張琳 李歡歡 于淑坤 黃曼 苗敏
摘要為了進(jìn)一步研究SlWDR204的功能,克隆了番茄的SlWDR204基因,通過亞細(xì)胞定位為研究其功能提供線索,并通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)法,利用RNAi技術(shù)獲得SlWDR204基因下調(diào)的轉(zhuǎn)基因植株。干旱脅迫試驗表明,轉(zhuǎn)基因番茄對干旱脅迫更加敏感,說明SlWDR204基因正向調(diào)控植物對干旱的響應(yīng),這一發(fā)現(xiàn)為分子育種提供了新的靶標(biāo)基因,并為闡明植物抗旱的分子機(jī)理奠定了基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞SlWDR204基因;WD40家族蛋白;轉(zhuǎn)基因番茄;抗旱性
中圖分類號S188文獻(xiàn)標(biāo)識碼A
文章編號0517-6611(2019)01-0096-03
doi:10.3969/j.issn.0517-6611.2019.01.030
開放科學(xué)(資源服務(wù))標(biāo)識碼(OSID):
植物由于固著生活的特點(diǎn)而不可避免地會受到環(huán)境不利因素的脅迫,這些脅迫包括生物的和非生物的,其中非生物的脅迫因素包括干旱、高溫、低溫、重金屬離子等[1]。干旱脅迫是植物脅迫中重要脅迫之一,干旱對作物的生長發(fā)育造成了不可逆轉(zhuǎn)的影響,嚴(yán)重影響了作物的品質(zhì)和產(chǎn)量[2]。
WD40家族蛋白在動植物中均有發(fā)現(xiàn),但其生物學(xué)功能有較大差別。WD40蛋白一般具有一個保守的結(jié)構(gòu)域WD40-repeat,一般含有6~8個WD40-repeat,每個repeat由40~60個保守的氨基酸構(gòu)成,其N端和C端分別有高度保守的二肽GH(Gly-His)和WD(Trp-Asp)[3]。番茄WD40(WD40-repeatdomain)基因家族編碼100多個番茄SlWDR(WD40-repeatdomainfamilymembersintomato)蛋白[3]。前人研究表明,WD40家族蛋白作為CUL4-DDB1泛素連接酶復(fù)合體與底物直接結(jié)合而發(fā)揮作用[4],參與包括果實發(fā)育、脅迫應(yīng)答、抵抗病害等許多重要生理過程[5-6]。而WD40家族蛋白成員SlWDR204蛋白參與紫外脅迫應(yīng)答和紫外修復(fù),是生物體中核苷酸切除修復(fù)通路的重要元件[7]。為了進(jìn)一步研究SlWDR204的功能,筆者克隆了番茄的SlWDR204基因,通過亞細(xì)胞定位為研究其功能提供線索,并通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)法,利用RNAi技術(shù)獲得SlWDR204基因下調(diào)的轉(zhuǎn)基因植株,并對轉(zhuǎn)基因植株進(jìn)行干旱脅迫,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因番茄對干旱脅迫更加敏感,表明SlWDR204基因正向調(diào)控植物對干旱的響應(yīng),以期為闡明植物抗旱的分子機(jī)理奠定基礎(chǔ)。
1材料與方法
1.1材料與試劑番茄(Solanumlycopersicum)、大腸桿菌(Escherichiacoli)DH5α菌株、農(nóng)桿菌(Agrobacterium)GV2260菌株、質(zhì)粒表達(dá)載體,反轉(zhuǎn)錄試劑盒、pfuDNA聚合酶、T4連接酶、限制性內(nèi)切酶、質(zhì)粒提取試劑盒、瓊脂糖凝膠回收試劑盒、MS(MurashigeandSkoog)、6-BA(6-Benzylaminopurine)、IAA(indole-3-aceticacid)、KT(Kinetin)、2,4-D(2,4-Dichlorophenoxyaceticacid)、ACE(Acetosyringone)、KANA(Kanamycin)、SB(Carbenicillin)。
1.2番茄SlWDR204基因的克隆根據(jù)SolGenomicsNetwork中SlWDR204基因(Solyc09g031610.2.1)序列信息,設(shè)計SlWDR204-F和SlWDR204-R的特異性引物。
提取番茄野生型幼苗總RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA,通過DNA聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)PCR擴(kuò)增SlWDR204基因,PCR條件如下:預(yù)變性95℃4min;變性溫度95℃2min,退火溫度58℃20s,延伸溫度72℃100s,72℃5min,30個循環(huán)。
1.3SlWDR204的亞細(xì)胞定位亞細(xì)胞定位是指某種蛋白或表達(dá)產(chǎn)物在細(xì)胞中的具體存在部位,例如存在核內(nèi)、胞質(zhì)內(nèi)或細(xì)胞膜上,GFP是綠色熒光蛋白,在掃描激光共聚集顯微鏡下可以發(fā)出綠色熒光,可以準(zhǔn)確定位蛋白質(zhì)在細(xì)胞中的位置[3]。構(gòu)建SlWDR204-GFP融合表達(dá)載體,該表達(dá)載體可由35S強(qiáng)啟動子啟動。構(gòu)建成功的表達(dá)載體轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌,篩選陽性菌株。采用煙草基因瞬時表達(dá)體系表達(dá)番茄基因SlWDR204。將經(jīng)過乙酰丁香酮誘導(dǎo)的農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)入煙草葉片中,SlWDR204-GFP經(jīng)過36h表達(dá),該蛋白經(jīng)過表達(dá)得到一定的積累。經(jīng)處理后的煙草葉片,利用激光共聚焦顯微鏡觀察番茄SlWDR204表達(dá)蛋白的亞細(xì)胞定位。
1.4番茄SlWDR204-RNAi轉(zhuǎn)基因植株的獲得與鑒定用液氮冷激法將SlWDR204-RNAi重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌中,篩選獲得陽性克隆菌株。利用組織培養(yǎng)的方法,獲得野生型植株的愈傷組織。采用經(jīng)乙酰丁香酮誘導(dǎo)處理后的農(nóng)桿菌侵染番茄愈傷組織,利用組織培養(yǎng)的方法培養(yǎng),經(jīng)共培養(yǎng)、篩選分化、生根等步驟,培養(yǎng)至幼苗[8]。經(jīng)過煉苗后,移栽至土中培養(yǎng),篩選獲得陽性轉(zhuǎn)基因植株。
1.5干旱脅迫試驗為了探究番茄SlWDR204基因?qū)Ω珊得{迫的抵御能力,使用生長狀況相同的番茄SlWDR204-RNAi轉(zhuǎn)基因植株和野生型植株進(jìn)行試驗。將番茄轉(zhuǎn)基因種子和野生型種子播種于土中,種子萌發(fā)暗處理3d,待種子露白,置于光下生長,光照18h、黑暗6h,溫度26℃。待番茄生長至幼苗,將番茄幼苗移栽至花盤中培養(yǎng)。待花盆中土壤吸水飽和后,將轉(zhuǎn)基因植株與野生型植株進(jìn)行干旱脅迫處理,觀察番茄植株葉片失水枯萎情況。
2結(jié)果與分析
2.1番茄SlWDR204基因分析番茄SlWDR204基因所編碼的蛋白質(zhì)長度為587aa,該基因定位于番茄的第9號染色體上,由10個內(nèi)含子和11個外顯子構(gòu)成,位于9號染色體的中部位置,番茄SlWDR204基因具有一個特殊DWD功能模塊,DWD模塊擁有125個氨基酸的保守結(jié)構(gòu)域,其所編碼的蛋白質(zhì)含有多個保守的WD(Trp-Asp)、D(Asp)以及R(Arg)重復(fù)氨基酸序列(圖1A)。番茄SlWDR204基因所編碼的蛋白質(zhì)與擬南芥WD40家族同源基因所編碼的蛋白質(zhì)具有較高的同源性,存在不同數(shù)量的重復(fù)保守氨基酸序列,如WD(Trp-Asp)(圖1B)。
2.2SlWDR204基因的克隆提取番茄野生型幼苗總RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA,以cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,所得的PCR產(chǎn)物進(jìn)行核酸瓊脂糖凝膠電泳,番茄SlWDR204基因的長度為1608bp,PCR產(chǎn)物的電泳結(jié)果見圖2,電泳結(jié)果顯示,所得條帶大小位于1000~2000bp,與原基因大小1608bp位置一致,測序結(jié)果顯示基因序列正確。
2.3SlWDR204的亞細(xì)胞定位將帶有SlWDR204-GFP融合表達(dá)載體的農(nóng)桿菌注射煙草的下表皮細(xì)胞,36h后用激光共聚焦顯微鏡觀察番茄SlWDR204表達(dá)蛋白的亞細(xì)胞定位。之前的研究顯示番茄WD40家族SlWDR13、SlWDR25以及SlWDR28等基因的蛋白表達(dá)定位細(xì)胞核中[5],推測番茄SlWDR204表達(dá)蛋白也定位細(xì)胞核中。亞細(xì)胞定位試驗結(jié)果顯示,GFP蛋白表達(dá)定位在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中,故而在整個細(xì)胞中都呈現(xiàn)綠色,SlWDR204表達(dá)蛋白主要定位于細(xì)胞核(圖3)。
2.4轉(zhuǎn)基因番茄的鑒定通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化和植物組織培養(yǎng)技術(shù),獲得SlWDR204-RNAi轉(zhuǎn)基因番茄。收取部分轉(zhuǎn)基因番茄葉片樣本,提取番茄葉片中的基因組DNA。植物表達(dá)載體pBI121含有NPTⅡ基因,使用NPTⅡ引物對番茄轉(zhuǎn)基因植株進(jìn)行陽性鑒定(圖4),獲得10株番茄轉(zhuǎn)基因陽性苗。
2.5番茄SlWDR204轉(zhuǎn)基因植株干旱脅迫后的植株形態(tài)試驗發(fā)現(xiàn),干旱脅迫8d時,SlWDR204-RNAi轉(zhuǎn)基因植株的部分葉片開始出現(xiàn)輕度失水,干旱脅迫13d時,SlWDR204-RNAi轉(zhuǎn)基因植株的所有葉片都出現(xiàn)嚴(yán)重失水,葉片全部呈現(xiàn)枯萎狀態(tài);而野生型植株葉片在干旱脅迫8d時,葉片呈平展?fàn)顟B(tài),干旱脅迫13d時,部分葉片呈失水枯萎狀態(tài)(圖5)。該試驗表明,SlWDR204基因有助于提高番茄植株的抗旱能力。
3結(jié)論與討論
利用農(nóng)桿菌侵染番茄愈傷組織獲得SlWDR204基因下調(diào)的番茄轉(zhuǎn)基因株系。通過觀察發(fā)現(xiàn)SlWDR204番茄轉(zhuǎn)基因株系長勢比野生型茂盛,分支較野生型多,說明SlWDR204基因?qū)Ψ焉L發(fā)育存在一定的影響。同時對轉(zhuǎn)基因番茄進(jìn)行干旱脅迫試驗。通過干旱脅迫試驗觀察野生型與SlWDR204-RNAi轉(zhuǎn)基因番茄葉片失水情況,發(fā)現(xiàn)野生型番茄的抗旱能力明顯優(yōu)于SlWDR204-RNAi轉(zhuǎn)基因番茄,確定番茄SlWDR204基因?qū)Ω珊得{迫具有很好的抵御作用。亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示,SlWDR204與CUL4、DDB1定位相同[3],均定位于細(xì)胞核中,說明SlWDR204可能與CUL4、DDB1發(fā)生相互作用,共同行使功能。前期的研究結(jié)果也表明,SlWDR204在CUL4泛素E3連接酶復(fù)合體中起到底物識別亞基的作用[4],SlWDR204蛋白與CUL4形成復(fù)合體之后,具有相應(yīng)的生物學(xué)活性,參與植物生長發(fā)育的調(diào)控,如修復(fù)UV損傷、果實發(fā)育和抵御病害等。也有研究表明WD40家族其他成員(如SlWD6[9]、SlWDR141[10])在抗旱或耐鹽等方面有重要功能。
目前只對番茄SlWDR204基因的抗旱性進(jìn)行研究,在試驗過程中亦發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因植株分支較多現(xiàn)象,但未能進(jìn)行深入探究。下一步將探究轉(zhuǎn)基因植株的多分支機(jī)理以及進(jìn)一步研究SlWDR204基因抗旱的分子生物學(xué)機(jī)制。
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