郭鵬波 葛麗麗 鄭州兒童醫(yī)院兒科醫(yī)學研究所 (河南 鄭州 450018)
內(nèi)容提要: 目的:探索多重鏈接探針擴增技術(MLPA)檢測在杜氏肌營養(yǎng)不良檢測方面的應用價值。方法:對鄭州兒童醫(yī)院2018年3月~2018年8月收治的7例杜氏肌營養(yǎng)病例進行多重鏈接探針擴增技術(MLPA)+Sanger測序檢測。結(jié)果:隨機挑選7例DMD疑似病例及母親,通過多重鏈接探針擴增技術(MLPA)+Sanger測序檢測,7例為均陽性或攜帶者,4例患兒發(fā)病年齡為8月~8歲,其中3例患兒為運動障礙來醫(yī)院就診。結(jié)論:多重鏈接探針擴增技術(MLPA)檢測在杜氏肌營養(yǎng)不良檢測方面有重要應用價值,能檢測出大部分的患者,但是需要以Sanger測序方法作為補充。
假肥大性肌營養(yǎng)不良(DMD)又稱杜氏肌營養(yǎng)不良,位于X染色體短臂Xp21處的DMD基因發(fā)生缺失、重復或點突變導致[1],發(fā)病率為1:3500[2],初期病征3~7歲,像鴨子般搖搖擺擺的步態(tài)、腰椎前凸、經(jīng)常跌倒,從地板上站立和攀登樓梯時出現(xiàn)困難,跌倒時站立困難。隨著年齡增長,肌肉病變萎縮越來越嚴重。到12~13歲時,患者便需倚助輪椅出入?;颊叩男呐K肌肉也會因此病而引起變化,導致心肌病??赡馨l(fā)生心律不正,心臟衰竭等病癥。通常到20多歲就會因為心肌、肺肌無力而死亡[3]。目前沒有治愈的方法,診斷DMD就變得尤為重要。本文介紹一種多重鏈接探針擴增技術(MLPA),可以診斷DMD,使用MLPA技術可以同時檢測DMD基因所有外顯子的缺失重復,約占病因的70~80%。
取新鮮或兩周內(nèi)4攝氏度保存的EDTA抗凝全血,用QIAGEN試劑盒提取DNA,再用Nanodrop測量濃度,將DNA稀釋到20ng/μL,進行去下步驟的操作(荷蘭MRC公司MLPA試劑盒):(1)取PCR反應管,各加入5μL DNA標本;(2)98?C變性5min,25?C冷卻;(3)配制探針MIX,往每個反應管內(nèi)加入3μL的探針MIX ;(4)95?C變性1min,60?C雜交過夜(16~20h);(5)配制連接酶MIX,吹打混勻;PCR儀降至54?C,每個反應管加入32μL的連接酶MIX,54?C連接15min,98?C 5min滅活連接酶,反應體系降至20?C;(6)配制PCR MIX,吹打混勻;每個反應管加入10μL的PCR MIX;(7)進行35個PCR循環(huán)(95?C 30s—60?C 30s—72?C 1min);72?C繼續(xù)延伸20min,15?C完成擴增;(8)配制毛細管電泳反應液MIX;取PCR管,每管加入9.2μL反應液MIX和0.7μL PCR產(chǎn)物;(9)86?C變性3min,4?C迅速冷卻;(10)上機。
本試驗使用ABI-3500基因分析儀,儀器設置:36cm毛細管:注射電壓:1.6 kV;注射時間:15秒;運行電壓:15 kV;多聚物:POP4;運行時間30分鐘。如果用POP7,運行電壓:10 kV;相應增加運行時間。密封注射混合物后,86?C變性3分鐘,4?C2min迅速冷卻。
2018年3月~2018年8月來鄭州兒童醫(yī)院就診的疑似DMD患者:位**,位**之母,靳**,靳**之母,徐**,徐**之母,郭**。見表1。
郭**的MLPA檢測結(jié)果即非陽性又非陰性,如圖1。由于郭**的結(jié)果無法判讀,我們又采用Sanger測序方法對其進行測序,設計引物序列如表2。
檢測出郭**的序列后用Snapgene軟件與標準序列比對,發(fā)現(xiàn)郭**的DMD基因44號外顯子部分區(qū)域及上游內(nèi)含子缺失196個bp,為陽性病例。
表1. 結(jié)果
圖1. 6例DMD患兒及母親的MLPA結(jié)果
表2. 44號外顯子引物
多重連接探針擴增技術(MLPA)于2002年由Schouten等首先報道,是近幾年發(fā)展起來的一種針對待檢DNA序列進行定性和半定量分析的新技術。該技術高效、特異,在一次反應中可以檢測45個核苷酸序列拷貝數(shù)的改變,目前已經(jīng)應用于多個領域、多種疾病的研究。Sanger法是根據(jù)核苷酸在某一固定的點開始,隨機在某一個特定的堿基處終止,并且在每個堿基后面進行熒光標記,產(chǎn)生以A、T、C、G結(jié)束的四組不同長度的一系列核苷酸,然后在尿素變性的PAGE膠上電泳進行檢測,從而獲得可見DNA堿基序列的一種方法。
七位受檢者全部是陽性或攜帶者,這表明DMD不難診斷,有經(jīng)驗的臨床醫(yī)生基本可以通過觀察患者的臨床表型診斷。
郭**的MLPA結(jié)果出現(xiàn)0.4個拷貝是因為探針區(qū)域存在部分缺失,改變了模板的序列,影響了探針的結(jié)合。DMD是比較經(jīng)典的大片段基因缺失重復導致疾病,MLPA是檢測DMD的首選方法,陽性率達到70%~80%。微小缺失及重復占所有DMD患者的10%~20%。對于有明顯DMD臨床表型但MLPA結(jié)果陰性的患者建議進行測序分析。