張 陽, 張玲玲,2??, 李若佼, 謝欣冉, 李仰平, 李婉茹, 包振民,2
(1. 中國(guó)海洋大學(xué)海洋生物遺傳學(xué)與育種教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山東 青島266003; 2. 海洋漁業(yè)科學(xué)與食物產(chǎn)出過程功能實(shí)驗(yàn)室,青島海洋科學(xué)與技術(shù)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室,山東 青島 266237)
FOXL2(Forkhead box L2)是叉頭轉(zhuǎn)錄因子超家族的成員之一,在脊椎動(dòng)物性別決定與分化的過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用,主要參與卵巢早期發(fā)育及成體卵巢的功能維持。迄今,已在多個(gè)物種中鑒定了FOXL2基因[1-5],但較深入的研究主要集中在脊椎動(dòng)物。研究發(fā)現(xiàn),該基因在大多數(shù)哺乳動(dòng)物的性腺中呈性別二態(tài)性表達(dá)模式。FOXL2在人性別分化前的生殖嵴細(xì)胞中表達(dá),且在卵巢中特異性表達(dá)[1]。小鼠(Musmusculus)、雞(Gallusgallus)、紅耳龜(Trachemysscripta)的早期卵巢中檢測(cè)到,F(xiàn)OXL2在性別決定前后表達(dá),推測(cè)該基因參與了卵巢分化[6]。FOXL2缺失突變的XX型小鼠,其性腺表現(xiàn)出精巢特征,表明FOXL2對(duì)成體的卵巢具有維持功能[7]。此外,F(xiàn)OXL2已被確定為山羊(Caprahircus)的雌性決定基因[8]。Oshima等也發(fā)現(xiàn)蛙(Ranarugosa)的FOXL2在卵巢分化的早期階段起著關(guān)鍵作用[9]。在羅非魚(Oreochromisniloticus)中,F(xiàn)OXL2基因在卵巢分化早期到成體持續(xù)表達(dá),說明該基因參與了魚類性腺分化以及卵巢的功能維持[10]。
雖然在一些無脊椎動(dòng)物中已經(jīng)獲得FOXL2基因,但關(guān)于該基因的研究相對(duì)較少。Zhang等分析了太平洋牡蠣(Crassostreagigas)FOXL2基因在性腺等組織的表達(dá)情況,認(rèn)為該基因可能是牡蠣性別決定的關(guān)鍵基因[11]。在櫛孔扇貝(Chlamysfarreri)中,F(xiàn)OXL2基因也呈現(xiàn)性別二態(tài)性表達(dá),推測(cè)其為雌性相關(guān)基因[12],并可能參與卵巢分化[13]。Li等分析了蝦夷扇貝(Patinopectenyessoensis)的精巢和卵巢轉(zhuǎn)錄組,認(rèn)為FOXL2是蝦夷扇貝性別決定/分化的關(guān)鍵候選基因[14]。珠母貝(Pinctadamargaritifera)的研究也發(fā)現(xiàn)FOXL2在其性反轉(zhuǎn)和性別分化過程中起著重要作用[15]。
由此推測(cè),F(xiàn)OXL2很可能是跨無脊椎動(dòng)物和脊椎動(dòng)物類群的保守的雌性決定與分化的關(guān)鍵基因。在脊椎動(dòng)物中,F(xiàn)OXL2主要通過調(diào)控芳香化酶CYP19A1的表達(dá),決定或維持雌性性別[16-17];但已有研究顯示,CYP19A1在脊索動(dòng)物才出現(xiàn)[18],在諸如扇貝之類的無脊椎動(dòng)物并不存在??梢?,F(xiàn)OXL2性別決定的機(jī)制在脊椎動(dòng)物與無脊椎動(dòng)物之間可能有所不同。該基因在無脊椎動(dòng)物中究竟與哪些蛋白相互作用,如何行使功能,目前尚不清晰。本研究將以蝦夷扇貝為材料,應(yīng)用酵母雙雜交系統(tǒng)初步篩選與FOXL2相互作用的蛋白,為解析無脊椎動(dòng)物FOXL2的性別決定機(jī)制提供思路。
實(shí)驗(yàn)材料二齡蝦夷扇貝采自遼寧省大連市獐子島養(yǎng)殖中心,取扇貝性腺組織,液氮固定后保存于-80 ℃冰箱以備提取RNA。蝦夷扇貝酵母雙雜交cDNA文庫和E.coliDH5α由本實(shí)驗(yàn)室保存;酵母菌株Y2HGold和Y187購自Clonetech公司;限制性內(nèi)切酶購自Takara公司;X-α-Gal、Aureobasidin A(AbA)、MatchmakerTMGold Yeast Two-Hybrid System試劑盒和YeastmakerTMYeast Transformation System 2試劑盒及各種酵母缺陷型培養(yǎng)基均購自Clontech公司。
1.2.1 誘餌質(zhì)粒pGBKT7-FOXL2的構(gòu)建 參考In-Fusion?HD Cloning Kit說明書設(shè)計(jì)蝦夷扇貝FOXL2基因的PCR引物,在FOXL2基因的ORF區(qū)5’端引入一段與線性化載體pGBKT7末端同源的16個(gè)堿基序列,引物序列如下:FOXL2-F:5’-CATGGAGGCCGAATTCATGGCCTTGTCATTTTACGACTCC-3’,F(xiàn)OXL2-R:5’-GCAGGTCGACGGATCCTCACCTCTCTCCCCAGTACGTGTA-3’(下劃線部分為線性載體同源序列);提取蝦夷扇貝性腺組織RNA,以反轉(zhuǎn)錄的蝦夷扇貝cDNA為模板,高保真DNA擴(kuò)增酶擴(kuò)增FOXL2基因片段,純化PCR產(chǎn)物。利用EcoR Ι和BamH Ι雙酶切空載體pGBKT7并純化。將純化后的目的基因和線性化載體pGBKT7構(gòu)建In-Fusion反應(yīng)體系,50 ℃孵育15 min,然后置于冰上,反應(yīng)液轉(zhuǎn)化E.coliDH5α,于含有卡那霉素的LB固體培養(yǎng)基37 ℃過夜培養(yǎng)。挑取單克隆,菌液PCR驗(yàn)證,陽性克隆提取質(zhì)粒并測(cè)序。
1.2.2 誘餌蛋白毒性及自激活檢測(cè) 利用YeastmakerTMYeast Transformation System 2試劑盒制備以及轉(zhuǎn)化酵母感受態(tài)。將誘餌質(zhì)粒pGBKT7-FOXL2、空載體pGBKT7分別轉(zhuǎn)化到Y(jié)2HGold感受態(tài)細(xì)胞中,涂布于SD/-Trp,SD/-Trp/X-α-Gal固體培養(yǎng)基;質(zhì)粒pGBKT7-53和pGADT7-T、質(zhì)粒pGBKT7-Lam和pGADT7-T共轉(zhuǎn)化Y2HGold感受態(tài)作為陽性對(duì)照和陰性對(duì)照,涂布于SD/-Leu/-Trp/X-α-Gal固體培養(yǎng)基,30 ℃培養(yǎng)3~5 d,觀察酵母菌株的生長(zhǎng)情況,檢測(cè)誘餌蛋白對(duì)酵母菌株是否具有毒性和自激活活性。
1.2.3 蝦夷扇貝酵母雙雜交cDNA文庫滴定實(shí)驗(yàn) 實(shí)驗(yàn)室前期已構(gòu)建蝦夷扇貝酵母雙雜交cDNA文庫,將1/100,1/10 000的文庫稀釋液涂布于SD/-Leu固體培養(yǎng)基,30 ℃培養(yǎng)3~5 d,統(tǒng)計(jì)菌落個(gè)數(shù),計(jì)算文庫滴度。
1.2.4 酵母雙雜交篩選FOXL2互作蛋白 從SD/-Trp固體培養(yǎng)基挑取2~3 mm的Y2HGold[pGBKT7-FOXL2]新鮮克隆,于50 mL SD/-Trp液體培養(yǎng)基30 ℃過夜培養(yǎng),至OD600達(dá)0.8。離心,棄上清液,4~5 mL SD/-Trp液體培養(yǎng)基重懸菌體并置于2 L的錐形瓶中,加入1 mL蝦夷扇貝酵母雙雜交cDNA文庫和45 mL含有50 μg/mL卡那霉素的 2×YPDA液體培養(yǎng)基,30 ℃、30~50 r/min培養(yǎng)20~24 h,離心,10 mL含有50 μg/mL卡那霉素的0.5×YPDA液體培養(yǎng)基重懸菌體。各取100 μL 1/10,1/100,1/1 000,1/10 000的稀釋雜交菌液涂布于SD/-Trp、SD/-Leu、SD/-Leu/-Trp固體培養(yǎng)基,30 ℃培養(yǎng)3~5 d后,統(tǒng)計(jì)各板菌落數(shù),計(jì)算雜交效率。剩余雜交菌液涂布于SD/-Leu/-Trp/X-α-Gal/AbA固體培養(yǎng)基,30 ℃培養(yǎng)3~5 d。挑取培養(yǎng)基上長(zhǎng)出的藍(lán)色單菌落,接種到高篩選強(qiáng)度的SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp/X-α-Gal/AbA培養(yǎng)基上,進(jìn)一步篩選出藍(lán)色陽性克隆,提取陽性克隆酵母質(zhì)粒,PCR鑒定并測(cè)序。
1.2.5 共轉(zhuǎn)化驗(yàn)證 陽性克隆酵母質(zhì)粒轉(zhuǎn)化E.coliDH5α,于含有氨芐青霉素的LB固體培養(yǎng)基進(jìn)行選擇培養(yǎng),提取獵物質(zhì)粒,分別和質(zhì)粒pGBKT7-FOXL2共轉(zhuǎn)化Y2HGold感受態(tài)細(xì)胞,30 ℃培養(yǎng)3~5 d后,觀察酵母菌株的生長(zhǎng)情況。
根據(jù)蝦夷扇貝FOXL2基因序列和線性化載體pGBKT7序列設(shè)計(jì)特異性引物,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),目的片段大小在1 000~2 000 bp之間,與理論值(1 139 bp)一致(見圖1)。構(gòu)建的誘餌質(zhì)粒轉(zhuǎn)化E.coliDH5α,陽性克隆進(jìn)行測(cè)序。序列比對(duì)分析確定陽性克隆包含蝦夷扇貝FOXL2基因的ORF框序列,重組的誘餌質(zhì)粒讀碼框無移碼突變,說明誘餌質(zhì)粒pGBKT7-FOXL2構(gòu)建成功。
將誘餌質(zhì)粒pGBKT7-FOXL2、空載體pGBKT7分別轉(zhuǎn)化Y2HGold感受態(tài)細(xì)胞,涂布于SD/-Trp固體培養(yǎng)基。結(jié)果顯示兩者菌落大小相近(見圖2),說明誘餌蛋白無毒性。將誘餌質(zhì)粒pGBKT7-FOXL2轉(zhuǎn)化Y2HGold感受態(tài)細(xì)胞,涂布于SD/-Trp/X-α-Gal固體培養(yǎng)基,結(jié)果如圖3A所示,誘餌質(zhì)粒pGBKT7-FOXL2轉(zhuǎn)化的酵母細(xì)胞在SD/-Trp/X-α-Gal培養(yǎng)基上長(zhǎng)出單菌落但未變藍(lán)。而陽性對(duì)照共轉(zhuǎn)化質(zhì)粒pGBKT7-53和pGADT7-T的酵母細(xì)胞在SD/-Leu/-Trp/X-α-Gal培養(yǎng)基上生長(zhǎng)且顯藍(lán)色(見圖3B),陰性對(duì)照共轉(zhuǎn)化質(zhì)粒pGBKT7-Lam和pGADT7-T的酵母細(xì)胞在SD/-Leu/-Trp/X-α-Gal培養(yǎng)基上生長(zhǎng)但不顯藍(lán)色(見圖3C)。這說明pGBKT7-FOXL2誘餌蛋白不能激活報(bào)告基因MEL1,誘餌蛋白無自激活活性。
(F:FOXL2基因PCR產(chǎn)物;M:DNA分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)(DL2 000)。F:FOXL2 PCR product; M: DL2 000 DNA marker. )
圖1FOXL2基因PCR產(chǎn)物電泳圖
Fig.1 Electrophoretic result ofFOXL2 PCR product
(A:pGBKT7-FOXL2涂布SD/-Trp培養(yǎng)基;B:pGBKT7涂布SD/-Trp培養(yǎng)基。A: pGBKT7-FOXL2 on SD/-Trp medium; B: pGBKT7 on SD/-Trp medium. )
圖2 誘餌蛋白毒性檢測(cè)
Fig.2 Testing on the toxicity of bait protein
(A:pGBKT7-FOXL2涂布SD/-Trp/X-α-Gal培養(yǎng)基;B:陽性對(duì)照(pGBKT7-53 + pGADT7-T)涂布SD/-Leu/-Trp/X-α-Gal培養(yǎng)基;C:陰性對(duì)照(pGBKT7-Lam + pGADT7-T)涂布SD/-Leu/-Trp/X-α-Gal培養(yǎng)基。A: pGBKT7-FOXL2 on SD/-Trp/X-α-Gal medium; B: positive control (pGBKT7-53 + pGADT7-T) on SD/-Leu/-Trp/X-α-Gal medium; C: negative control (pGBKT7-Lam + pGADT7-T) on SD/-Leu/-Trp/X-α-Gal medium. )
圖3 誘餌蛋白自激活活性檢測(cè)
Fig.3 Testing on the autoactivation of bait protein
稀釋104倍的50 μL文庫稀釋液涂布SD/-Leu培養(yǎng)基,獲得約200個(gè)酵母單菌落。根據(jù)滴度計(jì)算公式:滴度=(菌落個(gè)數(shù)/涂板體積mL)×稀釋倍數(shù),計(jì)算得到文庫滴度為4×107cfu/mL,大于2×107cfu/mL,說明蝦夷扇貝酵母雙雜交cDNA文庫符合酵母雙雜交的滴度要求。
酵母雜交菌液涂布后,統(tǒng)計(jì)各培養(yǎng)基平板的菌落個(gè)數(shù),經(jīng)計(jì)算共篩選的二倍體克隆數(shù)為6×106,雜交效率為7.14%,符合實(shí)驗(yàn)要求。本研究利用酵母雙雜交系統(tǒng),在SD/-Leu/-Trp/X-α-Gal/AbA固體培養(yǎng)基上篩選出24個(gè)藍(lán)色單菌落,進(jìn)一步在SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp/X-α-Gal/AbA培養(yǎng)基上篩選出17個(gè)藍(lán)色陽性克隆(見圖4)。
提取藍(lán)色陽性克隆酵母質(zhì)粒進(jìn)行PCR鑒定(見圖5),結(jié)果顯示陽性克隆均含有插入片段,片段大小主要集中在750~2 000 bp。陽性克隆酵母質(zhì)粒轉(zhuǎn)化E.coliDH5α,涂布于含有氨芐青霉素的培養(yǎng)基后,提取獵物質(zhì)粒,測(cè)序鑒定。測(cè)序結(jié)果在NCBI數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì),驗(yàn)證出12個(gè)讀碼框正確的陽性克隆,共得到4種蝦夷扇貝FOXL2的候選相互作用蛋白,分別是COP9信號(hào)復(fù)合體亞基5、鈉/鉀ATP酶β3、哺乳動(dòng)物室管膜相關(guān)蛋白1和胰脂肪酶相關(guān)蛋白2(見表1)。
圖4 酵母雙雜交篩選陽性克隆結(jié)果圖Fig.4 The positive clones screened by yeast two-hybrid system
圖5 FOXL2篩選的陽性克隆PCR鑒定結(jié)果(部分)Fig.5 Identification of the positive clones by PCR (partial)
候選互作蛋白Candidate interacting proteins登錄號(hào)Accession number克隆個(gè)數(shù)No. of clonesCOP9信號(hào)復(fù)合體亞基5 COP9 signalosome complex sub-unit 5XP_021363137.14鈉/鉀ATP酶β3 sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3XP_021377712.14哺乳動(dòng)物室管膜相關(guān)蛋白1 mammalian ependymin-related pro-tein 1-likeXP_021339375.13胰脂肪酶相關(guān)蛋白2 pancreatic lipase-related protein 2-likeXP_021367396.11
將4種互作蛋白的獵物質(zhì)粒分別和質(zhì)粒pGBKT7-FOXL2共轉(zhuǎn)化Y2HGold感受態(tài)細(xì)胞,涂布于SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp/X-α-Gal/AbA固體培養(yǎng)基。共轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)結(jié)果(見圖6)顯示,培養(yǎng)基上均出現(xiàn)藍(lán)色菌落,說明激活了報(bào)告基因的表達(dá),驗(yàn)證結(jié)果均為陽性,表明這4種蛋白與蝦夷扇貝FOXL2都可能存在相互作用。
圖6 4種FOXL2互作蛋白的共轉(zhuǎn)化驗(yàn)證Fig.6 Cotransformation analysis between FOXL2 and the four interacting proteins
蝦夷扇貝屬于軟體動(dòng)物門(Mollusca)、瓣鰓綱(Lamellibranchia)、珍珠貝目(Pterioida)、扇貝科(Pectenidae),是具有重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值的海洋貝類。蝦夷扇貝全基因組測(cè)序的完成,為我們提供了一個(gè)全新的視角去探究FOXL2在無脊椎動(dòng)物中的功能。本實(shí)驗(yàn)室前期研究發(fā)現(xiàn),與脊椎動(dòng)物相似,F(xiàn)OXL2很可能參與蝦夷扇貝的卵巢發(fā)育和維持。但FOXL2在無脊椎動(dòng)物中的研究較少,對(duì)該基因的功能分析還不夠深入。本研究成功構(gòu)建了重組誘餌質(zhì)粒pGBKT7-FOXL2,且實(shí)驗(yàn)表明誘餌蛋白對(duì)酵母菌株無毒,也無自激活活性,可以進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。利用酵母雙雜交系統(tǒng)共篩選出了4種可能與蝦夷扇貝FOXL2的相互作用蛋白,為研究FOXL2基因在蝦夷扇貝中的功能提供了參考。
研究結(jié)果顯示,COP9信號(hào)復(fù)合體亞基5(COP9 signalosome complex subunit 5,CSN5)是FOXL2的候選互作蛋白。COP9信號(hào)復(fù)合體(CSN)由8個(gè)亞基組成,在物種間較為保守[19]。CSN的主要功能是參與去Nedd化(Deneddylation)和磷酸化反應(yīng),它能使E3泛素連接酶的Cullin去Nedd化,從而調(diào)控Cullin-Ring泛素連接酶的活性。CSN5是COP9信號(hào)復(fù)合體的第五個(gè)亞基,具有催化中心并可以穩(wěn)定的獨(dú)立存在,對(duì)CSN起著關(guān)鍵作用[20]。研究發(fā)現(xiàn),CSN5的對(duì)應(yīng)蛋白BmJM在家蠶(Bombyxmori)生殖腺的表達(dá)水平較其它組織高,推測(cè)家蠶CSN5蛋白通過參與細(xì)胞周期相關(guān)蛋白的降解來調(diào)控細(xì)胞增殖發(fā)育過程[21]。Doronkin等發(fā)現(xiàn)果蠅(Drosophilamelanogaster)中CSN5突變阻止Gurken蛋白在卵母細(xì)胞中的積累,說明了CSN5對(duì)卵子發(fā)生的重要性[22]。Smith等利用RNAi干擾秀麗隱桿線蟲(Caenorhabditiselegans)CSN5,發(fā)現(xiàn)F1代線蟲卵子發(fā)生缺陷,導(dǎo)致其性腺變小且缺少卵母細(xì)胞,由此可知CSN5對(duì)線蟲卵子發(fā)生具有關(guān)鍵作用[23]。酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)初步表明CSN5與蝦夷扇貝FOXL2相互作用,鑒于CSN5在細(xì)胞周期和配子發(fā)生中的重要作用,推測(cè)CSN5可能調(diào)控FOXL2蛋白的表達(dá)進(jìn)而影響卵子發(fā)生過程。此外CSN能使一些轉(zhuǎn)錄因子磷酸化,關(guān)于CSN5與FOXL2之間的作用還有待進(jìn)一步研究。
蝦夷扇貝酵母雙雜交結(jié)果顯示FOXL2和胰脂肪酶相關(guān)蛋白(Pancreatic lipase-related protein,PLRP)具有直接的相互作用,這與之前的研究結(jié)果一致。比如,Kim等在扇貝卵巢中獲得了編碼PLRP的基因,RT-PCR結(jié)果顯示該基因在卵巢中高表達(dá),而在精巢中低表達(dá),暗示PLRP在扇貝卵母細(xì)胞的成熟和卵黃發(fā)生時(shí)期的脂質(zhì)代謝中發(fā)揮作用[24]。Dheilly等在太平洋牡蠣中篩選得到配子形成早期表達(dá)的雌性特異性基因,其中就包括FOXL2和PLRP[25]。以上研究結(jié)果說明FOXL2和PLRP關(guān)系密切,可能共同參與卵巢發(fā)育過程。
哺乳動(dòng)物室管膜相關(guān)蛋白1(Mammalian ependymin-related protein 1,MERP1)和鈉/鉀ATP酶β3(Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3)是扇貝FOXL2的另兩個(gè)互作蛋白。目前室管膜素相關(guān)蛋白的功能尚不清晰,但室管膜素相關(guān)蛋白在成體小鼠卵巢的體細(xì)胞中表達(dá)量較高[26],這與FOXL2主要在卵巢中表達(dá)這一現(xiàn)象類似,暗示MERP很可能與FOXL2有直接的相互作用。此外,已有研究發(fā)現(xiàn),鈉/鉀ATP酶是主動(dòng)跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)鈉鉀離子的載體蛋白,具有信號(hào)傳導(dǎo)功能,參與調(diào)控基因的表達(dá)及細(xì)胞的生長(zhǎng)[27]。鈉/鉀ATP酶還可能通過腦對(duì)卵巢的激素發(fā)揮調(diào)控作用[28]。由于相關(guān)報(bào)道較少,鈉/鉀ATP酶與FOXL2之間到底有怎樣的聯(lián)系有待進(jìn)一步的研究。