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微生物學(xué)技術(shù)在食品專業(yè)綜合實驗教學(xué)中的應(yīng)用與實踐
——以“豬源大腸桿菌耐藥性調(diào)查研究”為例

2019-02-18 07:09李佳瑤方結(jié)紅黃光榮朱誠
農(nóng)產(chǎn)品加工 2019年2期
關(guān)鍵詞:農(nóng)貿(mào)市場食品質(zhì)量耐藥性

蔣 晗,李佳瑤,方結(jié)紅,黃光榮,朱誠

(中國計量大學(xué)浙江省海洋食品品質(zhì)及危害物控制技術(shù)重點實驗室,浙江杭州 310018)

0 引言

食品質(zhì)量與安全專業(yè)自2002年招生至今,已在117所大學(xué)開設(shè),分布在農(nóng)、工、商、師、醫(yī)、水及綜合等各類高校。而食品質(zhì)量與安全專業(yè)綜合實驗是本科生在學(xué)習(xí)了食品學(xué)科基礎(chǔ)課程、專業(yè)基礎(chǔ)課程和專業(yè)課程,具有了一定理論基礎(chǔ)、專業(yè)技能和科學(xué)思維后,所進行的實踐性教學(xué)環(huán)節(jié),是培養(yǎng)學(xué)生實驗設(shè)計能力、實驗操作能力、問題總結(jié)能力和交流協(xié)調(diào)能力的一門側(cè)重點在“質(zhì)量”與“安全”上的專業(yè)綜合實驗課程,也是食品質(zhì)量與安全專業(yè)本科生的必修課[1]。

食品質(zhì)量與安全專業(yè)綜合實驗是一門獨立成課的專業(yè)課程,它打破了傳統(tǒng)教學(xué)中實驗課程作為教學(xué)課程的補充與輔助模式,形成了“學(xué)習(xí)、實踐、創(chuàng)新相互促進”的實踐教學(xué)理念,這在提高教學(xué)質(zhì)量、加強學(xué)生專業(yè)綜合能力和培養(yǎng)創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)意識上起到了不可替代的作用[2-6]。

以學(xué)校食品質(zhì)量與安全專業(yè)綜合實驗課題“豬源大腸桿菌耐藥性調(diào)查研究”為例,該課題由大四第一學(xué)期食品質(zhì)量與安全專業(yè)本科生完成,由食品微生物技術(shù)方向指導(dǎo)教師進行指導(dǎo)。試驗采集杭州市農(nóng)貿(mào)市場和超市新鮮豬肉樣本,利用選擇性培養(yǎng)基和特異性基因uidA分離鑒定大腸桿菌,利用K-B法藥敏試驗檢測其對抗生素的耐藥性,并利用PCR法進一步分析耐藥大腸桿菌攜帶耐藥基因的情況。這是一個半開放實驗,豬肉樣品和大腸桿菌篩選是固定內(nèi)容,而耐藥性研究是開放的,可由學(xué)生就自己查閱的文獻或感興趣的內(nèi)容進行深入研究。以下就是其中一組學(xué)生經(jīng)指導(dǎo)教師指導(dǎo)后,形成的試驗方法與結(jié)果分析案例。

1 試驗方法與結(jié)果

1.1 方法

1.1.1 樣品采集與前處理

樣品采集自浙江省某地區(qū)的20家農(nóng)貿(mào)市場和20家超市,每家農(nóng)貿(mào)市場或超市各選5個攤位,分別購買生鮮豬肉1份(約100 g),農(nóng)貿(mào)市場和超市樣品總計各100份。每份生鮮豬肉獨立放置于無菌保鮮袋中,記錄采樣地點和采樣時間后藏于冰盒,迅速低溫保存運回實驗室。運回實驗室后,立即在超凈工作臺用滅菌剪刀剪取25 g樣品,放入無菌袋內(nèi),向無菌袋內(nèi)加入225 mL無菌蛋白胨水,用均質(zhì)器高速均質(zhì)2 min,充分混勻,收集上清液約10 mL裝入15 mL無菌離心管于4℃下冷藏備用。

1.1.2 大腸桿菌的分離和鑒定

大腸桿菌的分離方法參照GB 4789.38—2012食品微生物學(xué)檢驗大腸埃希氏菌計數(shù)。大腸桿菌的分子鑒定方法驟如下:在NCBI網(wǎng)站下載大腸桿菌特異基因序列 uidA(GenBank ID:S69414),并利用primer premier 5.0軟件設(shè)計特異性引物:uidAF:5’-GTCCTGTAGAAACCCCAACCCGTGAA-3'; uidAR:5'-GGGATAGTCTGCCAGTTCAGTTCGT-3'。引物由上海生工合成。PCR反應(yīng)體系(25.0μL):上、下游引物各 1.0μL(10μmol/L),模板 DNA 2.0μL(250ng/μL),Premix Taq12.5μL,加ddH2O至25.0μL。PCR反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性1 min,98℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸30 s,35個循環(huán),72℃延伸10 min。取PCR反應(yīng)產(chǎn)物5μL,于1.2% 瓊脂糖凝膠中電泳,檢測擴增結(jié)果。

1.1.3 藥敏試驗

根據(jù)美國臨床和實驗室標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會(Clinical and Laboratory Standards Institute,CLSI) 推薦的 K-B紙片擴散法進行藥敏實驗,篩選對氯霉素類的氯霉素、氨基糖苷類的慶大霉素、磺胺類的復(fù)方新諾明、四環(huán)素類的四環(huán)素、喹諾酮類的環(huán)丙沙星、β-內(nèi)酰胺類的頭孢西丁等抗生素具有耐藥性的大腸桿菌。根據(jù)藥敏試驗結(jié)果,測量抑菌圈直徑大小,比對NCCLS標(biāo)準(zhǔn),分別判斷該菌為耐藥(R)、中介(I)或敏感(S)。

1.1.4 四環(huán)素類耐藥基因tetA的檢測

利用試劑盒法提取大腸桿菌基因組DNA,用primer premier 5.0軟件設(shè)計tetA特異性引物:tetAF:5'-GGCACCGAATGCGTAGAT-3';tetAR:5'-AAGCG AGCGGGTTGAGAG-3'。引物由上海生工合成。PCR反應(yīng)體系 (25.0μL):上、下游引物各 1.0μL(10 μmol/L), 模 板 DNA 2.0 μL(250 ng/μL),Premix Taq 12.5μL,加ddH2O至 25.0μL。PCR反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性1 min,98℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸30 s,35個循環(huán),72℃延伸5 min。取PCR反應(yīng)產(chǎn)物5μL,于1.2%瓊脂糖凝膠中電泳,檢測擴增結(jié)果。

1.2 結(jié)果與分析

1.2.1 大腸桿菌的分離和鑒定

通過伊紅美藍培養(yǎng)基從100份農(nóng)貿(mào)市場生鮮豬肉樣品中分離到大腸桿菌100株(每份樣品計分離株1株),未從超市生鮮豬肉樣品中分離到大腸桿菌。選用大腸桿菌特異性基因uidA為擴增對象,對疑似菌株進行PCR鑒定,標(biāo)準(zhǔn)菌株作為陽性對照,ddH2O作陰性對照,大腸桿菌特異性條帶為424 bp。經(jīng)PCR鑒定,100株農(nóng)貿(mào)市場生鮮豬肉源大腸桿菌疑似菌株均出現(xiàn)特異性條帶,陽性檢出率達到100%。

大腸桿菌分離鑒定見圖1。

圖1 大腸桿菌分離鑒定

1.2.2 大腸桿菌耐藥情況分析

豬源大腸桿菌分離株藥敏分析見表1。

由表1可知,①農(nóng)貿(mào)市場樣品中大腸桿菌對于慶大霉素、氯霉素、復(fù)方新諾明、四環(huán)素、頭孢西丁、環(huán)丙沙星6種抗生素耐藥率分別為5%,52%,14%,100%,5%,19%;②分析結(jié)果表明,農(nóng)貿(mào)市場來源的大腸桿菌對四環(huán)素的耐藥率顯著高于對頭孢西丁、環(huán)丙沙星、氯霉素、復(fù)方新諾明和慶大霉素等5種抗生素的耐藥率(p<0.05);③多重耐藥率達到59%,表明豬源大腸桿菌的多重耐藥性已經(jīng)成為普遍現(xiàn)象。

表1 豬源大腸桿菌分離株藥敏分析

大腸桿菌K-B藥敏試驗示意圖見圖2。

圖2 大腸桿菌K-B藥敏試驗示意圖

1.2.3 四環(huán)素類耐藥基因型tetA檢測結(jié)果

利用PCR方法對大腸桿菌四環(huán)素類耐藥基因tetA的攜帶情況進行分析,結(jié)果顯示大腸桿菌中tetA基因的檢出率達到65.00%(65/100),表明對四環(huán)素類抗生素產(chǎn)生耐藥性的大腸桿菌中大多富含tetA基因。

四環(huán)素類耐藥基因tetA凝膠電泳圖見圖3。

圖3 四環(huán)素類耐藥基因tetA凝膠電泳圖

2 試驗教學(xué)效果分析

通過綜合實驗的學(xué)習(xí),學(xué)生能夠掌握微生物檢驗的國標(biāo)方法,微生物分子生物學(xué)基本設(shè)計與操作、美國臨床和實驗室標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會推薦的K-B紙片擴散法藥敏試驗等一系列重要的微生物學(xué)技術(shù)。對于大部分基礎(chǔ)性實驗采用計劃安排的方式,在規(guī)定時間由全班學(xué)生統(tǒng)一完成,如此次實驗的大腸桿菌分離鑒定工作。對于少部分綜合設(shè)計性實驗采用課堂教學(xué)和小組預(yù)約結(jié)合的方式,如豬肉采樣和前處理工作,由指導(dǎo)教師課堂教學(xué)采樣及前處理方式,再由每5~6位學(xué)生具體負(fù)責(zé)一個區(qū)域的采樣,并立即送回實驗室進行前處理工作,指導(dǎo)教師或研究生現(xiàn)場指導(dǎo)。對于研究創(chuàng)新性實驗采用學(xué)生個人預(yù)約的方式,如此次實驗的耐藥數(shù)據(jù)分析處理工作,可由每位學(xué)生根據(jù)自己感興趣的角度對大量數(shù)據(jù)進行分析,并撰寫論文,期間可預(yù)約指導(dǎo)教師進行探討。通過多種渠道投入,逐步形成理論教學(xué)與實踐教學(xué)相互協(xié)調(diào)的實踐新體系。

加強師生有效互動,在指導(dǎo)教師的幫助下,食品質(zhì)量與安全專業(yè)本科生有更多機會鍛煉科學(xué)思維,提升科研能力。在綜合實驗學(xué)習(xí)過程中,以學(xué)生為主體,指導(dǎo)教師采用討論式教學(xué)和啟發(fā)式教學(xué),起到引領(lǐng)方向和答疑解惑的作用,既有大課堂的理論教學(xué),又有分組及點對點的討論,以多種形式啟發(fā)引導(dǎo)學(xué)生自主學(xué)習(xí),獨立分析、思考、和解決問題。

最后,在雄厚的科研實力支撐下,將科研中的先進實驗方法與內(nèi)容帶進實踐教學(xué)中,以實驗內(nèi)容改革引導(dǎo)實驗技術(shù)開發(fā),新型的實驗技術(shù)成果又反過來推動實驗內(nèi)容的不斷完善。同時,安排高層次理論課教師擔(dān)當(dāng)實踐教學(xué)、實驗項目開發(fā)和實驗室管理,既加強了理論教學(xué)、科學(xué)研究與實踐教學(xué)的結(jié)合,提高了實踐教學(xué)水平,又帶動和幫助實驗教師提高教學(xué)與科研水平,提高實踐教學(xué)質(zhì)量。

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