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利福平耐藥實時熒光定量核酸擴增技術在結(jié)核病診斷中的研究進展

2019-02-11 20:24吳桂輝章曉紅
實用醫(yī)院臨床雜志 2019年1期
關鍵詞:匯總涂片靈敏度

梁 愈,吳桂輝,黃 濤,章曉紅,陳 紅,Δ

(1.遵義醫(yī)學院,貴州 遵義 563000;2.成都市公共衛(wèi)生臨床醫(yī)療中心,四川 成都 610061;3.四川省醫(yī)學科學院·四川省人民醫(yī)院,四川 成都 610072)

結(jié)核病(tuberculosis,TB)是感染結(jié)核分枝桿菌(mycobacterium tuberculosis,MTB)而引起的一種慢性傳染病,WHO最新工作報告顯示[1],2016年全世界約1040萬人患病,170萬人死亡,60萬新病例對利福平(rifampicin,RIF)耐藥,TB依然是全球公共衛(wèi)生的重大威脅。目前TB診斷方法主要包括涂片法、結(jié)核培養(yǎng)及藥敏實驗(DST)等,涂片法簡便、快速,但靈敏度低;結(jié)核培養(yǎng)靈敏度和特異度較高,且可對陽性菌株進行DST,但耗時長,易延誤診治。基于傳統(tǒng)方法的局限性,新的診斷技術Xpert MTB/RIF檢測應運而生,該技術由美國Cepheid公司研發(fā)的以核酸擴增為基礎的全自動分子診斷方法,全程只需約2小時,即可檢測MTB和RIF耐藥,被廣泛認為是TB診斷的突破口。下面將對該技術在肺結(jié)核(PTB)、肺外結(jié)核(EPTB)、兒童TB、HIV/MTB雙重感染及耐多藥結(jié)核(MDR-TB)中的應用做一綜述。

1 Xpert MTB/RIF在PTB患者中的應用

TB可累及全身多個臟器,以PTB最為常見,占各器官TB總數(shù)的80%~90%,是最主要的TB類型。Xpert MTB/RIF作為PTB的一線快速診斷試驗,其診斷價值得到了國內(nèi)外廣泛認可,Steingart等[2]報道,Xpert MTB/RIF作為替代涂片的初步測試,匯總靈敏度為89%,匯總特異度為99%;作為涂陰后的附加測試,匯總靈敏度為67%,匯總特異度為99%;對于涂陽、培陽的標本,匯總靈敏度為98%。最新meta分析中報道[3],與結(jié)核培養(yǎng)相比,Xpert MTB/RIF靈敏度為87%,特異度為97%,在涂陽中,靈敏度為99%;涂陰中靈敏度為70%,與Steingart等[2]報道相近。Xpert檢測在培養(yǎng)陽性中靈敏度高,但仍不到100%,因為培養(yǎng)陽性僅代表分枝桿菌培養(yǎng)陽性,不能區(qū)分MTB和非結(jié)核分枝桿菌(NTM),而Xpert MTB/RIF能檢測出結(jié)核分枝桿菌復合群,能有效的鑒定MTB和NTM。不管是國外還是國內(nèi)研究中都報道了Xpert MTB/RIF在PTB診斷中的高敏感性和特異性,證實了其診斷價值,并推薦在結(jié)核病的初步檢測中應用。

1.1痰標本的XpertMTB/RIF檢測痰液為最常使用的呼吸道標本,其Xpert MTB/RIF試驗在世界范圍內(nèi)各研究機構開展較為廣泛,Chikaonda等[4]報道的痰標本行Xpert MTB/RIF檢測的靈敏度為93.8%,特異度為97.4%,陽性預測值(PPV)為97.8%和陰性預測值(NPV)92.6%。一項大樣本研究顯示[5],Xpert MTB/RIF檢測培養(yǎng)陽性PTB的總體靈敏度為95.7%,特異度為99.3%;涂陽、培陽組中靈敏度為99.2%;在檢測不同的痰液標本時,該試驗的靈敏度和特異度有差異,使用咳出痰作為檢測標本時,其靈敏度和特異度均較誘導痰高。另有報道Xpert MTB/RIF與涂片法和培養(yǎng)法對PTB檢測的一致性良好,Kappa值分別為0.783和0.818[6]。目前痰的Xpert檢測的報道較其他標本多,其高靈敏度和特異度得到有力證實,同時其與痰結(jié)核培養(yǎng)的一致性高,可推薦作為臨床使用。

1.2支氣管肺泡灌洗液(BALF)標本的XpertMTB/RIF檢測有學者認為在我國BALF為更可靠的呼吸道標本,BALF的Xpert MTB/RIF試驗可以在檢測早期PTB時提供準確結(jié)果,尤其在反復痰涂片陰性和自主排痰困難、無痰或痰少患者中更有應用價值。Gowda等[7]的最新研究中證實,在痰涂陰性和痰少患者中,BALF行Xpert檢測在PTB的診斷中具有較好的靈敏度,同時在培養(yǎng)陰性中亦有較好的診斷價值。在我國有關BALF的Xpert MTB/RIF試驗準確性的報道相對較少,一回顧性研究中提到[8],以結(jié)核培養(yǎng)作為標準,Xpert MTB/RIF的靈敏度為84.5%,特異度98.9%;以臨床診斷作為標準,Xpert MTB/RIF試驗的靈敏度和特異度分別為72.9%和98.7%,顯著高于涂片法。另一雙中心前瞻性研究也肯定了BALF的Xpert檢測在中國成人PTB診斷中的價值,研究中報道,以結(jié)核培養(yǎng)為標準,Xpert檢測PTB的靈敏度為83.1%,特異度為84.1%,靈敏度與Lu等[8]研究相近,特異度有差異[9]。韓丹等[10]通過比較BALF抗酸涂片、結(jié)核培養(yǎng)和 Xpert試驗三種檢測方法,其曲線下面積(AUC)分別為 0.551、0.674、0.810,顯示Xpert MTB/RIF檢測診斷效能最大;同時對Xpert MTB/RIF和結(jié)核培養(yǎng)進行Kappa檢驗,Kappa值為0.55,顯示兩種檢測方法一致性較好。

1.3非呼吸道標本的XpertMTB/RIF檢測研究證實,多種非呼吸道標本的Xpert MTB/RIF試驗對TB的診斷有較好準確性。Sulis等[11]的研究中提到,在非呼吸道樣本中,Xpert MTB/RIF檢測的靈敏度、特異度、PPV和NPV分別為78.3%、91.5%、81.8%和89.6%。Kokuto等[12]關于糞便Xpert MTB/RIF檢測診斷PTB的報道中,在痰涂片陽性(1+至3+)患者中,糞便Xpert MTB/RIF的靈敏度為100%,痰涂片弱陽性(±)患者中靈敏度為是81.0%,痰涂片陰性(-)患者中的靈敏度是50.0%;非TB組的所有糞便樣本Xpert MTB/RIF檢測均為陰性,診斷特異度為100%。在涂陰PTB的研究中,胃灌洗液(GLA)行MGIT檢測和Xpert的靈敏度分別為12.1%和48.6%,與國內(nèi)的研究一致,均肯定了GLA標本的高陽性率[13,27]。

2 Xpert MTB/RIF在EPTB患者中的應用

EPTB是指結(jié)核病變發(fā)生在肺以外的器官和部位,約占所有TB的15%,有meta分析中提到,XpertMTB/RIF在診斷EPTB的靈敏度和特異度分別為77%和97%[14]。國內(nèi)研究報道[3],以結(jié)核培養(yǎng)為標準,Xpert用于診斷EPTB的靈敏度為80%,特異度為97%,AUC為97%。國外文獻報道,以培養(yǎng)作為金標準,Xpert診斷EPTB的靈敏度為0.763,特異度為0.987[15],與國內(nèi)報道相近。Xpert MTB/RIF在EPTB的診斷中靈敏度及特異度較診斷PTB低,可能因為Xpert MTB/RIF檢測的準確性與標本類型及標本內(nèi)MTB的濃度有關,而EPTB的標本取材困難、標本異質(zhì)性大、含菌量少等,所以導致該檢測在EPTB的診斷效能低于在PTB中的診斷效能。

2.1結(jié)核性胸膜炎(TP) TP為最常見的EPTB之一,目前TP的診斷主要依賴在胸腔積液或胸膜中通過培養(yǎng)檢測MTB,或通過組織病理學檢查來證明胸膜中的干酪性肉芽腫。據(jù)研究報道,以結(jié)核培養(yǎng)作為標準,Xpert MTB/RIF的總體靈敏度為59%和特異度為92%,在不同的標本中其靈敏度存在差異,液體標本的靈敏度為51%,其中胸水為僅為47%[16]。國外Meta分析中提到[14],胸水Xpert檢測的匯總靈敏度較低(37%);國內(nèi)最新的meta分析中也報道,胸水Xpert檢測的匯總靈敏度和特異度分別為30%和99%[17]。綜合目前國內(nèi)外研究,胸腔積液Xpert MTB/RIF試驗靈敏度較低,作為TP的篩選測試價值有限。胸膜活檢為更可靠的診斷TP的方法,有報道涂片陰性的TP患者胸膜活檢樣本行Xpert MTB/RIF試驗的靈敏度和特異度分別為85.5%、97.2%[18],均較胸腔積液樣本高,可彌補液體樣本的不足,更能準確診斷TP。

2.2結(jié)核性腦膜炎(TBM) TBM是最嚴重的TB類型,診斷困難,易延誤診治。以臨床診斷TBM為標準,腦脊液(CSF)的Xpert檢測的靈敏度為59.3%,特異度為99.5%,而CSF涂片和培養(yǎng)的靈敏度分別為78.6% 和66.5%,均較Xpert法高[19]。有報道離心CSF樣本Xpert檢測的靈敏度顯著高于未離心樣本,與培養(yǎng)的靈敏度相近,離心CSF優(yōu)化了Xpert試驗在TBM檢測中的性能[20]。除外常用的CSF檢查,組織病檢亦是診斷TBM的途徑,對于組織病理學確診的TBM,Xpert檢測的靈敏度為100%,特異度為87%,對于組織病理學高度懷疑TBM的病例,其靈敏度為是87%[21]。Xpert檢測對于TBM的診斷能力有限,應綜合臨床各指標進行綜合評估及診斷,避免延誤診治。

2.3其他EPTB最新meta分析中提到[22],Xpert MTB/RIF檢測在肌肉骨骼TB的診斷中,匯總靈敏度和特異度分別為81.0%和83.0%,AUC超過0.9,表明Xpert用于檢測肌肉骨骼TB總體診斷準確度相對較高。在脊柱TB的應用中,抗酸染色、BACTEC MGIT960液體培養(yǎng)及Xpert檢測的靈敏度分別為25.92%、48.15%、77.78%,Xpert的靈敏度顯著高于傳統(tǒng)方法[23]。Xpert檢測在結(jié)核性腹膜炎中應用的報道相對較少,Edwards等[24]的報道中肯定了Xpert在結(jié)核性腹膜炎診斷中的價值,推薦在腹膜透析患者中早期篩查,避免延誤診斷。

3 Xpert MTB/RIF在兒童TB中的應用

Xpert MTB/RIF檢測在成人的應用價值得到了較多的肯定,因兒童TB的特殊性(不典型的臨床癥狀、排痰取痰困難、標本含菌量少、不配合肺外標本獲取等),其在兒童PTB和EPTB方面的應用受限。痰液Xpert MTB/RIF檢測診斷兒童PTB的匯總靈敏度為62%,匯總特異度為98%[25]。有相關文獻報道使用BALF和GLA這兩種標本分別行涂片、培養(yǎng)和Xpert檢測,均顯示Xpert的靈敏度顯著高于另外兩種方法[26]。Lu等[27]的報道中提到,收集確診TB的兒童的痰液、GLA、BALF和CSF等樣本,Xpert的檢出率顯著高于固體培養(yǎng),且不同樣本類型的Xpert陽性率顯著不同,GLA的陽性率最高。在合并HIV感染的兒童TB中,痰/胃抽吸物Xpert的靈敏度為60%,特異性為98%,糞便Xpert的靈敏度為63%,特異度為99%[28]。由于兒童自主排痰困難,且痰標本容易污染,合格率低,而GLA、BALF等非痰液標本的陽性率相對較高,因此臨床上可通過非痰標本的Xpert檢測提高兒童TB的檢出率。

4 Xpert MTB/RIF在HIV/MTB雙重感染患者中的應用

TB是HIV患者最易感染的疾病之一,也是最主要的致死原因,成人HIV患者中約16.9%合并MTB感染[29],據(jù)WHO報告,2016年,艾滋病病毒陽性者中有37.4萬人死于PTB,全球TB中約10%為艾滋病病毒感染者[1]。因此,在HIV/MTB雙重感染的患者中,早期的明確MTB診斷,及時的抗MTB治療,有助于降低HIV患者的死亡風險。Steingart等[2]報道,對于HIV感染者,Xpert MTB/ RIF匯總靈敏度為79%,對于沒有感染艾滋病毒的患者,匯總靈敏度為86%。另外,Xpert的靈敏度與患者免疫缺陷狀態(tài)相關,有報道中提到,免疫缺陷嚴重組(CD4+<100 cells/mm3)中Xpert的靈敏度為82.9%,免疫缺陷輕癥組(CD4+>200 cells/mm3)中其靈敏度為46.7%,嚴重組顯著高于輕癥組[29]。國內(nèi)研究報道,在HIV陽性的患者中,Xpert MTB/RIF檢測的靈敏度為81%,特異度為98%[3],特異度均較高,靈敏度與國外研究有差異,可在國內(nèi)進一步展開該研究,更準確了解我國HIV/TB雙重感染現(xiàn)狀及Xpert檢測在該類患者中的診斷價值。由于HIV/TB 患者的痰標本常不易獲取,臨床中常使用尿液樣本行Xpert檢測,有研究比較了痰樣本、尿樣本、痰和尿樣本聯(lián)合使用行Xpert檢測,三組的靈敏度分別為28.1%、64.0%和77.7%[30],可見在HIV/TB雙重感染患者中,采用多種標本聯(lián)合行Xpert檢測可有助于提高試驗的準確性,從而準確檢出結(jié)核。

5 Xpert MTB/RIF在MDR-TB患者中的應用

MDR-TB指致病MTB至少同時耐異煙肼 (INH) 和RIF。據(jù)WHO報告,2016年約49萬患有MDR-TB,約4.1%的新發(fā)病例和19%的接受過抗結(jié)核治療的病例患有MDR-TB[1]。早期檢測出機體對抗結(jié)核藥物的耐藥情況,有針對性的選擇抗結(jié)核藥物,避免無效的抗結(jié)核治療。目前檢測MDR-TB常用的DST為BACTEC MGIT960,有相關文獻均提到,在檢測MTB及耐藥性方面,BACTEC MGIT960法與傳統(tǒng)的羅式培養(yǎng)藥敏高度一致,用時需1周至半月左右,可替代傳統(tǒng)培養(yǎng)及藥敏檢測[31],而Xpert MTB/RIF檢測與BACTEC MGIT960法在檢測RIF耐藥方面一致性較高,用時僅需2小時。Xpert檢測在MDR-TB診斷的總體靈敏度、特異度、PPV和NPV分別為98.6%、100%、100%和93.8%[32],因其高靈敏度使得其可與常規(guī)DST媲美。但實際應用中發(fā)現(xiàn)Xpert與BACTEC MGIT960法在檢測RIF耐藥性方面仍存在一定差異,因Xpert對rpo-B基因啞變異的菌株可能出現(xiàn)假陽性,而啞變異的基因并不會改變其相應蛋白質(zhì)的表達,因此可能造成Xpert法與常規(guī)DST結(jié)果不一致,可能與MTB存活狀態(tài)、標本含菌量、患者的用藥史等有關。最新的meta分析報道,Xpert在檢測耐藥性方面,新發(fā)耐RIF的病例中有33.3%表現(xiàn)出對INH敏感,而之前已接受抗結(jié)核治療的耐RIF病例中有14.8%對INH敏感[33],可見在檢測RIF耐藥的基礎上,Xpert檢測并不能完全準確反映INH耐藥情況。因此,臨床上對于Xpert MTB/RIF檢測出RIF耐藥的病例,可再行常規(guī)的DST進一步明確。總體來說,Xpert MTB/RIF檢測靈敏度高,用時少,在MDR-TB的診斷上具有足夠的優(yōu)勢,可指導臨床快速識別MDR-TB,從而盡早選擇更合理的抗結(jié)核治療方案,提高MDR-TB患者的治療療效,降低死亡率。

6 總結(jié)與展望

Xpert MTB / RIF是一種快速準確檢測MTB及RIF耐藥的方法,尤其在PTB、HIV/MTB及MDR-TB患者中的診斷價值較高,但在EPTB及兒童TB應用中有其局限性,可通過不同標本的聯(lián)合送檢提高其檢測的準確度。總之,該方法可快速幫助臨床醫(yī)生做出臨床決策,應用價值較高,值得臨床推廣。

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