jìn)行測(cè)序,結(jié)果與Acinetobacterradioresistens的Asd基因大小一致。上述結(jié)果表明ArAsd基因已成功連接到pET28a載體質(zhì)粒上。
M-marker;1-目的基因;2-EcoRⅠ酶切載體pET-28a;EcoRⅠ和XhoⅠ雙酶切重組質(zhì)粒
圖1 重組載體pET28a-ArAsd酶切驗(yàn)證
Fig.1 The enzymic digestion of pET28a-ArAsd
將重組大腸桿菌BL21/pET28a-ArAsd于LB培養(yǎng)基中活化后,以1%的接種量接種于TB液體培養(yǎng)基培養(yǎng)至OD600約為0.8,加入終濃度為0.2 mmol/L的IPTG誘導(dǎo)表達(dá)12 h,收集細(xì)胞進(jìn)行超聲破碎,破碎上清液經(jīng)SDS-PAGE電泳驗(yàn)證(圖2)。電泳圖譜顯示在44.3 kDa與66.4 kDa之間有特異性表達(dá)條帶,與理論相對(duì)分子質(zhì)量60 kDa相符。破碎上清液經(jīng)His Trap HP鎳柱純化,獲得電泳純的目的蛋白(圖2),可用于進(jìn)一步蛋白性質(zhì)研究。
M-標(biāo)準(zhǔn)蛋白Marker;1-未誘導(dǎo)全細(xì)胞;2-誘導(dǎo)后破碎上清; 3-誘導(dǎo)后破碎沉淀;4-純化后ArAsd
圖2 重組菌BL21/pET28a-ArAsd表達(dá)產(chǎn)物的 SDS-PAGE電泳分析
Fig.2 The SDS-PAGE analysis of expression products in recombinant strain(BL21/PET28a-ArAsd)
酶促反應(yīng)過程中存在酶蛋白熱變性累積效應(yīng),表現(xiàn)為前期溫度較高時(shí)酶催化效率較高,后期由于蛋白質(zhì)發(fā)生變性,有效酶分子數(shù)量減少,酶促反應(yīng)效率降低。溫度對(duì)ArAsd的酶活力影響如圖3-a所示,其在50 ℃時(shí)達(dá)到最高酶活力。隨著溫度的升高,ArAsd酶活力呈現(xiàn)先升高后降低的趨勢(shì)。從重組Asd酶的熱穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)結(jié)果(圖3-b)可以看出,酶在設(shè)定的溫度下放置3 h,酶活力均有一定程度損失,溫度越高酶活力損失越快。40~45 ℃放置3 h,ArAsd較穩(wěn)定,酶活力剩余70%以上, 50 ℃處理3 h酶活力剩余約為20%。
a-酶活;b-熱穩(wěn)定性
圖3 溫度對(duì)ArAsd酶活力的影響及酶的熱穩(wěn)定性
Fig.3 Effect of reaction temperature on ArAsd activity and thermal stability of the enzyme
ArAsd的最適pH和pH穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖4所示,隨著pH的增加,其酶活力呈現(xiàn)先增高后降低的趨勢(shì),且在pH 4.5條件下具有最高酶活力;ArAsd在pH 6.0~7.0有較好的穩(wěn)定性。
a-酶活;b-穩(wěn)定性
圖4 pH對(duì)ArAsd酶活力的影響及酶的pH穩(wěn)定性
Fig.4 Effect of reaction pH on ArAsd activity and pH stability of the enzyme
重組純酶ArAsd在常規(guī)測(cè)定條件下(37 ℃,pH 4.5)比酶活力為753 U/mg,較已有報(bào)道Pseudomonassp.[7]來源的Asd比酶活力高1.7倍,較Alcaligenesfaecalis[8]來源的Asd酶高2.5倍。ArAsd酶動(dòng)力學(xué)常數(shù)如表2所示,其Km值較Pseudomonassp.[7]來源Asd酶低8.57 mmol/L,較Alcaligenesfaecalis[8]來源的Asd酶低5.95 mol/L,更易于與底物結(jié)合;同時(shí),kcat值為Alcaligenesfaecalis[8]來源的Asd酶的2倍,表明其分子活力更高。較高的kcat/Km說明ArAsd具有更高的催化效率。
表2 重組酶ArAsd的動(dòng)力學(xué)參數(shù)Table 2 the kinetic parameters of ArAsd
工業(yè)生產(chǎn)常利用全細(xì)胞作為催化劑進(jìn)行生產(chǎn),因此,測(cè)定重組菌對(duì)底物與產(chǎn)物濃度的耐受性對(duì)其應(yīng)用的方法選擇有重要影響。其結(jié)果如圖5所示,高濃度底物L(fēng)-天冬氨酸鈉對(duì)全細(xì)胞的酶活力有促進(jìn)作用,產(chǎn)物L(fēng)-丙氨酸濃度高于0.5 mol/L時(shí)會(huì)對(duì)全細(xì)胞催化活性產(chǎn)生抑制作用。
圖5 重組菌對(duì)底物與產(chǎn)物的耐受性
Fig.5 Tolerance of recombinant cell to substrate and product concentrations
Asd酶是工業(yè)上催化L-天冬氨酸生產(chǎn)L-丙氨酸的關(guān)鍵性酶,篩選具有高酶活力、高穩(wěn)定性的Asd酶對(duì)工業(yè)生產(chǎn)L-丙氨酸具有重要意義。本文以pET28a為載體,在大腸桿菌細(xì)胞中重組表達(dá)了不動(dòng)桿菌(Acinetobacterradioresistens)來源的Asd酶,SDS-PAGE電泳圖顯示Asd蛋白成功表達(dá)。對(duì)其進(jìn)行酶學(xué)性質(zhì)測(cè)定,結(jié)果顯示其在50 ℃、pH 4.5時(shí)具有最高比酶活力753 U/mg,50 ℃處理2 h酶活力剩余70%左右,在pH 4.5條件下穩(wěn)定性較差,處理12 h酶活力剩余20%左右。測(cè)定重組全細(xì)胞對(duì)底物與產(chǎn)物濃度的耐受性,結(jié)果顯示高濃度底物L(fēng)-天冬氨酸鈉對(duì)全細(xì)胞催化活性有促進(jìn)作用,產(chǎn)物L(fēng)-丙氨酸濃度高于0.5 mol/L時(shí)會(huì)對(duì)全細(xì)胞催化活性產(chǎn)生抑制作用。