陳文文,鄭文鋁,余碩,花晨,戴秋云
1.軍事醫(yī)學研究院 生物工程研究所,北京 100071;2.復旦大學 基礎醫(yī)學院,上海 200433
馬爾堡病毒(Marburg virus,MARV)屬絲狀病毒屬,為單股負鏈非節(jié)段RNA 病毒,在電鏡下呈細絲狀,為烈性傳染病馬爾堡出血熱的病原體。自1967 年發(fā)現(xiàn)以來,在非洲多地曾多次暴發(fā),累計出現(xiàn)460 多個感染病例,已造成380 多人死亡,病死率超過80%[1-2],最近的一次馬爾堡出血熱疫情發(fā)生在2017 年的烏干達,導致3 人死亡[3]。馬爾堡病毒基因組約19 kb,由7 個獨立的開放讀框(ORF)組成,共編碼7 個蛋白[4-5],分別為核衣殼蛋白(nucleocapsid protein,NP)、包膜糖蛋白(glyco?protein,GP)、基質蛋白(matrix protein)VP40,以及非結構蛋白VP24、VP30、VP35 和病毒聚合酶L(polymerase L),其中GP 是介導病毒進入宿主細胞的關鍵蛋白,也是疫苗及中和抗體的抗原或靶標[6-10]。一般認為,GP 亞單位GP1 負責細胞附著,GP2 催化 膜融 合[4]。 GP2 包 含 2 個 七肽重 復區(qū),N端和C 端(分別為NHR 和CHR)在融合過程中采用六螺旋束結構,這種結構為病毒和細胞膜融合提供了熱力學驅動力[11]。MARV 與埃博拉病毒(EBOV)同屬絲狀病毒,且二者的GP2 具有60%的序列同源性,總體結構相似,病毒進入機制可能類似[11-13]。目前,已發(fā)現(xiàn)來自 EBOV 的 CHR 的 C 肽具有較好的進入抑制活性,如GP610、1-chol、Tat-Ebo[14-17],但 MARV 的 CHR 的 C 肽抑制活性未見報道,作用機制也不清楚。我們合成了來自MARV的CHR 區(qū)域的C 肽MP 及突變體,利用pVAX1-MGP 與pNL-4.3-Luc-R-E-質粒包裝假病毒體系,測定各肽對假病毒融合的抑制活性;利用圓二色譜、凝膠色譜分析C 肽及其突變體對MARV 的N肽的相互作用,發(fā)現(xiàn)MARV 的C 肽與N 肽相互作用較弱,導致C 肽的抗病毒活性較弱,但C 肽改造后可提高活性。
BHK21-WI2、293T 細胞,pVAX1-MGP 質粒由本實驗室保存;pNL-4.3-Luc-R-E-質粒由中國醫(yī)學科學院病原生物學研究所種輝輝老師饋贈;Li?pofectAMINE 2000 購 自 Invitrogen 公 司 ;96 孔細 胞培養(yǎng)板、DMEM、胎牛血清購自Thermo Fisher Sci?entific 公司;細胞裂解液、螢光素酶報告試劑盒購自Promega 公司;Rink 樹脂購自天津南開公司;1-羥基苯并三唑(HOBT)、苯并三氮唑-四甲基脲六氟磷酸鹽(HBTU)、Fmoc 保護氨基酸等購自上海吉爾生化有限公司;哌啶、二甲基甲酰胺(DMF)、二氯甲烷、無水甲醇、無水乙醚等購自國藥集團;三氟乙酸(TFA)、二異丙基二乙胺(DIEA)等購自北京伊諾凱有限公司。
多肽固相合成儀(德國Zinsser analytic 公司);旋轉蒸發(fā)儀(日本Eyela 公司);凍干機(德國Christ 公司);安捷倫1200 型高效液相色譜儀(美國 Agilent Technologies 公司);Waters 1525 高效液相色譜儀(美國Waters 公司);多功能酶標儀(美國 PE 公司);microTOF QII 質譜儀(德國 Bruker 公司);Chirascan plus 圓二色光譜儀(英國Applied Photophysics Ltd 公司)。
C 肽(MP)來 源 于 MARV GP 的 CHR 區(qū) 域(611~637 殘基),MP-1 為 MP 的 N 端增加一個亮氨酸的C 肽突變體,以增加疏水相互作用;MP-2~MP-5 分別為 MP-1 的 b、f、c、g 位增加電荷相互作用氨基酸,以穩(wěn)定分子的α螺旋結構,同時增加C 肽與 N 肽作用的電荷相互作用;MP-6~MP-9 分別為MP 突變體N 端增加來自抗HIV 融合多肽的部分螺旋鏈(WEEILKK、WMEWDRE)[18]的突變體;MP-10 的 MT 也來自抗 HIV 融 合 多 肽[19-20],期望增加與N 肽的相互作用。
MGP 的N 肽(MGP-N)粗品由中科亞光公司合成,其余多肽采用本實驗室的Zinsser analytic多肽合成儀合成[21-22]。合成的0.06 mol 肽-樹脂用裂解液(TFA∶DTT∶H2O∶TIS=4.4 mL∶0.25 g∶0.25 mL∶0.1 mL)裂解,室溫攪拌 3 h 脫去保護基,旋轉蒸發(fā)除去大部分TFA,加入提前冷卻的無水乙醚,4℃靜置半小時,抽濾得粗肽。粗肽經HPLC 純化,純化柱為 Kromasil-C18 柱(100 ?,10 μm,10 mm×250 mm),0.1%三氟乙酸的水及乙腈梯度洗脫,凍干得純肽干粉。純化后的多肽經分析型HPLC 分析[色譜柱為Agilent Eclipse Plus C18(5 μm,4.6 mm×250 mm)。梯度:0~1 min,5% ~10% B;1~25 min,10% ~50% B。 A 為 含0.1% TFA 的水,B 為含 0.1% TFA 的乙腈,流速 1 mL/min,波長214 nm],最后用質譜儀測定多肽的相對分子質量。
參考實驗室之前研究的馬爾堡假病毒包裝策略[23],轉染前1 h 用Opti-DMEM 培養(yǎng)基處理細胞,pVAX1-MGP 與 pNL4-3.Luc.R-E-質粒按 1∶2 的比例共轉染293T 細胞,72 h 后收獲上清,添加FBS 至20%,0.2 μm 濾膜過濾,-80℃凍存?zhèn)溆谩?/p>
假病毒與不同濃度的抑制劑等體積混合,各50 μL/孔加入96 孔板中,陰性對照組加入等體積的H2O,37℃孵育30 min 備用。胰酶消化BHK21-WI2 細胞,用含2% FBS 的培養(yǎng)基重懸細胞至2×105/mL,向孵育后的96 孔板中每孔加入50 μL 細胞稀釋液,48 h 后裂解細胞,檢測相對發(fā)光值RLU,計算假病毒抑制率,用GraphPad-Prism 5 軟件計算各抑制劑的半數抑制濃度(IC50)值。
用0.01 mol/L 的磷酸緩沖液(pH7.2)配制各多肽溶液及N 肽與各C 肽、突變體的混合物溶液(終濃度均為35 μmol/L)。圓二色譜在室溫下測定,λ=190~260 nm,d=1 mm,空白對照為 0.01 mol/L 磷酸緩沖液,重復3 次取平均值并計算摩爾橢圓度。實驗數據用Origin 軟件進行繪圖及處理,用下式計算各多肽的α螺旋含量[24-25]:
α螺旋含量=(-[θ]222-2340)/30300
MGP-N、C 肽及C 肽突變體分別用磷酸鹽緩沖液(0.05 mol/L,pH7.2)稀釋至 0.2 mmo/L,各取30 μL 上樣,流速 0.8 mL/min,檢測波長214 nm,色譜柱為 TSK-G2000SWxl 柱(日本 Tosoh Biosci?ence LLC 公司)。C 肽、突變體與 MGP-N 復合物的高壓凝膠色譜條件同上,但等體積的MGP-N 與C 肽、突變體混合后,37℃水浴中孵育30 min 后上樣(60 μL)。
各多肽(表1)純度大于95%,部分多肽的HPLC 分析圖及質譜檢測結果見圖1、2,相對分子質量測定結果與理論計算一致。
各抑制劑IC50見圖3、表1。結果顯示,MARV的GP 蛋白C 肽對MARV 有一定的抑制活性,但抑制活性較差(IC50=32.67 μmol/L),其突變體活性IC50=9.61~33.47 μmol/L,其中 MP-4 的活性最高。抑制劑 MP-8 濃度≥20 μmol/L 時,顯著影響細胞正常生長,細胞毒性較高,未進行后續(xù)活性檢測。
表1 MARV的C肽氨基酸序列及抑制活性
典型多肽及混合肽圓二色譜結果見圖4,α螺旋含量計算結果見表 2。除 MP-6~MP-8 外,C 肽及 N 肽本身的α 螺旋含量低(0.30%~6.85%)(表2),在N 端增加螺旋鏈后(MP-6~MP-8),α螺旋含量提高(33.66%~69.77%),顯著高于其他C 肽。N肽與C 肽混合后形成了典型的α螺旋結構,MP、MP-1~MP-5 及 MP-9~MP-10 與 N 肽混合后α螺旋顯著增加(16.23%~29.23%),但 MP-6~MP-8 與MGP-N 混合后α螺旋含量變化不大。
圖1 部分多肽的HPLC 分析圖
圖2 部分多肽的質譜圖
圖3 部分多肽的IC50 結果
圖4 N 肽、C 肽及其復合物的圓二色譜
部分多肽及復合物的凝膠排阻色譜結果見圖5。N 肽與MP-6、MP-7 的出峰時間明顯早于其他肽,且N 肽峰高很低,顯示上述多肽可能形成了聚合體。N 肽與 MP、MP-1~MP-4、MP-9~MP-10 復合物凝膠排阻色譜結果類似(圖未列出),沒有出現(xiàn)明顯的多肽與MGP-N 復合物洗脫峰,但N肽與MP-5、MP-6 混合后出現(xiàn)了新的洗脫峰,說明有部分復合物的形成。
MP 的抑制活性較弱(IC50=32.67 μmol/L),通過增加 b、f、c、g 位的電荷相互作用可以提高 C 肽的活性,如 MP-4 的抑制活性(IC50=9.61 μmol/L)為MP、MP-1(IC50分別為32.67、33.47 μmol/L)的3倍多。然而,C 肽或復合物的α螺旋含量提高與活性的增加并無對應關系,如MP-6 的α螺旋含量較MP-4 有顯著提高,但抑制活性(IC50=15.82 μmol/L)低于MP-4。
表2 多肽及混合物α螺旋含量
圖5 多肽及其復合物凝膠排阻色譜
凝膠排阻色譜結果顯示,MP-6 及MP-7 自身也發(fā)生了聚集,可能與其N 端引入的螺旋序列有關。MP-5、MP-6 與N 肽混合后形成的新峰并未最先出峰,說明其多聚體并不大。N 肽的自聚集作用且α螺旋率低,可能影響了其與C 肽形成六束α螺旋,導致C 肽的抗病毒活性較低。
此外,在抑制劑活性檢測過程中,抑制劑濃度大于70 μmol/L 時,顯著影響細胞正常生長,48 h 后檢測,RLU 值遠大于陽性對照組,可能是高濃度的抑制劑破壞了細胞膜的完整性,導致病毒更易進入細胞。
總之,馬爾堡病毒包膜糖蛋白的C 肽抗病毒活性較弱,C 肽與N 肽相互作用較弱,C 肽改造后活性提高。本工作可為馬爾堡病毒抑制劑的設計提供參考。