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禽腺病毒-I群PCR-RFLP分型方法的建立

2019-05-16 01:40:52江之瑤王守春欒慶東尹燕博王建琳
中國獸醫(yī)雜志 2019年11期
關(guān)鍵詞:限制性血清型區(qū)分

江之瑤 , 王守春 , 欒慶東 , 尹燕博 , 王建琳

(青島農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院 , 山東 青島 266109)

禽腺病毒按照特異性抗原的不同可分為3個(gè)群,其中禽腺病毒-I群(Fowl adenovirus, FAdVs)共分為12個(gè)血清型(1~7、8a、8b、9~11),F(xiàn)AdVs能引起禽心包積液綜合征、包涵體肝炎、肌胃糜爛和再生障礙性貧血等[1]。FAdVs不僅可以水平傳播,還可以垂直傳播,對(duì)家禽養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大威脅[2]。目前,檢測FAdVs的經(jīng)典方法主要有病毒的分離鑒定、病毒中和試驗(yàn)等。在實(shí)際生產(chǎn)中,以分子生物為基礎(chǔ)的PCR檢測方法是進(jìn)行病原測定的主要方法[3],但單純的PCR檢測方法無法區(qū)分FAdVs的血清型,需要后續(xù)進(jìn)行基因測序分析等。

自2015年以來,F(xiàn)AdVs感染在我國廣泛流行,尤其血清4型FAdVs給我國養(yǎng)禽業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。我國FAdVs感染有多種血清型,為快速準(zhǔn)確的區(qū)分不同血清型 FAdVs感染,為后續(xù)的有效防控提供依據(jù),本試驗(yàn)擬建立FAdVs的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism,PCR-RFLP)分型方法,用于臨床FAdVs的快速分型。

1 材料與方法

1.1 毒株、載體與細(xì)胞 FAdVs的12個(gè)血清型 (購自中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所);感受態(tài)細(xì)胞 DH5α和pMD18-T 載體(TaKaRa公司)。

1.2 主要試劑與儀器 DMEM/F-12細(xì)胞培養(yǎng)液、胎牛血清、LB培養(yǎng)基、DNA Maker DL-2 000(TaKaRa公司); DEPC水(北京索萊寶科技有限公司);1×PCR Mix;DNAiso Plus(TaKaRa公司);氯仿、異丙醇、乙醇(天津化學(xué)試劑三廠)。PCR基因擴(kuò)增儀(TC-96/G/H(b)型,杭州博日公司),電泳儀(JY600E型,君意東方公司), 核酸電泳槽(JY-SPFT型,君意東方公司),凝膠成像儀(JY04S-3C型,君意東方公司),恒溫水槽(HH.S11-2型,上海博訊公司),超純水儀(best-R型,上海芷昂公司),離心機(jī)(Pico17型,ThermoFisher公司),恒溫培養(yǎng)箱(XT5116-IN70型,雪中炭公司)。

1.3 限制性內(nèi)切酶Eco130 I、Pf123Ⅱ、MluI、Psy I、BgⅡ(Thermo Fisher公司)。

1.4 引物設(shè)計(jì)與合成 根據(jù)GenBank中 FAdV-I的Hexon基因,應(yīng)用Premier5.0軟件設(shè)計(jì)通用引物(表1),并尋找酶切位點(diǎn),引物由北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公司合成。

表1 Hexon基因擴(kuò)增用引物

1.5 病毒核酸提取與PCR擴(kuò)增 取細(xì)胞毒上清200 μL,加入700 μL DNAisoPlus、140 μL 氯仿。輕柔混勻,室溫靜置10 min。12 000 r/min離心10 min,取上清500 μL,加入500 μL冷異丙醇。低溫靜置10 min。12 000 r/min離心 10 min 棄上清。加入1 000 μL冷75%乙醇,7 500 r/min離心5 min后棄上清,重復(fù)操作2次。室溫敞口干燥,確保乙醇揮發(fā)干凈后加入DEPC 水35 μL,輕彈,使核酸徹底溶解,置于-80 ℃冰箱備用。

PCR反應(yīng)體系為PCR Mix 45 μL,模板1 μL,上下游引物各2 μL。PCR反應(yīng)條件為95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性30 s,55 ℃退火20 s,72 ℃延伸40 s,35個(gè)循環(huán);72 ℃終延伸10 min。PCR結(jié)束后,電泳鑒定連接載體并測序。

1.6 目的基因的酶切及圖譜分析 取PCR產(chǎn)物7 μL,加入DEPC 水10 μL,限制性內(nèi)切酶1 μL,10×Fast Digest Buffer 2 μL。于恒溫箱中37 ℃酶切30 min。電泳確認(rèn)酶切結(jié)果。

2 結(jié)果與分析

2.1 毒株擴(kuò)增和測序結(jié)果 利用本試驗(yàn)所設(shè)計(jì)的引物,經(jīng)PCR擴(kuò)增,F(xiàn)AdVs的12個(gè)血清型均得到了與預(yù)期條帶大小一致的片段,約894 bp(圖1),連接載體測序結(jié)果為FAdVs(1~7、8a、8b、9~11)型。經(jīng)序列分析,各毒株的片段與GenBank中所登錄的FAdVs的同源性和覆蓋率均為98%~100%。

圖1 12個(gè)血清型FAdV-I Hexon基因PCR擴(kuò)增結(jié)果
M:DNA Marker DL-2 000 ; 1~12:FAV1-7、8a、8b、9-11PCR產(chǎn)物

2.2 PCR產(chǎn)物的酶切電泳結(jié)果與分析 FAdVs(1~7、8a、8b、9~11)Hexon基因894片段的限制性內(nèi)切酶酶切位點(diǎn)分析發(fā)現(xiàn),Eco130 I、Pf123Ⅱ、MluI、PsyI、BgⅡ組合酶切后有良好的特異性,能有效區(qū)分全部12個(gè)血清型。

12種血清型FAdVs的PCR片段的Eco130 I、Pf123Ⅱ、MluI 、PsyI、BgⅡ組合酶切結(jié)果見圖2、圖3和圖4。片段經(jīng)Eco130 I、Pf123Ⅱ、MluI 、PsyI、BgⅡ組合酶切后得到了12種RFLP圖譜,可以區(qū)分出12種血清型的FAdVs,酶切結(jié)果與軟件分析結(jié)果一致。

圖2 FAV-I Hexon基因擴(kuò)增片段Pf 123Ⅱ和BgⅡ酶切結(jié)果
M: DNA Marker DL-2 000 ; 左側(cè)1~7、8a、8b、9~11:12個(gè)血清型FAdVsHexon基因擴(kuò)增片段的Pf123Ⅱ酶切結(jié)果 ; 右側(cè)1~7、8a、8b、9~11:12個(gè)血清型FAdVs 的BgⅡ酶切結(jié)果

圖3 FAdVs Hexon基因擴(kuò)增片段Eco130 I和Mlu I酶切結(jié)果
M:DNA Marker DL-2 000 ; 左側(cè)1~7、8a、8b、9~11:12個(gè)血清型FAdVsHexon基因擴(kuò)增片段的Eco130 I酶切結(jié)果 ; 右側(cè)1~7、8a、8b、9~11:12個(gè)血清型FAdVsHexon基因擴(kuò)增片段的MluI酶切結(jié)果

圖4 FAdVs Hexon基因擴(kuò)增片段Psy I酶切結(jié)果
M:DNA Marker DL-2 000; 1~7、8a、8b、9~11:12個(gè)血清型FAdVsHexon基因擴(kuò)增片段的PsyI酶切結(jié)果

2.3 臨床樣本測定 本實(shí)驗(yàn)室2株(RZ株、YTPL株)臨床分離株經(jīng)Hexon全基因擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物測序確認(rèn)為FAdVs-4和FAdVs-11。這2個(gè)毒株應(yīng)用上述建立的PCR-RFLP方法進(jìn)行測定,得到酶切圖譜(圖5、圖6),經(jīng)分析比對(duì)其圖譜條帶與FAdVs中的FAdVs-4、FAdVs-11型的酶切圖譜相符合。

圖5 RZ株酶切圖譜
M:DNA Marker DL-2 000 ; 1:Pf123Ⅱ; 2:PsyI ;3:Eco130 I ; 4:MluI ; 5:BgⅡ

3 討論

FAdVs共有12個(gè)血清型(FAdVs 1~7、8a、8b、9~11),多數(shù)血清型的腺病毒都能引起禽類嚴(yán)重的疾病,不同血清型的腺病毒致病性和所引起的癥狀不完全相同[4]。FAdVs還容易與新城疫病毒、雞傳染性貧血病毒、傳染性支氣管炎病毒、H9亞型禽流感病毒和大腸桿菌等病原混合感染,對(duì)家禽養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大損失[5]。由于不同血清型的FAdVs之間有不同程度的交叉中和作用[6],所以以血清學(xué)方法為基礎(chǔ)的分型方法尚未建立[7]。本試驗(yàn)建立的方法與序列測定相比較更加簡便、快捷。本試驗(yàn)中所設(shè)計(jì)的引物能良好的擴(kuò)增出FAdVs全部12種血清型,以該引物為基礎(chǔ)的PCR-RFLP有良好的通用性。

圖6 YTPL株酶切圖譜
M:DNA Marker DL-2 000; 1:Pf123Ⅱ; 2:PsyI;3:Eco130 I; 4:MluI; 5:BgⅡ

Zsak等[8]利用BamH I和HindIII對(duì)FAdVs進(jìn)行PCR-RFLP分析,將FAdVs分為5種不同的A~E亞群,研究表明有一定致病性的禽腺病毒毒株之間的基因型具相關(guān)性。其中A亞群包含F(xiàn)AdVs-1;B亞群含F(xiàn)AdVs-5;C亞群含F(xiàn)AdVs-4;D亞群包含F(xiàn)AdVs-2、FAdVs-3、FAdVs-9和FAdVs-11;E亞群包含F(xiàn)AdVs-6、FAdVs-7、FAdVs-8a和FAdVs-8b,但其方法不能將全部血清型的FAdVs區(qū)分。李海英等[9]根據(jù)Hexon全基因的酶切位點(diǎn),建立了利用限制性內(nèi)切酶HaeⅡ分型方法,能區(qū)分FAdVs;但該方法需要擴(kuò)增Hexon基因的全長,約2 500 bp,且該方法所得到的酶切圖譜可以區(qū)分出FAdVs-3、4、6、8 b、9、10 這6種血清型,而FAdVs-1、2、5、7、8a和11這6種血清型由于酶切條帶太過接近,無法區(qū)分,故該方法無法完全區(qū)分出FAdVs的 12個(gè)血清型。而本試驗(yàn)中同樣擴(kuò)增FAdVsHexon基因,但其片段長度較短,易于擴(kuò)增;且選用限制性內(nèi)切酶Eco130 I、Pf123Ⅱ、MluI 、PsyI、BgⅡ?qū)U(kuò)增片段進(jìn)行酶切分析,酶切圖譜區(qū)分度良好,能很好地區(qū)分出FAdVs的12個(gè)血清型。G.Meulemans等[10]使用與本試驗(yàn)相同的引物,對(duì)FAdVs的Hexon基因進(jìn)行擴(kuò)增,并對(duì)所得到的PCR產(chǎn)物利用BsiW I、Sty1、MluI、AspI、ScaI和BgⅡ這6種限制性內(nèi)切酶進(jìn)行酶切,所得到的酶切圖譜可以將12個(gè)血清型的FAdVs區(qū)分。與該報(bào)道相比,本試驗(yàn)只需要Eco130 I、Pf123Ⅱ、MluI 、PsyI和BgⅡ這5種限制性內(nèi)切酶即可完成酶切,故更具有簡便性。

為簡化操作,本試驗(yàn)采用統(tǒng)一溫度、統(tǒng)一反應(yīng)時(shí)間進(jìn)行限制性內(nèi)切酶酶切,且可得到良好的酶切效果,故該方法較為簡便。建立的PCR-RFLP方法對(duì)臨床分離株進(jìn)行酶切分析,其鑒定的血清型結(jié)果與Hexon基因的測序結(jié)果相一致,表明該方法具有準(zhǔn)確性。

故本試驗(yàn)基于Hexon基因建立的FAdVs PCR-RFLP分型方法,具有準(zhǔn)確性、簡便性和良好的區(qū)分性,可用于臨床FAdVs的分型診斷。

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