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動物疫病PCR檢測實(shí)驗(yàn)室的污染與對策

2019-07-05 09:53:33翟偉王秀東曹凱捷
農(nóng)家致富顧問·下半月 2019年3期
關(guān)鍵詞:動物疫病實(shí)驗(yàn)室污染

翟偉 王秀東 曹凱捷

摘 要 隨著近年來大規(guī)模的集約化養(yǎng)殖,加強(qiáng)了動物之間疾病的傳播率和擴(kuò)散率,因此也受到廣泛相關(guān)實(shí)驗(yàn)室科學(xué)家的關(guān)注,并發(fā)明了PCR檢測診斷技術(shù)并為檢驗(yàn)疫病提供了科學(xué)依據(jù)。這種技術(shù)操作簡單、容易掌握、有極高的靈敏度并且結(jié)果可靠,但該方法較強(qiáng)的擴(kuò)增能力也帶來了一些令人頭疼的問題,也就是易污染,極其微量的污染可能造成假陽性的產(chǎn)生。

關(guān)鍵詞 動物疫??;PCR檢測;實(shí)驗(yàn)室;污染

PCR檢測也就是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是一種用于放大擴(kuò)增特定的DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù);它可看作是生物體外的特殊DNA的復(fù)制,PCR的最大特點(diǎn)是能將微量的DNA大幅增加。這種技術(shù)被用在動物疫病的檢測當(dāng)中能夠?qū)游锏腄NA片段無限放大,從而在動物疫病的防治過程中起到很好的效果,未來隨著時代的進(jìn)步實(shí)驗(yàn)室的環(huán)境會進(jìn)一步得到改善。

1 引起 PCR污染的原因

1.1 PCR試劑的污染

引起PCR污染的主要原因之一是PCR試劑的污染,做實(shí)驗(yàn)其基本的實(shí)驗(yàn)器材就是試劑,保護(hù)好相關(guān)的試劑器材,也就是直接減少了在實(shí)驗(yàn)中對污染物的接觸。具體表現(xiàn)在PCR試劑配制過程中,由于加樣槍、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。

1.2 樣本間的交叉污染

引起PCR污染的主要原因之二是樣本間的交叉污染,在實(shí)驗(yàn)的標(biāo)本儲存的過程中,由于密封方法不當(dāng)或是密封不夠嚴(yán)密導(dǎo)致樣本之間進(jìn)行交互交叉感染,這是其中的原因之一,屬于人為存儲不當(dāng)而導(dǎo)致的樣本感染。還有比較重要的原因是來自于客觀原因,或者也可以說是有人為所導(dǎo)致的,就是存儲的容器被污染,主要是樣本的容器外沾有標(biāo)本而造成的相互交叉感染。又或者樣本核酸模板在人為提取的過程中,由于移液槍的污染而導(dǎo)致樣本間的污染等等因素,這些在人為的實(shí)驗(yàn)過程中經(jīng)常會出現(xiàn),如果要避免的話建議做實(shí)驗(yàn)的時候要留心,多注意細(xì)節(jié)以防樣本交叉污染帶來的實(shí)驗(yàn)結(jié)果有誤。

1.3 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物污染

引起PCR污染的主要原因之三是PCR擴(kuò)增產(chǎn)物污染,這是PCR反應(yīng)中最主要最常見的污染問題,也是最主要的污染原因之一。因?yàn)镻CR產(chǎn)物拷貝量是非常大的,其拷貝量遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于PCR檢測數(shù)個拷貝的極限,所以極微量的PCR產(chǎn)物污染很可能造成假陽,就可形成假陽性,形成污染源,對實(shí)驗(yàn)室環(huán)境帶來極強(qiáng)的破壞性。

1.4 操作者的污染

在實(shí)驗(yàn)的過程中,由于操作者過于注重操作的結(jié)果和效益,往往在實(shí)驗(yàn)的過程中就會因?yàn)樾募痹斐烧`操作,或者自身的頭發(fā)、皮膚等當(dāng)中含有的細(xì)菌都會帶來PCR的污染。這不僅僅是個人的實(shí)驗(yàn)室防護(hù)措施沒有做好,更重要的是實(shí)驗(yàn)室的操作安全知識以及細(xì)節(jié)沒有從整體上有清晰的認(rèn)識,長時間這樣開展實(shí)驗(yàn)肯定是對實(shí)驗(yàn)的不重視,其結(jié)果可想而知。

2 防止污染的措施

2.1 對PCR實(shí)驗(yàn)室合理分區(qū)

防止污染的措施之一是對PCR實(shí)驗(yàn)室合理進(jìn)行分區(qū),這是最重要的防止污染的措施之一,能從根本上杜絕PCR實(shí)驗(yàn)室的污染。將實(shí)驗(yàn)室分為以下三個區(qū)域:第一,標(biāo)本處理區(qū),包括擴(kuò)增摸板的制備;第二,PCR擴(kuò)增區(qū),包括反應(yīng)液的配制和PCR擴(kuò)增;第三,產(chǎn)物分析區(qū),凝膠電泳分析,產(chǎn)物拍照及重組克隆的制備。在操作的過程中一定要將這些重要的工作區(qū)進(jìn)行有效的隔離,操作的時候使用專業(yè)的器械,以防出現(xiàn)交叉感染。

2.2 良好的實(shí)驗(yàn)室操作習(xí)慣

由于操作不當(dāng)引起的實(shí)驗(yàn)結(jié)果和樣本交叉污染的案例在科學(xué)實(shí)驗(yàn)室當(dāng)中經(jīng)??梢?,不良的操作習(xí)慣在實(shí)驗(yàn)室搞科研是實(shí)在對科學(xué)不尊重的一種行為舉動,因此在進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室操作之前一定要注意對自身進(jìn)行全副的武裝。在開始操作的時候還要養(yǎng)成良好的操作習(xí)慣,該將本次實(shí)驗(yàn)的器具放在哪里就放在哪里,不把器具混合交叉使用。

2.3 合理的試劑分裝與貯存

其次,相對來說比較有效的措施是要合理的試劑分裝與貯存,在PCR試劑配制過程中,由于加樣槍、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果的失敗,因此將所有的試劑進(jìn)行小量的包裝,而且將PCR反應(yīng)液先行配置好再進(jìn)行小量的分裝,放在零下負(fù)20攝氏度的環(huán)境下進(jìn)行保存,避免感染次數(shù)的增加。

2.4 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)盡量減少PCR循環(huán)次數(shù)

最后是要在實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中盡量減少PCR循環(huán)次數(shù),將PCR產(chǎn)物只要達(dá)到檢測水平就可以了,這樣就可以很好地避免高濃度大量的擴(kuò)增產(chǎn)物帶來的污染。但是一旦產(chǎn)生了污染就必須要立即追蹤污染物,盡快找到污染的源頭,從而盡快保證實(shí)驗(yàn)?zāi)軌蝽樌_展。這個防治對策在經(jīng)過多次的驗(yàn)證后,多數(shù)實(shí)驗(yàn)科學(xué)家都表示十分有效,能夠很好的減少PCR的污染。

3 結(jié)束語

綜上所述,在動物疫病PCR檢測實(shí)驗(yàn)室的污染和對策當(dāng)中格外要注意到的是要注意操作的規(guī)范性和嚴(yán)格性,目前引起 PCR污染的原因的主要原因都有 PCR試劑的污染、樣本間的交叉污染、PCR擴(kuò)增產(chǎn)物污染和操作者的污染,因此在實(shí)驗(yàn)的過程中一定要以嚴(yán)謹(jǐn)?shù)目茖W(xué)的態(tài)度來對待每一場PCR檢測實(shí)驗(yàn),以防在實(shí)驗(yàn)當(dāng)中由于個人主觀上帶來的樣本交叉污染和實(shí)驗(yàn)室器具的混合使用,這些對于實(shí)驗(yàn)來說是毫無幫助的。所以在實(shí)驗(yàn)污染防治當(dāng)中要養(yǎng)成良好的操作習(xí)慣,改變不良的操作陋習(xí)。

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