張前程,文紅梅,劉娜,袁琪,劉睿,崔小兵,李松,陳盛君
(1.南京中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院,江蘇 南京 210023;2.江陰天江藥業(yè)有限公司,江蘇 江陰 214434)
地龍為常用動物類中藥,2015年版《中國藥典》收載地龍為鉅蚓科動物參環(huán)毛蚓Pheretimaaspergillum(E. Perrier)、通俗環(huán)毛蚓Pheretimavulgaris(Chen)、威廉環(huán)毛蚓Pheretimaguillelmi(Michaelsen)或櫛盲環(huán)毛蚓Pheretimapectinifera(Mkhaeken)的干燥體。前一種習(xí)稱“廣地龍”,后三種習(xí)稱“滬地龍”[1]。地龍具有清熱定驚,通絡(luò),平喘利尿的功效[2-4]?,F(xiàn)代研究表明,地龍還有降壓[5]、抗癌[6-9]、抗凝血[10]、抗氧化[11-13]、抗肝纖維化[14]等作用。市場上流通的地龍藥材主要為廣地龍,廣地龍體長、藥材加工精細,藥理活性顯著,臨床應(yīng)用廣泛[15]。以其為原料藥的中成藥有40多個品種,還有廣地龍配方顆粒及廣地龍湯劑等[16]。廣地龍藥材與相近物種因形態(tài)相似,容易造成品種混雜和摻假現(xiàn)象。廣地龍藥材的真?zhèn)侮P(guān)系著臨床用藥的有效性和安全性。因此,有必要建立快速準確的特異性物種鑒別方法,以控制廣地龍藥材的質(zhì)量。DNA條形碼分子鑒定法是利用基因組中一段公認的、相對較短的DNA序列來進行物種鑒定的一種分子生物學(xué)技術(shù),是傳統(tǒng)形態(tài)鑒別方法的有效補充[17-18]。在動物藥的鑒別中大多采用通用引物COⅠ序列進行PCR擴增測序,如龐中化等[19]通過COⅠ序列對全蝎及其混偽品進行DNA條形碼鑒別;賈靜等[20]采用COⅠ序列和ITS序列分別鑒別家蠶和白僵菌。但COⅠ序列不能直接作為特異性引物來區(qū)分藥材品種,必須對所有的樣品進行測序再進行聚類分析構(gòu)建進化樹,成本較高,時間較長。通過設(shè)計特異性引物,可省去對擴增產(chǎn)物進行測序、構(gòu)建進化樹等復(fù)雜的步驟,操作簡便快捷,已用于多種動物藥品種的基原鑒定。趙玉洋等[21]通過比較麝香及其混偽品的COⅠ序列,設(shè)計出一對約180 bp的麝香微型DNA條形碼鑒別引物,對麝香及其混偽品進行測序鑒定;劉富艷等[22]通過比較海龍及其混偽品的COⅠ基因序列差異,根據(jù)變異位點設(shè)計出刁海龍、尖海龍及擬海龍的特異性鑒別引物,鑒別海龍及其混偽品;陳維明等[23]用12SrRNA序列鑒定了廣地龍及其近緣品種;田娜等[24]建立了多重位點特異性PCR鑒別方法區(qū)分不同地龍品種。本文前期實驗中考察了COⅠ、12SrRNA和16SrRNA 3對引物,結(jié)果發(fā)現(xiàn)COⅠ序列擴增出的條帶更為清晰,利用COⅠ序列對廣地龍、滬地龍及其易混品(如海南大腔蚓)等進行PCR擴增和雙向測序,通過比對廣地龍及其混偽品的DNA測序結(jié)果,尋找廣地龍的變異位點,設(shè)計出廣地龍的特異性引物,用于廣地龍及其混偽品的鑒定,為廣地龍藥材的質(zhì)量評價提供方法。
PCR擴增儀(伯樂公司,型號:AL110394);電泳儀(伯樂公司,型號:041BR170879);浸沒式瓊脂糖水平電泳槽[生工生物(上海)股份有限公司,RDY-SP6];化學(xué)發(fā)光凝膠成像儀(伯樂公司,型號:721BR10360)。
瓊脂糖(批號:4241055);水為屈臣氏超純水;Ⅰ型核酸染料(批號:20181012);DNA Marker(100~2 000 bp)(批號:E905KA9473);2×Taq PCR Master Mix(批號:20190926);動物DNA基因組提取試劑盒(TSP 201-200,020190120)。通用引物COⅠ以及設(shè)計的特異性引物PA-f/PA-r,由南京擎科醫(yī)藥科技有限公司合成。
地龍樣品及其偽品共計37批次,其中廣地龍(參環(huán)毛蚓)14批,滬地龍(通俗環(huán)毛蚓)6批,滬地龍(威廉環(huán)毛蚓)4批,滬地龍(櫛盲環(huán)毛蚓)3批,海南地龍(大腔蚯蚓)6批。其他的動物品種水蛭,蜈蚣,僵蠶和蟬蛻各1批。
廣地龍購于廣東、廣西,呈長條狀薄片,彎曲,邊緣略卷,長15~25 cm,寬1~2 cm。全體具環(huán)節(jié),背部棕褐色至紫灰色,腹部淺黃棕色;第14~16環(huán)節(jié)為生殖帶,寬0.8~1.5 cm。
滬地龍藥典上收載有3種品種,長8~15 cm;寬0.5~1.5 cm。全體具環(huán)節(jié),背部棕褐色至黃褐色,腹部淺黃棕色;第14~16環(huán)節(jié)為生殖帶,較光亮。第18環(huán)節(jié)有一對雄生殖孔。通俗環(huán)毛蚓較常見,購于上海、安徽、河南等地,原動物灰青色,背中線深青色,性狀鑒定顯示其雄交配腔能全部翻出,呈花菜狀或陰莖狀。威廉環(huán)毛蚓購于宿遷泰通地龍養(yǎng)殖基地,原動物性狀鑒定顯示其雄交配腔孔呈縱向裂縫狀。櫛盲環(huán)毛蚓采集于上海閔行校區(qū),原動物性狀鑒定顯示其雄生殖孔內(nèi)側(cè)有1或多個小乳突。
大腔蚓購于海南,呈長條狀薄片,彎曲,邊緣略卷,長15~35 cm,寬1.0~2.5 cm。全體具環(huán)節(jié),背部棕黑色,腹部淺黃棕色;第14~16環(huán)節(jié)為生殖帶,寬1.6~2.2 cm,呈棕黑色。
所有樣品由南京中醫(yī)藥大學(xué)中藥鑒定教研室陳建偉教授鑒定,保存于南京中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院藥物分析實驗室。樣品信息詳見表1。
表1 地龍及其混偽品的樣品信息表
取已用乙醇擦拭的地龍藥材,打粉過五號篩,稱取藥材粉末約40 mg,使用動物DNA基因組提取試劑盒(TSP 201-200,020190120)提取地龍的總DNA。將提取的DNA模板-20 ℃保存。
對收集的不同動物藥地龍、蜈蚣、水蛭、僵蠶及蟬蛻進行COⅠ序列的PCR擴增。COⅠ序列正向引物L(fēng)CO1490:5'-GGTCAACAAATCAAGATATTGG-3',反向引物HCO2198:5'-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3'。PCR反應(yīng)體積25 μL,體系包含2×Taq PCR Master Mix 12.5 μL,正向引物L(fēng)CO1490(10 μmol/L) 1 μL,反向引物HCO2198(10 μmol/L)1 μL,超純水H2O 8.5 μL,模板(基因組DNA 50 ng)2 μL。擴增程序:94 ℃變性1 min,55 ℃退火1.5 min,72 ℃延伸1 min(進行35個循環(huán));72 ℃延伸5 min。擴增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,電泳儀參數(shù)設(shè)置:電壓140 V,電泳時間90 min。
對各批次廣地龍以及其他品種地龍進行測序,委托南京擎科醫(yī)藥科技有限公司完成。
根據(jù)上述測序結(jié)果分析廣地龍及其混偽品COⅠ序列的擴增產(chǎn)物,同時使用引物設(shè)計軟件(Snapgene軟件)進行序列比對,尋找正品廣地龍及其混偽品的COⅠ基因序列擴增產(chǎn)物的差異,在變異位點較多的基因片段處,設(shè)計廣地龍的特異性鑒別引物。引物組由南京擎科醫(yī)藥科技有限公司合成。
對影響PCR鑒別特異性的主要因素如退火溫度(50、55、60 ℃),循環(huán)次數(shù)(32、35、38),DNA模板量(3、5、10、30、50、100 ng)以及Taq DNA聚合酶用量(0.625、1.25、2.50 U)進行考察。確定PCR擴增條件后,利用設(shè)計的廣地龍鑒別引物對收集的藥材進行PCR擴增,鑒別廣地龍及其混偽品,驗證該引物對的特異性。
使用動物DNA基因組提取試劑盒提取廣地龍及其混偽品滬地龍、海南地龍以及其他物種蟬蛻、蜈蚣等藥材的DNA,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳得到PCR擴增電泳圖,見圖1,擴增效果較好,條帶較亮,沒有拖尾現(xiàn)象,COⅠ序列擴增產(chǎn)物均在750 bp左右。通用引物不僅不能區(qū)分不同品種的地龍,且無法鑒別地龍和其他動物如蜈蚣,蟬蛻等。
經(jīng)測序采用引物設(shè)計Snapgene軟件,發(fā)現(xiàn)正品廣地龍及其混偽品的COⅠ基因序列擴增產(chǎn)物的差異,差異最顯著的基因片段見圖2。設(shè)計得到的廣地龍?zhí)禺愋砸餅镻A-f/PA-r,見表2。
表2 廣地龍鑒別引物
使用設(shè)計的特異性引物PA-f/PA-r進行PCR擴增,退火溫度在50~60 ℃的范圍內(nèi),廣地龍樣品均可以獲得574 bp左右的條帶,滬地龍通俗環(huán)毛蚓、威廉環(huán)毛蚓、櫛盲環(huán)毛蚓及大腔蚓均呈陰性,為確保退火溫度的穩(wěn)定,選擇55 ℃為適宜的退火溫度,見圖3A。在此基礎(chǔ)上,考察循環(huán)次數(shù)對PCR鑒別的影響,設(shè)置循環(huán)次數(shù)為32、35、38,結(jié)果顯示廣地龍均可以獲得約574 bp的條帶,其中循環(huán)35次條帶更清晰,滬地龍3個品種及大腔蚓均未獲得條帶,見圖3B,故選擇循環(huán)次數(shù)為35次。進一步對PCR反應(yīng)的DNA模板量進行考察,DNA模板量在3~100 ng廣地龍均可以擴增出特異性條帶,滬地龍3種品種及大腔蚓均呈陰性,見圖3C~D。由圖可見,隨著DNA模板量的增加,條帶的亮度增加,其中3、5 ng的擴增帶較弱,適合的DNA模板量為10~100 ng。對25 μL PCR反應(yīng)體系中的Taq聚合酶的用量進行考察,Taq聚合酶量為0.625~2.5 U,3個酶濃度下廣地龍都可獲得清晰、明亮的條帶,其余樣品則呈陰性,見圖3E。為了節(jié)約成本,最終確定0.625 U為25 μL PCR體系Taq聚合酶的加入量。
確定PCR擴增條件以后對37個批次地龍藥材和混偽品進行PCR擴增。采用廣地龍?zhí)禺愋砸颬A-f/PA-r對14批次廣地龍(7批廣西產(chǎn)和7批廣東產(chǎn))進行擴增,PCR鑒別圖如圖4所示;對4批廣地龍、6批通俗環(huán)毛蚓和4批威廉環(huán)毛蚓進行PCR擴增,結(jié)果見圖5;對3批廣地龍、3批櫛盲環(huán)毛蚓、6批大腔蚓,其他動物(水蛭、蜈蚣、僵蠶、蟬蛻等)進行PCR擴增,PCR鑒別結(jié)果見圖6。
由圖4可見,14批廣地龍樣品均可擴增出條帶,序列長度在574 bp左右,廣西產(chǎn)和廣東產(chǎn)的地龍條帶整齊、清晰,未見明顯差異。由圖5可見,只有4批廣地龍樣品呈陽性,可以擴增出清晰條帶,大小約574 bp,6批通俗環(huán)毛蚓和4批威廉環(huán)毛蚓地龍樣品呈陰性,無條帶擴增;由圖6可見,只有3批廣地龍可以擴增出條帶,3批櫛盲環(huán)毛蚓、6批大腔蚓地龍樣品呈陰性,無條帶擴增,水蛭、蜈蚣、僵蠶、蟬蛻其他動物樣品也呈陰性。實驗結(jié)果表明,設(shè)計的特異性引物可以區(qū)分廣地龍及3種滬地龍,也可以區(qū)分廣地龍及其他動物品種(蜈蚣、僵蠶、水蛭等)。
臨床入藥的地龍品種大多是廣地龍,但是目前市場上地龍品種繁雜,常有廣地龍的偽品混入其中,影響臨床用藥。地龍品種的傳統(tǒng)鑒定受到加工方式及程度的影響,性狀鑒定要求藥材保存完好,藥材破損情況下,性狀鑒別非常困難,此外還需專業(yè)人員和專業(yè)的儀器設(shè)備才能鑒定。本文設(shè)計廣地龍的特異性引物,進行廣地龍的DNA條形碼鑒定,對藥材保存要求較低,而且藥材用量很少,并且對藥材部位沒有要求,能提出DNA即可鑒定出是否為廣地龍品種。廣地龍品種的確定,為地龍臨床用藥提供了有效的方法。
目前動物藥DNA條形碼鑒別中,使用的基因片段有COⅠ、16SrRNA和12SrRNA序列,其中COⅠ序列最為常見。在預(yù)實驗中,對COⅠ、16SrRNA和12SrRNA 3對引物都進行了考察,發(fā)現(xiàn)使用COⅠ序列擴增的條帶比16SrRNA和12SrRNA序列更清晰。故本文選擇COⅠ序列作為地龍藥材的擴增引物。本文在COⅠ序列的基礎(chǔ)上擴增了廣地龍及混偽品,并對PCR擴增產(chǎn)物進行DNA測序,將廣地龍及混偽品的DNA序列進行比對,找出差異位點,設(shè)計了廣地龍的特異性引物PA-f/PA-r。引物是PCR特異性反應(yīng)的關(guān)鍵,PCR產(chǎn)物的特異性取決于引物與模板DNA互補的程度。本實驗設(shè)計的廣地龍?zhí)禺愋砸颬A-f/PA-r長度為25 bp左右,G+C含量約50%,避免了因G+C太少擴增效果不佳或G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶的情況。引物3'端的堿基,特別是最末及倒數(shù)第2個堿基,嚴格配對,避免了因末端堿基不配對而導(dǎo)致PCR失敗。
酶是PCR擴增的關(guān)鍵因子,酶質(zhì)量的好壞,濃度的大小直接影響著擴增的效果。本文選擇常用的Taq聚合酶,具有耐高溫(95 ℃)的特性,酶濃度過高可引起非特異性擴增,濃度過低則合成產(chǎn)物量減少,通過對酶量的考察,確定25 μL PCR反應(yīng)體系中酶的用量為0.625 U。DNA模板的濃度直接影響擴增的重復(fù)性、特異性和擴增的產(chǎn)量。過量的模板導(dǎo)致錯配機率增高、非特異性增大,模板太少,擴增產(chǎn)物重復(fù)性不佳、難以檢出。通過對DNA模板量的考察,最適宜的DNA模板量為10~100 ng。此外,對影響PCR特異性鑒別的其他重要因素退火溫度和循環(huán)次數(shù)等進行了考察,確定了PCR反應(yīng)適宜的條件范圍,最終建立了廣地龍?zhí)禺愋訮CR鑒別方法。
本論文設(shè)計得到的引物PA-f/PA-r具有較好的特異性,可快速、準確地鑒別廣地龍基原的真實性,可以區(qū)分廣地龍和3種品種的滬地龍,也可以準確鑒別廣地龍和偽品地龍(海南大腔蚓)及其他動物品種(蜈蚣、僵蠶、水蛭等),為廣地龍品種鑒定提供有效方法。