汪德會,李 攀,李能章,彭遠義
(西南大學(xué) 動物科技學(xué)院,重慶 400715)
革蘭陰性菌(Gram-negative bacteria)的外膜是一種由蛋白質(zhì)、脂多糖、磷脂等多種物質(zhì)組成的復(fù)合結(jié)構(gòu),約占細胞壁干重的80%,是革蘭陰性菌抵抗外來有毒化合物的第一道防線??椎鞍祝≒orins)是外膜蛋白(OMPs)家族中的一類典型膜通道蛋白,1979 年Nakae 第一次描述了它的特征并將其命名為孔蛋白。孔蛋白的結(jié)構(gòu)在莢膜紅細菌(Rhodobacter capsulatus)中首次得到了精準解析[1],這類蛋白質(zhì)參與了多種營養(yǎng)物質(zhì)和有毒小分子(糖、藥物、小肽、化學(xué)物質(zhì))的運輸。此外,孔蛋白可誘導(dǎo)宿主產(chǎn)生免疫應(yīng)答、參與細菌的耐藥和補體活化等,并可作為新型疫苗候選靶標和免疫佐劑[2-3]。本文從孔蛋白的分子結(jié)構(gòu)、在細菌感染和耐藥中的作用以及作為疫苗佐劑研究等予以綜述,為了解細菌的耐藥機制以及研發(fā)新的疫苗提供參考。
孔蛋白貫穿于細菌外膜的磷脂雙分子層,在其外表面形成一富含水的通道,通常僅允許小于0.6 ku 的親水性小分子通過。革蘭陰性菌孔蛋白有單體和三聚體兩種結(jié)構(gòu)。
經(jīng)典的孔蛋白是由三個單體聚合而成的三聚體結(jié)構(gòu),單體之間由L2 環(huán)(Loop)連接,每個單體由300~420 個氨基酸構(gòu)成,其N 端有由21 個氨基酸組成的信號肽序列,其C 端有一個苯丙氨酸殘基,該殘基是孔蛋白正確導(dǎo)入外膜并在其中折疊的重要前提[4]。經(jīng)典孔蛋白分為非特異孔蛋白(General or Non-specific porins)(如OmpF、PhoE 和OprP)和底物特 異 孔 蛋 白(Substrate specific porins)(如LamB 和ScrY)兩類,這兩類蛋白的單體分別由16 和18 條反平行的肽鏈折疊成一個β桶(β barrel)狀結(jié)構(gòu),孔徑的最大橫徑在30 ?~35 ?之間,最大高度約為50 ?[5-6]。每個單體鏈在周質(zhì)內(nèi)側(cè)以7 或8 條短環(huán)連接,在細胞外側(cè)則以不規(guī)則的9 或7 條長環(huán)連接,最長的L3 環(huán)并不在胞外側(cè)暴露而是在桶內(nèi)通道高度的一半處折疊形成收縮區(qū),在該收縮區(qū)內(nèi),L3 環(huán)中的酸性殘基(Asp-113、Glu-117)和與之相對筒體壁中的一簇堿性殘基(Lys-16、Arg-42、Arg-82、Arg-132)形成了較強的橫向靜電場,對孔隙的滲透性起著決定性的作用[7](圖1)。L3 環(huán)含有一個序列基序—PEFGG,在大腸桿菌孔蛋白(OmpF)中高度保守,該基序構(gòu)成了L3 環(huán)中最柔性的區(qū)域,使L3 環(huán)在孔徑內(nèi)有局部運動的可能性。底物特異孔蛋白與非特異孔蛋白不同的是,長環(huán)L1 也能在桶內(nèi)折疊,與L3 環(huán)共同決定孔徑的大小,并且外環(huán)通常聚合形成一個保護傘,起著保護孔徑和限制大分子物質(zhì)進入孔隙的作用,這可能與底物特異性結(jié)合相關(guān)[8]。
單聚體孔蛋白與三聚體孔蛋白的單體結(jié)構(gòu)類似,一般由8、12 或14 條肽鏈β折疊而成,因其孔隙內(nèi)缺少像三聚體孔蛋白L3 環(huán)類似的收縮區(qū)結(jié)構(gòu),使得其孔徑比經(jīng)典的孔蛋白單體大;其孔徑一般為橢圓狀,單側(cè)在鏈S6~S10 處稍扁[7]。大腸桿菌單聚體孔蛋白(OmpG)構(gòu)型受pH 值的影響,在中性pH下, L6 和L7 環(huán)投射到細胞外介質(zhì)中,使孔洞打開,而在低pH 下,其在孔道內(nèi)折疊并阻塞孔道[9](圖2)。
圖1 大腸桿菌三聚體孔蛋白OmpF 的結(jié)構(gòu)[8]
圖2 大腸桿菌單體孔蛋白OmpG 的結(jié)構(gòu),A、B 和C、D 分別為孔徑開放和關(guān)閉狀態(tài)[9]
孔蛋白是細菌外膜重要的組成成分,在細菌感染宿主的過程中,孔蛋白可黏附侵入不同類型的組織細胞,刺激宿主細胞產(chǎn)生一系列促炎因子、抗炎因子和趨化因子,并誘導(dǎo)下游效應(yīng)細胞的成熟與分化,從而增強細胞表面MHC 分子以及共刺激分子(Co-stimulatory molecules)的表達,在天然免疫和獲得性免疫中起著重要的作用。
孔蛋白的特異受體目前尚不明確,但其作為病原相關(guān)分子模式(Pathogen associated molecular patterns,PAMPs)能 被Toll 樣 受 體(Toll-like receptor,TLR)或其它模式識別受體(Pattern-recognition receptors,PRRs)所識別而發(fā)揮作用[3](圖3)。TLR 廣泛表達于多種組織和細胞,其中TLR2 是TLR 家族中功能較多、識別譜最廣的受體之一,在天然免疫中起著重要的作用。大量研究表明,許多革蘭氏陰性菌孔蛋白均能被TLR2 或其它受體分子識別,使免疫細胞活化,誘導(dǎo)炎癥反應(yīng)。例如,腦膜炎奈瑟氏菌(Neisseria meningitidis)孔蛋白PorB 能被TLR2 識別,通過髓樣分化因子88(MyD88)依賴途徑、絲裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated protein kinases,MAPK)和核轉(zhuǎn)錄因子kappa B(Nuclear factor κB,NF-κB)通路誘導(dǎo)抗原遞呈細胞(Antigen presenting cell,APC)的活化、增強MHC Ⅱ和CD86分子的表達、并誘導(dǎo)B細胞增殖和樹突狀細胞(DCs)的成熟,可在天然免疫與獲得性免疫中起著橋梁的作用[10-11]。研究顯示,PorB 可直接與TLR2 結(jié)合,在TLR6 敲除小鼠內(nèi)誘導(dǎo)B 細胞分泌高水平的IL-6,而在TLR1 敲除小鼠內(nèi)使B 細胞分泌IL-6 的能力明顯減弱,表明PorB 誘導(dǎo)細胞的活化需要TLR2/TLR1(而不是TLR2/TLR6)異源二聚體進一步來發(fā)揮其生物學(xué)效應(yīng)[12]。此外,痢疾桿 菌(Shigella dysenteriae)MOMP、流 感 嗜 血 桿 菌(Haemophilus influenzae)Hib 以及具核梭桿菌(Fusobacterium nucleatum)FomA 等孔蛋白也能被TLR2 識別,誘導(dǎo)相應(yīng)免疫細胞的活化,促使發(fā)生一系列免疫反應(yīng)[13-15]。
孔蛋白除了能被TLR2 識別之外,也能通過其它信號途徑或方式誘導(dǎo)免疫反應(yīng)。鼠傷寒沙門氏菌(Salmonella enterica serovar typhimurium)34 ku 和36 ku孔蛋白能在不同的組織細胞中通過相似或不同的信號通路誘導(dǎo)炎癥因子、共刺激分子的表達。其中,這兩種蛋白在小鼠巨噬細胞(RAW 264.7)中通過P38 和JNK MAPK 通路誘導(dǎo)一氧化氮分子(NO)的分泌[16],在人白血病單核細胞(U937)中可通過Raf-1-MEK1-MEK2-MAPK 通路活化NF-κB 和AP-1,以及誘導(dǎo)蛋白酪氨酸激酶(NT-PTK)、蛋白激酶A(PKA)和蛋白激酶C(PKC)磷酸化并促使TNF-α 、IL-1β 、IL-6 和IL-10 的分泌[17-18]。此外,這兩種蛋白在小鼠脾細胞模型中活化CD4+T 細胞并促進IFN-γ和IL-4的分泌,在人外周淋巴細胞(Human PBMCs)中可誘導(dǎo)CD80 和CD86 的表達[19]。流感嗜血桿菌孔蛋白P2中的L5、L6 和L7 環(huán)也能激活JNK 和P38 MAPK 通路促進IL-6 和TNF-α的分泌,表明孔蛋白細胞的外側(cè)環(huán)可發(fā)揮生物學(xué)活性作用[20]。
圖3 革蘭陰性菌孔蛋白介導(dǎo)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)及免疫反應(yīng)[3]
補體系統(tǒng)(Complement system)是存在于人和動物血液、組織液和細胞膜表面的一種復(fù)雜的限制性蛋白水解系統(tǒng),是機體固有免疫防御體系的重要組成部分,可參與病原微生物的防御和免疫調(diào)節(jié)。研究表明部分革蘭陰性菌孔蛋白可與補體C1q 結(jié)合,通過經(jīng)典途徑激活補體。嗜水氣單胞菌(Aeromonas hydrophila)孔蛋白II 能與C1q 結(jié)合,并以非抗體依賴方式激活補體經(jīng)典途徑,然后酶解C4 并降低血清總?cè)苎钚訹21]。肺炎克雷伯氏菌(K.pneumoniae)孔蛋白OmpK36 通過與C1q 結(jié)合激活體內(nèi)經(jīng)典補體途徑,并使C3、C5-9(MAC)成分在孔蛋白中沉積[22]。淋球菌孔蛋白Por1B 通過酰胺鍵和酯鍵選擇性結(jié)合補體結(jié)合蛋白C4b 和C3b,促使C5 轉(zhuǎn)化酶的形成[23]。Mishra M 等研究顯示體外重組表達的銅綠假單胞菌孔蛋白OprF 可與補體C3b 結(jié)合,同時增加補體介導(dǎo)的殺菌效應(yīng)[24]。
革蘭陰性菌目前占耐藥細菌的主導(dǎo)部分,隨著抗菌藥物的使用增多,其耐藥復(fù)雜性也隨之增加,給臨床用藥以及細菌疾病的防治帶來了巨大的挑戰(zhàn)??椎鞍资羌毦饽て琳系闹匾煞郑粋€細胞擁有孔蛋白的數(shù)量和類型將決定其滲透性,從而決定細菌對抗生素的敏感或耐藥性。目前認為,孔蛋白表達量的變化、基因突變(點突變、缺失突變、插入元件)等均會引起細菌外膜通透性降低而引起細菌耐藥[25-26]。
大量研究表明,孔蛋白的缺失可導(dǎo)致細菌耐藥。Hao 等從臨床分離了18 株耐碳青霉烯酶(Carbapenems)的產(chǎn)氣腸桿菌(Enterobacter aerogenes),其中14 株有耐碳青霉烯酶基因(blaKPC-2)的存在,對這14 株耐藥菌株進行SDS-PAGE 分析,發(fā)現(xiàn)有兩株(A4 和A23)缺失孔蛋白Omp35,兩株(A18 和A19)孔蛋白Omp36 的表達下降;而對這4 株孔蛋白缺陷菌株的功能恢復(fù)后發(fā)現(xiàn)其對碳青霉烯類藥物的最小抑菌濃度(MIC)降低了2~4 倍,表明孔蛋白Omp35和Omp36 缺失或表達減少會引起產(chǎn)氣腸桿菌對碳青霉烯酶藥物的耐藥[27]。另外,Zhen 等從214 株產(chǎn)KPC 的肺炎克雷伯菌(KPC producing Klebsiella pneumonia,KPC-KP)中篩選出了24 株耐頭孢他啶(Ceftazidime)菌株,根據(jù)最小抑菌濃度將其分為高、中、低三組,用ELISA 和RT-PCR 技術(shù)檢測發(fā)現(xiàn)高MIC 組菌株的頭孢他啶水解酶活性以及耐藥基因(blaKPC)的轉(zhuǎn)錄水平均明顯高于其它兩組,同時SDS-PAGE 結(jié)果顯示MIC>1 mg/mL 的所有菌株孔蛋白OmpK35 均缺失,而在敏感菌株中孔蛋白OmpK35和OmpK36 均存在;測序分析顯示,由于孔蛋白基因存在移碼致使轉(zhuǎn)錄提前終止(n=15)以及孔蛋白負調(diào)控基因micF 和ompR 的過表達導(dǎo)致OmpK35 缺失,表明孔蛋白缺失并伴有抗菌藥物的水解酶表達增加時,可加重細菌的耐藥[28]。
此外,孔蛋白基因點突變和插入元件(IS)也能引起細菌耐藥。Emmanuelle Dé等首次描述腸桿菌(Enterobacteriaceae)孔蛋白L3 環(huán)中第112 位氨基酸由G 突變?yōu)镈 可改變該蛋白的功能從而導(dǎo)致該菌對β-內(nèi)酰胺類藥物的耐藥[29]。同樣地,淋病奈瑟菌孔蛋白PIB L3 環(huán)基因突變同時伴隨mtrR 突變導(dǎo)致外排泵(Efflux pump)過表達時可導(dǎo)致該菌對青霉素和四環(huán)素耐藥[30]。Diene S M 等從一名沒有接受碳青霉烯類藥物治療的囊性纖維化(CF)患者身上分離了6 株銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa),其中有5 株對亞胺培南(Imipenem)耐藥,1 株敏感。在這6 株菌中均未檢測到碳青霉烯酶耐藥基因以及碳青霉烯酶活性,PCR 和測序顯示耐藥菌株(n=5)孔蛋白基因porD 中均存在插入序列ISPa46,而敏感菌株(n=1)存在的插入序列ISPa46 并未插入到porD 基因中,表明其耐藥原因與碳青霉烯酶無關(guān),而是孔蛋白oprD基因中插入ISPa46 發(fā)生轉(zhuǎn)位導(dǎo)致耐藥[31]。臨床中耐藥細菌可能同時存在耐藥基因和孔蛋白基因突變,這些耐藥因素的疊加作用致使耐藥情況更加復(fù)雜化。
細菌可以在不利于其生存的環(huán)境通過調(diào)控自身基因的表達來抵抗外來因素的威脅。研究顯示,細菌孔蛋白的表達減少可導(dǎo)致細菌耐藥。Lee J Y 等從357 株腸桿菌中篩選了31 株耐亞胺培南菌株,通過多位點序列(MLST)和ERIC-PCR 分析顯示這些菌株的遺傳關(guān)系較遠,并且在大多數(shù)耐藥菌株(n=29)中均不存在亞胺培南耐藥基因,同時其孔蛋白ompD和ompK35 基因的表達水平均下降;表明亞胺培南抗性似乎在大多數(shù)亞胺培南耐藥菌株中均是獨立發(fā)生的,而孔蛋白表達減少是導(dǎo)致亞胺培南敏感性降低的主要原因[32]。此外,非藥物特異孔蛋白表達增加時會影響細菌外膜通透性,從而導(dǎo)致細菌對某一類藥物敏感或耐藥。Anuwat A 等研究顯示伯克霍爾假單胞菌(Burkholderia pseudomallei,Bps)表達孔蛋白BpsOmp38 的菌株比對照菌株的抗菌敏感性更低,同時脂質(zhì)體腫脹試驗顯示,Bps 耐藥的藥物(頭孢西丁、頭孢吡肟和多瑞培南)并不能通過BpsOmp38 通道,Bps 敏感的藥物頭孢他啶和美羅培南卻與此相反;此外,編碼BpsOmp38 基因的氨基酸Tyr119 被Ala119 取代時有利于Bps 對抗菌藥物的吸收,而被Phe119 取代時則可抑制Bps 對抗菌藥物的吸收;表明BpsOmp38 是一個特異性孔蛋白并與膜通透性相關(guān),而殘基Tyr119 的替代影響了BpsOmp38 通道對中性糖和抗菌藥物的吸收[33]。
孔蛋白作為一類膜通道蛋白暴露于革蘭陰性菌表面,具有高度的免疫原性,可作為疫苗候選靶標及活性佐劑。Yadav 等將40 ku 嗜水氣單胞菌孔蛋白OmpF 腹腔免疫小鼠,在49 d 后還能檢測到很高的免疫球蛋白IgG 滴度,同時發(fā)現(xiàn)該蛋白的抗血清能同時與不同親水性的氣單胞菌反應(yīng);此外,該蛋白在體外能夠促進小鼠淋巴細胞的增殖和T 細胞分泌IL-4 和IFN-γ[34]。而將同菌株孔蛋白Omp48 免疫鯪魚,該蛋白可對鯪魚針對同一菌株和遲緩型愛德華菌(Edwardsiella tarda)提供60%~70%的抗感染能力,表明OmpF 和Omp48 有作為疫苗抗原的潛質(zhì)[35]。Li等研究顯示,副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)的孔蛋白VP1061 和VP2850 對魚和小鼠針對溶藻弧菌(V.alginolyticus)、嗜水氣單胞菌(A.hydrophila)和熒光假單胞菌(Pseudomonas fluorescens)的感染具有交叉抵抗能力,而有望成為新型多價疫苗[36]。Tan 等將B型多殺性巴氏桿菌(Pasteurella multocida,Pm)孔蛋白OmpH 分別皮下和腹腔注射免疫小鼠,該蛋白可對小鼠針對同型Pm 菌株分別提供80%和100%的抗感能力;而本實驗室將A 型Pm OmpH 與PM0979 融合表達免疫小鼠,該融合蛋白可對小鼠針對A 型和B 型Pm 分別提供70%和30%的抗感染能力[37-38]。另外,奈瑟菌屬孔蛋白PorB 作為TLR2 的激動劑已成為佐劑的研究熱點,其誘導(dǎo)APCs 的活化以及下游效應(yīng)分子的表達必須依賴完整的MyD88 信號分子[11]。其中Liu 等用Nlac PorB 作為佐劑并以卵清蛋白(OVA)作為標準抗原免疫小鼠,與單獨免疫卵清蛋白相比,可誘導(dǎo)小鼠產(chǎn)生高滴度、OVA 特異的IgG 和IgM,與用Nme-PorB 和鋁膠佐劑免疫小鼠產(chǎn)生的抗體滴度相同,并可促進炎性因子IL-4、 IL-10、IL-12 和INF-γ的分泌,以及誘導(dǎo)Th1 和Th2 型免疫反應(yīng)[39]。最近研究顯示,PorB 可誘導(dǎo)小鼠分泌與Th2/Th1 型反應(yīng)相關(guān)的OVA 特異性抗體IgG1、IgG2b、IgG2c 和IgG3 以 及效應(yīng)分子MIG、MCP-1、IP-10、MIP-1、CXCL1 和IL-2,同時促進T 細胞分泌IL-4、IL-5、IL-13 和IFN-γ;PorB 佐劑疫苗還能促進抗原特異性的CD4+T 和CD8+T 細胞的增殖,同時能降低小鼠在單增李斯特菌低劑量感染時的定殖,提高在高劑量感染時的存活率[40]。表明以TLR2配體為主的奈瑟菌孔蛋白PorB 具有廣泛的佐劑和抗原活性,可用于疫苗佐劑研發(fā)。
孔蛋白有單聚體和三聚體兩種結(jié)構(gòu),其可通過激活補體、作為PAMPs 識別TLR2、通過膜通透性變化等參與細菌的致病過程,同時其本身可作為疫苗候選靶標和佐劑(表1)??椎鞍譒3 環(huán)在胞內(nèi)折疊形成收縮區(qū),以限制大分子物質(zhì)進入胞內(nèi),并且L3環(huán)基因突變可導(dǎo)致細菌耐藥[29],深入探究L3 環(huán)的結(jié)構(gòu)和功能有助于了解細菌的耐藥機制,同時為臨床研發(fā)小分子量、靶向細胞外的一類藥物以減少耐藥細菌的產(chǎn)生提供參考。然而,細菌的耐藥除與細胞膜通透性有關(guān)外,還與耐藥基因、細菌水解酶的多少以及用藥情況息息相關(guān),這為臨床用藥帶來了極大的挑戰(zhàn)[2]。佐劑是疫苗的重要組成部分,安全有效的佐劑能夠提高疫苗的免疫效果,TLR激動劑已廣泛用于人和動物的疫苗生產(chǎn),例如瘧疾、HIV、結(jié)核、癌癥等許多疑難疾病的疫苗也加入了這些佐劑[41]。研究孔蛋白的TLR2 激動劑效應(yīng)可為臨床疫苗研發(fā)的多樣性提供新的可能。因此,深入研究孔蛋白的分子結(jié)構(gòu)以及與宿主的相互作用,有利于了解細菌的耐藥和致病機制,同時為開發(fā)針對細菌病的新型疫苗奠定基礎(chǔ)。
表1 革蘭陰性菌孔蛋白結(jié)構(gòu)及功能應(yīng)用