基因編輯編年史可以追溯到30年前,第一次基因編輯是在酵母細胞實驗中完成,但是直到近5年,隨著CRISPR技術(shù)出現(xiàn)并且迅速成為目前最受歡迎的基因編輯手段,誕生于20世紀70年代末的重組DNA技術(shù)才真正被視為在人類新藥研發(fā)中取得了革命性進步。
專家預測這種基因編輯技術(shù)將會改造我們的星球,甚至改變我們生活的社會和周邊的生物。基因編輯技術(shù)可能代表了藥物研發(fā)的新紀元。大量創(chuàng)新公司正在引領(lǐng)基因編輯治療產(chǎn)品的開發(fā)工作,并吸引了來自風險投資機構(gòu)和制藥公司的大量投資。然而,我們也應(yīng)該謹慎地看到,基因編輯產(chǎn)品成為常規(guī)療法之前,還需要解決一系列重大技術(shù)挑戰(zhàn)。
基因編輯技術(shù)使用一種切割細胞中特定DNA序列的酶——核酸酶,針對具體的疾病將相關(guān)基因進行刪除、修復或替代。這些技術(shù)包括大范圍核酸酶、鋅指核糖核酸酶、轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物核酸酶和常間回文重復序列叢集。
2015年前橫空出世的CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)被《科學》雜志評選為2015年度的突破技術(shù)。由于簡單性和低成本,成為了最受歡迎的基因編輯技術(shù),廣受學術(shù)科學家、投資者、企業(yè)家、生物制藥業(yè)內(nèi)人士以及公眾的擁躉。
雖然基因編輯最初的重點主要針對罕見的遺傳性疾病,但它其實具有更加廣泛的應(yīng)用。
基因編輯技術(shù)可以適用于農(nóng)業(yè),以改善動植物育種,為農(nóng)民和消費者帶來好處。在環(huán)境保護方面,基因編輯有可能挽救受氣候變化威脅的瀕危生物,或者創(chuàng)造新的生物燃料作為化石燃料的替代品。
簡單地說,可以將基因編輯比作在計算機上的查找、替換或刪除功能的文本操作。許多基因編輯技術(shù)的擁護者認為技術(shù)的適用性沒有任何限制,因為它賦予遺傳研究人員和藥物開發(fā)人員強大的編輯能力,不僅能撕下整頁(指大段的錯誤基因信息),而且可以精準地調(diào)整某個特定單詞(指某個基因,甚至是某個堿基),從而實現(xiàn)改變或改善特定癥狀的目標。
的確,目前的治療性基因編輯研究的指數(shù)級增長得益于近30年來基因治療的基礎(chǔ)研究突破。CRISPR出現(xiàn)并成為有潛力的臨床開發(fā)候選藥物只有幾年,2016年6月美國就批準了第一個臨床試驗。
但是我們也必須看到,第一款基因療法上市花了30多年。預測治療性基因編輯產(chǎn)品什么時候能獲批上市并不容易??茖W家表示基因編輯領(lǐng)域目前仍然有重大障礙要克服,如果參照傳統(tǒng)基因療法的臨床開發(fā)進度,我們在對新技術(shù)的激動之外還需要更多的耐心等待。
哈佛大學遺傳學教授George Church是基因組學領(lǐng)域的先驅(qū)之一,也是CRISPR技術(shù)的發(fā)明人之一,他說:“大約2 400種基因治療已被批準進入臨床試驗,幾乎所有這些試驗都涉及增加基因,少數(shù)涉及抑制基因功能。當人們聽他說到基因治療領(lǐng)域正在開展如此多的臨床試驗時,大多數(shù)人都會感到驚訝?!?/p>
他認為,在開發(fā)基因編輯的現(xiàn)階段,釋放技術(shù)的巨大潛力主要取決于克服體內(nèi)和體外向細胞提供有效荷載的障礙,然后確保精準編輯。教授說:“體外基因編輯明顯是讓基因進入細胞最簡單的手段,也有很多有趣的靶標。CRISPR技術(shù)目前的問題在于體內(nèi)療效,以及脫靶活性。”另外,他認為將體外基因編輯轉(zhuǎn)化為廣泛可銷售的產(chǎn)品,一個關(guān)鍵的未解答的問題是:“我們究竟是依照每名患者的不同來開發(fā)gRNA(真核生物中參與RNA編輯的具有與mRNA互補序列的RNA),還是開發(fā)出一種能應(yīng)用在所有條件下的gRNA?!?p>
Church作為麻省理工學院的遺傳學教授,與企業(yè)家關(guān)注的具體技術(shù)應(yīng)用相比,他更多地向我們提供了基因編輯技術(shù)的全景。他說:“今天對基因編輯的描述是誤導性的,因為現(xiàn)有的候選藥物都不代表他認為所謂的‘精準的基因編輯?!?/p>
他解釋說:“增加基因時,基因能插入到染色體的任何一個位置。要移除或是下調(diào)一個基因表達,你要么引入一個干擾分子,要么直接攻擊這個基因,把它弄成一團糟。在一定程度上,這也是隨機的。”
Church教授認為的“精確的基因編輯”意味著改變DNA的核苷酸成分——腺嘌呤、胞嘧啶、鳥嘌呤和胸腺嘧啶?!袄缒米咭粋€胸腺嘧啶,補上一個腺嘌呤這樣的操作,或者是指正好移除4個堿基,不多不少。”
Church教授說:“混亂或優(yōu)雅地改變基因組成是不一樣的。拿鐮狀細胞貧血來說,致病原因是腺嘌呤變成了胸腺嘧啶。你只需要改正這一個堿基就可以了,但事實上,我們正在不斷繞圈圈。我們會說,也許有一個基因,我們突變掉它以后,能達到同樣的效果。囊性纖維化也同樣如此,主要病因只是少了3個堿基。”
Church教授認為目前針對遺傳性疾病的產(chǎn)品開發(fā)工作正在摘“低處果實”,因為“在樹頂?shù)目赡苁撬崞咸选?,但他補充說:“如果我們真的能像基因敲除那樣方便地實現(xiàn)精準的基因組編輯,我們肯定會選擇后者,抑制基因功能?!?h3>未來還有很長的路要走
如果將基因編輯這種有巨大前景的科學轉(zhuǎn)化為治療性產(chǎn)品,未來將會如何呢?
在技術(shù)方面,將基因編輯產(chǎn)品在體內(nèi)遞送到細胞仍然是有問題的。Church教授說:“目前,我們使用AAV,它對某些器官具有強烈靶向性,如肝臟。急需解決其他器官的給藥機制,使基因編輯能夠應(yīng)用于其他疾病領(lǐng)域。”例如,需要新載體遞送到中樞神經(jīng)系統(tǒng)中以治療神經(jīng)變性疾病,如阿爾茨海默病,如果可以將鋅指蛋白遞送到肝臟以外的組織,基因組編輯的治療潛力則會大大增加。
一旦產(chǎn)品的技術(shù)細節(jié)得到解決,監(jiān)管的成功突破,商業(yè)規(guī)模的制造就會成為另一個關(guān)注的問題,Church教授相信隨著基因編輯行業(yè)走向成熟,制造工藝無疑也會迎來里程碑。他認為,目前“供應(yīng)商數(shù)量相對較少,GMP制造經(jīng)驗較少,大規(guī)模制造經(jīng)驗有限,臨床試驗成功案例不足,都是這個領(lǐng)域的挑戰(zhàn)”。然而,許多基因編輯公司已經(jīng)花費了大量的時間、金錢和努力來應(yīng)對這些挑戰(zhàn)。
盡管基因編輯在藥物的開發(fā)方面得到了廣泛關(guān)注,但是Church教授再次把眼光擴大到其他已經(jīng)在使用基因編輯的農(nóng)業(yè)和野生動物領(lǐng)域?;蝌?qū)動(gene drive)就是這樣一個例子,它可以強制性地實現(xiàn)特定遺傳特征的遺傳。
Church教授在哈佛的課題組是首批公開提到基因編輯這些影響的團隊之一,他們也討論了潛在的解決方案,包括生物控制、反向驅(qū)動以及“雛菊驅(qū)動”(daisy drives,一種能自我限制的驅(qū)動系統(tǒng))。
Church教授解釋說:“人們不想讓生物失控跑到野外,自己又無法將它帶回。我們能預見到一個潛在問題是,基于CRISPR基因編輯的驅(qū)動方式是不可逆的。因此我們在可逆性和控制性上做了不少工作?!?/p>
Church教授作為一名院士,他正在開發(fā)一個更先進的“新的基因組技術(shù)生態(tài)系統(tǒng)”,包括閱讀和編寫遺傳密碼。他說:“我認為真正的突破在于我們在‘讀取和‘編寫DNA上取得的進步。這能帶來巨大的影響,它包括添加基因,刪除基因(或降低基因表達)以及精準編輯。最終,我們能在任何想要的地方,寫入任何你想要的基因?!?/p>
目前科學技術(shù)的進步表明基因編輯不僅是一種應(yīng)用廣泛的技術(shù),它的準確性和安全性也日益得到證實,不過現(xiàn)在還存在諸多現(xiàn)實問題亟待解決,因此基因編輯還有很長的路要走。