周龍 王立林 胡序懷
[摘要]目的 篩選出小鼠原代肝細(xì)胞中PTEN基因沉默所需的高效siRNA。方法 采用兩步膠原酶灌注法分離小鼠原代肝細(xì)胞,放入25 cm2膠原包被瓶中(1×106個/瓶),均分為5組:對照組(C組)、陰性對照組(NC組)、siR-996組、siR-1381組、siR-1519組。采用HiPerFect轉(zhuǎn)染試劑將各組對應(yīng)的siRNA序列轉(zhuǎn)入小鼠原代肝細(xì)胞,24 h后提取RNA和蛋白,通過Real-time PCR檢測各組PTEN mRNA表達(dá),通過Western blot檢測各組PTEN蛋白含量。結(jié)果 siR-996組、siR-1381組和siR-1519組的PTEN蛋白含量低于NC組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01),siR-996組、siR-1381組和siR-1519組的PTEN mRNA水平低于NC組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01)。siR-996組的PTEN蛋白含量及PTEN mRNA水平最低,其PTEN蛋白含量及PTEN mRNA水平的沉默效率高于siR-1381組和siR-1519組。結(jié)論 siR-996是小鼠原代肝細(xì)胞中PTEN基因沉默所需的高效siRNA。
[關(guān)鍵詞]小鼠原代肝細(xì)胞;PTEN磷酸水解酶;小干擾RNA;胰島素抵抗
[中圖分類號] R332? ? ? ? ? [文獻(xiàn)標(biāo)識碼] A? ? ? ? ? [文章編號] 1674-4721(2019)3(b)-0022-04
胰島素抵抗是影響危重患者預(yù)后的重要因素[1-2],丙泊酚在臨床上廣泛用于處于胰島素抵抗?fàn)顟B(tài)患者的鎮(zhèn)靜和麻醉,但是丙泊酚對胰島素抵抗的影響及機(jī)制卻鮮有研究。本課題組先前研究發(fā)現(xiàn)[3],丙泊酚可抑制小鼠原代肝細(xì)胞Akt/GSK-3β信號通路,引起小鼠原代肝細(xì)胞胰島素抵抗,但丙泊酚的作用靶點并不在GSK-3β,而是在其上游。PTEN是PI3K/Akt信號通路的重要調(diào)節(jié)基因[4-7],處于GSK-3β上游,本課題組將選擇PTEN作為研究對象,試圖通過在基因水平對PTEN進(jìn)行干擾,揭示丙泊酚所致胰島素抵抗的分子機(jī)制。所以,篩選出PTEN基因沉默所需的高效siRNA是關(guān)鍵,吉瑪基因公司以PTEN為靶基因,設(shè)計合成了3條siRNA供選擇,本實驗將這些siRNA轉(zhuǎn)染小鼠原代肝細(xì)胞,篩選出沉默效率最高的siRNA,為后續(xù)基因沉默實驗合理選擇siRNA提供依據(jù),現(xiàn)報道如下。
1材料與方法
1.1材料
siRNA-996、siRNA-1381、siRNA-1519、陰性對照siRNA(吉瑪基因公司,上海),各組siRNA的序列見表1。細(xì)胞培養(yǎng)試劑(Invitrogen公司,美國),HiPerFect轉(zhuǎn)染試劑盒(Qiagen公司,德國),SDS-PAGE試劑(Bio-Rad Laboratories公司,美國),兔抗PTEN抗體(Cell Signaling Technology公司,美國),聚偏二氟乙烯(PVDF)膜(Millipore公司,美國),M-MLV逆轉(zhuǎn)錄酶(Promega公司,美國),Trizol試劑盒(Invitrogen公司,美國)。雄性C57BL/6小鼠由北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部實驗動物科學(xué)部提供[許可證號:SCXK(京)2016-0010]。
1.2方法
1.2.1細(xì)胞培養(yǎng)及分組? 采用兩步膠原酶灌注法分離小鼠原代肝細(xì)胞[8-9],收集細(xì)胞于50 ml離心管中,800 r/min,8 min離心,棄上清液,用細(xì)胞培養(yǎng)基重新懸浮,顯微鏡下臺盼藍(lán)染色觀察活細(xì)胞,計數(shù),調(diào)整細(xì)胞密度,放入25 cm2膠原包被瓶中(1×106個/瓶)。這些細(xì)胞均分為5組:對照組(C組);陰性對照組(NC組):加入終濃度為50 nmol/L的陰性對照siRNA;siR-996組:加入終濃度為50 nmol/L的siR-996;siR-1381組:加入終濃度為50 nmol/L的siR-1381;siR-1519組:加入終濃度為50 nmol/L的siR-1519。
1.2.2 siRNA轉(zhuǎn)染? 按HiPerFect轉(zhuǎn)染試劑盒說明書,在24孔板中每孔加入6×104個小鼠原代肝細(xì)胞,用含100 U/ml青霉素、10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)液稀釋至500 μl,置于37℃的CO2培養(yǎng)箱中。用無血清的DMEM培養(yǎng)液稀釋75 ng siRNA至終濃度為50 nmol/L,然后加入3 μl HiPerFect轉(zhuǎn)染試劑,輕搖混勻,室溫下靜置10 min。將混合物逐滴加入培養(yǎng)皿中,混勻,置于CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h。
1.2.3 PETN蛋白檢測? 先用RIPA裂解緩沖液提取各組細(xì)胞中的總蛋白,再用BCA法檢測蛋白含量。每組上樣30 μg總蛋白經(jīng)10%SDS-PAGE凝膠行恒壓電泳,將其轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,用5%脫脂奶粉室溫下封閉1 h,加入1:1000稀釋的PTEN和β-actin一抗,4℃孵育過夜,加入1:3000稀釋的辣根過氧化物酶標(biāo)記的相應(yīng)二抗,室溫孵育1 h,洗膜后采用ECL化學(xué)發(fā)光顯影,最后用Gel-Pro Analyzer分析蛋白條帶灰度值。
1.2.4 PTEN mRNA檢測? 按Trizol試劑盒的說明書提取細(xì)胞總的RNA。逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)按照M-MLV逆轉(zhuǎn)錄酶試劑盒的說明書操作。PTEN上游引物:3′-TGTATCGCGGAGACTGACCCTTAA-5′,PTEN下游引物:5′-GATTGCAAGTTCCGCCACTGAACA-3′。HPRT1上游引物:3′-TCGTTCTGCAAGTCAGGACAGGTATTAA-5′,HPRT1下游引物:5′-TCCAGCAGGTCAGCAAAGAATTTATAGC-3′。PCR的反應(yīng)條件:95℃ 10 min,95℃ 15 s,60℃ 1 min,40個循環(huán)。PCR完畢后以HPRT1作為內(nèi)參基因,采用SDS軟件分析產(chǎn)物熔解曲線。
1.3觀察指標(biāo)及評價標(biāo)準(zhǔn)
比較NC組、siR-996組、siR-1381組、siR-1519組的PTEN蛋白含量及PTENmRNA水平。PTEN蛋白含量及PTENmRNA水平的沉默效率與各組的PTEN蛋白含量及PTENmRNA水平成反比,含量或水平越低,表明其沉默效率越高。
1.4統(tǒng)計學(xué)方法
采用SPSS 18.0統(tǒng)計學(xué)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,計量資料用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(x±s)表示,組間比較用單因素方差分析;以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2結(jié)果
siR-996組、siR-1381組和siR-1519組的PTEN蛋白含量低于NC組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01),siR-996組、siR-1381組和siR-1519組的PTEN mRNA水平低于NC組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01)(表2)。siR-996組的PTEN蛋白含量及PTEN mRNA水平最低,其PTEN蛋白含量及PTEN mRNA水平的沉默效率高于siR-1381組和siR-1519組。
3討論
胰島素抵抗是指正常劑量的胰島素所產(chǎn)生的生物學(xué)效應(yīng)降低的一種現(xiàn)象,不僅存在于糖尿病,還可以存在于其它許多病理情況下,甚至于生理情況下[10-14]。胰島素抵抗是導(dǎo)致手術(shù)患者和危重患者發(fā)生應(yīng)激性高血糖的重要機(jī)制之一[1-2]。丙泊酚是當(dāng)前臨床上最常用的靜脈麻醉劑,被廣泛用于手術(shù)患者的麻醉,而且還常用于危重患者的鎮(zhèn)靜。在當(dāng)前臨床實踐中丙泊酚常用于處在胰島素抵抗?fàn)顟B(tài)的危重患者,但是丙泊酚對胰島素抵抗的影響或機(jī)制卻少有研究。先前研究表明[15],丙泊酚可引起大鼠全身性胰島素抵抗,但具體的分子機(jī)制尚不清楚。本課題組研究發(fā)現(xiàn)[3],丙泊酚能抑制小鼠原代肝細(xì)胞Akt/GSK-3β信號通路,從而抑制糖原合成,同時還發(fā)現(xiàn)丙泊酚的作用靶點并不在GSK-3β,而是在GSK-3β的上游。PTEN處于GSK-3β的上游,是PI3K/Akt/GSK-3β信號通路的重要調(diào)節(jié)基因[4-7],因此在后續(xù)研究中課題組將PTEN列為觀察對象,試圖通過在基因水平對PTEN進(jìn)行干擾,探究丙泊酚對小鼠原代肝細(xì)胞PTEN表達(dá)的影響。所以,篩選出PTEN基因沉默所需的高效siRNA是當(dāng)前研究的關(guān)鍵。吉瑪基因公司以PTEN為靶基因,設(shè)計合成了3條siRNA供選擇:siR-996、siR-1381和siR-1519。本實驗采用siR-996、siR-1381和siR-1519轉(zhuǎn)染小鼠原代肝細(xì)胞,評價3種siRNA各自的沉默效率,旨在篩選出沉默效率最高、效果滿意的的siRNA,為后續(xù)PTEN基因沉默實驗選擇較為理想的siRNA。
PTEN是第一個被人類發(fā)現(xiàn)的具有磷酸酶活性的抑癌基因[16-17],PTEN編碼的蛋白在細(xì)胞漿中表現(xiàn)出雙重特異性磷酸酶活性,在細(xì)胞周期阻滯和細(xì)胞凋亡過程中起重要作用。PTEN蛋白募集到細(xì)胞膜上,發(fā)揮脂質(zhì)磷酸酶作用,使多種蛋白質(zhì)磷酸化,從而影響多條信號傳導(dǎo)通路,最終對基因轉(zhuǎn)錄進(jìn)行調(diào)控。PTEN被認(rèn)為是PI3K/Akt信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的重要調(diào)節(jié)基因,PTEN結(jié)合到質(zhì)膜后可催化抑制PIP3生成的反應(yīng),從而調(diào)控PI3K/Akt信號通路的轉(zhuǎn)導(dǎo)[4-7]。
RNA干擾(RNA interference,RNAi)是生物體內(nèi)特定基因表達(dá)受到抑制的一種現(xiàn)象。當(dāng)細(xì)胞內(nèi)導(dǎo)入雙鏈RNA或短發(fā)夾RNA時,與之互補(bǔ)的內(nèi)源性mRNA編碼區(qū)將裂解,從而導(dǎo)致基因沉默[18]。雙鏈RNA經(jīng)外界進(jìn)入細(xì)胞,被Dicer酶識別而被加工成21-25nt的雙鏈RNA,這些短雙鏈RNA在沉默通道中發(fā)揮主要作用,是特定mRNA被降解的主要因素,被稱為小干擾RNA(siRNA)。與目標(biāo)mRNA互補(bǔ)的siRNA可介導(dǎo)沉默復(fù)合體,特異性地降解與之高度互補(bǔ)的靶mRNA,從而抑制靶基因表達(dá)[19-20]。HiPerFect轉(zhuǎn)染試劑是一種中性脂和陽離子組成的混合物,可有效攝入siRNA并釋放細(xì)胞內(nèi)的siRNA,基因敲除效率較高。設(shè)立對照是評估RNAi實驗可信度的重要因素,本研究設(shè)立陰性對照主要是用來評估RNA干擾的特異性。本研究結(jié)果提示,siR-996組、siR-1381組和siR-1519組的PTEN蛋白含量低于NC組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01),siR-996組、siR-1381組和siR-1519組的PTEN mRNA水平低于NC組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01)。siR-996組的PTEN蛋白含量及PTEN mRNA水平最低,其PTEN蛋白含量及PTEN mRNA水平的沉默效率高于siR-1381組和siR-1519組。提示基因公司提供的3種siRNA都可不同程度地抑制PTEN表達(dá),但以siR-996抑制程度最深、效果最滿意,與NC組比較,其PTEN蛋白表達(dá)和PTEN mRNA表達(dá)均下降較多。
綜上所述,本研究以PTEN為靶基因,觀察比較了3種不同siRNA的沉默效率,其中siR-996的沉默效率最高,是PTEN基因沉默實驗較為理想的選擇。
[參考文獻(xiàn)]
[1]Vanhorebeek I,Gunst J,Van Den Berghe G.Critical care management of stress-induced hyperglycemia[J].Curr Diab Rep,2018,18(4):17.
[2]Van den Berghe G,Wilmer A,Hermans G,et al.Intensive insulin therapy in the medical ICU[J].N Engl J Med,2006,354(5):449-461.
[3]Zhou L,Wang L,Yang B,et al.Protective effect of pretreatment with propofol against tumor necrosis factor-α-induced hepatic insulin resistance[J].Exp Ther Med,2015,10(1):289-294.
[4]Driessen GJ,Ijspeert H,Wentink M,et al.Increased PI3K/Akt activity and deregulated humoral immune response in human PTEN deficiency[J].J Allergy Clin Immunol,2016,138(6):1744-1747.
[5]Yue S,Li J,Lee SY,et al.Cholesteryl ester accumulation induced by PTEN loss and PI3K/AKT activation underlies human prostate cancer aggressiveness[J].Cell Metab,2014,19(3):393-406.
[6]Bleau AM,Hambardzumyan D,Ozawa T,et al.PTEN/PI3K/Akt pathway regulates the side population phenotype and ABCG2 activity in glioma tumor stem-like cells[J].Cell Stem Cell,2009,4(3):226-235.
[7]Haddadi N,Lin Y,Travis G,et al.PTEN/PTENP1:"Regulating the regulator of RTK-dependent PI3K/Akt signalling",new targets for cancer therapy[J].Mol Cancer,2018,17(1):37.
[8]Seglen PO.Preparation of isolated rat liver cells[J].Methods Cell Biol,1976,13(1):29-83.
[9]Casciano DA.Development and utilization of primary hepatocyte culture systems to evaluate metabolism,DNA binding,and DNA repair of xenobiotics[J].Drug Metab Rev,2000,32(1):1-13.
[10]Pedro MN,Rocha GZ,Guadagnini D,et al.Insulin Resistance in HIV-Patients:Causes and Consequences[J].Front Endoc rinol (Lausanne),2018,(9):514.
[11]Reaven GM.Banting lecture 1988.Role of insulin resistance in human disease[J].Diabetes,1988,37(12):1595-1607.
[12]Sripetchwandee J,Chattipakorn N,Chattipakorn SC.Links Between Obesity-Induced Brain Insulin Resistance,Brain Mitochondrial Dysfunction,and Dementia[J].Front Endocrinol (Lausanne),2018,(9):496.
[13]Díaz BB,González DA,Gannar F,et al.Myokines,physical activity,insulin resistance and autoimmune diseases[J].Imm unol Lett,2018,(203):1-5.
[14]Maffeis C,Morandi A.Body composition and insulin resistance in children[J].Eur J Clin Nutr,2018,72(9):1239-1245.
[15]Yasuda Y,F(xiàn)ukushima Y,Kaneki M,et al.Anesthesia with propofol induces insulin resistance systemically in skeletal and cardiac muscles and liver of rats[J].Biochem Biophys Res Commun,2013,431(1):81-85.
[16]Chen CY,Chen J,He L,et al.PTEN:Tumor Suppressor and Metabolic Regulator[J].Front Endocrinol (Lausanne),2018, (9):338.
[17]Lee YR,Chen M,Pandolfi PP.The functions and regulation of the PTEN tumour suppressor:new modes and prospects[J].Nat Rev Mol Cell Biol,2018,19(9):547-562.
[18]Elbashir SM,Harborth J,Lendeckel W,et al.Duplexes of 21-nucleotide RNAs mediate RNA interference in cultured mammalian cells[J].Nature,2001,411(6836):494-498.
[19]Arif M,Islam SU,Adnan M,et al.Recent progress on gene silencing/suppression by virus-derived small interfering RNAs in rice viruses especially Rice grassy stunt virus[J].Microb Pathog,2018,(125):210-218.
[20]Baltusnikas J,Satkauskas S,Lundstrom K.Long-Term Tran scriptional Gene Silencing by RNA Viruses[J].Trends Biochem Sci,2018,43(6):397-401.
(收稿日期:2018-09-25? 本文編輯:孟慶卿)