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(1.貴州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院/農(nóng)業(yè)生物工程研究院/山地植物資源保護(hù)與種質(zhì)創(chuàng)新教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,貴州省農(nóng)業(yè)生物工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 貴陽 550025;2.貴州省農(nóng)業(yè)科學(xué)院國家農(nóng)業(yè)農(nóng)村部DUS中心貴陽分中心, 貴陽 550006)
水稻(OryzasativaL.)不僅是重要的糧食作物,也是單子葉植物研究中最重要的模式作物之一。轉(zhuǎn)基因技術(shù)現(xiàn)已成為植物分子生物學(xué)研究基因功能的重要手段[1]。農(nóng)桿菌介導(dǎo)法具有遺傳穩(wěn)定性強(qiáng)、拷貝數(shù)較低且結(jié)合位點(diǎn)穩(wěn)定等優(yōu)勢,水稻轉(zhuǎn)基因植株絕大部分是利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)法獲得的[2]。以愈傷組織作為轉(zhuǎn)化受體需要對水稻苗幼胚或成熟種子在無菌條件下誘導(dǎo)獲得胚性愈傷組織后再進(jìn)行轉(zhuǎn)化,這種方式需要嚴(yán)格的無菌環(huán)境,并且愈傷組織誘導(dǎo)及再分化對基因型依賴性較強(qiáng),因此,不同水稻品種之間轉(zhuǎn)化難易程度差異較大[3,4,5]。以植物莖尖為受體進(jìn)行遺傳轉(zhuǎn)化,無需經(jīng)過愈傷組織誘導(dǎo)及再分化,具有轉(zhuǎn)化周期短、操作簡單、轉(zhuǎn)基因植物遺傳穩(wěn)定等特點(diǎn), 已在玉米、棉花、水稻等植物中成功應(yīng)用[6-8]。前期對不同水稻品種的莖尖遺傳轉(zhuǎn)化體系轉(zhuǎn)化條件研究發(fā)現(xiàn),不同水稻品種的最適條件各異,且主效因素也不一樣[6,9]。
來攏是從江地區(qū)特有的貴州香禾粳糯品種,前期品質(zhì)測定發(fā)現(xiàn)其具有優(yōu)良食味品質(zhì)[10],可作為水稻品種改良的一種良好材料[11],但其對稻瘟病抗性較低,需對其進(jìn)行品種改良。本實(shí)驗(yàn)室曾經(jīng)也以貴州禾來攏愈傷組織為受體,利用農(nóng)桿菌侵染進(jìn)行遺傳轉(zhuǎn)化并已獲得抗除草劑、抗稻瘟病的轉(zhuǎn)基因來攏植株,但轉(zhuǎn)化周期過長,且轉(zhuǎn)化效率較低[12,13]。因此,本研究以貴州禾來攏莖尖為材料設(shè)計(jì)正交試驗(yàn),研究不同菌液侵染濃度OD600、真空處理時(shí)間、真空滲透壓等因素對貴州禾來攏轉(zhuǎn)化效率及植株死亡率的影響,建立高效的農(nóng)桿菌介導(dǎo)貴州禾來攏遺傳轉(zhuǎn)化體系,為基因工程改良貴州禾來攏奠定基礎(chǔ)。
植物材料為貴州禾來攏,農(nóng)桿菌菌株為LBA 4404,均由貴州大學(xué)山地植物資源保護(hù)與種質(zhì)創(chuàng)新教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室保存并提供。pCambia-Ubi-McCHIT1遺傳轉(zhuǎn)化載體由西南大學(xué)裴炎教授惠贈(zèng)。
1.2.1遺傳轉(zhuǎn)化材料的準(zhǔn)備
將貴州禾來攏成熟種子置于10 cm×12 cm網(wǎng)袋中清水浸泡,37 ℃避光培養(yǎng),每8 h換水1次,待種子露白后,用清水清洗干凈。37 ℃避光催芽生根,待水稻胚芽鞘長至1.5~2.0 cm長時(shí),切除莖環(huán)上部胚芽,暴露水稻的莖尖分生組織,用于農(nóng)桿菌的侵染及轉(zhuǎn)化。
1.2.2農(nóng)桿菌的活化及培養(yǎng)
取出-80 ℃保存的含有pCambia-Ubi-McCHIT1載體的農(nóng)桿菌LBA 4404,接種到含有50 mg·L-1卡那霉素及20 mg·L-1利福平的YEP固體培養(yǎng)基上,28 ℃培養(yǎng)箱中暗培2 d。挑取單菌落于10 mLYEP液體培養(yǎng)基(卡那霉素及利福平濃度分別為50 mg·L-1、20 mg·L-1)中 180 r·min-1,28 ℃振蕩過夜培養(yǎng)。再取100μL菌液繼續(xù)放入新的YEP液體培養(yǎng)基中震蕩過夜,待菌液濃度OD600值達(dá)到0.8左右后,5 000 r·min-1離心收集菌體。
1.2.3遺傳轉(zhuǎn)化體系的建立
選擇農(nóng)桿菌菌液侵染濃度OD600(0.4、0.6、0.8、1.0、1.2)、真空處理時(shí)間(2、5、8、11、14 min)及真空滲透壓(4、8、12、16、20 kPa)進(jìn)行三因素五水平的正交試驗(yàn)設(shè)計(jì),設(shè)計(jì)為L25(53)正交表(詳見表1)。每個(gè)處理樣本為30粒,并做3次重復(fù)。AAM培養(yǎng)基[14]重懸農(nóng)桿菌菌體并稀釋至相應(yīng)濃度后,加入0.02%表面活性劑Silwet-L 77與100μmol·L-1乙酰丁香酮。將切除胚芽鞘的來攏種子浸泡在重懸后菌液中,使用Bio-Rad臺(tái)式基因槍對其進(jìn)行真空處理,調(diào)節(jié)真空處理時(shí)間與真空處理壓強(qiáng)。處理完畢后,倒掉菌液,用吸水紙吸干后將水稻種子置于濕潤的珍珠巖上,黑暗條件下28 ℃共培養(yǎng)3 d。
表1 遺傳轉(zhuǎn)化正交設(shè)計(jì)與結(jié)果
序號(hào)真空處理時(shí)間/min菌液侵染濃度OD600真空滲透壓/kPa植株死亡率/%GUS基因轉(zhuǎn)化率/%120.441.110.00220.6167.780.00320.883.330.004212011.111.11521.21211.112.22650.488.890.00750.62013.335.56850.81213.336.67951411.114.441051.21618.8910.001180.41213.336.671280.648.896.671380.81613.3313.331481812.228.891581.22024.4417.7816110.41618.8910.0017110.6815.5612.2218110.82028.8921.11191111221.1117.7820111.2428.8912.2221140.42033.3311.1122140.61227.7817.7823140.8435.5616.67241411644.4424.4425141.2847.7817.78
1.2.4植株死亡率及GUS組織化學(xué)檢測統(tǒng)計(jì)
共培3 d后,恢復(fù)正常光照,待水稻幼苗自然生長5 d,統(tǒng)計(jì)水稻幼苗死亡數(shù);參照J(rèn)efferson[15]的方法,剪取新萌發(fā)的幼苗葉片進(jìn)行GUS組織化學(xué)檢測,統(tǒng)計(jì)GUS染色陽性株數(shù)。計(jì)算植株死亡率和GUS基因轉(zhuǎn)化率。
圖1 pCambia-Ubi-McCHIT1載體結(jié)構(gòu)示意圖
注:A為GUS組織染色(左為貴州禾來攏野生型;右為GUS陽性植株。bar=500 μL);B為轉(zhuǎn)基因植株P(guān)CR檢測(M為Marker;W為貴州禾來攏野生型;P為菌液DNA;3~8為轉(zhuǎn)基因植株)圖2 轉(zhuǎn)基因植株組織化學(xué)染色及PCR檢測
植株死亡率(%)=(植株死亡株數(shù)/總侵染樣本數(shù))×100%;
GUS基因轉(zhuǎn)化率(%)=(GUS染色陽性植株/總侵染樣本數(shù))×100%。
1.2.5轉(zhuǎn)基因植株的PCR檢測
將GUS染色陽性植株移栽至土壤中,常規(guī)肥水管理。按天根新型植物DNA提取試劑盒說明書提取來攏野生型及GUS染色陽性水稻葉片DNA,進(jìn)行PCR檢測。PCR的反應(yīng)條件為:94 ℃,3 min;94 ℃,30 s,54 ℃,30 s,72 ℃,30 s,35次循環(huán);72 ℃延伸7 min;4 ℃保存。GUS特異性引物:Forward primer:5′-GGTGATTGATGAAACTGCTG-3′;Reverse primer:5′-GAACATTACATTGACGCAGG-3′,產(chǎn)物長度為304 bp。
1.2.6數(shù)據(jù)處理
試驗(yàn)數(shù)據(jù)用SPSS 21.0軟件及Microsoft office Excel 2016軟件處理分析,多重比較選用鄧肯氏法。
通過統(tǒng)計(jì)貴州禾來攏死亡株數(shù),計(jì)算出正交試驗(yàn)中各組植株的死亡率,分析各因素對水稻死亡率的影響。結(jié)果表明,真空處理時(shí)間、菌液侵染濃度OD600、真空滲透壓3個(gè)因素越大,植株死亡率最高(表1)。方差分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),真空處理時(shí)間與菌液侵染濃度對來攏的死亡率均有顯著影響,真空滲透壓對死亡率影響不大(表2)。極差分析發(fā)現(xiàn),真空處理時(shí)間的極值(R值)最大達(dá)到30.89,菌液侵染濃度次之,最小的是真空滲透壓。說明真空處理時(shí)間對植株死亡率的影響最大,真空滲透壓影響最小(表3)。
表2 3個(gè)因素對植株死亡率的方差分析
變異來源 平方和自由度均方F真空處理時(shí)間2841.164.00710.2958.16??菌液濃度OD600435.314.00108.838.91??真空滲透壓107.874.0026.972.21誤差146.5612.0012.21
表3 3個(gè)因素對植株死亡率的極差分析
同水平植株死亡率和真空處理時(shí)間菌液侵染濃度OD600真空滲透壓k1j6.8915.1117.11k2j13.1114.6717.56k3j14.4418.8917.33k4j22.6720.0020.67k5j37.7826.2222.22R30.8911.565.11
用于遺傳轉(zhuǎn)化的pCambia-Ubi-McCHIT1載體具有內(nèi)含子GUS報(bào)告基因,轉(zhuǎn)化成功的水稻植株經(jīng)過GUS組織化學(xué)染色會(huì)呈現(xiàn)出藍(lán)色(如圖2 A)。對GUS組織化學(xué)染色陽性植株與來攏野生型的葉片進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以質(zhì)粒DNA為陽性對照,來攏野生型為陰性對照。結(jié)果表明:GUS染色陽性植株與質(zhì)粒DNA均能得到大小304 bp左右的條帶,野生型來攏沒有條帶,說明外源基因已經(jīng)成功轉(zhuǎn)入了GUS染色陽性植株(如圖2 B)。
表6 各因素不同水平對植株死亡率及GUS基因轉(zhuǎn)化率的影響
因素水平 真空處理時(shí)間 菌液侵染濃度OD600 真空滲透壓 植株死亡率GUS 基因轉(zhuǎn)化率植株死亡率GUS 基因轉(zhuǎn)化率植株死亡率GUS 基因轉(zhuǎn)化率16.89d0.67e15.11c5.56c17.11b8.00b213.11c5.33d14.67c8.45b17.56b7.78b314.44c10.67c18.89b11.56a17.33b10.22a422.67b14.67b20.00b11.33a20.67a11.55a537.78a17.56a26.22a12.00a22.22a11.33a
注:表中同列不同小寫字母表示p<0.01差異顯著。
對GUS染色檢測呈陽性的植株數(shù)目統(tǒng)計(jì)分析,計(jì)算得出GUS基因轉(zhuǎn)化率,并對其進(jìn)行極差分析與方差分析,結(jié)果表明:真空處理時(shí)間14 min,菌液侵染濃度OD6001.2,真空滲透壓16 kPa植株GUS轉(zhuǎn)化率最高(表1);方差分析表明,3個(gè)因素均對植株遺傳轉(zhuǎn)化率有顯著影響(表4);3個(gè)因素的R值大小順序?yàn)檎婵仗幚頃r(shí)間>菌液侵染濃度OD600>真空滲透壓,說明對水稻轉(zhuǎn)化率影響最大的是真空處理時(shí)間,其次為菌液侵染濃度,真空滲透壓對轉(zhuǎn)化率的影響最小(表5)。
表4 3個(gè)因素對GUS基因轉(zhuǎn)化率的方差分析
變異來源平方和自由度均方F真空處理時(shí)間761.2004190.30025.833??菌液濃度OD600122.000430.5004.140?真空滲透壓105.600423.1003.549?誤差88.400127.367
注:“*”表示p<0.05差異顯著,“**”表示p<0.01差異極顯著。
表5 3個(gè)因素對GUS基因轉(zhuǎn)化率的極差分析
同水平GUS基因轉(zhuǎn)化率和真空處理時(shí)間菌液侵染濃度OD600真空滲透壓k1j0.675.568.00k2j5.338.457.78k3j10.6711.5610.22k4j14.6711.3311.55k5j17.5612.0011.33R值16.896.443.78
隨著真空處理時(shí)間的增長,植株死亡率呈現(xiàn)出增加趨勢。處理5~8 min時(shí),植株的死亡率并未出現(xiàn)顯著增加;處理時(shí)間大于8 min后,死亡率達(dá)到了20%以上,在14 min時(shí)達(dá)到最大值(為37.78%)。菌液侵染濃度OD600增大,植株死亡率也逐漸增加。當(dāng)菌液濃度OD600達(dá)到1.2時(shí),植株死亡率最大(為26.22%)。真空滲透壓對植株死亡率影響較小,真空滲透壓低于12 kPa時(shí),植株死亡率無明顯變化(在17%左右);高于16 kPa后,死亡率明顯提高(達(dá)到20%以上)。GUS轉(zhuǎn)化率與真空處理時(shí)間成正相關(guān)。真空處理時(shí)間2 min時(shí),GUS轉(zhuǎn)化率最小(僅達(dá)到0.67%);在高于8 min后,GUS轉(zhuǎn)化率能達(dá)到10%以上。菌液濃度OD600越大,GUS基因轉(zhuǎn)化率也越大,菌液濃度OD600為1.2時(shí),GUS基因轉(zhuǎn)化率達(dá)到最高水平(為12%)。對真空滲透壓與GUS基因轉(zhuǎn)化率結(jié)果分析發(fā)現(xiàn),滲透壓壓強(qiáng)低于8 kPa時(shí),GUS基因轉(zhuǎn)化率均處于10%以下;大于12 kPa時(shí),GUS轉(zhuǎn)化率達(dá)到10%以上,真空滲透壓16 kPa時(shí)基因轉(zhuǎn)化率最大(為11.55%)(表6)。
綜合各因素對植株死亡率及轉(zhuǎn)化效率的影響,認(rèn)為:真空處理11 min,菌液侵染濃度OD6000.8,真空滲透壓16 kPa是農(nóng)桿菌介導(dǎo)貴州禾來攏莖尖遺傳轉(zhuǎn)化的最優(yōu)參數(shù)。
研究表明,在農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化中,外植體類型、菌液濃度、真空滲透壓以及真空處理時(shí)間等因素對植株的轉(zhuǎn)化效率及死亡率有密切的影響[16-18]。菌液濃度作為影響農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化效率的關(guān)鍵因素之一,其最適濃度會(huì)隨著材料及方法的不同而發(fā)生很大的變化[19]。以植物愈傷組織為轉(zhuǎn)化受體的最適菌液濃度較低,在0.5左右;以莖尖為轉(zhuǎn)化受體的最適菌液濃度偏高,可以達(dá)到0.9以上[20,21]。張笑寒等認(rèn)為,粳型黑糯米“平塘黑糯”與貴州禾“黎平雜邊禾“進(jìn)行莖尖遺傳轉(zhuǎn)化體系構(gòu)建中發(fā)現(xiàn),菌液濃度與遺傳轉(zhuǎn)化率呈正相關(guān)[9];黃仁權(quán)等研究表明,菌液濃度對黎平雜邊禾死亡率影響較大但對平塘黑糯的影響不大,推測是由于水稻種類不同導(dǎo)致的[6]。本研究中貴州禾來攏與黎平雜邊禾的結(jié)果類似,菌液濃度對死亡率及轉(zhuǎn)化率均有顯著影響。本實(shí)驗(yàn)室在前期研究發(fā)現(xiàn):黑糯具有較白糯更強(qiáng)的抗逆性,可能是由于黑糯含有花青素等抗氧化性較強(qiáng)的物質(zhì),對生物和非生物脅迫的耐性都強(qiáng)。因此我們推測,黑糯米中由于含有花青素等物質(zhì),對農(nóng)桿菌濃度的耐受性較高;白糯米對菌液濃度更敏感。
作為輔助農(nóng)桿菌浸染植物的方法,真空滲透處理也會(huì)對植株的遺傳效率產(chǎn)生影響[22]。處理壓強(qiáng)過高、處理時(shí)間過長都會(huì)增大植株死亡率;處理壓強(qiáng)過低及處理時(shí)間過短,則會(huì)讓導(dǎo)入受體的農(nóng)桿菌數(shù)量過少,降低基因的轉(zhuǎn)化率。真空處理時(shí)間是影響貴州禾來攏死亡率及轉(zhuǎn)化率的最關(guān)鍵因素,處理時(shí)間越長,來攏的死亡率與轉(zhuǎn)化率均越高。真空滲透壓壓強(qiáng)對來攏死亡率影響較小,以16 kPa為分界點(diǎn),滲透壓壓強(qiáng)大于16 kPa后植株死亡率顯著提高到20%以上。來攏轉(zhuǎn)化率則以真空滲透壓12 kPa為分界點(diǎn),高于12 kPa轉(zhuǎn)化率明顯升高。說明貴州禾來攏對真空處理具有一定適應(yīng)力,短時(shí)間的高滲透壓對來攏的影響并不大,但長時(shí)間的處理會(huì)對來攏造成十分嚴(yán)重的影響。