嚴(yán)福林,溫 迪,任得強(qiáng),王 波,徐文芬,孫慶文,魏升華
(貴州中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院 貴陽(yáng) 550025)
清風(fēng)藤屬Sabia隸屬于清風(fēng)藤科Sabiaceae,我國(guó)分布 16 種、5 亞種、2 變種,分為清風(fēng)藤組Sect.Sabia與厚盤組Sect. Pachydiscus,主要集中分布于我國(guó)貴州、云南、廣西等西南地區(qū)[1,2]。清風(fēng)藤屬植物大多入藥使用,以小花清風(fēng)藤藥用最為廣泛,具有清熱利膽、祛風(fēng)止痛等功效,常用于治療肝炎、風(fēng)濕痹痛、跌打損傷等疾病,亦為貴州苗族、布依族等少數(shù)民族常用藥[3,4]。現(xiàn)代研究表明,清風(fēng)藤屬植物主要含有黃酮類、生物堿類及三萜類成分,具有顯著的抗乙肝病毒、保肝護(hù)肝、降酶、抗炎等作用[5-12]。此外,清風(fēng)藤屬植物藤蔓特殊,適應(yīng)性強(qiáng),亦是良好的園藝造景植物。可見(jiàn),該屬植物具有較好的園藝價(jià)值和藥物開(kāi)發(fā)價(jià)值。
清風(fēng)藤屬植物花期較短,花瓣易脫落,果實(shí)較少,標(biāo)本往往缺乏重要的鑒定器官,給該屬植物的系統(tǒng)分類學(xué)研究和藥材的真?zhèn)舞b別帶來(lái)了挑戰(zhàn)。王波、劉科成、溫迪等[13-16]在顯微鏡下對(duì)清風(fēng)藤屬植物葉表皮細(xì)胞、淀粉、非腺毛、石細(xì)胞特征進(jìn)行觀察,該屬植物的淀粉、非腺毛、葉表皮、石細(xì)胞形態(tài)、大小及紋孔等方面存在一定差異。郭文凱、孫慶文等[17]采用顯微觀察和數(shù)學(xué)統(tǒng)計(jì)學(xué)相結(jié)合的方法對(duì)凹萼清風(fēng)藤、平伐清風(fēng)藤、小花清風(fēng)藤等9 種清風(fēng)藤屬種植物葉片表皮細(xì)胞顯微表征進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)毛被與細(xì)胞形態(tài)不同。以上研究取得了卓著的成效,為該屬植物的分類及其藥材鑒別提供了重要的參考。Sui 等[18]采用DNA 條形碼技術(shù),考察了trnH-psbA、rbcL-a、matK 3個(gè)候選系列在小花清風(fēng)藤及其混偽品中的鑒定可行性,其中,3個(gè)候選系列均能將清風(fēng)藤屬植物與其他科屬植物分開(kāi),matk + rbcL-a 可將小花清風(fēng)藤與其他科(防己科、衛(wèi)矛科、茜草科等)的7種植物區(qū)別開(kāi),為小花清風(fēng)藤藥材及其偽品的鑒定奠定了基礎(chǔ)。但以上研究在取樣上還有一定局限,研究種類較少,該屬植物的分類與鑒定仍然依靠經(jīng)驗(yàn)豐富的專家[19,20]。因此,探求一種準(zhǔn)確簡(jiǎn)便又行之有效的鑒別方法來(lái)鑒別清風(fēng)藤屬植物的系統(tǒng)分類與鑒定仍然尤為重要。
內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)2 序列(internal transcribed spacer 2,ITS2)是核基因上位于5.8S rRNA 基因區(qū)和大的亞單位編碼區(qū)28S之間的一個(gè)片段,具有通用性好、變異性高、擴(kuò)增和測(cè)序料率高等優(yōu)點(diǎn),是分析動(dòng)植物系統(tǒng)進(jìn)化、分類鑒定的較好基因片段。在淫羊藿屬、人參屬、蘭屬、等諸多藥用生物的分類和鑒定中得到了廣泛應(yīng)用,是鑒定物種屬及物種水平的研究熱點(diǎn)[21-26]。本研究基于前期基礎(chǔ),對(duì)9種清風(fēng)藤屬藥用植物38個(gè)產(chǎn)地樣品進(jìn)行ITS2序列分析,為清風(fēng)藤屬植物的分類鑒定與系統(tǒng)學(xué)提供參考,為該屬植物的種質(zhì)資源的保護(hù)與可持續(xù)開(kāi)發(fā)利用奠定基礎(chǔ)。
本研究為清風(fēng)藤科清風(fēng)藤屬植物的9 個(gè)物種,38份樣品采自貴州、云南、重慶、臺(tái)灣4 個(gè)地區(qū)。對(duì)應(yīng)標(biāo)本均由貴州中醫(yī)藥大學(xué)孫慶文教授鑒定,憑證標(biāo)本存于貴州省生藥重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室標(biāo)本室。材料信息詳見(jiàn)表1。
取硅膠干燥的葉片約20 mg,根據(jù)試劑盒(Tiangen Biotech Co.,China)操作提取樣品總 DNA 樣本。候選引物 ITS2,以 50 μL 體系:24 μL Tad PCR Matermix(2×,bluedye)、正反向引物各2 μL,總DNA 模板2 μL,ddH2O 20 μL 進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增;擴(kuò)增程序均為:94℃,5 min;94℃,30 s;56℃,30 s;72℃,45 s;40 cycles;72℃,10 min。引物序列為 ITS2(堿基序列(5'-3')):2FATGCGATACTTGGTGTGAAT,3R-GACGCTTCTCCAGACTACAAT。經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳中檢測(cè),條帶單一且清晰的PCR產(chǎn)物送至上海生工純化及測(cè)序。
表1 樣品信息表
測(cè)序后所得峰圖應(yīng)用Codon Code Aligner V 8.0.2(CodonCode Co.,USA)軟件進(jìn)行校對(duì)拼接,去除引物區(qū)和低質(zhì)量序列。所得各序列經(jīng)ClustalX V 2.0(Higgins D.G)進(jìn)行多序列比對(duì)并查錯(cuò);再應(yīng)用The ITS2 Database在線工具(http://its2.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/)進(jìn)行注釋剪切,去除序列兩端5.8S 和28S 區(qū);應(yīng)用Geneious V 10.0.02 軟件分析ITS2 序列的組成和結(jié)構(gòu)特點(diǎn);使用MEGA V 7.0軟件計(jì)算(Kimura 2-parameter,K2P)距離值,比較ITS2序列的種間、種內(nèi)變異,應(yīng)用最大似然法(maximum likelihood,ML)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。
本研究統(tǒng)計(jì)了38 個(gè)居群清風(fēng)藤屬植物分子樣進(jìn)行PCR 擴(kuò)增后的擴(kuò)增成功率和測(cè)序成功率。結(jié)果顯示,擴(kuò)增成功率與測(cè)序成功率均為100%,表明本研究所選用的ITS2 序列引物在清風(fēng)藤屬植物中的通用性好。測(cè)序所得的序列經(jīng)拼接、去除引物區(qū)和低質(zhì)量序列,剪切兩端5.8S和28S區(qū),清風(fēng)藤屬植物的ITS2序列長(zhǎng)度均為241 bp,GC 含量為51.9-64.7%。保守位點(diǎn)168 個(gè),變異位點(diǎn)數(shù)目為73 個(gè),簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)數(shù)目為65 個(gè)。CpG、TpG(CpA)和 TpA 頻率為 20.75%(50/241),2倍簡(jiǎn)并位點(diǎn)25個(gè),4倍簡(jiǎn)并位點(diǎn)39個(gè)(圖1)。
應(yīng)用MEGA 7.0 軟件通過(guò)K2P 模型,統(tǒng)計(jì)清風(fēng)藤屬種間和種內(nèi)遺傳分化情況,獲得的ITS2序列的種內(nèi)與種間變異值詳情見(jiàn)表2。ITS2 序列在清風(fēng)藤屬中,種內(nèi)變異為0-0.074,其中種內(nèi)變異最大的為S.swinhoei(0.074±0.002),S.campanulata與S.fasciculate種內(nèi)遺傳變異為0;種間變異在0.007-0. 205,其中S.discolor與S. swinhoei種間遺傳距離最大,為 0.205 ±0.007,S.campanulata與S.transarisanensia種間遺傳距離最小,為0.007。總體看,ITS2 序列在清風(fēng)藤屬內(nèi)種間遺傳距離與種內(nèi)遺傳距離存在一定間隔,可將各種類進(jìn)行區(qū)分,是清風(fēng)藤屬植物較為理想的DNA條形碼候選序列。
應(yīng)用ML,自展支持率(bootstrap)1000 次重復(fù)檢驗(yàn)進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建(圖2)。由ITS2 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)可知:清風(fēng)藤屬厚盤組Sect.Pachydiscus下的四川清風(fēng)藤、鐘花清風(fēng)藤亞種(鄂西清風(fēng)藤)、云南清風(fēng)藤、阿里山清風(fēng)藤4 個(gè)種聚為1 支,組下的4 個(gè)種又各為單列,具有一定的遺傳距離,能夠較好的將清風(fēng)藤屬2 個(gè)組區(qū)分。其中,廣布種四川清風(fēng)藤由于采集地居群差異,具有較大的遺傳距離,貴陽(yáng)居群與其余居群區(qū)分,這與遺傳距離分析結(jié)果一致。
清風(fēng)藤組Sect.Sabia下的小花清風(fēng)藤S.parviflora、簇花清風(fēng)藤S. fasciculata樣品較好的各自聚為一支,可與其余種類較好的區(qū)分。平伐清風(fēng)藤S.dielsii與灰背清風(fēng)藤S.discolor聚成一支,且灰背清風(fēng)藤S.discolor2 個(gè)樣品均鑲嵌于平伐清風(fēng)藤S.dielsii中,不宜區(qū)分。尖葉清風(fēng)藤S. swinhoei樣品均能聚為成一支,但各產(chǎn)地樣品變異較大,不能聚類??梢?jiàn),小花清風(fēng)藤、簇花清風(fēng)藤、云南清風(fēng)藤、鄂西清風(fēng)藤較為保守;平伐清風(fēng)藤與灰背清風(fēng)藤親緣關(guān)系較近,但平伐清風(fēng)藤與四川清風(fēng)藤變異較為復(fù)雜。
清風(fēng)藤屬藥用植物以莖葉及根入藥,由于其特殊的藥用功效多數(shù)種類在其產(chǎn)地均為藥用,最早記載于宋代的《本草圖經(jīng)》,后《本草綱目》及貴州、湖南、廣西等地的《天目山藥用植物志》、《廣西本草選編》等地方醫(yī)藥典籍與醫(yī)藥地方標(biāo)準(zhǔn)均有記載。又名“青藤、尋風(fēng)藤”等,具有祛風(fēng)利濕,活血解毒等功效。以小花清風(fēng)藤藥用最為廣泛,在廣西、貴州、云南、湖南、湖北等地均有藥用,用于治療和預(yù)防黃疸型傳染性肝炎。現(xiàn)代研究表明,清風(fēng)藤屬植物具有良好的抗肝炎作用,有巨大的開(kāi)發(fā)利用潛力。
目前,清風(fēng)藤屬植物及其藥材的分類鑒定主要依賴于性狀鑒別,顯微方法等傳統(tǒng)方法。由于其特殊的結(jié)構(gòu)特性、遺傳與分布特性,依靠標(biāo)本難以對(duì)其進(jìn)行分類鑒定,該屬植物系統(tǒng)分類與鑒定還有待完善,尤其在清風(fēng)藤藥材的鑒定過(guò)程中應(yīng)用傳統(tǒng)分方法更難以區(qū)分。本研究對(duì)9 種清風(fēng)藤屬藥用植物38 個(gè)居群核基因片段ITS2序列的結(jié)構(gòu)、種間遺傳距離與系統(tǒng)關(guān)系進(jìn)行了分析。結(jié)果顯示,ITS2 序列在清風(fēng)藤屬植物中的擴(kuò)增率成功率與測(cè)序成功率均達(dá)到100%,引物通用性較好,較為容易得到質(zhì)量較高的序列片段,具有較高的可行性。
表2 清風(fēng)藤屬植物ITS2序列種內(nèi)和種間平均遺傳距離
圖2 基于ITS2構(gòu)建的清風(fēng)藤屬藥用植物ML系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)
分析獲得清風(fēng)藤屬ITS2 序列保守位點(diǎn)168 個(gè),變異位點(diǎn)數(shù)目73 個(gè),簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)數(shù)目65 個(gè);其中,二倍簡(jiǎn)并位點(diǎn)25 個(gè),四倍簡(jiǎn)并位點(diǎn)39 個(gè)。表明,ITS2 序列在清風(fēng)藤屬藥用植物中具有較好的進(jìn)化速率與變異程度,種間變異位點(diǎn)豐富,且種內(nèi)變異位點(diǎn)較少。
ITS2 序列在清風(fēng)藤屬種內(nèi)變異為0-0.074,種間變異為0.007-0.205,但從各種間遺傳距離看,種間遺傳距離均大于種內(nèi)遺傳距離,具有較好的種間分離度。從ITS2 構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)結(jié)果看,在四川清風(fēng)藤、尖葉清風(fēng)藤、灰背清風(fēng)藤等部分廣布種中,存在屬內(nèi)種間遺傳距離與種內(nèi)遺傳距離存在交叉,大多數(shù)種內(nèi)具有穩(wěn)定的遺傳,近地理居群親緣較近。系統(tǒng)樹(shù)基本符合傳統(tǒng)的系統(tǒng)分類學(xué)方法,清風(fēng)藤組Sect.Sabia從清風(fēng)藤屬中區(qū)分聚為一個(gè)大支,包括于厚盤組Sect.Pachydiscus中,傳統(tǒng)的分類方法將其單列,與清風(fēng)藤組Sect.Sabia平行,有待進(jìn)一步從基因組角度研究探討。種間聚類情況與遺傳距離分析結(jié)果一致,具有較好的種間分化。平伐清風(fēng)藤為貴州特有植物,是典型的狹域分布種類,具有明顯的區(qū)域分布特征,系統(tǒng)關(guān)系分析中,平伐清風(fēng)藤與灰背清風(fēng)藤親緣關(guān)系較近,且平伐清風(fēng)藤變異較為復(fù)雜,所有樣品不能更好聚類。這提示平伐清風(fēng)藤在可能是一個(gè)雜交形成物種,但還需結(jié)合形態(tài)特征,從多序列或基因組的角度進(jìn)一步深入研究,予以證實(shí)。
綜上,除平伐清風(fēng)藤、灰背清風(fēng)藤與廣布種四川清風(fēng)藤外,ITS2 序列基本能將屬下物種進(jìn)行區(qū)分。因此認(rèn)為,ITS2 序列在清風(fēng)藤屬植物中具有適宜的分化和保守性,能夠?qū)ΨN間進(jìn)行較為準(zhǔn)的分類和鑒別。研究中除阿里山清風(fēng)藤外,均具有2個(gè)以上的產(chǎn)地樣品,進(jìn)行了反復(fù)驗(yàn)證,具有可重復(fù)性,符合清風(fēng)藤屬藥用植物DNA條形碼鑒定要求。因此,本研究中的ITS2序列適用于清風(fēng)藤屬藥用植物的分類鑒定和系統(tǒng)學(xué)分析。本研究豐富了清風(fēng)藤屬藥用植物的分子生物學(xué)研究數(shù)據(jù),為該屬植物的種類鑒定、物種起源、演化與系統(tǒng)學(xué)等研究提供了一定參考。