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pH對褐環(huán)粘蓋牛肝菌蛋白質和核酸的影響

2019-06-11 05:31蔣瑩程永樂曹代京陳有君李國光閆偉
安徽農業(yè)科學 2019年2期
關鍵詞:核酸蛋白質

蔣瑩 程永樂 曹代京 陳有君 李國光 閆偉

摘要為了探明環(huán)境pH對褐環(huán)粘蓋牛肝菌(Suillus luteus(L.:Fr.)Gray)生長代謝的影響機理,研究不同pH條件下液體培養(yǎng)褐環(huán)粘蓋牛肝菌菌絲中蛋白質和核酸的含量變化,結果顯示:該菌在pH 3.0~6.0范圍內,隨著pH的增加,蛋白質及核酸的含量逐漸增加,并在pH 6.0時達到最高值;在pH 6.0~8.0范圍內,蛋白質及核酸的含量迅速降低。蛋白質的含量和RNA、DNA的含量之間極顯著相關,相關系數(shù)分別達0.923和0.977,DNA和RNA的含量之間也極顯著相關,相關系數(shù)達0.927。該研究可為進一步探索褐環(huán)粘蓋牛肝菌適應與調節(jié)環(huán)境pH機理方面提供依據(jù)。

關鍵詞褐環(huán)粘蓋牛肝菌;pH;蛋白質;核酸

中圖分類號S646.3文獻標識碼A文章編號0517-6611(2019)02-0004-03

doi:10.3969/j.issn.0517-6611.2019.02.002

開放科學(資源服務)標識碼(OSID):

褐環(huán)粘蓋牛肝菌(Suillus luteus(L.:Fr.)Gray)是分布于我國甘肅、內蒙古[1]、陜西、黑龍江、西藏、遼寧以及廣東等地的外生菌根真菌,不同地區(qū)土壤的酸堿度不同導致菌絲體的生長狀況不盡相同[2-3],所以環(huán)境pH對該菌的影響引發(fā)大量學者的研究討論。張茹琴等[4]發(fā)現(xiàn)該菌的最適生長pH為5.3~6.7,且培養(yǎng)后培養(yǎng)基的pH降低。雷增普等[5]通過大田試驗發(fā)現(xiàn),該菌具有抗堿能力(土壤pH 8.6)。姚慶智等[6]發(fā)現(xiàn)該菌在pH 6~7時生長最為旺盛。宋微等[7]研究發(fā)現(xiàn),該菌在pH 4.0~8.0的固體培養(yǎng)基上能生長,且最適pH為5.0,在pH小于5.0或者大于6.0時,該菌的增長速度減緩,菌苔變薄。劉淑清等[8]通過試驗發(fā)現(xiàn),含有檸檬酸-磷酸二氫鉀緩沖液且pH為4.5的培養(yǎng)基中該菌的生物量最高,當pH大于4.5時,菌絲的生物量隨著pH的增高而逐漸降低[8]。劉強等[9]研究發(fā)現(xiàn),在NaCl濃度為0.1 mol/L且pH為6.0時,該菌長勢最好,隨著環(huán)境pH的增加,菌體受到的抑制作用也愈加明顯。劉楊[10]研究不同培養(yǎng)基、pH、碳氮源等因素對該菌的影響,發(fā)現(xiàn)該菌在Pach培養(yǎng)基上的最適生長pH為4.5。王明慧[11]發(fā)現(xiàn)該菌的蛋白含量隨著pH的升高而升高,在pH為5.0時增長速率最大,且在pH 7.0時蛋白含量達到最大值,達到峰值后蛋白質含量迅速下降。劉萌[12]發(fā)現(xiàn)該菌在pH 5.0~6.0時分泌的有機酸最多,生長狀況最好。但是,環(huán)境pH對該菌核酸含量的影響還缺少研究。

通過對多種絲狀真菌的研究發(fā)現(xiàn),生物響應外界環(huán)境酸堿性的改變是通過自身基因表達的改變來實現(xiàn)的[13]。嗜水氣單胞菌在中性或偏酸性(pH 7.0和pH 5.0)環(huán)境中,4種毒性基因可以表達,而在堿性環(huán)境中僅僅只有1種基因可以表達[14]。賈海鋒等[15]通過不同pH處理草莓果實葉片的試驗,發(fā)現(xiàn)隨著pH的增加基因表達量呈顯著上升趨勢,并在pH 6時獲得最大值。沈靜等[16]發(fā)現(xiàn)低pH嚴重影響水稻根系細胞中細胞膜質子泵基因的表達,在pH 5.5時該基因的表達量最高。有研究表明,細胞膜質子泵的最高活性范圍為pH 6.0~6.5[17-18],pH通過影響其活性進而影響其表達量。以上說明環(huán)境pH會對生物體的基因產生影響。雖然部分研究學者針對pH與褐環(huán)粘蓋牛肝菌之間的關系做了大量研究,但從蛋白質及核酸含量方面研究該菌與環(huán)境pH之間關系的報道目前還不是很多。筆者研究了該菌在不同pH培養(yǎng)下蛋白質和核酸的含量變化,以期為深入了解褐環(huán)粘蓋牛肝菌生理學及其改變環(huán)境pH的調控機制提供依據(jù)。

1材料與方法

1.1試驗處理

將在Pach培養(yǎng)基中培養(yǎng)7 d的褐環(huán)粘蓋牛肝菌Sp9菌株(由內蒙古農業(yè)大學菌根技術研究室提供)轉接到不同pH(滅菌后pH為3.0、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、7.0和8.0)的液體培養(yǎng)基中,每瓶接入11塊,150 mL三角瓶裝液量為50 mL,置于25 ℃恒溫培養(yǎng)箱中靜置培養(yǎng),并每天更換其培養(yǎng)基,5 d后濾出菌絲,備用。

1.2試驗方法

1.2.1蛋白質的測定。

取0.01 g菌絲用液氮冷卻后于冰浴中進行研磨,加入1 mL研磨緩沖液后裝入離心管中于-4 ℃、6 000 r/min條件下離心5 min。取上清液,再次置于離心管中,并于-4 ℃、10 000 r/min條件下離心10 min,獲得上清液。用考馬斯亮藍法測定蛋白質含量(以牛血清蛋白溶液為標準液,用考馬斯亮藍法做標準曲線:y=85.816x-1.098 6,其中x為吸光度,y為蛋白質含量,線性相關系數(shù)r為0.999,根據(jù)標準曲線計算出8個樣品中相應蛋白質的含量)。

1.2.2RNA含量的測定。取0.01 g菌絲用液氮冷卻后在冰浴中充分研磨至粉末,按照RNAprep Pure 多糖多酚植物總RNA提取試劑盒(天根公司)所提供的方法提取該菌的總RNA,并溶于ddH2O中,取1 μL RNA ddH2O溶液于Biodrop中檢測RNA含量。

1.2.3DNA含量的測定。取0.01 g菌絲用液氮冷卻后于冰浴中充分研磨至粉末,按照植物基因組DNA提取試劑盒(天根公司)所給的方法提取該菌的總DNA,并溶于ddH2O。取1 μL DNA ddH2O溶液于Biodrop中進行DNA含量檢測。

2結果與分析

2.1pH對褐環(huán)粘蓋牛肝菌蛋白質含量的影響

不同環(huán)境pH培養(yǎng)5 d后菌絲體的蛋白含量如圖1所示。由圖1可知,當pH小于6時,蛋白質含量隨著pH的升高而逐漸上升,在pH為3.0~4.5時,蛋白質的含量上升緩慢,每增加1個單位的pH,蛋白質平均增加215.79 ng;在pH 4.5~5.0范圍內,單位pH的蛋白質增長量極其微小,僅增加43.07 ng;在pH為5.0~6.0時,蛋白質含量迅速增長,單位pH的蛋白質增長量高達714.35 ng,且在pH 6.0時蛋白質的含量達到最高值;達到峰值后,隨著pH的增加,蛋白質含量逐漸降低,在pH為6.0~8.0時,蛋白質含量顯著下降,單位pH的蛋白質減少量達到330.59 ng。就整體趨勢而言,蛋白質含量受環(huán)境pH的影響較大,在pH 6.0的條件下,蛋白質含量最高,推測pH 6.0為該菌的最適生長pH。

2.2pH對褐環(huán)粘蓋牛肝菌RNA含量的影響

不同環(huán)境pH培養(yǎng)5 d后菌絲體的RNA含量如圖2所示。由圖2可知,當pH小于6時,RNA含量隨著pH的升高而升高,在pH為3.0~4.5時,RNA含量增長緩慢,環(huán)境pH每增加1個單位,RNA含量增加77.30 ng;在pH為4.5~6.0時,RNA含量顯著增加,平均環(huán)境pH每增加1個單位,RNA含量的增長量可達283.79 ng,并在pH 6.0時達到峰值,為639.60 ng/mg。此后,隨著pH的增加,RNA含量開始下降,在pH為6.0~7.0時,RNA含量逐漸減少,單位減少量為150.38 ng;在pH為7.0~8.0時,RNA含量迅速下降,單位pH的RNA減少量達到313.16 ng,說明在堿性環(huán)境下不利于RNA的合成。就整體趨勢而言,環(huán)境pH對RNA含量影響較大,RNA含量在pH 6.0時獲得最大值,因此推測該菌的最適生長pH為6.0。

2.3pH對褐環(huán)粘蓋牛肝菌DNA含量的影響

不同環(huán)境pH培養(yǎng)5 d后菌絲體的DNA含量如圖3所示。由圖3可知,當pH小于6.0時,DNA含量隨著pH的升高而逐漸上升,在pH為3.0~4.0時,DNA含量增長緩慢,單位pH的DNA增加量為62.44 ng;在pH 4.0~4.5時DNA含量幾乎不變;在pH 4.5~6.0時,DNA含量顯著增加,單位pH的DNA增加量可達90.23 ng,并在pH 6.0時DNA含量達到最大值;在pH 6.0~8.0時,DNA含量快速下降,單位pH的DNA減少量可達59.21 ng。就整體變化趨勢而言,DNA含量受環(huán)境pH影響較大,DNA含量在pH 6.0時最高,因此推測該菌的最適生長pH為6.0。

3結論與討論

3.1褐環(huán)粘蓋牛肝菌蛋白質含量與RNA含量的相關性

由圖4可以看出,蛋白質含量隨RNA含量的增加而增加,相關分析表明二者之間具有極顯著的相關關系(相關系數(shù)r=0.923,P<0.01)。菌絲中蛋白質含量與RNA含量的線性回歸方程為y=1.5722x+1 832.1。

通過對圖1和圖2進行對比發(fā)現(xiàn),在pH 3.0~6.0的培養(yǎng)條件下,蛋白質與RNA的含量都隨著pH的升高而逐漸上升,其中在pH 3.0~4.5時,RNA含量的增加速率明顯高于蛋白質含量的增長速率,單位菌絲體中平均1 ng RNA可以翻譯為14.859 ng蛋白質;在pH 4.5~6.0時,蛋白質含量增長率高于RNA含量增長率,單位菌絲體中平均1 ng RNA可以翻譯為6.441 ng蛋白質,雖然翻譯率下降,但由于轉錄率較高,獲得的RNA含量較高,所以依然獲得較高的蛋白質含量,并在pH 6.0的培養(yǎng)條件下蛋白質含量達到峰值,說明在該pH范圍內更利于蛋白質的合成;在pH 6.0~8.0的培養(yǎng)條件下,二者的含量都明顯下降,單位菌絲體中平均1 ng RNA可以翻譯為7.732 ng蛋白質,雖然翻譯率有所提高,但由于該范圍的環(huán)境pH培養(yǎng)條件下RNA的合成量逐漸降低,因此翻譯獲得的蛋白質含量依然呈下降趨勢,尤其在pH 7.0~8.0時,RNA含量的下降速率比蛋白質的下降速率更大。

3.2褐環(huán)粘蓋牛肝菌蛋白質含量與DNA含量的相關性

由圖5可以看出,蛋白質含量隨DNA含量的增加而增加,相關分析表明二者之間具有極顯著的相關關系(相關系數(shù)r=0.977,P<0.01)。菌絲中蛋白質含量和DNA含量的線性回歸方程為y=5.452 4x+1 466.9。

通過對圖1和圖3進行對比發(fā)現(xiàn),在pH 3.0~6.0的培養(yǎng)條件下,蛋白質和DNA的含量都隨著pH的增加而增加,其中在pH 3.0~4.5時,DNA的增長率接近蛋白質增長率的7倍,說明在該pH范圍內,更有利于DNA的合成,單位基因的表達量不大,導致蛋白質含量的增加速率緩慢,但是在pH 4.5~6.0 的培養(yǎng)條件下,蛋白質的增長率迅速增加,即基因的表達量顯著增加,說明在該pH范圍內更有利于基因的表達。在pH 6.0~8.0的培養(yǎng)條件下,二者含量均顯著下降,其中,在pH 6.0~7.0時,DNA含量的減少率明顯高于蛋白質含量的減少率,說明在該環(huán)境pH下更不利于DNA的生成;在pH 7.0~8.0時,二者含量均繼續(xù)下降接近于最低值,說明在堿性條件下不利于該菌基因的表達。

3.3褐環(huán)粘蓋牛肝菌RNA含量與DNA含量的相關性

由圖6可知,RNA含量隨DNA含量的增加而增加,相關分析表明二者之間具有極顯著的相關關系(相關系數(shù)r=0.927,P<0.01)。菌絲中RNA含量與DNA含量線性回歸方程為y=3.037 1x-161.93。

通過對圖2和圖3進行綜合分析,可以發(fā)現(xiàn),在pH 3.0~4.5的培養(yǎng)條件下,單位菌絲體中平均1 ng DNA可以轉錄為1.443 ng RNA;在pH 4.5~6.0的培養(yǎng)條件下,單位菌絲體中平均1 ng DNA可以轉錄為2.254 ng RNA,轉錄率有所提高,并在pH 6.0的培養(yǎng)條件下獲得最高RNA含量;在pH 6.0~8.0的培養(yǎng)條件下,單位菌絲體中平均1 ng DNA可以轉錄為1.956 ng RNA,轉錄率有所下降,說明該范圍的環(huán)境pH下,不利于RNA的合成。

綜上所述,在pH 3.0~6.0的培養(yǎng)條件下,褐環(huán)粘蓋牛肝菌菌絲體中蛋白質和核酸的含量都隨著pH的增加而逐漸增加,并在pH 6.0時獲得峰值,此后隨著pH的增加其含量均顯著降低。該結果與孫琳[19]、蔡楠楠[20]在pH 6.0獲得最大生物量的結果相吻合,因此,可以認為弱酸性環(huán)境下更有利于褐環(huán)粘蓋牛肝菌的生長,并且該菌的最適生長pH為6.0。

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