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中草藥日本鳶尾內(nèi)生真菌的分離及其初步鑒定

2019-09-10 07:22:44李盼武才琪王慶林
關(guān)鍵詞:內(nèi)生真菌分離鑒定

李盼 武才琪 王慶林

〔摘要〕 目的 分析日本鳶尾(Iris japonica)內(nèi)生真菌的類群分布。方法 通過菌落形態(tài)特征、顯微鏡下的孢子觀察及基于ITS序列分析的分子生物學(xué)鑒定分析日本鳶尾各部位內(nèi)生真菌的類群組成。結(jié)果 從日本鳶尾的根莖葉中共分離得到5種內(nèi)生真菌。根中分離得到的內(nèi)生真菌為橘青霉(Penicillium citrinum)、尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum),莖中為小新殼梭孢菌(Neofusicoccum parvum),葉中為橘青霉(Penicillium citrinum)、肉色隔孢伏革菌(Peniophora incarnata)、首都葉點(diǎn)霉(Phyllosticta capitalensis)。結(jié)論 自日本鳶尾分離獲得5種內(nèi)生真菌,其分布具有一定的組織特異性,可為藥用植物內(nèi)生真菌的開發(fā)和利用提供一定基礎(chǔ)。

〔關(guān)鍵詞〕 日本鳶尾;內(nèi)生真菌;分離;鑒定

〔中圖分類號〕R284;R372? ? ? 〔文獻(xiàn)標(biāo)志碼〕A? ? ? ?〔文章編號〕doi:10.3969/j.issn.1674-070X.2019.02.011

內(nèi)生真菌是指一類生活在植物組織內(nèi)部而不使宿主植物產(chǎn)生明顯病害癥狀的真菌[1-2]。植物內(nèi)生真菌以其豐富的多樣性和復(fù)雜性,作為微生物資源寶庫之一,具有巨大的潛能,而且具有生物活性化合物的比例明顯比土壤來源的微生物高[3],因此,植物內(nèi)生真菌的分離、鑒定、生物活性物質(zhì)、次級代謝產(chǎn)物活性的研究近年來已經(jīng)成為國內(nèi)外學(xué)者研究的熱點(diǎn)[4-7]。日本鳶尾(Iris japonica Thunb)是天門冬目鳶尾科的草本植物,又名蝴蝶花、白花射干,原產(chǎn)地是中國、日本和韓國,其性寒、味苦,具有清熱解毒、消痰、利咽的功能,在臨床上對治療咽喉炎有很好的療效,特別用于治療喉頭痙攣水腫效果尤好,此外,與其他中藥配伍對感冒、氣管炎、慢性胃炎、肝炎都有一定療效,因此,該植物具有較好的應(yīng)用前景[8]。目前對日本鳶尾中的內(nèi)生真菌研究尚未見報(bào)道。通過選擇健康的日本鳶尾植物組織作為內(nèi)生真菌分離的材料,對日本鳶尾的根、莖、葉等部位的內(nèi)生真菌進(jìn)行系統(tǒng)的分離和類群鑒定分析,以期不斷地豐富內(nèi)生真菌資源,為開發(fā)利用藥用植物內(nèi)生真菌提供基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1? 材料

1.1.1? 樣品采集? 日本鳶尾采自湖南師范大學(xué)醫(yī)學(xué)院院內(nèi)中藥園,經(jīng)本院藥用植物教研室趙冰清教授鑒定后,采集其根、莖、葉,將樣本存放在冰盒中運(yùn)送回實(shí)驗(yàn)室中,保證其處于低溫干燥的環(huán)境中。5 h內(nèi)對采集樣本進(jìn)行處理,進(jìn)行內(nèi)生真菌的初步分離[9]。

1.1.2? 培養(yǎng)基? 馬鈴薯葡萄糖瓊脂(PDA)培養(yǎng)基。

1.1.3? 主要儀器與設(shè)備? BSG-4生物安全柜(造鑫企業(yè)有限公司);SHP-250生化培養(yǎng)箱(上海精宏實(shí)驗(yàn)設(shè)備有限公司);LD2X-50FA立式壓力蒸汽滅菌器(上海申安醫(yī)療器械廠);101-2AB電熱鼓風(fēng)干燥箱(天津市泰斯特儀器有限公司);ZD-85氣浴恒溫振蕩器(江蘇金壇市醫(yī)療儀器廠);SIGMA 3K3OH冷凍高速離心機(jī)(德國SIGMA公司);G:BOXF3電泳凝膠成像分析儀(基因有限公司);ABI2720 PCR儀(美國ABI公司);超凈工作臺(蘇州凈化設(shè)備公司);國之源純水器(湖南科爾頓水務(wù)有限公司);瓊脂糖凝膠電泳儀(北京市六一儀器廠);普通光學(xué)顯微鏡(日本Olympus公司);倒置熒光相差顯微鏡(日本Olympus公司)。

1.1.4? 試劑? HP真菌DNA小量抽提試劑盒(OMEGA公司);核酸染色劑(北京索萊寶科技有限公司);RNase A(MP生物醫(yī)學(xué)公司);2×Taq預(yù)混PCR反應(yīng)體系(北京康潤生物科技有限公司);瓊脂糖(BioFroxx公司);5×TBE、通用引物ITS1:5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′和ITS4:5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′(上海生工生物工程公司);500 bpDNA Ladder(天根生化科技有限公司);分析純次氯酸鈉、無水乙醇、β-巰基乙醇、三氯甲烷、異丙醇(上海國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司)。

1.2? 方法

1.2.1? 日本鳶尾內(nèi)生真菌的分離? 日本鳶尾的根、莖、葉先用自來水洗去表面泥漬,最后用無菌水沖洗一遍,再放入培養(yǎng)皿內(nèi)鋪平晾干后在超凈工作臺內(nèi)進(jìn)行嚴(yán)格的表面消毒[10]:75%乙醇1 min、次氯酸鈉溶液(3%~5%有效氯)3 min、75%乙醇0.5 min,后用無菌水沖洗4遍,采用兩種對照試驗(yàn)來進(jìn)行消毒效果檢測[11-12]:一是漂洗液檢測法,把最后一遍沖洗水涂布在PDA培養(yǎng)基上,放置于28 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)7 d;二是組織印跡法,將已經(jīng)滅菌的根莖葉分別壓入PDA培養(yǎng)基中,使樣品與培養(yǎng)基緊密接觸20 min,接著移去滅菌植物樣品,將培養(yǎng)基同樣放置在28 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)7 d。對消毒好的樣品晾干,在超凈工作臺中用無菌剪刀將根莖葉分別剪成大小約0.5 cm×0.5 cm的小組織塊,均勻的平鋪在PDA平板中,同時(shí)做好標(biāo)記,28 ℃恒溫培養(yǎng)1~2周,待菌落長出后根據(jù)菌落特征的不同再來進(jìn)行分離,最后將完全純化的內(nèi)生真菌保存于4 ℃冰箱備用。

1.2.2? 內(nèi)生真菌的形態(tài)學(xué)鑒定? 通過傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)鑒定方法,參照相關(guān)真菌書籍對分離得到的內(nèi)生真菌進(jìn)行鑒定[13-14]:主要從菌落的大小、顏色、質(zhì)地等肉眼特征和孢子的顏色、形狀、產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)類型、孢子大小等顯微特征進(jìn)行初步判斷和分類。

1.2.3? 內(nèi)生真菌的分子生物學(xué)鑒定 將分離培養(yǎng)好的內(nèi)生真菌接種到含有50 mL PDB的錐形瓶中,每種接種4瓶。26 ℃,180 r/min振蕩培養(yǎng)2~7 d,待其發(fā)酵渾濁后離心取其沉淀,將沉淀放入50 ℃烘箱中過夜干燥備用。稱取10~50 mg的干燥沉淀至事先已滅菌的研缽中,加入液氮充分研磨后轉(zhuǎn)入1.5 mL的離心管。按照真菌DNA提取試劑盒說明書提取真菌DNA。將所提DNA放置于-20 ℃條件下備用。利用真菌ITS1與ITS4通用引物(委托上海生工生物工程公司合成)對提取的DNA產(chǎn)物進(jìn)行PCR擴(kuò)增[14],反應(yīng)體系20 μL∶7 μL ddH2O、10 μL 2×Taq PCR StarMix with Loading Dye、1 μL正向引物、1 μL反向引物、1 μL DNA模板。PCR擴(kuò)增反應(yīng)條件:預(yù)變性94 ℃,3 min;變性94 ℃,30 s;退火55 ℃,30 s;延伸72 ℃,1 min。共30個(gè)循環(huán)后,72 ℃再延伸7 min,4 ℃保存。將擴(kuò)增好的PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,在凝膠成像儀下500 bp處有明顯條帶出現(xiàn)。最后委托湖南省擎科生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測序,測序后將真菌ITS序列在NCBI數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行BLAST(http://blast.ncbi.nim.nih.gov/Blast.cgi)比對,來獲得所提內(nèi)生真菌的分子生物學(xué)鑒定信息。

2 結(jié)果

2.1? 消毒效果的檢測

把最后一遍沖洗水涂布在PDA培養(yǎng)基上,放置于28 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)7 d,無菌落長出。同時(shí)將已經(jīng)滅菌的根莖葉壓入PDA培養(yǎng)基中,使樣品與培養(yǎng)基緊密接觸20 min,移去滅菌植物樣品,同樣放置在28 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)7 d也未觀察到真菌生長。以上結(jié)果充分證明,經(jīng)過嚴(yán)格的表面消毒程序后,附著在植物表面的菌類已經(jīng)被徹底消除,分離得到的菌株來自于植物體內(nèi)部,屬于內(nèi)生真菌。

2.2? 日本鳶尾內(nèi)生真菌的分布和分子生物學(xué)鑒定結(jié)果

從日本鳶尾的根、莖、葉中共分離純化出5種20株內(nèi)生真菌,分別為橘青霉、尖孢鐮刀菌、肉色隔孢伏革菌、首都葉點(diǎn)酶(有性形為球座菌屬(Guignardia))和小新殼梭孢菌。菌落特征和顯微特征描述見表1,分子鑒定結(jié)果見表2。通過基于測序結(jié)果將內(nèi)生真菌ITS序列在NCBI數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行BLAST比對后,收集同源性比較高的比對序列,通過鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,其同源性分別是:R1為100%;R2為100%;R3為84%,R4為87%;R5為64%。R1代表根4B和葉1D2的ITS序列,R2代表根2D和根5B的的ITS序列,R3代表葉2A1的ITS序列,R4代表莖2E的ITS序列,R5代表葉2A2的ITS序列。結(jié)果表明其同源性都大于50%,根據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化樹原理[16],ITS同源性支持形態(tài)學(xué)上R1、R2、R3、R4和R5菌株分別鑒定為橘青霉、尖孢鐮刀菌、肉色隔孢伏革菌、小新殼梭孢菌和首都葉點(diǎn)酶。因?yàn)橹参飪?nèi)生真菌在培養(yǎng)過程中受外在條件的影響易發(fā)生變異,因此,需綜合考慮來對其進(jìn)行分類鑒定。

3 討論

通過形態(tài)學(xué)以及分子生物學(xué)鑒定方法的研究表明:日本鳶尾的根、莖、葉中都存在一定量的內(nèi)生真菌,并且在植物的組織部位上及內(nèi)生真菌的屬別上均體現(xiàn)出一定的專一性,這可能是由于內(nèi)生真菌受宿主植物不同組織部位微環(huán)境差異的影響,如光照強(qiáng)度、濕度、氣溫變化等的影響[17],同時(shí)不同組織中也含有共同的菌群,表明內(nèi)生真菌在組織分布上既具有差異性又具有共同性。研究表明內(nèi)生真菌自身也能產(chǎn)生各種類型的生物活性物質(zhì),而且很多內(nèi)生真菌可能也帶有植物體的酶系,具有與宿主相同或類似生理活性的次級代謝產(chǎn)物,與宿主長期地共同進(jìn)化并產(chǎn)生協(xié)同作用[18]。姚裕群等人對越南槐中內(nèi)生真菌的多樣性、抑菌活性及其次生代謝產(chǎn)物研究發(fā)現(xiàn)其抗菌資源豐富,多個(gè)菌株顯示了與宿主相似的強(qiáng)抑菌活性,對白色念珠菌、大腸桿菌和金黃色葡萄球菌等人體病原菌具有明顯的抑制作用[6],有學(xué)者從藥用植物鴉膽子的根、莖、葉和果實(shí)中共分離出83株內(nèi)生真菌,且擬莖點(diǎn)霉屬中的菌株YJ-17對靶向微生物具有較好的抑制作用[7]。今后我們將進(jìn)一步開展日本鳶尾內(nèi)生真菌次級代謝產(chǎn)物及其生物活性的研究。

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