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溫室白粉虱染色體水平基因組圖譜組裝成功(2020.4.13 科學(xué)網(wǎng))

2020-04-28 08:03:15
三農(nóng)資訊半月報(bào) 2020年7期
關(guān)鍵詞:虱的煙粉白粉

近日,《分子生態(tài)資源》在線發(fā)表了農(nóng)業(yè)害蟲溫室白粉虱的染色體級(jí)別基因組圖譜。

該項(xiàng)工作由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所(以下簡稱蔬菜所)蔬菜蟲害防控創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)和美國康奈爾大學(xué)BTI合作完成。他們揭示了溫室白粉虱發(fā)育特異性表達(dá)和抗藥性分子機(jī)制。該項(xiàng)研究對(duì)深入開展白粉虱功能基因組學(xué)研究、植物—昆蟲—微生物及病毒互作、粉虱類害蟲抗性治理應(yīng)用均具有重要意義。

論文第一作者、蔬菜所副研究員謝文介紹,溫室白粉虱和煙粉虱是世界上分布最廣且危害最為嚴(yán)重的兩種粉虱類害蟲。煙粉虱基因組在2016年和2017年由合作雙方共同解析完成,但溫室白粉虱基因組一直懸而未決。

在最新研究中,他們利用三代測(cè)序平臺(tái)Pacbio長reads和Hi-C技術(shù),實(shí)現(xiàn)了白粉虱基因組染色體級(jí)別的組裝,其組裝大小為787Mb,含11條染色體;注釋到18275個(gè)蛋白編碼基因,重復(fù)序列占基因組的56.6%。

通過白粉虱發(fā)育階段特異性表達(dá)分析,他們找到一些和白粉虱蛹化和羽化有關(guān)聯(lián)的基因,例如卵黃蛋白基因和cuticle基因。

此外,白粉虱和煙粉虱進(jìn)化上的分化程度遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于煙粉虱不同生物型之間。白粉虱和煙粉虱的比較基因組發(fā)現(xiàn),天冬氨酰蛋白酶家族在白粉虱中有顯著擴(kuò)張,這可能和白粉虱所特有的寄主偏好有關(guān)。通過細(xì)胞色素P450家族的比較分析,研究人員在白粉虱中找到了與煙粉虱CYPCM1同源的4個(gè)P450基因,這4個(gè)基因?qū)⒂兄诤Y選白粉虱代謝新煙堿類藥劑。

相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1111/1755-0998.13159

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