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基于生信分析預(yù)測(cè)人參-茯苓藥對(duì)治療結(jié)直腸癌的分子機(jī)制*

2019-05-06 05:32:26周小英苗大興符中柱龔超超袁盛蘭
關(guān)鍵詞:茯苓人參靶點(diǎn)

周小英,苗大興,符中柱,龔超超,袁盛蘭,熊 浩

(1.貴州中醫(yī)藥大學(xué),貴州 貴陽(yáng) 550002;2.貴州中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院,貴州 貴陽(yáng) 550001)

結(jié)直腸癌(colorectal cancer,CRC)在全球范圍內(nèi)是發(fā)病率排名第3的癌癥,也是全球第2的死亡原因,其中亞洲的死亡率最高,達(dá)52.4%[1]。目前CRC的發(fā)病率仍處于上升趨勢(shì),過(guò)去幾十年中發(fā)病率增加了2倍[2]。目前結(jié)直腸癌的治療主要為手術(shù)治療、放化療及靶向治療,但不可避免的存在治療費(fèi)用昂貴、副作用大的弊端[3]。祖國(guó)醫(yī)學(xué)對(duì)結(jié)直腸癌研究歷史悠久,屬中醫(yī)“鎖肛痔”“積聚”“臟毒”“腸蕈”等范疇。在控制疾病的進(jìn)展,延長(zhǎng)患者生存時(shí)間,減少不良反應(yīng)和改善生活質(zhì)量等有著重要的作用[4]。

人參-茯苓藥對(duì)來(lái)源于四君子湯,為貴州省名中醫(yī)符中柱教授治療結(jié)直腸癌的經(jīng)典藥對(duì),被廣泛應(yīng)用于CRC的治療[5]。人參始載于《神農(nóng)本草經(jīng)》,主補(bǔ)五臟、安精神、定魂魄、除邪氣等功效。臨床多被用于抗腫瘤、抗衰老、抗疲勞、調(diào)節(jié)免疫力及抗菌等[6]。茯苓始載于《神農(nóng)本草經(jīng)》,具有利水滲濕、健脾寧心等功效。具有利尿、抗氧化、抑菌、抗炎、抗腫瘤、美白、降血脂、抗癲癇及免疫調(diào)節(jié)等藥理作用[7]。兩者合用共筑益氣補(bǔ)血、補(bǔ)益脾胃等功效,對(duì)結(jié)直腸癌后期脾胃氣虛型效果顯著。目前針對(duì)中醫(yī)藥治療CRC的相關(guān)研究越來(lái)越多,但仍集中于單味藥和復(fù)方中藥,對(duì)藥對(duì)研究較少。本藥對(duì)中的人參皂苷、人參多糖等都被證明具有抗腫瘤作用[8],且茯苓的茯苓酸、茯苓新酸等也被證明對(duì)腫瘤有很好的抑制作用[9]。但中藥的化學(xué)成分較多,單成分的研究不能反映中藥的多成分、多靶點(diǎn)的作用特點(diǎn)。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是以網(wǎng)絡(luò)學(xué)方法分析藥對(duì)、疾病和靶點(diǎn)之間“多成分、多靶點(diǎn)、多途徑”作用關(guān)系的藥理學(xué)學(xué)科,有利于推進(jìn)中藥現(xiàn)代藥理學(xué)研究進(jìn)程。本研究對(duì)人參-茯苓藥對(duì)活性成分的作用靶點(diǎn)及信號(hào)通路與CRC疾病的發(fā)生發(fā)展進(jìn)行探索,從而闡明人參-茯苓藥對(duì)治療CRC的可能作用機(jī)制。

1 材料與方法

1.1 結(jié)直腸癌的基因數(shù)據(jù)芯片獲取 在基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù) GEO(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)下載與結(jié)直腸癌相關(guān)的GSE128449基因表達(dá)譜,由Angel Esteban-Gil等提交,實(shí)驗(yàn)平臺(tái)是基于GPL4133平臺(tái)。總共包含了36個(gè)樣本,樣本都來(lái)自于受試者的息肉基因,其中正常組5個(gè)樣本,結(jié)直腸癌31個(gè)樣本。

1.2 差異基因的獲取與分析 使用在線分析軟件GEO2R對(duì)基因進(jìn)行分組分析,分為結(jié)直腸癌組和正常人組。設(shè)置P值和差異倍數(shù)(fold change,F(xiàn)C)進(jìn)行差異基因的篩選。認(rèn)為當(dāng)P<0.01并∣log2FC∣>1.5時(shí)差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。使用ImageGP(www.ehbio.com/ImageGP/index.php/Home/Index/)在線制作火山圖,Morpheus在 線 工 具(https://software.broadinstitute.org/morpheus/)制作熱圖。

1.3 人參-茯苓藥對(duì)成分靶點(diǎn)的獲取 使用BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫(kù)中輸入人參、茯苓,設(shè)置預(yù)測(cè)候選目標(biāo)積分>20,P<0.05,獲得人參-茯苓藥對(duì)的化合物和可能干預(yù)的靶基因。

1.4 關(guān)鍵靶點(diǎn)的篩選及構(gòu)建蛋白作用網(wǎng)絡(luò) 將人參、茯苓及結(jié)直腸癌的靶基因取交集獲取核心靶點(diǎn)基因,并制作韋恩圖,將核心靶基因在使用PPI分析數(shù)據(jù)庫(kù)STRING構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò),設(shè)置人種為“Homo sapiens”,最低互作閾值為 0.4,制作 PPI網(wǎng)絡(luò)。

1.5 靶點(diǎn)及其對(duì)應(yīng)有效成分的預(yù)測(cè) 將1.4所獲取的核心靶點(diǎn)基因?qū)隑ATMAN-TCM系統(tǒng),得到每個(gè)靶點(diǎn)對(duì)應(yīng)的有效成分,使用Cytoscape軟件構(gòu)建疾病-靶點(diǎn)-藥物有效成分網(wǎng)絡(luò)。在生成的網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點(diǎn)代表化合物、蛋白質(zhì)或疾病,連線代表相互作用關(guān)系。

1.6 核心靶點(diǎn)的GO分析和KEGG通路富集分析使用R語(yǔ)言對(duì)“人參-茯苓”藥對(duì)治療CRC的關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行GO分析與京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路富集分析,設(shè)置 P<0.05,Q<0.05.分析結(jié)果以氣泡圖展示,僅展示前20個(gè)。

1.7 核心蛋白的聚類功能模塊分析 將STRING所獲得的PPI網(wǎng)絡(luò)導(dǎo)入Cytoscape軟件,使用MCODE插件對(duì)差異基因進(jìn)行模塊化分析,篩選積分較高的核心基因,并對(duì)核心基因進(jìn)行生物過(guò)程GO分析和KEGG分析,以P<0.05表示具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 結(jié)直腸癌差異基因收集結(jié)果 CRC患者和正常人之間共有892個(gè)差異基因,其中上游基因307個(gè),下游基因585個(gè)。圖1展示了差異基因的火山圖,圖3只展示了前30個(gè)上調(diào)基因和前30個(gè)下調(diào)基因的熱圖。

圖1 結(jié)直腸癌差異基因的火山圖分析

2.2 關(guān)鍵靶點(diǎn)的篩選 從BATMAN-TCM中設(shè)置預(yù)測(cè)候選目標(biāo)積分>20,P<0.05,獲得人參的化合物有293個(gè),其中155個(gè)化合物含有結(jié)構(gòu)信息,可能干預(yù)的靶基因有1 338個(gè);茯苓的化合物共54個(gè),其中21個(gè)化合物含有結(jié)構(gòu)信息,可能干預(yù)的靶基因有503個(gè);將它們與結(jié)直腸癌的差異基因取交集共獲得關(guān)鍵基因23個(gè),分別為:LEP、APOE、HTR3A、NPPA、TNF、PTGS2、HMBS、CREB1、AKR1C1、NFKB1、COX5A、 RXRA、 CAMK2D、 PPARG、 HDAC9、GABRA2、IL6、MAOB、 NFIB、 RAB3B、 GRIN1、ADK、RRM2B。結(jié)果見(jiàn)圖2。

圖2 核心基因?qū)ふ翼f恩圖

2.3 化合物分子-靶點(diǎn)相互作用網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建 在設(shè)置核心靶點(diǎn)基因的積分>20后,篩選靶點(diǎn)基因的化合物,共獲得人參相關(guān)的化合物有53個(gè),β-欖香烯、δ-欖香烯、草烯、三磷酸腺苷、蝙蝠葛堿、腐胺、腺苷、木糖、鼠李糖、石竹胺、蔗糖、棕櫚酸、3,5-二甲基-4-甲氧基苯甲酸、腺嘌呤、γ-谷甾醇、甘露糖、Ginsenol、棕櫚酸甲酯、20(S)-原人參二醇、原人參二醇、原人參三醇(皂苷)、尿苷、香茅醇、膽堿、欖香素等。其中的20(S)-原人參二醇、原人參二醇、原人參三醇是人參皂苷的特征類型,已被實(shí)驗(yàn)證明有助于腫瘤的治療[10]。茯苓相關(guān)的化合物有11個(gè),分別為齒孔醇、麥角胺、八仙花酸、脫氫苯甲酸、對(duì)羥基苯甲醇、腺嘌呤、多孔酸B、麥角固醇、茯苓酸、Undecan-2-Ol、月桂醛,其中茯苓酸已經(jīng)被證明可調(diào)節(jié)誘導(dǎo)細(xì)胞周期停止和細(xì)胞凋亡來(lái)達(dá)到抗癌作用[11]。如圖4所示,將化合物和核心靶點(diǎn)基因構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)圖形,連線代表相關(guān)性,分析網(wǎng)絡(luò)圖共含有87個(gè)節(jié)點(diǎn),其中代表人參活性成分的節(jié)點(diǎn)有53個(gè),茯苓的活性成分節(jié)點(diǎn)有11個(gè),節(jié)點(diǎn)與節(jié)點(diǎn)之間的作用關(guān)系共209條,其中腺嘌呤(Adenine)為人參、茯苓共有的化合物。

圖3 前60個(gè)結(jié)直腸癌差異表達(dá)基因的熱圖分析

圖4 人參-茯苓活性成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)

2.4 關(guān)鍵基因的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 將所獲得的23個(gè)靶點(diǎn)基因輸入STRING數(shù)據(jù)庫(kù),構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò),如圖5所示。PPI網(wǎng)絡(luò)中共包含節(jié)點(diǎn)23個(gè),38條相互作用關(guān)系。

圖5 PPI網(wǎng)絡(luò)圖

2.5 GO生物過(guò)程分析和KEGG通路分析 對(duì)23個(gè)關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行細(xì)胞組分、分子功能與生物過(guò)程富集分析,其主要富集于發(fā)射器門控離子通道活動(dòng)、發(fā)射機(jī)門控通道活動(dòng)、單羧酸結(jié)合、激素受體結(jié)合、羧酸結(jié)合、細(xì)胞外配體門控離子通道活性、肌動(dòng)蛋白結(jié)合、核受體活動(dòng)、轉(zhuǎn)錄因子活性,直接配體調(diào)節(jié)序列特異性DNA結(jié)合、類固醇激素受體活性、受體配體活性、抑制轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、激活轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合等生物學(xué)過(guò)程。見(jiàn)圖6,展示了前20位GO分析結(jié)果(氣泡大小代表基因富集個(gè)數(shù),顏色深淺代表P值大?。?/p>

人參-茯苓藥對(duì)治療CRC的關(guān)鍵靶點(diǎn)基因進(jìn)行KEGG分析,其主要富集于TNF信號(hào)通路、HIF-1信號(hào)通路、Toll樣受體信號(hào)通路、NF-κB信號(hào)通路、NOD樣受體信號(hào)通路、PI3K/Akt信號(hào)通路、癌癥中的轉(zhuǎn)錄失調(diào)、病毒致癌作用、AMPK信號(hào)通路、PPAR信號(hào)通路、IL-17信號(hào)通路等,以上通路對(duì)CRC的發(fā)病、進(jìn)展、侵襲、轉(zhuǎn)移都有著關(guān)鍵性的作用。見(jiàn)圖7,展示了前20位KEGG信號(hào)通路富集分析。

2.6 核心蛋白基因篩選 通過(guò)Cytoscape中Cyto-Hubba插件進(jìn)行Hub(核心)基因的篩選,使用MCC算法,顯示前10個(gè)積分較高的基因,分別為TNF、PPARG、CREB1、PTGS2、IL6、LEP、APOE、NFKB1、RXRA、GRIN1。見(jiàn)圖 8,其中顏色越深,積分越高。后續(xù)對(duì)核心基因進(jìn)一步PPI分析,得出其主要富集于TNF信號(hào)通路、Toll樣受體信號(hào)通路、破骨細(xì)胞分化、PI3K/Akt信號(hào)通路、癌癥中的轉(zhuǎn)錄失調(diào)、NOD樣受體信號(hào)通路、NF-κB信號(hào)通路等,主要參與生物合成過(guò)程和代謝過(guò)程的積極調(diào)節(jié)、甾醇運(yùn)輸、炎癥反應(yīng)、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞死亡、細(xì)胞增殖的負(fù)調(diào)節(jié)以及RNA代謝過(guò)程的積極調(diào)節(jié)等生物過(guò)程。

圖6 關(guān)鍵靶點(diǎn)的GO分析結(jié)果

圖7 關(guān)鍵靶點(diǎn)的KEGG分析結(jié)果

圖8 核心基因篩選

圖9 TNF信號(hào)通路

3 討論

中醫(yī)學(xué)認(rèn)為CRC屬于“鎖肛痔”“積聚”“臟毒”“腸蕈”等范疇?!鹅`樞·水脹》說(shuō):“腸覃何如?岐伯曰:寒氣客于腸外,與衛(wèi)氣相搏,……肉乃生。其始也,大如雞卵,稍以益大,至其成也,如懷子之狀,久者離歲,按之則堅(jiān),推之則移,……”中醫(yī)認(rèn)為結(jié)直腸司糟粕傳送,CRC的發(fā)生是因正氣虧虛,邪毒入侵,正氣已虛,無(wú)力抗邪,致邪氣留內(nèi),氣、瘀、毒停滯于大腸,大腸傳導(dǎo)失司,日久則積聚于腸內(nèi),發(fā)為大腸癌。故結(jié)直腸癌與正氣虧虛、外邪入侵密切相關(guān),補(bǔ)虛兼以解毒散結(jié)是治療CRC的主要治法。人參、茯苓作為常用的補(bǔ)氣健脾中藥,合用能益氣補(bǔ)血、健脾和胃,使正氣得以恢復(fù),在中醫(yī)藥防治CRC中被廣泛運(yùn)用。近年來(lái)大量研究都表明,人參、茯苓對(duì)CRC有著較好的防治效果[12-14]。

本研究共篩選出63個(gè)有效成分,關(guān)鍵靶點(diǎn)基因23個(gè),通過(guò)有效成分-靶點(diǎn)基因-疾病網(wǎng)絡(luò),共得到87個(gè)節(jié)點(diǎn),相互作用關(guān)系連線209條。對(duì)關(guān)鍵的靶點(diǎn)基因進(jìn)行GO分析和KEGG通路分析發(fā)現(xiàn)其作用主要涉及代謝途徑、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞增殖、癌癥傳導(dǎo)路徑等多個(gè)方面。

通過(guò)文獻(xiàn)分析,發(fā)現(xiàn)人參的有效成分β-欖香烯可通過(guò)下調(diào)miR-191改善結(jié)直腸癌細(xì)胞對(duì)5-FU的抗性,抑制Wnt/β-catenin途徑,誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,從而治療結(jié)直腸癌[15]。有實(shí)驗(yàn)證明δ-欖香烯可調(diào)節(jié)細(xì)胞凋亡途徑,誘導(dǎo)惡性腫瘤細(xì)胞周期停滯[16]。蝙蝠葛堿是人參的活性成分,廣泛應(yīng)用于炎癥性疾病中,近年來(lái)也發(fā)現(xiàn)可用于防治結(jié)直腸癌,其途徑是通過(guò)抑制NF-κB活性及其下游基因的表達(dá)影響細(xì)胞增殖、侵襲和誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡[17]。腐胺是細(xì)胞合成或從飲食或腸道細(xì)菌中獲得的小陽(yáng)離子胺。有研究發(fā)現(xiàn)外源性多胺可能對(duì)結(jié)直腸的健康有益,提示了人參中的腐胺可能是治療結(jié)直腸癌的有效化合物[18]。有研究證明腺苷可通過(guò)甲基化途徑,抑制細(xì)胞增殖,促進(jìn)結(jié)直腸細(xì)胞凋亡[19]。有研究表明甘露糖受體(MR)在結(jié)直腸癌組織中顯著高表達(dá),可作為結(jié)直腸癌患者的新型生物標(biāo)記物[20]。原人參二醇是一種腸道細(xì)菌產(chǎn)生的人參代謝產(chǎn)物,可干擾脂質(zhì)代謝并誘導(dǎo)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激和p53促進(jìn)結(jié)直腸癌細(xì)胞的凋亡[21]。另有實(shí)驗(yàn)證明原人參二醇可增加化療藥物尿嘧啶對(duì)結(jié)直腸癌的抑制作用[22]。有效化合物中20(S)-原人參二醇、原人參二醇和原人參三醇都是人參中皂苷的特征類型,已被實(shí)驗(yàn)證明有助于癌癥的治療[10]。膽堿是人體必需的營(yíng)養(yǎng)素,對(duì)從細(xì)胞維持到產(chǎn)生神經(jīng)遞質(zhì)的各種功能都是必需的,有研究發(fā)現(xiàn)血清膽堿水平對(duì)預(yù)測(cè)所有解剖亞位點(diǎn)的結(jié)直腸癌風(fēng)險(xiǎn)具有很強(qiáng)的預(yù)后價(jià)值,較高的血清膽堿水平與結(jié)直腸癌風(fēng)險(xiǎn)增加有關(guān)[23]。而茯苓的有效成分麥角甾醇的過(guò)氧化物也被發(fā)現(xiàn)能下調(diào)β-連環(huán)蛋白信號(hào)傳導(dǎo),影響CRC細(xì)胞的增殖和凋亡,從而發(fā)揮其多癌癥的防治作用[24]。茯苓新酸B屬茯苓中三萜類成分,可以抑制癌癥細(xì)胞的活性,抑制腫瘤的生成[14]。其他有效成分雖尚未發(fā)現(xiàn)與結(jié)直腸癌有直接關(guān)系,但可作為未來(lái)深入研究的內(nèi)容。

通過(guò)對(duì)關(guān)鍵基因進(jìn)行篩選,獲得積分最高的10個(gè)基因,分別為腫瘤壞死因子(TNF)、過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體γ(PPARG)、CAMP響應(yīng)元件結(jié)合蛋白 1(CREB1)、前列腺素內(nèi)過(guò)氧化物合酶 2(PTGS2)、白細(xì)胞介素 6(IL6)、瘦素(LEP)、載脂蛋白 E(APOE)、核因子 kappa b 亞單位 1(NFKB1)、維甲酸X受體α(RXRA)、谷氨酸離子型受體NMDA型亞基1(GRIN1)。其中TNF是多功能促炎細(xì)胞因子,主要由巨噬細(xì)胞分泌,參與細(xì)胞增殖、分化、凋亡等生物過(guò)程,與其相關(guān)的疾病包括自身免疫、癌癥等,在眾多試驗(yàn)中被證明是癌癥進(jìn)展的重要因素,也是癌癥中重要的檢測(cè)指標(biāo),減少TNF基因的表達(dá)可以延緩腫瘤的生長(zhǎng)、侵襲和轉(zhuǎn)移[25,26]。PPARG是脂肪細(xì)胞分化的調(diào)節(jié)因子,通過(guò)抑制NF-κB介導(dǎo)的促炎反應(yīng),作為腸內(nèi)穩(wěn)態(tài)的關(guān)鍵調(diào)節(jié)劑,與癌癥密切相關(guān)。研究發(fā)現(xiàn)PPARG基因的多態(tài)性可能是CRC的保護(hù)因子,會(huì)降低整體患CRC的風(fēng)險(xiǎn)[27]。PTGS2是前列腺素生物合成的關(guān)鍵酶,在癌細(xì)胞中PTGS2是前列腺素E2(PGE2)產(chǎn)生的關(guān)鍵步驟,其在調(diào)節(jié)運(yùn)動(dòng)性、增殖和對(duì)細(xì)胞凋亡的抗性中起重要作用,研究表明其是CRC預(yù)防和治療的靶標(biāo)[28]。IL6是炎癥和B細(xì)胞成熟中起作用的細(xì)胞因子,主要參與調(diào)節(jié)免疫反應(yīng)和炎癥傳導(dǎo)過(guò)程,有研究發(fā)現(xiàn)通過(guò)阻斷IL6信號(hào)傳導(dǎo)可減少結(jié)腸相關(guān)腫瘤的發(fā)生[29]。也有研究表明人結(jié)腸中TNF-α和IL6的升高會(huì)促進(jìn)CRC的發(fā)生[30]。NFKB1是NF-κB的亞基1,幾乎所有細(xì)胞類型中存在的多效轉(zhuǎn)錄因子,主要參與炎癥、免疫、分化、腫瘤發(fā)生和細(xì)胞凋亡,同時(shí)也是NF-κB信號(hào)通路的關(guān)鍵基因,而NF-κB信號(hào)通路已被證明可用于調(diào)節(jié)結(jié)直腸癌的進(jìn)展[31-32]。人參-茯苓可能主要通過(guò)TNF、PPARG、PTGS2、IL6、NFKB1等靶點(diǎn)來(lái)達(dá)到治療作用的。

從富集分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),其主要與炎癥傳導(dǎo)和癌癥相關(guān)信號(hào)通路密切相關(guān),包括TNF信號(hào)通路、HIF-1信號(hào)通路、Toll樣受體信號(hào)通路、NF-κB信號(hào)通路、NOD樣受體信號(hào)通路、PI3K/Akt信號(hào)通路、癌癥中的轉(zhuǎn)錄失調(diào)、病毒致癌作用、AMPK信號(hào)通路、PPAR信號(hào)通路、IL-17信號(hào)通路等。其中TNF的信號(hào)傳導(dǎo)中的TNF-α、TNF-β都被證明與CRC密切相關(guān),可調(diào)節(jié)炎癥轉(zhuǎn)錄因子(NF-κB)及其生物標(biāo)志物,影響腫瘤的增殖、侵襲、轉(zhuǎn)移和細(xì)胞存活[33]。NF-κB信號(hào)通路主要參與免疫應(yīng)答和炎癥調(diào)節(jié),與癌癥的發(fā)生和進(jìn)展密切相關(guān),其主要通過(guò)參與細(xì)胞增殖和凋亡途徑來(lái)介導(dǎo)CRC的發(fā)展[34-35]。PI3K/Akt信號(hào)傳導(dǎo)也是癌癥中最易被激活的傳導(dǎo)途徑之一,其在CRC中被過(guò)度激活,導(dǎo)致癌細(xì)胞凋亡減少,刺激癌細(xì)胞的生長(zhǎng)[36]等。以上證據(jù)表明人參-茯苓藥對(duì)主要是通過(guò)炎癥傳導(dǎo)和腫瘤相關(guān)傳導(dǎo)途徑來(lái)防治CRC的。

綜上,本研究使用生物信息分析技術(shù),挖掘到人參-茯苓藥對(duì)中176個(gè)有效化合物,共同干預(yù)的潛在靶基因415個(gè),CRC疾病相關(guān)靶基因892個(gè),其中藥對(duì)-疾病共同的靶點(diǎn)共23個(gè),通過(guò)對(duì)核心靶點(diǎn)基因進(jìn)行GO分析和KEGG分析得出,人參-茯苓藥對(duì)可能通過(guò)干預(yù) TNF、PTGS2、IL6、LEP、APOE、NFKB1 等靶基因,調(diào)控癌癥、炎癥相關(guān)信號(hào)通路,TNF信號(hào)通路、Toll樣受體信號(hào)通路、PI3K/Akt信號(hào)通路、癌癥中的轉(zhuǎn)錄失調(diào)途徑、NOD樣受體信號(hào)通路、NF-κB信號(hào)通路等,從而通過(guò)調(diào)控細(xì)胞凋亡和炎癥反應(yīng)來(lái)防治CRC。但本試驗(yàn)僅從GEO數(shù)據(jù)中獲取了36個(gè)樣本,未包含大樣本的基因組分析,也受限于算法和軟件的限制,目前只是進(jìn)行實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的分析整理,仍需后期實(shí)驗(yàn)的進(jìn)一步驗(yàn)證。

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