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大鼠細(xì)小病毒檢測(cè)技術(shù)研究進(jìn)展*

2019-04-10 05:47吳定宇呂瑞青
關(guān)鍵詞:病毒檢測(cè)細(xì)小毒株

吳定宇 呂瑞青 彭 芳

(1. 大理大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心,大理 671003)(2. 成都大熊貓繁育研究基地,成都 610081) (3.大理大學(xué)藥學(xué)與化學(xué)學(xué)院,大理 671003)

實(shí)驗(yàn)動(dòng)物是生命科學(xué)研究的基礎(chǔ)和條件。其質(zhì)量直接影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物質(zhì)量控制的核心是對(duì)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物攜帶的微生物和寄生蟲(chóng)進(jìn)行嚴(yán)格控制。

大鼠細(xì)小病毒(Rat Parvovirus,RPV)屬于細(xì)小病毒科、細(xì)小病毒屬,單鏈負(fù)鏈DNA病毒,無(wú)囊膜,具有多種血清型。該病毒存在于實(shí)驗(yàn)大鼠、野生大鼠和自然環(huán)境中,嚴(yán)重危害實(shí)驗(yàn)大鼠健康,感染后可造成動(dòng)物死亡和種群繁殖率下降,造成環(huán)境污染。大鼠排泄物和分泌物是主要的傳染源。該病毒同時(shí)會(huì)污染血清、細(xì)胞培養(yǎng)物、胚胎等生物樣品,尤其是該病毒某些毒株可以污染腫瘤細(xì)胞系,對(duì)腫瘤細(xì)胞造成抑制。為控制該病毒傳播,確保實(shí)驗(yàn)動(dòng)物質(zhì)量,已建立了RPV的多種檢測(cè)方法。本文就目前大鼠細(xì)小病毒檢測(cè)方法進(jìn)行綜述。

1 大鼠細(xì)小病毒毒株分類(lèi)

RPV分為三個(gè)血清型包括RPV-1(Rat Parvovirus Type 1),KRV(Kilham Rat Virus)和H-1(Toolan’s H-1)[1]。根據(jù)我國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物微生物學(xué)檢測(cè)的規(guī)定[2], SPF級(jí)實(shí)驗(yàn)大鼠須檢測(cè)RPV的KRV株和H-1株。國(guó)外對(duì)RPV分類(lèi)與檢測(cè)范圍和我國(guó)不同,美國(guó)查爾斯河實(shí)驗(yàn)室(Charles River Laboratories)[3],指出RPV病毒包括RPV-1,RPV-2(Rat Parvovirus Type 2),RMV(Rat Minute Virus),KRV,H-1。歐洲實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)會(huì)聯(lián)合會(huì)(FELASA)[4]要求檢測(cè)KRV,RMV,RPV和H-1。具體見(jiàn)表1。

表1 不同國(guó)家和地區(qū)SPF級(jí)實(shí)驗(yàn)大鼠RPV血清型的檢測(cè)Table 1 The Serological detection of RPV for SPF rat in different countries and regions

注:●代表檢測(cè)

Note:●show detection

1959年Kilham和Olivier[5]發(fā)現(xiàn)在大鼠腫瘤細(xì)胞系中存在一種污染性物質(zhì),經(jīng)分離發(fā)現(xiàn)該污染物為病毒,并稱為Kilham rat virus(KRV)或Rat Virus(RV)。1960年Toolan等[6]總結(jié)前人研究,通過(guò)移植人類(lèi)腫瘤的無(wú)細(xì)胞(Cell-free)游離成份,會(huì)導(dǎo)致倉(cāng)鼠出現(xiàn)病變,認(rèn)為這種可濾過(guò)性因子是病毒引起的,并從大鼠中分離該因子,移植到人肝癌細(xì)胞1(HEp-1)中,最終鑒定為病毒,這種病毒稱之為T(mén)oolan病毒,通常稱之為H-1病毒。

1998年Ball-Goodrich等[7]發(fā)現(xiàn)了一種新的大鼠細(xì)小病毒PRV-1,通過(guò)克隆、DNA序列分析來(lái)與其他細(xì)小病毒進(jìn)行比對(duì)發(fā)現(xiàn),PRV-1的編碼衣殼蛋白的VP1序列和其他細(xì)小病毒的VP1序列相似度不超過(guò)69%,這就解釋了PRV-1的抗原差異性。同時(shí),Ball-Goodrich進(jìn)行抗體檢測(cè)分析發(fā)現(xiàn),其有別于KRV和H-1不同的血清型,是第三種血清型。2002年Wan等[8]發(fā)現(xiàn)了之前三種大鼠細(xì)小病毒不同的RMV毒株,分別是RMV-1a,RMV-1b,RMV-1c,通過(guò)基因組核苷酸序列分析和蛋白質(zhì)氨基酸序列預(yù)測(cè)的方法,發(fā)現(xiàn)三種RMV毒株它們有著共同的啟動(dòng)子和剪切區(qū)域,轉(zhuǎn)錄起始密碼子和終止密碼子,它們基因序列的同源性約97%,氨基酸序列的相似性約95%,RMV與KRV和H-1的基因序列差異性小,但是與PRV-1存在較大差異。通過(guò)HAI試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),RMV有著與KRV、H-1和RPV-1不同的血清型。

2 大鼠細(xì)小病毒檢測(cè)方法

2.1 毒株分離與鑒定

對(duì)疑似感染細(xì)小病毒的大鼠進(jìn)行組織取材,取材部位根據(jù)可能感染毒株的不同而不同。將取材的組織進(jìn)行培養(yǎng),獲取上清液,用濾膜過(guò)濾,濾過(guò)液接種特定細(xì)胞進(jìn)行培養(yǎng),然后進(jìn)行病毒檢測(cè),如動(dòng)物回歸實(shí)驗(yàn)、分子生物學(xué)鑒定、血清學(xué)鑒定等。

國(guó)外一般采用NB-324 K細(xì)胞對(duì)H-1毒株進(jìn)行分離培養(yǎng)[9-11],如Leuchs等在研究如何高質(zhì)量大規(guī)模純化生產(chǎn)H-1毒株時(shí),采用由SV40轉(zhuǎn)化的新生兒腎細(xì)胞NB-324 K,來(lái)提高H-1作為DNA病毒的復(fù)制擴(kuò)增能力。對(duì)KRV株一般采用DMEM培養(yǎng)基培養(yǎng)大鼠腎細(xì)胞(NRK細(xì)胞)[12-13],KRV病毒在NRK細(xì)胞上會(huì)形成吞噬斑,所以可以通過(guò)病毒空斑實(shí)驗(yàn)檢測(cè)KRV毒株。

劉先菊等[14-15]分別建立了大鼠細(xì)小病毒KRV株和H-1株的細(xì)胞培養(yǎng)方法。采用大鼠膠質(zhì)瘤細(xì)胞系(Rat glial cell line C6)培養(yǎng)大鼠細(xì)小病毒KRV和H-1,待細(xì)胞病變達(dá)到測(cè)定標(biāo)準(zhǔn)后,進(jìn)行FITC鑒定所培養(yǎng)病毒的抗原,用HA測(cè)定培養(yǎng)物上清效價(jià),用DNA測(cè)序鑒定所培養(yǎng)病毒,結(jié)果發(fā)現(xiàn)采用C6細(xì)胞系可以大量培養(yǎng)KRV和H-1。

2.2 血清學(xué)檢測(cè)

血清學(xué)檢測(cè)是診斷和鑒定病毒的重要方法之一。我國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了四種方法用于大鼠細(xì)小病毒的檢測(cè)[2]:血凝抑制試驗(yàn)(HI)、免疫酶試驗(yàn)(IEA)、免疫熒光試驗(yàn)(IFA)、酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)。

吳小閑等[16]采用HI方法檢測(cè)大鼠細(xì)小病毒RV株(也稱KRV)和H-1株,均發(fā)現(xiàn)存在陽(yáng)性感染的情況。賀爭(zhēng)鳴等[17]采用ELISA、IEA和HI這三種方法進(jìn)行比較,檢測(cè)了大鼠細(xì)小病毒RV株,發(fā)現(xiàn)ELISA和IEA在重復(fù)性和抗體陽(yáng)性檢出率方面均優(yōu)于HI(P<0.05)。王翠娥等[18]采用ELISA方法對(duì)2012年至2013年國(guó)內(nèi)36家單位的大鼠和小鼠血清進(jìn)行病毒抗體檢測(cè),檢測(cè)出來(lái)的陽(yáng)性樣品再用免疫熒光試驗(yàn)(IFA)進(jìn)行復(fù)檢,大鼠細(xì)小病毒檢測(cè)項(xiàng)目按照查爾斯河實(shí)驗(yàn)室的檢測(cè)項(xiàng)目進(jìn)行,發(fā)現(xiàn)大鼠細(xì)小病毒毒株RPV、H-1、KRV、RMV均呈陽(yáng)性。李曉波等[19]報(bào)道,在16個(gè)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物質(zhì)量檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行比對(duì)中,14個(gè)實(shí)驗(yàn)室采用ELISA,占87.5%,3個(gè)實(shí)驗(yàn)室采用IFA方法,另有1個(gè)實(shí)驗(yàn)室同時(shí)采用IFA和ELISA方法。目前,對(duì)大鼠細(xì)小病毒進(jìn)行檢測(cè)的進(jìn)口ELISA試劑盒一般采用Charles River、Biotech Trading Partners、XpressBio Life Science等公司產(chǎn)品。國(guó)產(chǎn)ELISA大鼠細(xì)小病毒檢測(cè)試劑盒主要采用中國(guó)食品藥品檢定研究院產(chǎn)品。付瑞等[20]建立了H-1細(xì)小病毒抗體ELISA檢測(cè)方法,經(jīng)試驗(yàn)發(fā)現(xiàn)與大鼠KRV病毒有交叉反應(yīng)。

不同國(guó)家或地區(qū)檢測(cè)大鼠細(xì)小病毒毒株類(lèi)型不同,初檢和復(fù)檢的方法也有所差異。如美國(guó)查爾斯河實(shí)驗(yàn)室的動(dòng)物診斷研究服務(wù)部[21]對(duì)近五年北美地區(qū)和西歐(主要是法國(guó))的大鼠和小鼠流行病學(xué)情況進(jìn)行研究。共收集了50萬(wàn)份小鼠樣品和8萬(wàn)份大鼠樣品。采用血清學(xué)方法檢測(cè)大鼠細(xì)小病毒(病毒毒株為KRV、RMV、H-1和RPV)。初步檢測(cè)采用多重免疫熒光方法(Multiplexed Flurometric Immuneno Assay,MFIA)或ELISA,對(duì)于檢測(cè)出的陽(yáng)性樣品復(fù)檢采用IFA或HAI,具體見(jiàn)表2。

表2 SPF級(jí)大鼠細(xì)小病毒血清學(xué)檢測(cè)(查爾斯河實(shí)驗(yàn)室)Table 2 The Serological detection of rat parvovirus for SPF rat in Charles River Laboratories

Manjunath等[22]對(duì)印度26個(gè)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物機(jī)構(gòu)的大鼠和小鼠進(jìn)行了血清學(xué)調(diào)查,每個(gè)機(jī)構(gòu)分別采集5份大鼠和5份小鼠血樣,在130份大鼠血樣中用ELISA方法檢測(cè)大鼠細(xì)小病毒KRV株和RPV株,發(fā)現(xiàn)RPV感染率在5.38%,KRV無(wú)感染。Mcinnes等[23]在2004年到2009年間從澳大利亞、新西蘭和新加坡等國(guó)家的大學(xué)、研究中心、科研機(jī)構(gòu)獲取SPF級(jí)的大鼠和小鼠,采用過(guò)量CO2安樂(lè)死,在收集的血清和組織樣品中檢測(cè)出大鼠細(xì)小病毒,毒株包括H-1,KRV,RMV和RPV。檢測(cè)方法為首先進(jìn)行ELISA檢測(cè),對(duì)于ELISA檢測(cè)結(jié)果不確定或可疑的,再用IFA進(jìn)行重測(cè)。Liang等[24]、 Zenner和Reqnault[25]以及Schoondermark等[26]對(duì)不同國(guó)家或地區(qū)大鼠和小鼠進(jìn)行病毒流行調(diào)查和血清學(xué)篩查,均采用ELISA作為大鼠和小鼠細(xì)小病毒的首選檢測(cè)方法。

綜上所述,國(guó)內(nèi)外實(shí)驗(yàn)室在檢測(cè)大鼠細(xì)小病毒毒株種類(lèi)上存在差異,但普遍采用血清學(xué)檢測(cè)方法,ELISA使用最多。對(duì)于某些血清樣品結(jié)果的不確定性,通常采用IFA或HAI進(jìn)行復(fù)檢,以對(duì)檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行確認(rèn)。

2.3 分子生物學(xué)檢測(cè)

采用普通PCR檢測(cè)大鼠細(xì)小病毒,如Besselsen等[27]采用PCR技術(shù)來(lái)檢測(cè)H-1和KRV毒株,通過(guò)設(shè)計(jì)引物來(lái)擴(kuò)增H-1和KRV編碼衣殼蛋白的VP基因?yàn)槟康钠?。Wan等[28]采用PCR檢測(cè)RPV和RMV病毒,設(shè)計(jì)引物分別擴(kuò)增RPV的NS區(qū)序列和RMV的VP區(qū)序列目的基因。

除普通PCR方法之外,我國(guó)學(xué)者還采用多重PCR方法進(jìn)行大鼠細(xì)小病毒的分子生物學(xué)檢測(cè)。李曉波等[29]建立對(duì)大鼠H-1和KRV毒株檢測(cè)的雙重PCR方法,分別設(shè)計(jì)特異性引物,擴(kuò)增目的片段是病毒的衣殼蛋白基因編碼區(qū)(VP),并確定2對(duì)引物無(wú)交叉反應(yīng),實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn)能夠高效檢測(cè)大鼠細(xì)小病毒的感染。饒丹等[30]根據(jù)大鼠細(xì)小病毒基因特異性,采用雙重PCR的方法,來(lái)檢測(cè)H-1、KRV、RMV和RPV四種大鼠細(xì)小病毒,在VP2基因篩選一對(duì)用于特異擴(kuò)增RPV毒株的引物,在NS1基因設(shè)計(jì)一對(duì)用于擴(kuò)增H-1、KRV和RMV的引物,敏感實(shí)驗(yàn)表明,雙重PCR的最低檢測(cè)限可達(dá)1 000拷貝/μL。

以高通量測(cè)序方法為基礎(chǔ),可以進(jìn)行不同毒株的大鼠細(xì)小病毒檢測(cè)。傳統(tǒng)的基因測(cè)序技術(shù)采用Sanger法,存在成本高、耗時(shí)及測(cè)序樣品受限等不利因素,Life Sciences公司發(fā)明了高通量測(cè)序技術(shù)又稱第二代測(cè)序技術(shù)(next generation sequencing,NGS)可以對(duì)上百萬(wàn)DNA分子進(jìn)行測(cè)序檢測(cè)。查爾斯河實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)開(kāi)展了商業(yè)化高通量試驗(yàn)—檢測(cè)DNA病毒服務(wù)。H?fler等[31]針對(duì)嚙齒類(lèi)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物存在的病毒、細(xì)菌的監(jiān)控,開(kāi)發(fā)出一種新的高通量多重PCR分析方法,稱之為rDVF(rodent DNA virus finder),可以同時(shí)鑒定24種大鼠和小鼠DNA病毒感染情況,其中大鼠細(xì)小病毒包括H-1、RPV、KRV和RMV。

Luminex液相芯片分析技術(shù)可進(jìn)行多種微生物和病毒的檢測(cè),其技術(shù)包括xMAP技術(shù)和xTAG技術(shù)。xTAG技術(shù)使用專有通用標(biāo)簽系統(tǒng),易于進(jìn)行優(yōu)化和核酸檢測(cè)開(kāi)發(fā),Luminex公司所提供的基于xTAG技術(shù)的核酸檢測(cè),包括感染性疾病和基因檢測(cè)相關(guān)的臨床診斷檢測(cè)。如對(duì)多種腸道病原體和呼吸道病毒均可以采用xTAG技術(shù)進(jìn)行檢測(cè)[32-33]。Xu等[34]發(fā)明一種陣列式xTAG檢測(cè)方法,可同時(shí)檢測(cè)大鼠細(xì)小病毒KRV、H-1、RPV和RMV,并對(duì)這四種毒株予以區(qū)別,通過(guò)xTAG技術(shù)和常規(guī)PCR技術(shù)檢查了50個(gè)臨床樣品,結(jié)果顯示高度一致。

3 結(jié)語(yǔ)

病毒分離培養(yǎng)和觀察鑒定被認(rèn)為是病原微生物檢測(cè)的“金標(biāo)準(zhǔn)”(Gold Standard),但缺點(diǎn)是檢測(cè)周期長(zhǎng),速度慢,對(duì)操作要求較高且成本也高。

血清學(xué)檢測(cè)是現(xiàn)行的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定的方法,目前各實(shí)驗(yàn)室普遍采用ELISA進(jìn)行大鼠細(xì)小病毒初篩,復(fù)檢時(shí)用IFA或HIA進(jìn)行。雖然ELISA和IFA檢測(cè)敏感性好,但是由于大鼠細(xì)小病毒毒株的非結(jié)構(gòu)蛋白相對(duì)保守,導(dǎo)致抗體會(huì)產(chǎn)生交叉反應(yīng),因此ELISA和IFA檢測(cè)的特異性較差,不易將不同毒株的細(xì)小病毒區(qū)分開(kāi)來(lái)。HIA檢測(cè)有一定特異性,但由于其只針對(duì)抗體直接作用于不同毒株的血細(xì)胞凝集素上,形成血凝抑制反應(yīng),因此敏感性較低。

以PCR為主的分子生物學(xué)技術(shù)具有高效、快速、靈敏的優(yōu)點(diǎn),但該技術(shù)也存在有假陽(yáng)性和假陰性的缺點(diǎn)。目前該技術(shù)及衍生技術(shù)廣泛應(yīng)用于國(guó)內(nèi)外嚙齒類(lèi)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物病毒檢測(cè)中。多重PCR及液相芯片分析技術(shù)等方法可以快速區(qū)分不同毒株的大鼠細(xì)小病毒。

細(xì)小病毒是嚴(yán)重影響實(shí)驗(yàn)大鼠健康的病毒之一,因此建立起靈敏、準(zhǔn)確、操作方便的檢測(cè)方法,是準(zhǔn)確檢測(cè)和有效控制該病毒傳播的重要手段。

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