李亞飛 張 霄 王雪飛 翁明嬌 王天真
Lin28是一種高度保守的RNA結(jié)合蛋白,其家族包括Lin28A和Lin28B兩個(gè)成員[1]。Lin28A最早在線蟲中被發(fā)現(xiàn)[2],隨后研究人員證實(shí),在哺乳動(dòng)物中也能檢測(cè)到Lin28A的表達(dá)。Lin28A具有調(diào)控發(fā)育時(shí)相的作用,在胚胎干細(xì)胞中表達(dá)水平相對(duì)較高,對(duì)于維持干細(xì)胞的自我更新具有重要意義。2006年,Lin28A的同源異構(gòu)體-Lin28B首次在人肝細(xì)胞癌中被鑒定出來(lái)[3]。研究證實(shí),Lin28B在結(jié)構(gòu)、功能和表達(dá)部位上與Lin28A具有很多相似之處。近些年來(lái),大量研究證實(shí)Lin28分子在多數(shù)惡性腫瘤組織中表達(dá)上調(diào),其作為原癌基因,在腫瘤的發(fā)生和進(jìn)展過(guò)程中發(fā)揮重要推動(dòng)作用[4]。然而到目前為止,Lin28參與腫瘤發(fā)生和進(jìn)展的上下游調(diào)控機(jī)制尚不明確。即哪些因素誘導(dǎo)了Lin28的表達(dá),同時(shí)Lin28又通過(guò)哪些路徑參與了腫瘤惡性表型的調(diào)控,都有待于進(jìn)一步探索。本文就現(xiàn)有文獻(xiàn)進(jìn)行整理,對(duì)Lin28在惡性腫瘤中的生物學(xué)作用進(jìn)行了歸納,同時(shí)對(duì)其上游調(diào)控機(jī)制和下游信號(hào)路徑進(jìn)行了分析和總結(jié)。
2009年,Viswanathan等[5]首先證實(shí)Lin28具有促進(jìn)正常細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化的作用。該小組在小鼠胚胎成纖維細(xì)胞中過(guò)表達(dá)了Lin28分子,結(jié)果發(fā)現(xiàn)細(xì)胞在軟瓊脂內(nèi)形成克隆,并在裸鼠體內(nèi)形成腫瘤,這與Lin28抑制let-7的生成密切相關(guān)。隨后,King等[6]發(fā)現(xiàn),Lin28B可以使結(jié)腸上皮細(xì)胞獲得永生化,細(xì)胞具有軟瓊脂克隆形成能力,轉(zhuǎn)移能力也得到顯著提升。Madison等[7]還發(fā)現(xiàn),Lin28B的上調(diào)能促進(jìn)結(jié)腸隱窩的轉(zhuǎn)化,進(jìn)而形成腸息肉和腺癌。
大量研究證實(shí),Lin28過(guò)表達(dá)具有促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖的作用[8-9]。Lin28可以通過(guò)激活增殖相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子[10]、上調(diào)細(xì)胞周期相關(guān)因子[11]、刺激細(xì)胞增殖信號(hào)通路[12]、促進(jìn)核糖體蛋白合成和增強(qiáng)葡萄糖代謝等提高腫瘤細(xì)胞的增殖能力[13-14]。但也有報(bào)道稱,Lin28能擾亂胃癌細(xì)胞的周期進(jìn)程,并誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,從而抑制癌細(xì)胞的增殖能力[14]。
轉(zhuǎn)移是惡性腫瘤重要表型之一。大量證據(jù)表明,Lin28能促進(jìn)多種惡性腫瘤的轉(zhuǎn)移過(guò)程[15]。Lin28參與癌細(xì)胞侵襲和轉(zhuǎn)移與其調(diào)節(jié)上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化過(guò)程(Epithelial-mesenchymal transition,EMT)有關(guān)[16]。Lin28可以通過(guò)抑制let-7家族而間接促進(jìn)EMT相關(guān)基因的表達(dá)。同時(shí)作為RNA結(jié)合蛋白,Lin28可以抑制E-鈣黏蛋白的翻譯。另外,Lin28也可促進(jìn)高遷移率族蛋白中的HMGA1表達(dá),而HMGA1又可通過(guò)誘導(dǎo)Slug和Snail的表達(dá)來(lái)促進(jìn)EMT發(fā)生[8]。
總之,現(xiàn)有的研究顯示,Lin28在多種惡性腫瘤組織中表達(dá)上調(diào)。Lin28表達(dá)上調(diào)不但與細(xì)胞轉(zhuǎn)化和腫瘤的發(fā)生密切相關(guān),同時(shí)對(duì)腫瘤演進(jìn)過(guò)程也有重要推動(dòng)作用。
近年來(lái),研究人員已經(jīng)揭示了幾種調(diào)控Lin28表達(dá)增加的分子機(jī)制,主要包括轉(zhuǎn)錄水平和轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控。目前,已經(jīng)有幾種轉(zhuǎn)錄因子被證實(shí)可以促進(jìn)Lin28的轉(zhuǎn)錄,如c-myc、NF-κB、STAT3、β-連環(huán)蛋白和SOX2[17-20]。這些轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)上調(diào)是導(dǎo)致Lin28過(guò)表達(dá)的重要原因。另外,轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機(jī)制也被發(fā)現(xiàn)調(diào)控了Lin28的表達(dá)。具體方式如下:(1)某些miRNA可以調(diào)控Lin28的表達(dá)。如let-7和miR-181,可以與Lin28的mRNA結(jié)合,抑制其翻譯,因此這些miRNA下降可導(dǎo)致Lin28表達(dá)增加[21];(2)某些RNA結(jié)合蛋白可以在轉(zhuǎn)錄后水平影響Lin28的表達(dá),例如,鋅指蛋白36(Tristetraprolin,TTP)能綁定Lin28 mRNA 3′UTR內(nèi)的AU富含元件,進(jìn)而導(dǎo)致其mRNA降解[22]。然而,TTP在腫瘤中通常下調(diào),因此Lin28表達(dá)水平相對(duì)增加。又如,胰島素樣生長(zhǎng)因子2 mRNA結(jié)合蛋白3(IMP3)能綁定并增加Lin28B mRNA的穩(wěn)定性,進(jìn)而促進(jìn)Lin28B的表達(dá)[23];(3)RNA編輯也可能影響Lin28的產(chǎn)生。研究發(fā)現(xiàn),Lin28 mRNA的3′-UTR中含有Alu反向重復(fù)元件,RNA腺苷脫氨酶(ADAR)可對(duì)其進(jìn)行識(shí)別,并通過(guò)催化水解脫氨作用使Lin28的腺苷(A)轉(zhuǎn)變?yōu)榧≤?I),從而導(dǎo)致Lin28 RNA被扣留在核旁斑中而不能有效輸出到細(xì)胞質(zhì)內(nèi)[24]。最后,Lin28的翻譯后修飾可能會(huì)通過(guò)增加Lin28B穩(wěn)定性而上調(diào)其水平。如在多能干細(xì)胞中,MAPK/ERK激活時(shí),ERK可直接磷酸化Lin28而顯著增強(qiáng)其穩(wěn)定性[25]。與此同時(shí),泛素連接酶TRIM71可通過(guò)泛素介導(dǎo)的蛋白酶體降解機(jī)制而誘導(dǎo)Lin28B的降解[26]。總之,現(xiàn)有的研究證實(shí),機(jī)體可通過(guò)轉(zhuǎn)錄激活、翻譯增強(qiáng)或提高穩(wěn)定性等機(jī)制促進(jìn)Lin28的表達(dá)。
作為RNA結(jié)合蛋白,Lin28可通過(guò)直接結(jié)合特定的堿基序列來(lái)調(diào)節(jié)RNA分子。Lin28有兩個(gè)RNA綁定區(qū)域(Binding RNA domains,RBD):冷休克結(jié)構(gòu)域(Cold-shock domain,CSD)和鋅指結(jié)構(gòu)域(ZKD,或Cys-Cys-His-Cys[CCHC]型CCHCx2結(jié)構(gòu)域),可以與各種preE-let-7的前體RNA結(jié)合[27]。其中CSD與前元素(preE)中的莖-環(huán)結(jié)構(gòu)結(jié)合,而ZKD與preE3′末端附近的高度保守的GGAG序列相互作用。連接兩個(gè)折疊結(jié)構(gòu)域的連接體是靈活的,從而適應(yīng)Lin28與不同let-7家族成員的結(jié)合[27]。最近有研究人員提出了一個(gè)新的RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)模型,Lin28可以識(shí)別其中由4個(gè)鳥嘌呤構(gòu)成的G四分體結(jié)構(gòu)(G4)[28]。通過(guò)這些特殊的結(jié)構(gòu)和序列,Lin28可以識(shí)別、綁定并調(diào)控多種RNA分子的表達(dá),進(jìn)而實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤發(fā)生和進(jìn)展的促進(jìn)效應(yīng)。
let-7家族是最早被發(fā)現(xiàn)受Lin28調(diào)控的miRNA分子,研究也最為清楚。阻斷l(xiāng)et-7目前被認(rèn)為是Lin28發(fā)揮生物學(xué)功能最重要的分子機(jī)制之一。Lin28可以通過(guò)CSD識(shí)別并綁定pri-let-7和pre-let-7環(huán)內(nèi)的GGAG序列,阻止了Drosha和Dicer對(duì)let-7前體的加工來(lái)調(diào)節(jié)let-7 microRNA的成熟[29]。同時(shí),Lin28的CCHC鋅指結(jié)構(gòu)域通過(guò)促進(jìn)其降解來(lái)抑制let-7的作用:首先穩(wěn)定Lin28:let-7復(fù)合物,然后通過(guò)與N-末端TUT4的直接相互作用募集TUT4,誘導(dǎo)pre-let-7發(fā)生寡聚化,然后由Dis3L2的聚(U)進(jìn)行特異性降解Lin28[13]。此外,SET7/9可以使Lin28A發(fā)生甲基化,導(dǎo)致其穩(wěn)定性增強(qiáng)并轉(zhuǎn)位至核中,與pri-let-7結(jié)合限制其出核,從而抑制let-7的成熟過(guò)程[30]。研究發(fā)現(xiàn),并非所有l(wèi)et-7家族成員都能被Lin28調(diào)節(jié)。在12種let-7成員中,人類let-7a-3逃逸了Lin28介導(dǎo)的抑制作用。另外,鼠同源性let-7c-2對(duì)Lin28結(jié)合的親和力也較低,其機(jī)制與let-7c-2內(nèi)的一個(gè)短小莖環(huán)結(jié)構(gòu)有關(guān),其阻止了Lin28的CSD和pre-let-7c-2環(huán)之間的相互作用[31]。
除了let-7家族外,Lin28也被發(fā)現(xiàn)可調(diào)節(jié)其他miRNA。如Lin28B通過(guò)GGAG序列與miR-17~92和miR-363結(jié)合,上調(diào)這些miRNA的生成[32-33]。Lin28還可通過(guò)其CSD與miR-302d前體相互作用,并抑制miR-302d的表達(dá)水平[34]。此外,Lin28也可以抑制miR-107在胃癌細(xì)胞中的表達(dá),抑制miR-125在人肝細(xì)胞癌中的表達(dá)[35-36]??傊?,Lin28可以通過(guò)CSD識(shí)別和CCHC鋅指結(jié)構(gòu)域來(lái)調(diào)節(jié)某些miRNA的生成,從而影響腫瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)。許多miRNA都是Lin28的潛在調(diào)控靶點(diǎn)。隨著研究的深入,更多的Lin28靶miRNA將會(huì)被發(fā)現(xiàn)并且其機(jī)制也會(huì)越來(lái)越明確。
2007年,研究人員發(fā)現(xiàn)Lin28可以結(jié)合胰島素樣生長(zhǎng)因子2(IGF-2)的mRNA,并通過(guò)驅(qū)動(dòng)IGF-2 mRNA到核糖體而增強(qiáng)其翻譯效率[37]。這為L(zhǎng)in28作為RNA結(jié)合蛋白直接結(jié)合和調(diào)節(jié)mRNA分子提供了證據(jù)。此后,一系列細(xì)胞周期調(diào)節(jié)因子等的mRNA陸續(xù)被證實(shí)為L(zhǎng)in28的調(diào)控靶點(diǎn),Lin28可以增強(qiáng)它們的翻譯水平[38]。在胚胎干細(xì)胞內(nèi)的基因廣譜研究證實(shí),一些與生長(zhǎng)和存活相關(guān)的mRNA是Lin28的靶基因[13]。Lin28通過(guò)將RNA解旋酶A(RHA)募集到多核糖體來(lái)增強(qiáng)這些基因的翻譯[13]。除了對(duì)翻譯的影響,Lin28也可以影響特異性mRNA的穩(wěn)定性,Lin28與靶mRNA結(jié)合可以抵消Drosha依賴性mRNA的不穩(wěn)定性[39]。在惡性腫瘤中,Lin28還可以直接結(jié)合原癌基因并增加其翻譯,如HER2和BMP4,借以誘導(dǎo)細(xì)胞增殖[40-41]。然而,Lin28有時(shí)也能抑制其靶mRNA的翻譯。例如,在胚胎干細(xì)胞分化過(guò)程中,Lin28可以通過(guò)結(jié)合Hmga2 3′UTR中的高度保守元件下調(diào)Hmga2的翻譯[42]。
隨著越來(lái)越多的mRNA被鑒定為L(zhǎng)in28的靶mRNA,研究人員開始分析這些mRNA中的特異綁定序列。結(jié)果發(fā)現(xiàn),這些靶mRNA中都存在的一個(gè)富含GGAGA序列的環(huán)狀結(jié)構(gòu),并認(rèn)為這是Lin28的識(shí)別位點(diǎn),而且這個(gè)識(shí)別位點(diǎn)在大約1/4人類轉(zhuǎn)錄物本中都存在,全基因組研究也發(fā)現(xiàn)了幾個(gè)潛在的Lin28結(jié)合位點(diǎn),包括GGAGA、AYYHY(Y=U,C和H=A,C,U)和AAGNNG[43]。這些研究提示,體內(nèi)很多mRNA都是Lin28的潛在調(diào)控靶點(diǎn)。相信隨著Lin28結(jié)合位點(diǎn)的發(fā)現(xiàn),越來(lái)越多的受Lin28調(diào)控的靶mRNA將被發(fā)現(xiàn)。Lin28通過(guò)調(diào)控mRNA的翻譯和穩(wěn)定性,進(jìn)一步影響腫瘤等的發(fā)生發(fā)展。
已經(jīng)有研究發(fā)現(xiàn),乳腺癌中Lin28能優(yōu)先結(jié)合編碼剪接因子的轉(zhuǎn)錄本,如hnRNP F、TIA-1、FUS/TLS和TDP-43,增強(qiáng)其翻譯并導(dǎo)致細(xì)胞出現(xiàn)廣泛剪接[43]。最近,Yang等[40]通過(guò)質(zhì)譜分析發(fā)現(xiàn),剪接因子hnRNP A1與Lin28的表達(dá)具有相關(guān)性。然而,RIP-Seq數(shù)據(jù)顯示,Lin28在hnRNP A1位點(diǎn)沒(méi)有富集。提示Lin28可以調(diào)節(jié)乳腺癌細(xì)胞的剪接過(guò)程,但并不依賴于hnRNP A1??傊?,Lin28可以通過(guò)影響剪接因子的翻譯而影響癌細(xì)胞中RNA剪接過(guò)程,進(jìn)而調(diào)控腫瘤的發(fā)生和演進(jìn)。
盡管是一個(gè)公認(rèn)的RNA結(jié)合蛋白,但已經(jīng)有研究證實(shí),Lin28可以在轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控基因表達(dá)。Zeng等[44]首次證實(shí)了Lin28A具有直接調(diào)控轉(zhuǎn)錄的能力,并對(duì)Lin28A的DNA結(jié)合特征做了總結(jié)。該團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),Lin28A能識(shí)別活性轉(zhuǎn)錄泡中的DNA共有序列,并通過(guò)調(diào)節(jié)胞嘧啶修飾狀態(tài)招募Tet1共同調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄。盡管這一說(shuō)法還沒(méi)有得到充分的驗(yàn)證,但確實(shí)有一些證據(jù)為L(zhǎng)in28的此項(xiàng)功能提供了佐證。Hudson等[45]曾經(jīng)證明,某些蛋白分子中的CSD結(jié)構(gòu)可以結(jié)合單鏈DNA。RNA結(jié)合蛋白-剪接調(diào)節(jié)子人精氨酸/絲氨酸豐富剪接因子2(RSF2),被證實(shí)可作為轉(zhuǎn)錄因子發(fā)揮作用[46]。據(jù)此,Lin28確實(shí)可能具有DNA結(jié)合能力,通過(guò)這種方式可以調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄,從而影響腫瘤的發(fā)生和發(fā)展。但其具體機(jī)制尚不明確,有待進(jìn)一步研究。
RNA結(jié)合蛋白Lin28已經(jīng)被證實(shí)在多種人類惡性腫瘤中表達(dá)增加,具有促進(jìn)腫瘤發(fā)生和進(jìn)展的作用,也是腫瘤預(yù)后不良的生物學(xué)標(biāo)志物?,F(xiàn)有的研究證實(shí),Lin28在腫瘤組織中表達(dá)上調(diào)的分子機(jī)制主要包括轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控和轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控兩種。如某些miRNA和RNA結(jié)合蛋白可以在轉(zhuǎn)錄后水平影響Lin28的表達(dá),同時(shí)RNA編輯也可能影響Lin28的產(chǎn)生。作為RNA結(jié)合蛋白Lin28也可直接調(diào)節(jié)靶mRNA的轉(zhuǎn)錄、剪接、穩(wěn)定性和翻譯,進(jìn)而實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤的促進(jìn)效應(yīng)。Lin28對(duì)靶基因的識(shí)別依賴于特定序列,因此通過(guò)對(duì)這些特定序列的研究可以幫助我們發(fā)現(xiàn)更多的Lin28調(diào)控靶點(diǎn),發(fā)掘Lin28的功能。另外,我們最近的研究提示,在結(jié)直腸癌中Lin28 mRNA和蛋白質(zhì)的功能可能并不一致[47]。鑒于Lin28A和Lin28B的mRNA分子含有較長(zhǎng)的3′-UTR,我們推測(cè)Lin28的mRNA分子可能具有一些新的不依賴于蛋白編碼功能的作用,這個(gè)假設(shè)需要通過(guò)進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)來(lái)驗(yàn)證。一旦被證實(shí),將從全新角度完善Lin28分子機(jī)制。總之,Lin28是腫瘤進(jìn)展的一個(gè)重要調(diào)控因子,是惡性腫瘤治療中的重要靶點(diǎn)。