潘野雄 蔣皆恢 王敏 左傳濤
1上海大學(xué),上海先進(jìn)通信與數(shù)據(jù)科學(xué)研究院 200444;2復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院PET中心,上海 200235
阿爾茲海默癥(Alzheimer disease,AD)是一種老年性神經(jīng)退化性疾病,主要臨床表現(xiàn)為認(rèn)知功能下降、記憶力逐漸喪失、精神和日常生活能力顯著降低。目前全球AD患者超過(guò)千萬(wàn),且預(yù)計(jì)在未來(lái)的幾十年內(nèi)其患病率將急劇增長(zhǎng)[1]。
AD作為一種不可逆神經(jīng)退行性疾病,發(fā)病機(jī)制十分復(fù)雜,涉及到病理、生理系統(tǒng)間的各種相互作用,主要的病因包括腦灰質(zhì)中β-淀粉樣蛋白積聚的淀粉樣蛋白斑塊和與tau蛋白相關(guān)的神經(jīng)纖維纏結(jié)[2]。有研究表明,AD的疾病進(jìn)程與其他類型的分子病理、生理機(jī)制也存在相關(guān)性,如突觸功能障礙、神經(jīng)炎癥和腦代謝功能紊亂等[3-5]。因此,明確AD的發(fā)病進(jìn)程和病理、生理學(xué)特征是一項(xiàng)十分艱巨的挑戰(zhàn)。
近年來(lái)隨著人工智能技術(shù)的興起,各種數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)被廣泛地應(yīng)用于AD早期診斷和對(duì)其機(jī)理的研究中,其中,基于圖論的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析方法為臨床工作者提供了一個(gè)全新的視角[6]。該方法將大腦看作一個(gè)復(fù)雜的交互網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng),將腦區(qū)或神經(jīng)元組視作網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn),通過(guò)對(duì)比觀察AD患者和正常人群中腦網(wǎng)絡(luò)參數(shù)變化,實(shí)現(xiàn)對(duì)AD的早期鑒別和機(jī)理研究。在過(guò)去的十幾年,從動(dòng)物模型到活體人腦的跨物種研究已經(jīng)揭示了AD會(huì)造成腦網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)和功能變化,如小世界特性、富人俱樂(lè)部和分層模塊化等特性的變化[7-10]。而隨著諸多神經(jīng)影像學(xué)技術(shù)[如結(jié)構(gòu)磁共振成像(structural magnetic resonance imaging, sMRI)、功能磁共振成像(functional magnetic resonance imaging, fMRI)、PET 等]在 AD臨床的大規(guī)模普及應(yīng)用,基于神經(jīng)影像的AD復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)研究成為可能[7]。
綜上,復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析技術(shù)與腦神經(jīng)成像技術(shù)的結(jié)合為AD的早期診斷和明確其病理機(jī)制提供了全新的思路[8-9]。筆者將基于圖論復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)的相關(guān)概念,對(duì)其在AD領(lǐng)域的應(yīng)用進(jìn)展和未來(lái)發(fā)展趨勢(shì)等方面進(jìn)行綜述。
自Watts和Strogatz[10]首次提出圖論結(jié)合神經(jīng)系統(tǒng)分析框架后,基于圖論的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析技術(shù)被廣泛地應(yīng)用于動(dòng)物和人類的神經(jīng)系統(tǒng)研究。與神經(jīng)元的結(jié)構(gòu)相類似,復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析試圖理解由個(gè)體的功能單元(通常稱為節(jié)點(diǎn))及其之間的相互作用或連接(通常稱為邊)組成的腦結(jié)構(gòu)或功能系統(tǒng)。這些節(jié)點(diǎn)及其相互作用的邊結(jié)合形成一個(gè)網(wǎng)絡(luò)模型,這個(gè)網(wǎng)絡(luò)模型可用于描述、解釋或預(yù)測(cè)它所代表的真實(shí)物理網(wǎng)絡(luò)行為。例如,可使用N×N鄰接矩陣來(lái)描述成對(duì)節(jié)點(diǎn)之間的相互作用關(guān)系,其中N是網(wǎng)絡(luò)中的節(jié)點(diǎn)的數(shù)量,鄰接矩陣中第{i,j}個(gè)元素代表了節(jié)點(diǎn)i和節(jié)點(diǎn)j之間的連接強(qiáng)度[11-12];并使用數(shù)學(xué)方法來(lái)表征鄰接矩陣的體系結(jié)構(gòu)[13]。其他類似的方法,包括超圖(邊可以鏈接任意數(shù)量的頂點(diǎn))、單純復(fù)形(高階交互項(xiàng)成為基本單位)和非基于圖的技術(shù),同樣可用于分析構(gòu)成生物腦組織的神經(jīng)元網(wǎng)絡(luò)[14-15]。
復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)分析中,由MRI技術(shù)(如sMRI和彌散張量成像等結(jié)構(gòu)成像)構(gòu)建的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)被稱為結(jié)構(gòu)性腦網(wǎng)絡(luò),該網(wǎng)絡(luò)可根據(jù)成像出的腦解剖信息揭示腦結(jié)構(gòu)之間的生理相互關(guān)系;使用fMRI和PET等功能性成像技術(shù)構(gòu)建的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)被稱為功能性腦網(wǎng)絡(luò),通過(guò)分析該網(wǎng)絡(luò)各節(jié)點(diǎn)之間的腦血流動(dòng)力學(xué)或腦葡萄糖代謝水平相關(guān)性等,可以反映大腦在進(jìn)行功能活動(dòng)中各腦區(qū)或神經(jīng)元組之間的聯(lián)系。
為了實(shí)現(xiàn)腦網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,首先應(yīng)對(duì)腦網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)進(jìn)行定義,現(xiàn)有研究多使用先驗(yàn)解剖模板,如標(biāo)準(zhǔn)的大腦解剖標(biāo)記模板等;而各節(jié)點(diǎn)之間的相互關(guān)系有許多度量方法,其中使用最廣泛的包括皮爾遜相關(guān)和格蘭杰因果相關(guān)等[8-9]。
常規(guī)的復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)分析可以簡(jiǎn)要概括為以下5個(gè)步驟,如圖1所示。
(1)神經(jīng)成像。腦網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建分為兩種:針對(duì)結(jié)構(gòu)成像如sMRI、DTI等構(gòu)建結(jié)構(gòu)腦網(wǎng)絡(luò);或針對(duì)功能成像如fMRI、PET等構(gòu)建功能腦網(wǎng)絡(luò)。
(2)腦網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)定義。對(duì)于腦電圖或腦磁圖數(shù)據(jù),可以定義為電極的位置;對(duì)于sMRI、fMRI或PET數(shù)據(jù),可以定義為解剖學(xué)腦區(qū)。
(3)定義節(jié)點(diǎn)的結(jié)構(gòu)或功能連接。連接可以是sMRI數(shù)據(jù)中兩個(gè)腦區(qū)間之間的皮層厚度或灰質(zhì)體積測(cè)量值的相關(guān)性、彌散張量成像數(shù)據(jù)中兩個(gè)腦區(qū)之間的連接概率、腦電圖數(shù)據(jù)中兩個(gè)腦電圖電極信號(hào)之間格蘭杰因果關(guān)系或相位同步性、fMRI數(shù)據(jù)中兩腦區(qū)之間血流動(dòng)力信號(hào)的因果相關(guān)性、PET數(shù)據(jù)中兩腦區(qū)之間的代謝相關(guān)性等。
(4)計(jì)算成對(duì)節(jié)點(diǎn)之間的連接權(quán)重得到鄰接矩陣,通常對(duì)該矩陣進(jìn)行閾值化處理,去除連接較弱的連接,最后生成二值化的連接矩陣。
(5)計(jì)算腦網(wǎng)絡(luò)模型中感興趣的網(wǎng)絡(luò)參數(shù),如度、聚類系數(shù)、最短路徑長(zhǎng)度、小世界系數(shù)和模塊化系數(shù)等,并將它們與隨機(jī)網(wǎng)絡(luò)的等效參數(shù)進(jìn)行比較,或與對(duì)照組的網(wǎng)絡(luò)參數(shù)進(jìn)行比較,進(jìn)而發(fā)現(xiàn)與疾病相關(guān)的網(wǎng)絡(luò)特性。
圖1 腦網(wǎng)絡(luò)分析流程 圖中,DTI:彌散張量成像;sMRI:結(jié)構(gòu)磁共振成像;fMRI:功能磁共振成像;PET:正電子發(fā)射斷層顯像術(shù)Fig. 1 The workflow of brain network analysis
AD復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)研究主要基于sMRI、fMRI、PET等神經(jīng)影像(表1)。He等[16]基于sMRI影像的結(jié)構(gòu)性腦網(wǎng)絡(luò)研究結(jié)果表明,AD患者較正常對(duì)照組呈現(xiàn):(1)腦網(wǎng)絡(luò)全局整合能力下降,平均路徑長(zhǎng)度更長(zhǎng),全局效率降低;(2)網(wǎng)絡(luò)局部處理能力增加,如網(wǎng)絡(luò)具有更高的聚類系數(shù)。部分研究者將這些結(jié)果解釋為AD患者腦內(nèi)神經(jīng)元信息分離和整合平衡發(fā)生改變,導(dǎo)致AD患者的腦網(wǎng)絡(luò)傾向于向規(guī)則網(wǎng)絡(luò)(更高聚類系數(shù),更長(zhǎng)路徑長(zhǎng)度)方向演變,并進(jìn)一步證明了這些網(wǎng)絡(luò)參數(shù)與認(rèn)知變量和記憶表現(xiàn)之間具有相關(guān)性[26]。
Supekar等[17]基于fMRI影像的功能性腦網(wǎng)絡(luò)研究結(jié)果表明,AD患者較正常對(duì)照組呈現(xiàn):(1)腦網(wǎng)絡(luò)路徑長(zhǎng)度顯著增加,即AD患者大腦加工效率明顯下降,而且該網(wǎng)絡(luò)參數(shù)與患者疾病量表顯著相關(guān)[27];(2)AD患者腦網(wǎng)絡(luò)局部連接下降[28],如默認(rèn)模式網(wǎng)絡(luò)(靜息狀態(tài)下相互聯(lián)系、維持健康代謝活動(dòng)的若干腦區(qū)組成的網(wǎng)絡(luò))的連接下降。此外,雖然研究發(fā)現(xiàn)AD患者腦功能網(wǎng)絡(luò)局部功能連接下降,但由于大腦具有可塑性,因此AD患者腦功能網(wǎng)絡(luò)全局功能連接仍保持穩(wěn)定[29];(3) AD患者腦網(wǎng)絡(luò)遠(yuǎn)距離連接丟失嚴(yán)重[28,30]。研究結(jié)果同樣表明,中心節(jié)點(diǎn)在AD的形成中起著關(guān)鍵性作用。例如,Buckner等[31]發(fā)現(xiàn),AD患者在靜息態(tài)fMRI網(wǎng)絡(luò)中心節(jié)點(diǎn)腦區(qū)出現(xiàn)較高淀粉樣β-淀粉樣蛋白沉積,這表明AD患者的中心節(jié)點(diǎn)會(huì)受到疾病選擇性攻擊。部分研究結(jié)果同樣表明,AD患者腦網(wǎng)絡(luò)的中心節(jié)點(diǎn)連接減少,特別是在額葉和顳葉區(qū)域[32]。中心節(jié)點(diǎn)的改變?cè)谝欢ǔ潭壬辖忉屃薃D患者腦網(wǎng)絡(luò)中觀察到的較長(zhǎng)路徑長(zhǎng)度和較低局部效率??傊@些觀察結(jié)果與AD患者腦網(wǎng)絡(luò)小世界屬性減弱和遠(yuǎn)距離連接的丟失是一致的[18,33]。
表1 AD患者的神經(jīng)影像腦網(wǎng)絡(luò)研究Table 1 Brain network studies for AD subjects based on neuroimaging techniques
雖然基于PET影像的AD復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)研究起步較晚,但近年來(lái)發(fā)展迅速。基于FDG PET影像的網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果表明:使用稀疏逆協(xié)方差方法可以構(gòu)建代謝腦網(wǎng)絡(luò),通過(guò)與正常組的對(duì)比發(fā)現(xiàn),AD患者在顳葉腦區(qū)內(nèi)的功能連接減少,且額葉內(nèi)和頂葉與枕葉之間的功能連接也有減少[23-24]。Duan等[25]基于匹斯堡復(fù)合物PET影像的腦網(wǎng)絡(luò)分析揭示,AD患者的代謝腦網(wǎng)絡(luò)的小世界屬性增強(qiáng),集聚系數(shù)降低,最短路徑長(zhǎng)度明顯縮短。此外,基于PET/MRI多模態(tài)影像的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析也提高了AD疾病的早期預(yù)測(cè)能力[34]。
基于神經(jīng)影像的復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)研究正逐漸加深學(xué)界對(duì)AD病理的理解,而該技術(shù)的未來(lái)發(fā)展方向?qū)⒅饕性谀X網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)和功能系統(tǒng)化研究、腦網(wǎng)絡(luò)宏觀現(xiàn)象背后的微觀機(jī)制研究、結(jié)合PET/fMRI的多模態(tài)腦網(wǎng)絡(luò)研究以及結(jié)合機(jī)器學(xué)習(xí)和(或)深度學(xué)習(xí)方法的復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)研究等中。
第一,復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)分析的規(guī)范化和系統(tǒng)化。當(dāng)前腦網(wǎng)絡(luò)研究中,研究者常用平均最短距離、中心度、小世界屬性等來(lái)刻畫(huà)腦結(jié)構(gòu)或功能的屬性。隨著對(duì)該領(lǐng)域的不斷探索,近年來(lái)也相繼有研究者提出使用相關(guān)系數(shù)和介數(shù)等參數(shù),力求更加精準(zhǔn)、全方位地描述腦網(wǎng)絡(luò)[35]。然而,現(xiàn)有的網(wǎng)絡(luò)參數(shù)能否全面刻畫(huà)AD患者的腦網(wǎng)絡(luò)特征,是否存在未知宏觀參數(shù)能更好地描述AD患者腦網(wǎng)絡(luò)特性,都值得進(jìn)一步研究。此外,網(wǎng)絡(luò)分層研究將是一個(gè)重要趨勢(shì),最近大量實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明真實(shí)腦網(wǎng)絡(luò)具有分層結(jié)構(gòu)[36]。由于不同網(wǎng)絡(luò)層次對(duì)應(yīng)不同功能單元,因此如何選取特征量來(lái)刻畫(huà)這種分層結(jié)構(gòu)以及分層結(jié)構(gòu)如何影響AD患者腦網(wǎng)絡(luò)是當(dāng)今頗受關(guān)注的一個(gè)問(wèn)題[37]。
第二,探尋AD患者腦網(wǎng)絡(luò)宏觀現(xiàn)象背后的微觀機(jī)制也備受關(guān)注。雖然現(xiàn)在對(duì)網(wǎng)絡(luò)的無(wú)標(biāo)度性質(zhì)、小世界性質(zhì)的微觀機(jī)制已有一定了解,但是,對(duì)度相關(guān)、模塊結(jié)構(gòu)等更為復(fù)雜、宏觀性質(zhì)的微觀生成機(jī)制與AD病理關(guān)聯(lián)之間的探索還處于起步階段。
第三,PET/fMRI相結(jié)合的AD患者腦網(wǎng)絡(luò)研究。隨著影像學(xué)技術(shù)的發(fā)展,基于PET/fMRI成像的網(wǎng)絡(luò)分析正在成為腦網(wǎng)絡(luò)分析的主流方法。PET/fMRI的結(jié)合研究中,有不少研究關(guān)注PET檢測(cè)的局部腦活動(dòng)(常用的指標(biāo)是每個(gè)體素的測(cè)量值)與fMRI網(wǎng)絡(luò)屬性的關(guān)聯(lián)性分析[38-39]。因此,如何充分發(fā)揮PET/fMRI的成像優(yōu)勢(shì),也是AD患者腦網(wǎng)絡(luò)研究的重要方向之一。
第四,結(jié)合機(jī)器學(xué)習(xí)和(或)深度學(xué)習(xí)方法的腦網(wǎng)絡(luò)分析研究。在過(guò)去的研究中,基于機(jī)器學(xué)習(xí)和(或)深度學(xué)習(xí)的分類與預(yù)測(cè)模型已廣泛應(yīng)用到AD早期診斷,模型框架主要包括:基于機(jī)器學(xué)習(xí)和(或)深度學(xué)習(xí)的影像特征提??;基于回歸模型的特征降維、選擇以及疾病分類與預(yù)測(cè)。例如,該框架在輕度認(rèn)知障礙的轉(zhuǎn)換預(yù)測(cè)以及AD、輕度認(rèn)知障礙、正??刂平M的分類中獲得了較高的準(zhǔn)確率,其中支持向量機(jī)是最常見(jiàn)的分類與預(yù)測(cè)模型[38-40]。今后,是否能通過(guò)復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析獲取高維度影像特征,并結(jié)合機(jī)器學(xué)習(xí)和(或)深度學(xué)習(xí)進(jìn)行疾病分類與預(yù)測(cè),仍需要研究者進(jìn)一步探索。
雖然復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)分析方法已經(jīng)被應(yīng)用于AD早期診斷和對(duì)其的病理生理學(xué)探索,但是此方面研究仍處于初級(jí)階段,還存在許多亟待解決的難題。例如,AD患者腦網(wǎng)絡(luò)參數(shù)改變規(guī)律無(wú)法完全解釋其大腦結(jié)構(gòu)和功能變化;網(wǎng)絡(luò)分析方法不夠完善;現(xiàn)有結(jié)果無(wú)法歸納腦功能的動(dòng)態(tài)變化和結(jié)構(gòu)變化之間的相互影響等。今后的研究一方面需要完善復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)分析方法,使神經(jīng)影像能為臨床提供反映AD患者腦結(jié)構(gòu)和功能變化的更多定量指標(biāo),為AD早期診斷提供更具敏感性和特異性更高的腦網(wǎng)絡(luò)影像學(xué)標(biāo)記物;另一方面還需要深入研究AD患者網(wǎng)絡(luò)參數(shù)改變與認(rèn)知功能變化之間的關(guān)系,進(jìn)一步解釋AD病理機(jī)制??傊?,復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)技術(shù)為臨床進(jìn)一步了解大腦的結(jié)構(gòu)和功能提供了新的解決方法,因而基于神經(jīng)影像的AD復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)研究將會(huì)帶來(lái)廣闊的臨床應(yīng)用前景。
利益沖突本研究由署名作者按以下貢獻(xiàn)聲明獨(dú)立開(kāi)展,不涉及任何利益沖突。
作者貢獻(xiàn)聲明潘野雄負(fù)責(zé)論文的撰寫(xiě);蔣皆恢負(fù)責(zé)命題的提出和論文的審閱;王敏負(fù)責(zé)資料的整理和論文的修改;左傳濤負(fù)責(zé)命題的提出和論文的審閱。