薛 威, 喜多島敏彥, 高曉冬
(江南大學(xué) 生物工程學(xué)院,江蘇 無錫214122)
蛋白質(zhì)天冬酰胺連接的糖基化(N-糖基化)是高等真核生物中重要的蛋白質(zhì)翻譯后修飾途徑。 天冬酰胺連接的糖鏈(N-糖鏈)可以幫助蛋白質(zhì)在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中正確折疊[1];在高爾基體中,糖鏈末端的甘露糖會被水解掉,然后N-乙酰氨基葡萄糖轉(zhuǎn)移酶I 在糖鏈末端加上一個N-乙酰葡糖胺(GlcNAc)[2],接下來一系列糖基轉(zhuǎn)移酶進(jìn)一步修飾糖鏈結(jié)構(gòu)。 各酶的底物特異性和相對活性的差異導(dǎo)致同一糖蛋白在細(xì)胞內(nèi)也可能攜帶不同的糖鏈結(jié)構(gòu)。 這種糖鏈結(jié)構(gòu)上的異質(zhì)性不僅會影響蛋白質(zhì)的純化和生產(chǎn)可重復(fù)性,還可能影響藥用蛋白質(zhì)的藥物動力學(xué)特性和生物活性[3-4]。 通過基因組編輯改變細(xì)胞N-糖鏈修飾途徑可以優(yōu)化糖鏈結(jié)構(gòu),然而蛋白質(zhì)的糖鏈依然存在一定異質(zhì)性[5]。
內(nèi)切-β-N-乙酰氨基葡糖苷酶(ENGase)是一類水解N-糖鏈中核心殼二糖之間β-1,4-糖苷鍵的酶類。 它具有兩大家族, 即糖苷水解酶85 家族(GH85)和糖苷水解酶18 家族(GH18)。 GH18,如Endo-H, 具有水解糖苷鍵的功能。 而Endo-M 和Endo-Om 等GH85 除具有水解酶功能外,還可以將整個寡糖轉(zhuǎn)移到含一個GlcNAc 的受體上[6-9]。 化學(xué)酶合成法合成均一糖蛋白就是利用該類酶的轉(zhuǎn)糖基功能。 該方法的應(yīng)用潛力受到糖苷酶的底物選擇性及活性的限制,如何開發(fā)出高活性和低底物選擇性的ENGase 仍然是一個很大的挑戰(zhàn)。
綠色熒光蛋白(GFP)由238 個氨基酸組成,其11 個β 折疊和4 個α 螺旋構(gòu)成圓筒形結(jié)構(gòu), 通常情況下會形成二聚體。 將第221 位亮氨酸突變成賴氨酸(L221K)可得到單體綠色熒光蛋白(mGFP);第65 位絲氨酸突變成蘇氨酸(S65T)后蛋白質(zhì)熒光增強(qiáng)(EGFP)[10]。 自被發(fā)現(xiàn)以來,綠色熒光蛋白及其各種突變體在基因表達(dá)水平研究、 蛋白質(zhì)定位分析、蛋白質(zhì)糖基化研究、膜蛋白拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析等方面具有廣泛應(yīng)用[11-15]。研究表明,將GFP 的147 位天冬酰胺突變成蘇氨酸(N147T),使其含有一個N-糖基化位點(diǎn)(N-glycosylatable GFP,Ng-GFP),該突變體熒光強(qiáng)度對N-糖基化敏感[14]。本研究中作者使用的是熒光增強(qiáng)的單體綠色熒光蛋白(mEGFP) 及其147糖基化突變體Ng-mEGFP。 在與人N-乙酰氨基葡萄糖轉(zhuǎn)移酶(hGnTI)跨膜區(qū)域(1~99 aa)融合表達(dá)后, 成功將Ng-mEGFP 定位到中國倉鼠卵巢細(xì)胞(Chinese hamster ovary cell,CHO K1) 高爾基體中,并篩選出表達(dá)融合蛋白hGnTI- mEGFP (GE)和hGnTI- Ng-mEGFP (GN) 的 單 細(xì) 胞 株K1GE 和K1GN。用衣霉素處理后,K1GN 細(xì)胞熒光強(qiáng)度降低,同時細(xì)胞糖基化被抑制,二者呈現(xiàn)很好的相關(guān)性。
酵母表達(dá)載體pRS-424-TEF-αfactor-mEGFPHDEL、 動物細(xì)胞表達(dá)載體pME18sf-PGKpPuro 和pME-Zeo-hGnTI-EGFP-Flag、 大 腸 桿 菌E. coliDH5α、中國倉鼠卵巢細(xì)胞:均為作者所在實驗室保存; 質(zhì) 粒pRS-424-TEF-αfactor-Ng-mEGFPHDEL:為作者所在實驗室柳藝石構(gòu)建。
DNA 聚合酶PrimeSTAR、DNA 限制性內(nèi)切酶、T4DNA 連接酶: 大連TaKaRa 公司; 氨芐青霉素、goat serum 、SanPrep 柱式質(zhì)粒DNA 小量抽提試劑盒、SanPrep 柱式DNA 膠回收試劑盒、SanPrep 柱式PCR 產(chǎn)物純化試劑盒: 上海Sangon Biotech;Triton X-100、多聚甲醛:SIGMA;Endo Hf、PNGaseF:NEB;DNA ladder Marker、Mouse Anti-GFP、Goat Anti-Mouse HRP:北京全式金生物;Rabbit Anti-GPP130:BioLegend;BSA、磷酸鹽緩沖液(PBS)、嘌呤霉素、Lipofectamine2000、Alexa Fluor? 488 chicken antimouse IgG (H +L) conjugate、Alexa Fluor ? 555 donkey anti-rabbit IgG (H+L):Invitrogen。 氯化銨、SDS、NaCl、Tris、HCl:國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司。
封閉緩沖液A:含1% BSA,0.1% NaN3和0.1%Triton X-100 的PBS 溶液。
封閉緩沖液B:含2.5% goat serum,0.05% NaN3和0.1% Triton X-100 的PBS 溶液。
細(xì)胞裂解液:含20 mmol/L Tris-HCl(pH 7.5),150 mmol/L NaCl,1% Triton X-100,0.1% SDS 的PBS 溶液。
以mEGFP 為模板設(shè)計擴(kuò)增引物, 在末端加10個組氨酸作為標(biāo)簽(華大基因合成):
上游引物 (mEGFP-F):5’-gcgcACGCGTATGG TGAGCAAGGGCGAGGAGCTG-3’,含MluI 位點(diǎn);
下游引物(mEGFP-10His-TAA):5’- aaaaGCG GCCGCTTAGTGGTGGTGGTGATGGTGATGATGATG ATGCTTGTACAGCTCGTCCATGCCGAGAG -3’, 含NotI 位點(diǎn)。
用1.3 中 引 物, 以pRS-424-TEF-αfactormEGFP -HDEL 或 pRS -424 -TEF -αfactor -Ng -mEGFP-HDEL 為模板PCR 擴(kuò)增得到mEGFP 和Ng-mEGFP 的DNA 片段。PCR 條件如下:94 ℃預(yù)變性2 min;98 ℃變性30 s;50 ℃退火30 s;68 ℃延伸80 s,35 個循環(huán)。 以上PCR 產(chǎn)物經(jīng)純化后雙酶切(MluI 和NotI); 質(zhì)粒pME-Zeo-hGnTI-EGFP-Flag雙酶切 (XhoI 和MluI) 得到高爾基體定位序列hGnTI; 質(zhì)粒pME18sf-PGKpPuro 雙酶切 (XhoI 和NotI)得到整合質(zhì)??蛰d體。以上雙酶切(37 ℃、3 h)產(chǎn)物用1 g/dL 瓊脂糖凝膠做膠回收,得到的產(chǎn)物按照2∶2∶1(V∶V∶V)比例加入10 μL 體系連接(16 ℃、3 h)。 取5 μL 連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)E. coliDH5α,氨芐青霉素平板篩選陽性克隆子,得到整合質(zhì) 粒 pME18sf -PGKpPuro -hGnTI -mEGFP 和pME18sf-PGKpPuro-hGnTI-Ng-mEGFP。 所有質(zhì)粒均送上海Sangon Biotech 測序。
按以下操作順序?qū)⒄腺|(zhì)粒pME18sf-PGKpPuro-hGnTI-mEGFP 和pME18sf-PGKpPurohGnTI-Ng-mEGFP 線性化: 取10 μg 質(zhì)粒單酶切(FspI,37 ℃,3 h); 向酶切體系中加入1/10 體積的醋酸鈉和2.5 倍體積無水乙醇(-20 ℃,20 min);離心(15 000 r/min、5 min), 去上清液; 加入500 μL 70% 乙醇,振蕩混勻;離心(15 000 r/min、5 min),去上清液;室溫干燥;將DNA 沉淀溶于20 μL TE 用于線性化轉(zhuǎn)染。
CHO K1 細(xì)胞用含10%胎牛血清(BI)的DMEM(Gibco)培養(yǎng)基在37 ℃、5% CO2條件下于10 cm 培養(yǎng)皿貼壁生長。 轉(zhuǎn)染前,胰酶(Gibco)消化細(xì)胞接種于6 cm 培養(yǎng)皿(接種密度40%)。 培養(yǎng)24 h 后換4 mL 新培養(yǎng)基, 同時加入線性化質(zhì)粒(Lipofectamine2000 操作手)。培養(yǎng)12 h 后換新培養(yǎng)基。
線性化轉(zhuǎn)染3 d 后,消化細(xì)胞,用含6 μg/mL 嘌呤霉素的DMEM 培養(yǎng)基傳代培養(yǎng)3 周獲得穩(wěn)定表達(dá)嘌呤霉素抗性基因的混合細(xì)胞株,利用有限稀釋法篩選單細(xì)胞株。
對于衣霉素(Tunicamycin)處理實驗,細(xì)胞接種于6 孔板 (接種密度30%), 用不同濃度衣霉素的DMEM 培養(yǎng)基培養(yǎng)48 h,胰酶消化收集細(xì)胞用于分析。
胰酶消化收集細(xì)胞于1.5 mL 離心管,用500 μL磷 酸 鹽 緩 沖 液 (phosphate buffered saline,PBS,Sangon)洗滌并重懸。 用BD Accuri C6(BD)流式細(xì)胞分析儀檢測細(xì)胞綠色熒光蛋白質(zhì)信號。
細(xì)胞經(jīng)4 ℃PBS 洗兩次后, 用4% 多聚甲醛PBS 溶液孵育20 min 使其固定。 PBS 清洗兩次,然后用50 mmol/L 氯化銨PBS 溶液孵育10 min。 吸去氯化銨溶液, 用封閉緩沖液A 透化細(xì)胞60 min,然后 用 含 一 抗 (Mouse Anti-GFP 或Rabbit Anti-GPP130;1∶400)的封閉緩沖液B 孵育60 min。 用封閉緩沖液A 清洗兩次除去一抗, 然后加入含二抗(Alexa Fluor? 488 chicken anti-mouse IgG (H+L)conjugate 或Alexa Fluor? 555 donkey anti-rabbit IgG(H+L),1∶800)的封閉緩沖液A 孵育60 min。 用Nikon C2si 共聚焦顯微鏡收集細(xì)胞熒光信號數(shù)據(jù),NIS-Elements AR analysis4.20.00 處理輸出圖片,Photoshop 調(diào)整圖片對比度。
6 孔板長滿后收集細(xì)胞于1.5 mL 離心管,用500 μL 4 ℃PBS 洗一次,離心除去PBS。 用100 μL細(xì)胞裂解液裂冰上解細(xì)胞30 min,離心(1 500 r/min、10 min)收集上清液蛋白質(zhì)。在蛋白質(zhì)溶液中加入變性劑,使其終濃度為0.5% SDS 和0.5 mmol/L DTT,然后于95 ℃加熱5 min,使蛋白質(zhì)徹底變性。 每30微升蛋白質(zhì)中加入1 μL Endo Hf 或PNGaseF 于37℃孵育3 h。 用10%聚丙烯酰胺凝膠跑蛋白質(zhì)電泳,用Mouse Anti-GFP (1∶5 000) 和Goat Anti- Mouse HRP(1∶6 000)檢測目標(biāo)蛋白質(zhì)。
按照1.4 中的方法, 成功構(gòu)建整合質(zhì)粒pME18sf-PGKpPuro-hGnTI-mEGFP 和pME18sf-PGKpPuro-hGnTI-Ng-mEGFP。 雙酶切經(jīng)1 g/dL 瓊脂糖凝膠電泳檢測,在1 066 bp 處為目標(biāo)基因片段hGnTI- mEGFP(圖1 泳道1)和hGnTI- Ng-mEGFP(圖1 泳道2),5 124 bp 處為空載體。
圖1 整合質(zhì)粒雙酶切驗證Fig. 1 Confirmation of the plasmids expressing GE and GN
利用1.6 中的方法將2.1 中質(zhì)粒線性化后轉(zhuǎn)染CHO K1 細(xì)胞,線性化轉(zhuǎn)染的整合效率較低,作者用嘌呤霉素篩選整合成功的基因。 轉(zhuǎn)染pME18sf-PGKpPuro-hGnTI-mEGFP 后,有39.9%的存活細(xì)胞獲得了GN (圖2 紅色峰圖); 轉(zhuǎn)染pME18sf-PGKpPuro-hGnTI-Ng-mEGFP 后, 有58.0%存活細(xì)胞獲得了GE(圖2 綠色峰圖)。 結(jié)果顯示,融合了N-乙酰氨基葡萄糖轉(zhuǎn)移酶的跨膜區(qū)域后,蛋白質(zhì)仍然可以發(fā)出熒光, 且整合了GN 的細(xì)胞熒光明顯弱于GE 的細(xì)胞熒光。 可以用此混合細(xì)胞株篩選出單細(xì)胞株用于進(jìn)一步研究。
得到穩(wěn)定表達(dá)GN 和GE 的混合細(xì)胞株后,作者用有限稀釋法篩選出單細(xì)胞株K1GN 和K1GE。單細(xì)胞株K1GN 細(xì)胞熒光強(qiáng)度約為K1GE 細(xì)胞的1/10(圖3(a))。
GPP130 是一個定位在高爾基體的膜蛋白[16],被廣泛用于高爾基體定位研究[17]。 作者用GPP130 作為高爾基體定位參照,圖3(b)中間一列紅色熒光定位圖給出了結(jié)合抗GPP130 抗體的二抗發(fā)出的熒光,顯示高爾基體的位置信息。 左側(cè)一列綠色圖給出了結(jié)合抗GFP 抗體的二抗發(fā)出的熒光, 顯示GN在細(xì)胞中的位置。 可以看出GN 與GPP130 定位在相同位置。 結(jié)果表明,作者構(gòu)建的融合蛋白質(zhì)成功定位到了高爾基體。
圖2 線性化轉(zhuǎn)染后混和細(xì)胞株熒光分析Fig. 2 Fluorescence of bulk population after liner transfection
衣霉素(Tunicamycin)是一種類核苷酸抗生素,可以抑制阻斷細(xì)胞N-糖鏈合成途徑[18]。使用含有不同質(zhì)量濃度衣霉素的DMEM 培養(yǎng)基培養(yǎng)細(xì)胞,2 d后收集細(xì)胞做流式細(xì)胞儀分析。 用DMSO 作為對照處理細(xì)胞,K1GN 的熒光信號強(qiáng)度約為1.4×104。 當(dāng)衣霉素質(zhì)量濃度大于0.5 μg/mL 時, 細(xì)胞熒光信號開始有明顯降低(圖4(b))。當(dāng)衣霉素質(zhì)量濃度大于1 μg/mL 時, 細(xì)胞EGFP 熒光信號峰出現(xiàn)明顯偏移(圖4(a)),此時細(xì)胞熒光強(qiáng)度約降低30%(圖4(b)(c))。
圖3 單細(xì)胞株熒光分析及GN 定位分析Fig. 3 Fluorescence microscopy of single cell line expressing GN
為確定細(xì)胞熒光強(qiáng)度降低與綠色熒光蛋白的糖基化程度是否有關(guān)系, 作者提取圖4A 中流式細(xì)胞儀分析所剩細(xì)胞的蛋白質(zhì),做蛋白質(zhì)免疫印跡分析。當(dāng)衣霉素質(zhì)量濃度大于0.5 μg/mL 時,蛋白質(zhì)糖基化水平明顯降低,且隨著衣霉素質(zhì)量濃度逐漸提高,蛋白質(zhì)糖基化水平會進(jìn)一步降低,與細(xì)胞熒光強(qiáng)度變化有很好的相關(guān)性(圖4(b)和圖4(c))。 這一表型在該細(xì)胞株中穩(wěn)定存在。 另外,被糖基化的蛋白質(zhì)條帶1 程彌散狀態(tài), 用PNGaseF 切除糖鏈后該條帶消失(圖4(c)),表明該蛋白質(zhì)上糖鏈結(jié)構(gòu)不均一,可以通過基因組編輯敲除高爾基體中蛋白質(zhì)N-糖基化途徑中下游特定基因,如St8sia IV、Fut4 等[19-20],在高爾基體中積累特定糖鏈結(jié)構(gòu)的Ng-mEGFP。
圖4 N-糖基化對K1GN 細(xì)胞熒光的影響Fig. 4 Effect of N-glycasylation on mEGFP fluorescence
將N-乙酰氨基葡萄糖轉(zhuǎn)移酶的跨膜定位區(qū)域與綠色熒光蛋白質(zhì)融合表達(dá),成功把帶有天冬酰胺連接糖基化位點(diǎn)的單體增強(qiáng)綠色熒光蛋白質(zhì)定位到中國倉鼠卵巢細(xì)胞的高爾基體中,并篩選得到單細(xì)胞株K1GN。流式細(xì)胞儀分析顯示,融合了定位區(qū)域后的綠色熒光蛋白質(zhì)仍可以發(fā)出熒光,在引入糖基化位點(diǎn)后,其熒光強(qiáng)度約降低10 倍。 用含不同質(zhì)量濃度衣霉素的培養(yǎng)基培養(yǎng)細(xì)胞,蛋白質(zhì)糖基化被抑制,同時細(xì)胞熒光信號強(qiáng)度相應(yīng)減弱。 當(dāng)衣霉素質(zhì)量濃度大于1 μg/mL 時, 細(xì)胞EGFP 熒光信號峰出現(xiàn)明顯偏移,此時細(xì)胞熒光強(qiáng)度約降低30%。 本研究證明了該細(xì)胞株熒光強(qiáng)度對N-糖基化敏感,可以在其高爾基體中表達(dá)ENGase, 檢測細(xì)胞熒光強(qiáng)度及蛋白質(zhì)糖基化水平以判定ENGase 的糖苷水解酶活性。
本研究所用mEGFP 第147 位糖基化突變體,內(nèi)源表達(dá)該突變體的CHO 細(xì)胞在有無糖鏈情況下表現(xiàn)出一定熒光差異。 可以在mEGFP 不同位置引入糖基化位點(diǎn),以篩選出在有無糖鏈下熒光差異更明顯的突變體。
值得注意的是, 細(xì)胞熒光強(qiáng)度不僅與GN 的糖基化程度有關(guān),還與該蛋白質(zhì)在細(xì)胞中的表達(dá)量有關(guān)[11]。因此,該細(xì)胞株還可以用于蛋白質(zhì)表達(dá)相關(guān)功能基因的高通量篩選研究。