趙曦,鄭德洪
(廣西大學(xué)農(nóng)學(xué)院 南寧市 530004)
許多植物病原細(xì)菌引發(fā)的重要病害,給各國(guó)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失,盡管許多研究學(xué)者不斷研究對(duì)抗植物病原細(xì)菌的防治辦法,但依然較難防控病原細(xì)菌病害。
丁香假單胞菌能夠引起菜豆暈疫病、桃樹潰瘍病、十字花科黑斑病、番茄細(xì)菌性葉斑病等,現(xiàn)已感染300 多種經(jīng)濟(jì)作物,包括豆科、十字花科、薔薇科、茄科等,是引發(fā)植物病害十大病害之首[1]。
青枯雷爾氏菌可能是世界上最具破壞性的植物病原細(xì)菌。它是一種土壤傳播的病原體,通過植物的傷口、根尖或側(cè)根出芽處的裂縫感染植物,造成植物整株萎蔫。由于青枯雷爾氏菌遍布世界許多國(guó)家和地區(qū),它們的地理來源、宿主范圍和致病行為各不相同,在熱帶地區(qū)的許多發(fā)展中國(guó)家的農(nóng)業(yè)中發(fā)病率較高[2]。
農(nóng)桿菌是冠癭瘤的病原體,冠癭瘤是世界范圍內(nèi)影響各種作物的最嚴(yán)重的植物病害之一。在自然界中,這種土壤細(xì)菌在寄主植物的傷口部位誘導(dǎo)腫瘤生長(zhǎng),嚴(yán)重限制了作物的生長(zhǎng)能力和產(chǎn)量。
水稻黃單胞菌是一種棒狀革蘭氏陰性細(xì)菌。它產(chǎn)生一種黃色的可溶性色素(稱為菌黃素)以及胞外多糖。胞外多糖在保護(hù)細(xì)菌免受環(huán)境影響以及幫助細(xì)菌在風(fēng)、雨傳播擴(kuò)散方面具有重要作用。水稻黃單胞菌的傳播途徑包括灌溉用水系統(tǒng)、水花飛濺或風(fēng)吹雨淋,以及最重要的初級(jí)接種源是受侵染的上一季稻茬。水稻黃單胞菌引起的水稻白葉枯病對(duì)水稻產(chǎn)量影響非常大,減產(chǎn)達(dá)20%~30%嚴(yán)重可達(dá)50%~60%甚至顆粒無收[2]。
國(guó)內(nèi)外研究學(xué)者對(duì)植物病害的防治進(jìn)行了大量的研究,目前的防治措施有以下幾類:
由于化學(xué)藥劑成本較低,人們對(duì)其使用不加以限制,出現(xiàn)濫用、過量使用化學(xué)藥劑的情況。不同種類的化學(xué)藥劑的使用,對(duì)環(huán)境和人體都存在負(fù)面影響。抗生素的濫用還會(huì)導(dǎo)致一些植物病原菌對(duì)抗生素的抗性,植物病原菌對(duì)抗生素的耐藥性已成為防治病原細(xì)菌的嚴(yán)重問題[3-5]。常用的抗生素類殺菌劑如農(nóng)用硫酸鏈霉素、中生菌素等使病原細(xì)菌產(chǎn)生較強(qiáng)的抗藥性,防治效果較差且對(duì)人體、動(dòng)物及環(huán)境有較強(qiáng)的毒害作用,國(guó)家即將出臺(tái)政策將抗生素類化學(xué)藥劑列為“處方藥”,不得濫用[6]。
常用的銅基化合物殺菌劑如無機(jī)銅化物、堿式硫酸銅(波爾多液)等。自1885 年波爾多液首次用于植物病害防治以來,大量的銅基抗菌化合物被開發(fā)應(yīng)用于植物保護(hù),銅基化合物對(duì)植物病原細(xì)菌有較強(qiáng)的毒性,對(duì)動(dòng)物的毒性較低且制作成本低廉。隨著銅基抗菌化合物大量頻繁的使用,許多病原細(xì)菌對(duì)銅基化合物產(chǎn)生了抗性。銅基化合物大多為堿性,無法與其他農(nóng)藥混用,可混性差,且重金屬對(duì)環(huán)境的污染,引起人們對(duì)生態(tài)系統(tǒng)長(zhǎng)期可持續(xù)性的擔(dān)憂[4]。
土壤處理法處理一些土傳病害,使用土壤添加劑、土壤暴曬和熏蒸等方法。例如利用塑料薄膜覆蓋地面,膜下灌水淹沒土壤,密封30 d左右,如遇連續(xù)高溫,土壤溫度可達(dá)60℃,20 d 即可起到殺蟲殺菌的作用[7]。缺點(diǎn)是操作有一定難度,同時(shí)會(huì)對(duì)土壤中的一些有益微生物造成損害。
合理的輪作能夠在一定程度上降低少數(shù)植物的病原細(xì)菌的為害。如煙草黑脛病、蠶豆根腐病、甜菜褐斑病、西瓜蔓割病和番茄青枯病等均通過土壤侵染。如將感病的寄主作物與非寄主作物實(shí)行輪作或水旱作物輪作,便可較大程度地減少這種病菌在土壤中的數(shù)量,減輕病害;同時(shí)也可減少作物根部的線蟲,使其在土壤中的蟲卵數(shù)量減少,達(dá)到減輕危害的目的。
抗病品種是利用常規(guī)雜交育種技術(shù)結(jié)合分子標(biāo)記輔助選擇技術(shù),快速高效地選育優(yōu)良品種的一種技術(shù)手段[8]??共∑贩N的選育能夠使該品種在一定程度上減少病蟲害的發(fā)生。例如雜交得到感溫型常規(guī)稻品種白絲占,能夠抗白葉枯強(qiáng)病毒菌系Ⅴ型菌兼抗稻瘟病,抗白葉枯病(Ⅳ型菌1 級(jí),Ⅴ型菌3級(jí))[9]。
噬菌體是一種專門殺死細(xì)菌的病毒,但對(duì)非靶向的細(xì)菌和人類無毒[10]。早在100 多年前被發(fā)現(xiàn),但當(dāng)時(shí)抗生素的崛起,導(dǎo)致科研人員擱置了對(duì)噬菌體的研究。由于時(shí)代的發(fā)展,人們?cè)絹碓街匾暽鷳B(tài)環(huán)境的保護(hù)。細(xì)菌對(duì)抗生素產(chǎn)生耐藥性,以及使用化學(xué)品對(duì)環(huán)境可能產(chǎn)生的不良影響,使人們重新對(duì)開發(fā)替代控制策略來防治植物中的細(xì)菌性病害產(chǎn)生了興趣[11]。噬菌體是通過在細(xì)菌內(nèi)感染、復(fù)制、傳播。噬菌體在生態(tài)系統(tǒng)中廣泛存在且種類豐富,存在于所有可以發(fā)現(xiàn)細(xì)菌的環(huán)境中,在人類和動(dòng)物身上也有他們的身影,在生態(tài)系統(tǒng)營(yíng)養(yǎng)循環(huán)、細(xì)菌病原體的進(jìn)化等方面起著非常重要的作用。噬菌體和細(xì)菌在進(jìn)化中勢(shì)均力敵,不相上下。盡管我們看不到噬菌體,但它對(duì)我們的生活依然起到相當(dāng)重要的作用。噬菌體作為生物農(nóng)藥正在被廣泛研究。
噬菌體根據(jù)核酸類型可分為四大類:?jiǎn)捂淒NA(ssDNA)、雙鏈DNA(dsDNA)、單鏈RNA(ssRNA)、雙鏈RNA(dsRNA)。由于噬菌體專性寄生于易感染病原細(xì)菌,按照噬菌體在宿主細(xì)胞體內(nèi)呈現(xiàn)的生命狀態(tài)可分為4 種:裂解性、溶原性、偽溶原性和慢性感染[12]。根據(jù)形態(tài)大體分為頭尾、瓶狀、絲狀、水滴狀、桿狀、球狀等[13]?,F(xiàn)有關(guān)于噬菌體的報(bào)道大多為裂解性噬菌體,近幾年相繼出現(xiàn)了利用絲狀噬菌體治療的報(bào)道[14-15]。
頭尾結(jié)構(gòu)的噬菌體是通過中空的尾部將遺傳物質(zhì)注射到宿主菌細(xì)胞內(nèi),一旦進(jìn)入細(xì)胞,噬菌體就會(huì)利用宿主菌細(xì)胞的代謝機(jī)制,在細(xì)胞內(nèi)完成遺傳物質(zhì)的復(fù)制、組裝,最后裂解宿主細(xì)胞。宿主細(xì)胞被裂解后釋放大量子代噬菌體,子代噬菌體再次侵入相鄰細(xì)胞,循環(huán)往復(fù)。絲狀噬菌體,由幾千個(gè)不等(例如M13由6 407個(gè)核苷酸)的核苷酸構(gòu)成一個(gè)環(huán)狀單鏈DNA,呈螺旋陣列排列,再由長(zhǎng)絲的管狀衣殼蛋白包裹著[16]。絲狀噬菌體相對(duì)溫和,不會(huì)溶解宿主細(xì)胞,與宿主細(xì)胞共生共存。絲狀噬菌體進(jìn)入細(xì)胞后,在細(xì)胞內(nèi)繁殖,再從細(xì)胞內(nèi)源源不斷地分泌出來,噬菌體在細(xì)胞內(nèi)持續(xù)釋放病毒粒子,但噬菌體的合成和釋放都不會(huì)破壞細(xì)胞或使細(xì)胞裂解,細(xì)胞處于持續(xù)感染狀態(tài)。例如絲狀噬菌體VGJφ、CTXφ和φRSM1從霍亂弧菌基因組中切除一部分堿基對(duì),但不會(huì)殺死宿主細(xì)胞[17]。
在許多年前,研究學(xué)者已經(jīng)認(rèn)識(shí)到噬菌體能夠很大程度影響細(xì)菌基因組進(jìn)化[15]。利用基因工程改造噬菌體,能夠直接或間接賦予噬菌體殺菌能力,例如將rpsL和gyrA基因整合到溫和噬菌體中,受感染的病原細(xì)菌對(duì)鏈霉素敏感[18]。隨著人口增長(zhǎng)對(duì)糧食產(chǎn)量的巨大需求,噬菌體防治病害的應(yīng)用與日俱增,噬菌體既可以作為單獨(dú)的防治策略,也可以作為綜合防治的一部分。
Kelvin Kimutai Kering 發(fā)現(xiàn)噬菌體混合物可以與低濃度的CuSO4一起用于殺死更多的植物病原菌[19]。Flaherty 等人利用突變噬菌體對(duì)天竺葵白葉枯病進(jìn)行防治,每日噴灑突變噬菌體混合液于濕潤(rùn)天竺葵葉片表面,與對(duì)照組(未噴灑噬菌體混合液)相比,每天使用噬菌體混合物降低了70%~85%的發(fā)病率[11]。Obradovic 利用噬菌體合成孔徑雷達(dá)誘導(dǎo)劑在6周左右的番茄根部施藥,能夠顯著降低番茄細(xì)菌斑病的發(fā)生[20]。Adriaenssens 利用噬菌體?AS1浸泡受感染的馬鈴薯種子塊莖,軟腐病病情明顯減輕,產(chǎn)量增加13%[21]。Das等人利用噬菌體雞尾酒療法提前處理未發(fā)病的葡萄藤,預(yù)防通過昆蟲傳播的葡萄皮爾斯病,能夠明顯降低葡萄皮爾斯病的發(fā)病率[22]。Rombouts 利用從韭菜白葉枯病地區(qū)土壤中分離、篩選到噬菌體,提前用噬菌體浸泡韭菜苗再將其種植在含有紫丁香單胞菌的地區(qū),韭菜白葉枯病的發(fā)病率明顯降低?;蚍N植韭菜后噴灑噬菌體混合液,噴灑噬菌體混合液的韭菜與未噴灑噬菌體的對(duì)照組發(fā)病率分別為38.5%和63%。兩種方法都能能夠明顯抑制韭菜白葉枯病的發(fā)病[23]。Wei利用噬菌體雞尾酒療法防治馬鈴薯青枯病,將6種噬菌體混合液注入植株能使80%的馬鈴薯免受青枯病困擾,噴灑混合液一周后能夠殺滅土壤中98%的青枯菌[24]。Muturi利用噬菌體抑制果膠桿菌引起的肯尼亞馬鈴薯軟腐病,在馬鈴薯切片上接種細(xì)菌前后1 h,涂抹噬菌體,可使軟腐病減輕90%以上[25]。Denyes 等人利用噬菌體具有特異性的特點(diǎn)對(duì)大量食源性細(xì)菌進(jìn)行穩(wěn)健和特異性診斷,不僅可以降低食源性疾病的發(fā)病率,還可以降低傳統(tǒng)病原體檢測(cè)的昂貴費(fèi)用[26]。越來越多的研究學(xué)者利用噬菌體防治病原細(xì)菌,噬菌體作為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)防治有很大的發(fā)展前景。
噬菌體是包括根系在內(nèi)的生態(tài)系統(tǒng)中最豐富的生物之一,在細(xì)菌的進(jìn)化過程中起到了至關(guān)重要的作用。而且噬菌體對(duì)環(huán)境沒有毒性,不會(huì)造成環(huán)境污染。1921年Bruynoghe等最先使用噬菌體制劑治療皮膚葡萄球菌化膿性感染,病情在2 d內(nèi)有所好轉(zhuǎn),身體其他部位未受影響[27]。
由于噬菌體有很強(qiáng)的生物特異性,只感染宿主細(xì)菌,對(duì)非靶向細(xì)胞沒有識(shí)別能力,對(duì)環(huán)境中的其他菌群不產(chǎn)生影響,不會(huì)破壞土壤微生物的多樣性,可滿足當(dāng)代提倡的綠色無公害農(nóng)業(yè)要求。
盡管噬菌體的基因組相對(duì)較小,但是對(duì)宿主細(xì)胞的影響卻很大[16]。由于噬菌體基因組堿基或堿基對(duì)數(shù)量少,使得噬菌體的基因組測(cè)序、分子克隆和基因組學(xué)研究都相對(duì)容易[28]。噬菌體基因組較小,但是依舊能夠從已被大家熟知的噬菌體中揭示新的信息,說明與它們的小體積相比,它們對(duì)病原菌的行為和進(jìn)化都有重要影響[16]。噬菌體也會(huì)根據(jù)病原菌的突變產(chǎn)生適當(dāng)?shù)淖儺悾瑐鹘y(tǒng)細(xì)菌病害防治手段則不具備這種優(yōu)勢(shì)。
噬菌體由于基因組序列較小,研制開發(fā)所需的時(shí)間短、成本低,僅需將噬菌體與宿主菌細(xì)胞共培養(yǎng),通過離心就可以去除細(xì)菌碎片獲得噬菌體粗提物。例如Wei從不同地區(qū)含有青枯病的土壤中分離到的噬菌體,通過噬菌體與高濃度的宿主菌細(xì)胞共培養(yǎng)一段時(shí)間后離心得到的噬菌體用于實(shí)驗(yàn)[24]。得到的噬菌體易于保存,在4℃條件下可以儲(chǔ)存幾個(gè)月沒有明顯的消亡。
噬菌體無法自我復(fù)制,需要在宿主細(xì)胞內(nèi)復(fù)制繁殖,如果沒有宿主細(xì)胞,噬菌體無法在環(huán)境中長(zhǎng)期存活,會(huì)在較短時(shí)間內(nèi)凋亡。一般噬菌體對(duì)植物病原細(xì)菌的防治是將噬菌體施用于植物根際,由于噬菌體的結(jié)構(gòu)不太穩(wěn)定,在環(huán)境中長(zhǎng)期儲(chǔ)存有一定困難,會(huì)受到土壤中其他微生物、土壤的pH、紫外線等因素影響。
由于細(xì)菌和噬菌體之間無休止的爭(zhēng)奪,細(xì)菌已經(jīng)進(jìn)化出噬菌體抗性,例如毒素—抗毒素系統(tǒng)、CRISPR CAS免疫系統(tǒng),會(huì)使噬菌體無法進(jìn)入病原細(xì)菌或一旦進(jìn)入,病原細(xì)菌啟動(dòng)自殺系統(tǒng),防止噬菌體在細(xì)菌內(nèi)復(fù)制合成[29]。宿主細(xì)胞對(duì)噬菌體也可以產(chǎn)生抗性突變,宿主菌細(xì)胞的受體對(duì)于噬菌體侵染細(xì)菌起著至關(guān)重要的作用。如果宿主菌細(xì)胞突變與噬菌體結(jié)合的受體,使噬菌體受體不可接近宿主細(xì)菌或與宿主細(xì)菌受體結(jié)合蛋白不互補(bǔ),噬菌體就失去了有效感染宿主的能力。受體結(jié)構(gòu)的改變以及噬菌體受體的喪失也可能導(dǎo)致吸附受阻[30]。
化學(xué)物質(zhì)對(duì)噬菌體的影響研究至今還相對(duì)較少,但是表面活性劑和天然有機(jī)物會(huì)影響噬菌體的存活,其中表面活性劑破壞性較強(qiáng)[31]。
施用噬菌體24 h 后,其存活率明顯降低。頻繁施用噬菌體是目前提高防治效果最有效的方法。但在日常應(yīng)用上,經(jīng)濟(jì)條件是主要問題,需要評(píng)估和尋找延長(zhǎng)作物中的噬菌體壽命的化合物平衡環(huán)境與條件。
由于噬菌體結(jié)構(gòu)的特點(diǎn),不易在環(huán)境中長(zhǎng)期存活,但在溶液中具有一定的穩(wěn)定性[32],考慮到噬菌體的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),可以添加賦形劑或者將噬菌體溶液轉(zhuǎn)化成粉末制劑作為提高噬菌體穩(wěn)定的手段[19]。針對(duì)噬菌體對(duì)溫度、pH、紫外線等環(huán)境因素的敏感性,可調(diào)整施用時(shí)間,如夜間或清晨使用噬菌體制劑,延長(zhǎng)噬菌體存活時(shí)間,以盡可能多的感染病原細(xì)菌。此外,噬菌體可以通過基因改造,降低病原細(xì)菌對(duì)噬菌體產(chǎn)生抗性的可能[33]??梢岳檬删w依附在無毒性的病原細(xì)菌內(nèi)投入環(huán)境中進(jìn)行生物防治。
隨著社會(huì)的發(fā)展,人們?cè)絹碓街匾暱股氐葌鹘y(tǒng)防治手段對(duì)環(huán)境的破壞,為實(shí)現(xiàn)自然生態(tài)協(xié)調(diào)可持續(xù)發(fā)展的環(huán)境友好型社會(huì),各界研究學(xué)者努力尋找新型生物防治辦法抵御病原細(xì)菌。噬菌體有價(jià)格低廉、數(shù)量龐大、易于生產(chǎn)、保存便利等特點(diǎn),已然成為極其重要的生物防治手段之一。噬菌體作為生態(tài)系統(tǒng)中存在范圍最廣,數(shù)量、種類都非常繁多的生物,對(duì)特定病原細(xì)菌的特異性極強(qiáng),且對(duì)環(huán)境、人體及其他細(xì)菌沒有毒害作用,有利于環(huán)境保護(hù)。在噬菌體與細(xì)菌爭(zhēng)奪戰(zhàn)中,噬菌體一直占據(jù)著有利條件。相比化學(xué)藥劑在很大程度上降低了病原細(xì)菌抗性的產(chǎn)生。噬菌體作為植物病害生物防治還處于研究階段,研究學(xué)者可以通過各種途徑對(duì)噬菌體進(jìn)行探索和研究,未來利用噬菌體作為植物病害的生物防治手段有良好的發(fā)展前景。