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結(jié)腸癌不同轉(zhuǎn)移潛能細(xì)胞株SW620及SW480的代謝組學(xué)研究

2019-04-28 05:10:46牛燕周怡鄭宏趙良才李晨高紅昌
關(guān)鍵詞:糖酵解谷氨酰胺代謝物

牛燕,周怡,鄭宏,趙良才,李晨,高紅昌

(溫州醫(yī)科大學(xué) 藥學(xué)院,浙江 溫州 325035)

結(jié)直腸癌是臨床常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,在世界范圍內(nèi)發(fā)病率位居第三,致死率位居第四[1]。在我國(guó),結(jié)直腸癌的發(fā)病率和病死率呈逐年上升的趨勢(shì),嚴(yán)重威脅著人類的生命健康[2]。轉(zhuǎn)移是惡性腫瘤的重要生物學(xué)表型,是結(jié)直腸癌患者病死的主要原因之一。而異常的代謝模式是惡性腫瘤的另一重要特征[3],多項(xiàng)研究[4-6]表明代謝方式的改變參與腫瘤轉(zhuǎn)移?;诤舜殴舱駳渥V(1H nuclear magnetic resonance spectroscopy,1H NMR)的代謝組學(xué)方法,能定性、定量分析代謝物水平,已廣泛用于篩選疾病發(fā)生相關(guān)的生物標(biāo)志物,探討發(fā)病機(jī)制和藥物動(dòng)力學(xué)研究等[7-8]。本研究基于1H NMR的代謝組學(xué)技術(shù),探索SW480、SW620兩種不同轉(zhuǎn)移潛能的結(jié)腸癌細(xì)胞的代謝模式,為進(jìn)一步篩選結(jié)直腸癌轉(zhuǎn)移相關(guān)標(biāo)志物和尋找新靶點(diǎn)提供依據(jù)。

1 材料和方法

1.1 細(xì)胞和主要試劑 人結(jié)腸癌高轉(zhuǎn)移性細(xì)胞株SW620和低轉(zhuǎn)移性細(xì)胞株SW480購(gòu)自美國(guó)菌種保藏中心。PMI Modified Medium培養(yǎng)基購(gòu)自美國(guó)Hyclone公司,磷酸鹽緩沖液購(gòu)自北京Solarbio公司,0.25%Trypsin購(gòu)自上海吉?jiǎng)P基因科技有限公司,三甲硅烷基丙磺酸鈉(TSP)購(gòu)自美國(guó)Sigma公司,D2O(99.9%氘代)購(gòu)自美國(guó)劍橋同位素實(shí)驗(yàn)室,谷氨酰胺LGlutamine、葡萄糖D-(+)-Glucose Solution購(gòu)自美國(guó)Sigma公司,NaOH購(gòu)自美國(guó)Acros Organics公司,XF Base Medium Minimal基礎(chǔ)培養(yǎng)液、XF Calibrant校準(zhǔn)液、Seahorse XF細(xì)胞線粒體壓力測(cè)試試劑盒、Seahorse XF糖酵解壓力測(cè)試試劑盒購(gòu)自美國(guó)Seahorse Bioscience公司,胎牛血清購(gòu)自美國(guó)GEMINI公司。

1.2 主要儀器 Bruker AVANCE III 600 MHz NMR波譜儀購(gòu)自德國(guó)Bruker公司,Seahorse XF96細(xì)胞能量代謝分析儀購(gòu)自美國(guó)Seahorse Bioscience公司,無(wú)CO2培養(yǎng)箱、CO2培養(yǎng)箱、超低溫冰箱購(gòu)自美國(guó)Thermo公司,低溫高速離心機(jī)購(gòu)自德國(guó)Eppendorf公司,超凈臺(tái)購(gòu)自北京東聯(lián)哈爾儀器制造公司,倒置顯微鏡購(gòu)自日本Nikon公司,冷凍干燥機(jī)購(gòu)自德國(guó)Christ公司。

1.3 方法

1.3.1 細(xì)胞株及細(xì)胞培養(yǎng):采用來(lái)自同一親本、遺傳背景一致的人結(jié)腸癌高轉(zhuǎn)移性細(xì)胞株SW620和低轉(zhuǎn)移性細(xì)胞株SW480。用含10%胎牛血清和1%雙抗的RPMI Modified Medium培養(yǎng)基,在37 ℃、5% CO2的條件下傳代培養(yǎng)。

1.3.2 細(xì)胞樣本收集及胞內(nèi)代謝物提?。禾幱趯?duì)數(shù)生長(zhǎng)期的SW480和SW620細(xì)胞用15 mL冰0.9%氯化鈉溶液快速洗2遍,終止代謝;加15 mL Hank’s平衡液洗1遍;加2.5 mL胰酶消化,終止消化,轉(zhuǎn)移至15 mL離心管中;2 000 r/min,4 ℃,離心5 min,收集細(xì)胞沉淀;加5 mL Hank’s平衡液再2 000 r/min,4 ℃,離心5 min,棄上清;加冰甲醇∶氯仿=2∶1(300 μL+150 μL),超聲冰上破碎30 min;加冰氯仿∶水=1∶1(225 μL+225 μL),渦旋1 min,置于冰上15 min;12 000 r/min,4 ℃,離心20 min;取上清液,凍干48 h。

1.3.31H NMR樣本的制備和圖譜采集:SW480和SW620細(xì)胞代謝物提取凍干粉末中加500 μL含TSP濃度為0.05 mmol/L的D2O,震蕩15 s至完全溶解,置于4 ℃,12 000×g條件下離心10 min,取上清490 μL,移入直徑為5 mm的NMR樣品管。使用Bruker AVANCE III 600 MHz NMR譜儀進(jìn)行檢測(cè)。采用單脈沖序列,預(yù)飽和法壓制殘余水峰。為了能夠?qū)Υx物的1H NMR進(jìn)行定量分析,試驗(yàn)中脈沖翻轉(zhuǎn)角為90°,采樣點(diǎn)數(shù)32 K,累加次數(shù)1 024次,弛豫延遲為4 s,實(shí)驗(yàn)溫度為298.0 K?;诙嗑SNMR技術(shù),結(jié)合本課題組以前發(fā)表的工作[9-12],以及NMR Suite軟件(加拿大Chenomx公司)和網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù)(Human Metabo-lome Database,www.hmdb.ca)對(duì)采集的譜圖中的代謝物進(jìn)行詳細(xì)確認(rèn)。

1.3.4 譜圖處理:為了得到更多的代謝相關(guān)信息并且更直觀也更客觀地發(fā)現(xiàn)組間差異代謝物,采用Bruker Topspin 2.1軟件將所有樣本的譜圖導(dǎo)成數(shù)據(jù),然后應(yīng)用MATLAB R2013b軟件(美國(guó)Mathworks公司)對(duì)所有樣本1H NMR譜圖積分?jǐn)?shù)據(jù)進(jìn)行位置校正,為了消除飽和水峰時(shí)引起的譜線扭曲,除去預(yù)飽和壓水峰后的殘留水峰區(qū)。之后將積分?jǐn)?shù)據(jù)導(dǎo)入SIMCA-P+12.0軟件包(瑞典Umetrics公司)進(jìn)行多元統(tǒng)計(jì)分析。PLS-DA的第一主成分(principal component 1,PC1)和第二主成分(principal component 2,PC2)可以代表矩陣中最大的信息變量,Q2代表模型的預(yù)測(cè)能力。其構(gòu)建的得分圖上的每一個(gè)點(diǎn)代表一個(gè)樣本的代謝模式,相應(yīng)的載荷圖反映積分區(qū)間對(duì)分組的貢獻(xiàn)[13-14]。

1.3.5 Seahorse XF96細(xì)胞能量代謝分析:使用Seahorse XF96細(xì)胞能量代謝分析儀測(cè)量線粒體耗氧率(oxygen consumption rate,OCR)和細(xì)胞外酸化率(extracellular acidification rate,ECAR)來(lái)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)基礎(chǔ)呼吸、線粒體呼吸、糖酵解。在XF96細(xì)胞培養(yǎng)板上接種SW480和SW620細(xì)胞,4×104個(gè)/孔,于37 ℃ 5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h。在測(cè)定前1 h,在37 ℃無(wú)CO2培養(yǎng)箱中,更換培養(yǎng)基為含有11 mmol/L葡萄糖和2.05 mmol/L谷氨酰胺的無(wú)碳酸氫鹽的XF Base Medium Minimal 1640。Seahorse測(cè)量板A孔中加入寡霉素(Oligomycin,1.0 μmol/L),B孔中加入羰基-氰-對(duì)-三氟甲氧基苯腙(FCCP,1.0 μmol/L),C孔加入抗霉素A和魚藤酮的組合抑制劑(Rot/AA,0.5 μmol/L),測(cè)定細(xì)胞OCR水平[15-16]。對(duì)于ECAR的檢測(cè),需首先測(cè)定含葡萄糖(11 mmol/L)時(shí)的基礎(chǔ)糖酵解速率和線粒體呼吸產(chǎn)生的酸化速率;板內(nèi)加入Rot/AA(0.5 μmol/L)記錄細(xì)胞的最大代償性糖酵解能力;再加入2-脫氧-D-葡萄糖(2-DG,50 mmol/L),記錄糖酵解儲(chǔ)備能力,計(jì)算細(xì)胞ECAR水平[17]。

1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理方法 應(yīng)用SPSS18.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。數(shù)據(jù)以表示,2組間比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 細(xì)胞裂解物1H NMR譜歸屬結(jié)果 通過(guò)1H NMR譜可以同時(shí)獲得結(jié)直腸癌細(xì)胞SW480和SW620的多種水溶性小分子代謝物信息,包括:異亮氨酸/亮氨酸(δ0.95)、纈氨酸(δ1.02)、乳酸(δ1.33,δ4.10)、丙氨酸(δ1.47)、乙酸(δ1.91)、谷氨酸(δ2.36)、琥珀酸(δ2.40)、谷氨酰胺(δ2.46)、谷胱甘肽(δ2.52)、肌酸(δ3.03,δ3.90)、氧化磷酸膽堿(δ3.19)、牛磺酸(δ3.25,δ3.40)、甘氨酸(δ3.55)、葡萄糖(δ4.65,δ5.24)、肌苷(δ6.08)、延胡索酸(δ6.50)、ATP(δ6.14)、酪氨酸(δ6.89,δ7.20)、苯丙氨酸(δ7.39)。見(jiàn)圖1。

圖1 SW480細(xì)胞(A)和SW620細(xì)胞(B)典型的1H NMR譜

2.2 PLS-DA分析結(jié)果 原發(fā)性結(jié)直腸癌細(xì)胞SW480和高轉(zhuǎn)移潛能SW620細(xì)胞的代謝模式能夠在第一主成分上明顯分開(kāi)(R2X=0.736,R2Y=0.985,Q2=0.97,見(jiàn)圖2A),對(duì)應(yīng)的模式置換圖也顯示所建立的PLSDA模型是可行的(見(jiàn)圖2B)。從第一主成分相應(yīng)的載荷圖中可以看出支鏈氨基酸(branched chain amino acid,BCAA,即亮氨酸、異亮氨酸、纈氨酸)、乳酸、丙氨酸、乙酸、葡萄糖、肌苷、延胡索酸等代謝物對(duì)2組細(xì)胞代謝模式的區(qū)分有較大的貢獻(xiàn),對(duì)應(yīng)的顏色越紅表示其貢獻(xiàn)越大(見(jiàn)圖2C)。

2.3 代謝物定量分析 與原發(fā)性結(jié)直腸癌細(xì)胞SW480相比,具有高轉(zhuǎn)移潛能的SW620細(xì)胞中葡萄糖代謝相關(guān)的代謝物乳酸顯著升高;氨基酸代謝中,異亮氨酸、丙氨酸、甘氨酸水平升高,乙酸、?;撬崴斤@著降低(P<0.05);能量代謝相關(guān)的代謝物氧化磷酸膽堿、ATP、肌苷顯著下降,琥珀酸顯著升高(P<0.05),見(jiàn)圖3。

2.4 Seahorse XF96細(xì)胞能量代謝分析 根據(jù)Seahorse中Mito-Stress結(jié)果,具有高轉(zhuǎn)移潛能的SW620細(xì)胞OCR水平較高(見(jiàn)圖4)。具體變化為:基礎(chǔ)呼吸(即細(xì)胞在加寡霉素刺激之前的OCR值)和偶聯(lián)ATP產(chǎn)生的呼吸(即基礎(chǔ)呼吸OCR值和加入FCCP刺激之前的OCR值之差)。SW480和SW620細(xì)胞之間這2種呼吸并沒(méi)有顯著差異,而具有高轉(zhuǎn)移潛能的SW620細(xì)胞最大呼吸能力顯著升高(P<0.01),即加入FCCP之后至加Rot/AA之前OCR最大值與加入寡霉素之后OCR最低值之差。同時(shí),SW620細(xì)胞呼吸儲(chǔ)備能力也顯著升高(P<0.01),質(zhì)子漏耗氧率升高,即細(xì)胞呼吸過(guò)程轉(zhuǎn)化為熱量的氧消耗量非線粒體呼吸耗氧量降低,說(shuō)明高轉(zhuǎn)移潛能的SW620細(xì)胞更傾向于線粒體呼吸方式??偠灾?,SW620細(xì)胞呼吸異常升高同時(shí)釋放出更多的熱量。

葡萄糖是細(xì)胞糖酵解的能量來(lái)源,能促進(jìn)細(xì)胞的糖酵解,其終產(chǎn)物是乳酸,從而提高細(xì)胞ECAR,XF Glycolytic Rate Assay明確SW620的ECAR水平較高。具體變化為:我們定義基礎(chǔ)糖酵解為加入Rot/AA之前的ECAR值,它代表細(xì)胞對(duì)葡萄糖的吸收能力和細(xì)胞代謝的活力;當(dāng)加入Rot/AA后,細(xì)胞有氧呼吸被抑制,所得的ECAR值代表細(xì)胞最大糖酵解代償能力,當(dāng)再加入2-DG后,糖酵解途徑被抑制,ECAR值下降,證明所得的ECAR值是由細(xì)胞糖酵解所引起的,它代表細(xì)胞的糖酵解能量代謝水平和能力(見(jiàn)圖5)。這一結(jié)果與1H NMR譜圖結(jié)果中檢測(cè)到SW620細(xì)胞內(nèi)乳酸水平升高一致,均表明SW620細(xì)胞糖酵解能力顯著升高。

圖2 2種細(xì)胞1H NMR譜的PLS-DA分析結(jié)果

3 討論

結(jié)直腸癌的發(fā)生及轉(zhuǎn)移是一個(gè)多因素、多步驟的復(fù)雜過(guò)程,研究表明,代謝模式的異常與結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展及轉(zhuǎn)移密切相關(guān)[4-6]。研究結(jié)直腸癌轉(zhuǎn)移進(jìn)程的代謝模式,進(jìn)一步了解結(jié)直腸癌轉(zhuǎn)移機(jī)制,可為其提供診斷標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)。

在本研究中,我們以不同轉(zhuǎn)移潛能的結(jié)直腸癌細(xì)胞株作為研究對(duì)象,應(yīng)用1H NMR技術(shù),結(jié)果發(fā)現(xiàn)SW480、SW620細(xì)胞的代謝模式存在明顯不同,多種代謝物的水平在2種細(xì)胞株中有顯著差異。

腫瘤的侵襲及轉(zhuǎn)移需要大量能量,與SW480相比,高轉(zhuǎn)移潛能的SW620細(xì)胞中乳酸等水平顯著升高。多項(xiàng)研究表明腫瘤細(xì)胞有較高含量的乳酸,其誘導(dǎo)的酸性環(huán)境能夠抵抗細(xì)胞凋亡并促進(jìn)腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移[18-19]。琥珀酸水平在SW620細(xì)胞中也顯著升高,LU等[20]發(fā)現(xiàn)TCA循環(huán)中間體在不同轉(zhuǎn)移潛能腫瘤細(xì)胞中有顯著差異,其含量隨轉(zhuǎn)移潛能增加而增加。為了進(jìn)一步探討不同轉(zhuǎn)移潛能細(xì)胞株的能量代謝,本研究通過(guò)使用Seahorse細(xì)胞代謝能量分析儀測(cè)定ECAR水平,結(jié)果發(fā)現(xiàn)SW620細(xì)胞的基礎(chǔ)糖酵解水平較高,該結(jié)果與NMR檢測(cè)到乳酸水平升高相對(duì)應(yīng),也與SIMES等[19]在乳腺癌中的研究結(jié)果相一致。此外,OCR的活性也被證明與多種腫瘤的侵襲能力相關(guān)[21-22],我們的結(jié)果也顯示高轉(zhuǎn)移能力的SW620具有較高水平的OCR。

氨基酸參與多種生化反應(yīng),CHEN等[23]指出,與健康人相比,結(jié)直腸癌患者的多種氨基酸如丙氨酸、谷氨酸、色氨酸、甘氨酸等水平顯著升高。MONTROSE等[24]指出結(jié)直腸癌的發(fā)展進(jìn)程中氨基酸水平都有階段性改變。我們發(fā)現(xiàn)丙氨酸水平在SW620中較高,這與高轉(zhuǎn)移潛能的4T1細(xì)胞相一致[19]。此外,高轉(zhuǎn)移潛能的SW620細(xì)胞中谷氨酰胺水平顯著升高。谷氨酰胺是合成核苷酸、氨基酸和ATP的必要底物,也是TCA循環(huán)的主要前體,谷氨酰胺成癮在腫瘤細(xì)胞中較常見(jiàn)[25]。SINGH等[26]指出侵襲性高的細(xì)胞株中谷氨酰胺成癮與細(xì)胞轉(zhuǎn)移能力相關(guān)。

圖3 SW480細(xì)胞和SW620細(xì)胞的代謝通路圖

圖4 2種細(xì)胞OCR水平測(cè)定結(jié)果

圖5 2種細(xì)胞ECAR水平測(cè)定結(jié)果

綜上所述,本研究運(yùn)用1H NMR技術(shù)并結(jié)合Seahorse XF96分析不同轉(zhuǎn)移潛能結(jié)腸癌細(xì)胞株的代謝模式,兩者代謝模式存在顯著差異,與SW480細(xì)胞相比,轉(zhuǎn)移潛能高的SW620細(xì)胞具有更高的糖酵解水平、TCA循環(huán)活性、氨基酸水平、ECAR和OCR水平。SW620中較高的代謝基礎(chǔ)潛能,提示其高轉(zhuǎn)移能力的能量需要,也能更快適應(yīng)其所在微環(huán)境。

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