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集胞藻Synechocystis sp. PCC 6803 slr1501的克隆及原核表達(dá)分析

2019-09-03 16:19張燕岳壽松陳高游銀偉鐘懷榮于金慧
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年7期
關(guān)鍵詞:原核表達(dá)

張燕 岳壽松 陳高 游銀偉 鐘懷榮 于金慧

摘要:組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶上調(diào)表達(dá)與抗逆性有一定相關(guān)性。集胞藻Synechocystis sp. PCC 6803 Slr1501是一個(gè)未知蛋白,預(yù)測(cè)其屬于組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶GNAT家族N-乙酰基轉(zhuǎn)移酶。為了進(jìn)一步明確slr1501基因功能,本研究從集胞藻6803中克隆slr1501基因,成功構(gòu)建了pET-28a(+)-slr1501原核表達(dá)載體,并轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)進(jìn)行分析。經(jīng)1 mmol/L IPTG誘導(dǎo)2 h后Slr1501蛋白成功表達(dá),表達(dá)量隨誘導(dǎo)時(shí)間的延長(zhǎng)而增加,且主要以包涵體形式表達(dá)。Western blot檢測(cè)結(jié)果顯示Slr1501重組蛋白特異性表達(dá)。本試驗(yàn)結(jié)果為進(jìn)一步研究該基因的功能奠定了基礎(chǔ)。

關(guān)鍵詞:集胞藻6803; 乙酰基轉(zhuǎn)移酶; slr1501; 原核表達(dá); 基因功能

中圖分類號(hào):S555+.6:Q785文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A文章編號(hào):1001-4942(2019)07-0001-05

集胞藻Synechocystis sp. PCC 6803 (以下簡(jiǎn)稱集胞藻6803)歸屬于藍(lán)藻門集胞藻屬,是一種單細(xì)胞藍(lán)藻,其基因組序列遺傳背景清楚、結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,是基因工程研究的模式藻類。Slr1501是集胞藻6803中的一個(gè)未知蛋白,根據(jù)序列相似性和相應(yīng)蛋白功能比對(duì)結(jié)果,預(yù)測(cè)其為組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶GNAT家族N-乙酰基轉(zhuǎn)移酶(http://bacteria.kazusa.or.jp/cyanobase)。組蛋白乙酰化由組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶(histone acetyltransferase,HAT)和組蛋白去乙?;福╤istone deacetylases,HDAC)共同參與,過(guò)程動(dòng)態(tài)可逆。組蛋白乙酰化是表觀遺傳調(diào)控的重要機(jī)制,在HAT的作用下,將乙?;鶊F(tuán)轉(zhuǎn)移到目標(biāo)受體氨基酸位點(diǎn)的過(guò)程,是細(xì)胞控制基因表達(dá)、蛋白質(zhì)活性或生理過(guò)程的一種機(jī)制[1]。HAT對(duì)細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的激活起到非常重要的作用,已證實(shí)乙酰化參與原核生物的轉(zhuǎn)錄后修飾,涉及轉(zhuǎn)錄調(diào)控和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白[2]。

集胞藻6803 slr1501與逆境適應(yīng)相關(guān),如鹽脅迫、滲透脅迫、酸脅迫和堿脅迫等[3-7]。當(dāng)轉(zhuǎn)至pH值為10條件下,集胞藻6803細(xì)胞中slr1501轉(zhuǎn)錄水平升高;而再次轉(zhuǎn)至中性pH值條件時(shí),slr1501轉(zhuǎn)錄水平迅速下降至高pH條件時(shí)表達(dá)水平的1/40左右,1 h后,檢測(cè)不到slr1501的表達(dá)。這種快速的基因表達(dá)反應(yīng),目前尚未在其它pH逆境反應(yīng)相關(guān)基因中發(fā)現(xiàn)[6]。slr1501可能在更大范圍的逆境適應(yīng)中具有潛在作用,它的表達(dá)上調(diào)不僅只發(fā)生在pH值升高時(shí),在高鹽、黑暗、冷脅迫、熱脅迫、缺鐵、缺氮、缺磷等逆境條件,特別是強(qiáng)光下上調(diào)最顯著[8]。但Taylor[7]的研究表明,在多重逆境(如高鹽、高光和高滲透壓)條件下,slr1501基因?qū)?803細(xì)胞生長(zhǎng)具有負(fù)調(diào)控效應(yīng);在單逆境高pH條件下,缺失slr1501基因時(shí),集胞藻6803細(xì)胞的生長(zhǎng)不受影響。

目前,對(duì)集胞藻6803 slr1501的研究多停留在各種逆境條件下該基因的表達(dá)水平及抗逆反應(yīng)上[3-7],具體功能并未開(kāi)展研究?;诖?,本研究擬通過(guò)構(gòu)建pET-28a(+)-slr1501表達(dá)載體,并在大腸桿菌中表達(dá)Slr1501蛋白,旨在為進(jìn)一步研究該基因的功能奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 材料

集胞藻Synechocystis 6803基因組,本實(shí)驗(yàn)室提取保存;pET-28a(+)載體,本實(shí)驗(yàn)室保存;大腸桿菌DH5α和BL21 (DE3)感受態(tài),購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司。

1.2 主要試劑

DNA凝膠回收試劑盒、質(zhì)?;厥赵噭┖芯?gòu)自O(shè)MEGA公司;限制性內(nèi)切酶和T4 DNA連接酶均購(gòu)自TaKaRa公司;PCR擴(kuò)增高保真酶和PCR檢測(cè)用酶均購(gòu)自青島擎科梓熙生物技術(shù)有限公司;his tag兔多克隆抗體、辣根過(guò)氧化物酶(HRP)標(biāo)記的羊抗兔二抗和ECL高靈敏度化學(xué)發(fā)光檢測(cè)試劑盒購(gòu)自康為世紀(jì)生物科技有限公司。

1.3 slr1501基因克隆

根據(jù)Cyanobase中集胞藻6803基因組序列,應(yīng)用Primer Premier 5.0設(shè)計(jì)擴(kuò)增slr1501基因全長(zhǎng)引物:slr1501-NdeⅠ-F:5′-ACTCCATATGGTGATGTCAACCACGCTAAA-3′和slr1501-XhoⅠ-R:5′-ACTCCTCGAGTTAGTTGAGACGCATACCAA-3′,上下游引物5′端分別引入NdeⅠ和XhoⅠ兩個(gè)酶切位點(diǎn)(下劃線處)。由青島擎科梓熙生物技術(shù)有限公司合成引物。

以集胞藻6803基因組DNA為模板,對(duì)slr1501基因進(jìn)行擴(kuò)增。PCR反應(yīng)體系為50 μL:I5 PCR mix 25 μL,上下游引物各1 μL,DNA 1 μL,加ddH2O至50 μL。PCR反應(yīng)程序:98℃ 2 min;98℃ 10 s,55℃ 10 s,72℃ 15 s,35個(gè)循環(huán);72℃ 5 min。

1.4 pET-28a(+)-slr1501載體構(gòu)建和轉(zhuǎn)化

分別用NdeⅠ和XhoⅠ限制性內(nèi)切酶雙酶切slr1501目的基因和 pET-28a(+)質(zhì)粒,后經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳回收目的基因和pET-28a(+)線性片段。經(jīng)T4 DNA連接酶16℃過(guò)夜連接后,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,Kan抗性篩選。挑取單克隆進(jìn)行PCR和雙酶切驗(yàn)證,并將陽(yáng)性克隆送至青島擎科梓熙生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測(cè)序。

將測(cè)序正確的pET-28a(+)-slr1501質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài),用Kan抗性進(jìn)行篩選,挑取陽(yáng)性克隆進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證。

1.5 重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)

挑取含有重組質(zhì)粒pET-28a(+)-slr1501的BL21(DE3)陽(yáng)性菌落接種于5 mL含Kan抗性的LB液體培養(yǎng)基中,37℃振蕩(180 r/min)過(guò)夜培養(yǎng)。取培養(yǎng)過(guò)夜的菌液按照1∶100的接種量接種至新的含Kan抗性的LB液體培養(yǎng)基上,37℃振蕩培養(yǎng)2~3 h,至菌液OD600值達(dá)到0.6~0.8時(shí),加IPTG(終濃度為1 mmol/L)開(kāi)始誘導(dǎo)Slr1501蛋白表達(dá),繼續(xù)振蕩培養(yǎng),分別于誘導(dǎo)開(kāi)始后0、2、4、6 h取 1 mL菌液離心收集菌體,加入100 μL的1% SDS,重懸菌體,70℃孵育10 min,后加入5×SDS蛋白上樣緩沖液,混勻后于沸水中煮10 min,進(jìn)行SDS-PAGE(12%分離膠,5%濃縮膠)電泳,90 V恒壓至樣品跑至分離膠內(nèi)時(shí),電壓調(diào)至120 V,直至蛋白電泳結(jié)束。收集誘導(dǎo)6 h的pET-28a(+)-slr1501菌液3 mL,離心后加1 mL PBS懸浮菌體進(jìn)行超聲破碎,分別將上清和沉淀SDS-PAGE電泳,檢測(cè)誘導(dǎo)的Slr1501重組蛋白可溶性。

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