王西西 陳青 陳鴻軍 朱鴻飛 李金祥 郭曉宇
非洲豬瘟病毒(African swine fever virus,AS-FV)是一種核質(zhì)大DNA病毒,在病毒分類中隸屬于DNA病毒目、非洲豬瘟病毒科、非洲豬瘟病毒屬,為該病毒科唯一成員。ASFV具有雙層囊膜結(jié)構(gòu),病毒基因組為線性雙鏈DNA分子,不同毒株基因組大小存在一定差異,總體介于170~190 kb之間,可編碼150多個(gè)開(kāi)放閱讀框,成熟病毒粒子中含有50種以上結(jié)構(gòu)蛋白。
巨噬細(xì)胞是 ASFV感染的主要靶細(xì)胞,病毒主要通過(guò)肌動(dòng)蛋白介導(dǎo)的內(nèi)吞作用和巨胞飲作用進(jìn)入巨噬細(xì)胞,隨后病毒內(nèi)層囊膜與次級(jí)內(nèi)體融合,病毒核心被釋放到細(xì)胞質(zhì)中。ASFV主要在巨噬細(xì)胞內(nèi)完成復(fù)制、組裝及子代病毒顆粒的釋放,病毒表達(dá)自身DNA聚合酶、連接酶和核酸內(nèi)切酶等保證復(fù)制的準(zhǔn)確性。已有研究表明,ASFV基因組可編碼多種蛋白質(zhì),用以調(diào)控宿主細(xì)胞蛋白表達(dá)、干擾宿主天然免疫系統(tǒng)和調(diào)控細(xì)胞周期等,從而抑制和逃避宿主的免疫應(yīng)答反應(yīng),為自身增殖、擴(kuò)散創(chuàng)造有利條件。ASFV編碼的免疫逃逸蛋白按功能主要分為以下幾類:① 調(diào)控宿主細(xì)胞蛋白表達(dá)系統(tǒng)及細(xì)胞因子的轉(zhuǎn)錄,如DP71L和A238L等;② 抑制Ⅰ型干擾素信號(hào)通路,如多基因家族蛋白 MGF360、MGF505/530和 I329L等;③ 調(diào)控細(xì)胞程序性死亡,包括p54、A179L、A224L和EP153R等;④ 其他免疫抑制蛋白,如CD2v、L83L等。
DP71L基因位于ASFV基因組右側(cè)可變區(qū),緊鄰 ASFV毒力基因DP96R,是高度保守的晚期表達(dá)蛋白。大部分ASFV毒株的DP71L蛋白為短鏈(DP71Ls/NL-S,70~72個(gè)氨基酸),其他一些分離株(如ASFV Malawi Lil-20/1和pig/Kenya/KEN-50/1950毒株)的DP71L為長(zhǎng)鏈蛋白(DP71Ll,184~185個(gè)氨基酸)。NL-S蛋白氨基酸序列同源性為94%~100%,DP71Ll蛋白118~185位氨基酸與NL-S蛋白7~71位氨基酸序列的同源性為 61%。NL-S和 DP71Ll都具有的保守 C端結(jié)構(gòu)域,與單純皰疹病毒毒力蛋白ICP34.5和生長(zhǎng)抑制DNA損傷蛋白34(GADD34)的同源性為30%~40%。
eIF2是一種通用的真核翻譯因子,是由α、β和γ亞基組成的異源三聚體,在病毒感染或蛋白質(zhì)應(yīng)激(ERS)等刺激發(fā)生時(shí)α亞基在eIF2激酶作用下發(fā)生磷酸化修飾,引起蛋白翻譯受阻。ASFV編碼的免疫逃逸蛋白NL-S和DP71Ll蛋白可募集蛋白磷酸酶 1(PP1),使翻譯起始因子2α(eIF2α)去磷酸化以恢復(fù)蛋白合成,從而使得病毒利用細(xì)胞蛋白表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)自身蛋白。
ASFV利用內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(Endoplasmic reticulum,ER)進(jìn)行蛋白表達(dá)與修飾,大量病毒蛋白表達(dá)造成未折疊蛋白質(zhì)在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi)積累,導(dǎo)致內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激(ER stress,ERS)。持久的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激激活peIF2α-ATF4-CHOP信號(hào)通路,使細(xì)胞進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激誘導(dǎo)的凋亡程序。而ASFV表達(dá)的DP71L通過(guò)促進(jìn)eIF2α去磷酸化,抑制 peIF2α-ATF4-CHOP信號(hào)通路的激活及其介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡,以促進(jìn)病毒在細(xì)胞內(nèi)增殖。
ASFV E70缺失DP71L基因后對(duì)宿主的毒力明顯下降,缺失病毒感染豬后除了短暫的發(fā)熱反應(yīng)沒(méi)有出現(xiàn)其他臨床癥狀,血液中病毒滴度能夠降低1000倍,所有接種動(dòng)物均未出現(xiàn)死亡。然而 ASFV Malawi Lil-20/1毒株(Mal)缺失DP71L基因后,在家豬中的致死率仍達(dá)100%;ASFV Pretoriuskop/96/4毒株(Pr4)缺失DP71L基因后,能夠延遲家豬接種后出現(xiàn)病毒血癥及死亡的時(shí)間,但致死率仍然很高。以上研究表明:DP71L基因是ASFV非必需毒力基因,Mal和 Pr4缺失 DP71L基因后仍有其他補(bǔ)償性基因以維持病毒毒力。
A238L為ASFV早期表達(dá)蛋白,分子量大小約為28 kD,含有226~239個(gè)氨基酸,是ASFV在巨噬細(xì)胞中復(fù)制的非必需蛋白。A238L包含一個(gè)錨蛋白重復(fù)序列(Ankyrinrepeat,ANK),為IkappaB蛋白同系物,與豬IκBα因子同源性為40%。A238L能夠抑制NF-κB轉(zhuǎn)錄因子的活化,進(jìn)而抑制促炎性因子的表達(dá),并調(diào)控NF-κB通路下游一氧化氮合酶、粘附分子和補(bǔ)體因子等蛋白的表達(dá)與活化。ASFVE-70毒株缺失A238L基因后,感染豬PBMC可誘導(dǎo)TNF-α顯著上調(diào)表達(dá)。A238L通過(guò)其結(jié)構(gòu)域競(jìng)爭(zhēng)性地占據(jù)鈣調(diào)神經(jīng)磷酸酶(Calcineurin,CN)底物結(jié)合位點(diǎn),抑制CN與底物結(jié)合,進(jìn)而抑制CN對(duì)T細(xì)胞核因子蛋白(NFAT)進(jìn)行脫磷酸化,阻礙 NFAT向細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)移,實(shí)現(xiàn)對(duì)生理活動(dòng)的調(diào)節(jié)作用。此外,A238L蛋白抑制 iNOS啟動(dòng)子活性,下調(diào)iNOS表達(dá)及其誘導(dǎo)的抗病毒反應(yīng)。
ASFV基因組結(jié)構(gòu)分為左右兩側(cè)可變區(qū)和中央保守區(qū),中央保守區(qū)幾乎不出現(xiàn)大片段的插入和缺失突變,左右兩側(cè)可變區(qū)內(nèi)串聯(lián)排列的多基因家族基因在不同的毒株中具有不同的拷貝數(shù)和互補(bǔ)性。位于可變區(qū)的多基因家族蛋白主要分為5種:MGF100、MGF110、MGF300、MGF360和MGF505/530,在不同的毒株中MGFs具有不同的拷貝數(shù)和序列多樣性。與痘病毒類似,ASFV基因組多樣性來(lái)源于兩端基因組的多樣性,通?;蚪M兩側(cè)可變區(qū)的基因?qū)Σ《倔w外增殖是非必需的,而是參與抑制宿主Ⅰ型干擾素(Interferon,IFN)產(chǎn)生和調(diào)控促炎性細(xì)胞因子表達(dá)等功能。
已有研究表明,MGF360、530/505能夠抑制I型干擾素表達(dá),同時(shí)抑制干擾素的抗病毒效應(yīng),并通過(guò)延長(zhǎng)感染細(xì)胞的存活時(shí)間來(lái)提高病毒在宿主細(xì)胞中的增殖效率和數(shù)量。MGF360家族成員A276R可以抑制Poly(I:C)刺激的I型干擾素上調(diào)表達(dá),而對(duì) I型和 II型干擾素誘導(dǎo)的JAK-STAT途徑和NF-κB信號(hào)通路沒(méi)有抑制作用。MGF505家族成員A528R可以抑制Poly(I:C)刺激的IFN誘導(dǎo)表達(dá),同時(shí)對(duì)I型和II型干擾素誘導(dǎo)的JAK-STAT途徑具有抑制作用。ASFV弱毒株OURT88/3缺失MGF360-10L、11L、12L、13L、14L和MGF530/505-1R、2R及部分MGF530/505-3R后,與母本病毒相比,MGF基因缺失毒株可以在體內(nèi)和體外誘導(dǎo)產(chǎn)生較高水平的IFN,且可提供針對(duì)同源基因I型和其他基因型的攻毒保護(hù)。AS-FV強(qiáng)毒或弱毒株缺失MGF360和530/505后在巨噬細(xì)胞或軟蜱體內(nèi)的復(fù)制效率下降,病毒毒力下降,免疫動(dòng)物后可以提供針對(duì)同源病毒或部分異源病毒的保護(hù)力。
I329L蛋白是ASFV晚期蛋白,含有329個(gè)氨基酸,序列相對(duì)保守。I329L為高度糖基化的 I型跨膜蛋白,分布于感染細(xì)胞的細(xì)胞膜以及病毒囊膜表面。I329L包含信號(hào)肽(1~17 aa)、N-末端的細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域(18~239 aa),跨膜結(jié)構(gòu)域(240~260 aa)和 C末端的細(xì)胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域(氨基酸261~329 aa)。ASFV I329L為T(mén)LR家族蛋白同系物,其胞內(nèi)區(qū)氨基酸序列與TLR3的BOX1和BOX2序列相似性可達(dá) 35%,胞外區(qū)結(jié)構(gòu)域富含亮氨酸的重復(fù)序列(LRR),LRR在幾種 TLRs中均有存在,是蛋白質(zhì)之間相互作用的重要基序。
研究表明,I329L可拮抗TLR3介導(dǎo)的固有免疫激活,抑制dsRNA/Poly(I:C)刺激后誘導(dǎo)的NF-κB和 IRF3信號(hào)通路。TRIF是TLR信號(hào)通路中的關(guān)鍵接頭蛋白,是I329L調(diào)控免疫系統(tǒng)的靶蛋白。對(duì)I329L的構(gòu)象研究表明,該蛋白能夠抑制接頭分子TRIF的活性,進(jìn)而阻斷TRIF介導(dǎo)的 IRF3和 NF-κB激活以及下游細(xì)胞因子的轉(zhuǎn)錄,過(guò)表達(dá)TRIF可以逆轉(zhuǎn)I329L的抑制作用。
3.1.1 A179LA179L蛋白在病毒感染早期和晚期均有表達(dá),分子量大小約為18 kD,含有179個(gè)氨基酸,在不同的ASFV毒株中A179L序列高度保守。A179L是Bcl-2家族成員之一,具有Bcl-2家族成員保守結(jié)構(gòu)域 BH1、BH2、BH3和 BH4,但缺少相應(yīng)跨膜結(jié)構(gòu)域。Bcl-2家族蛋白在細(xì)胞凋亡過(guò)程中起重要作用,主要分為兩大類:一類抗細(xì)胞凋亡,主要包括Bcl-2、Bcl-XL、Bcl-W、Mcl-1、CED9等;一類促進(jìn)細(xì)胞凋亡,主要包括Bax、Bak、Bcl-XS、Bad、Bik、Bid等。
研究表明,A179L主要定位在線粒體或內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。在多種細(xì)胞系中表達(dá)A179L后均能抑制細(xì)胞凋亡。例如,A179L抑制p68誘導(dǎo)的HeLa和BSC-40細(xì)胞凋亡,以及大分子誘導(dǎo)的BSC-40細(xì)胞凋亡。A179L能夠抑制重組桿狀病毒感染單層生長(zhǎng)昆蟲(chóng)細(xì)胞而非懸浮培養(yǎng)細(xì)胞的凋亡,表明A179L抗細(xì)胞凋亡活性可能與細(xì)胞錨定特性有關(guān)。
Galindo等證明A179L可以與促凋亡的僅表達(dá)BH3的截短活性蛋白Bidp13和p15相互作用,抑制其活性;A179L還可以與促凋亡蛋白家族的其他蛋白如 Bad、Bmf、Bik和Bim等相互作用,形成異源二聚體,使得細(xì)胞不進(jìn)入凋亡程序。此外,A179L還通過(guò)與 Beclin-1互作調(diào)節(jié)細(xì)胞自噬,并抑制饑餓條件誘導(dǎo)的自噬體的形成。
3.1.2 A224LA224L蛋白具有224個(gè)氨基酸,在不同的AS-FV毒株中序列相對(duì)保守,同源性為90%~99%。A224L在ASFV感染細(xì)胞晚期表達(dá),是凋亡抑制蛋白(inhibitor of apoptosis proteins,IAP)家族蛋白成員。IAPs是內(nèi)源性抑制細(xì)胞凋亡的蛋白質(zhì)家族,其顯著結(jié)構(gòu)特征是均具有1~3個(gè)桿狀病毒重復(fù)結(jié)構(gòu)(baculorius IAP repeat,BIR)結(jié)構(gòu)域。人的IAPs包括XIAP和cIAP1等,XIAP與caspase-9、caspase-3和caspase-7相互作用,抑制它們的活化以及其所介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡。
在細(xì)胞中穩(wěn)定表達(dá)A224L蛋白能夠抑制TNF-α誘導(dǎo)的caspase3激活及細(xì)胞凋亡,具體機(jī)制涉及對(duì)caspase-3蛋白水解的抑制,可能通過(guò)A224L與caspase-3蛋白水解片段的直接互作,從而干擾細(xì)胞凋亡路徑,促進(jìn)ASFV感染細(xì)胞的存活。Vero細(xì)胞感染A224L基因缺失病毒后,caspase-3的蛋白水解作用顯著增加。此外,有研究表明細(xì)胞瞬時(shí)表達(dá)A224L后能激活NF-κB信號(hào)通路,NF-κB具有抑制細(xì)胞凋亡并促進(jìn)宿主細(xì)胞增殖的功能,對(duì)病毒在細(xì)胞內(nèi)增殖具有促進(jìn)作用。ASFV在不同感染時(shí)期對(duì) NF-κB具有不同的調(diào)控機(jī)制。在病毒感染早期,ASFV表達(dá)A238L對(duì)NF-κB信號(hào)通路產(chǎn)生抑制作用;隨著感染進(jìn)程的推進(jìn),ASFV表達(dá)晚期蛋白A224L,激活NF-κB通路并抑制caspase活性及細(xì)胞凋亡。
3.1.3 EP153REP153R編碼含有153~163個(gè)氨基酸的凝集素類似膜蛋白,EP153R與一些C型凝集素分子的 N-端結(jié)構(gòu)域具有同源性。EP153R在病毒感染期間的早期和晚期均具有表達(dá),為病毒在細(xì)胞增殖的非必需蛋白。EP153R含有中央跨膜區(qū),C型凝集素樣結(jié)構(gòu)(C-type lectin)和細(xì)胞附著序列,蛋白中潛在多個(gè)N-糖基化、磷酸化和豆蔻?;稽c(diǎn)。
EP153R蛋白為多功能蛋白,能夠調(diào)控細(xì)胞凋亡,抑制MHC-I表達(dá),且參與 ASFV感染細(xì)胞后的血細(xì)胞吸附過(guò)程。用缺失EP153R基因后的ASFV BA71V毒株感染細(xì)胞,caspase-3表達(dá)水平及細(xì)胞死亡量顯著增加。在Vero或Cos細(xì)胞中過(guò)表達(dá)EP153R后,p53蛋白的反式激活活性受到抑制,進(jìn)而抑制星形孢菌素或病毒感染誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡。
Hurtado C等模擬了EP153R的3D結(jié)構(gòu),預(yù)測(cè)EP153R的二聚體可能與MHC-I分子具有相互作用。過(guò)表達(dá)和病毒感染實(shí)驗(yàn)表明,EP153R抑制MHC-I的表達(dá),主要通過(guò)抑制MHC-I從內(nèi)質(zhì)網(wǎng)到細(xì)胞膜的胞外分泌過(guò)程,而不是影響MHC-I的表達(dá)及成熟過(guò)程。用缺失 EP153R的NH/P68毒株免疫動(dòng)物后29 d后,可以提供針對(duì)同源病毒AS-FVL60的免疫攻毒保護(hù)。
3.2.1 E183L E183L基因編碼含有183~197個(gè)氨基酸的ASFV膜蛋白p54。p54為ASFV結(jié)構(gòu)蛋白,參與病毒粒子組裝,以及病毒粘附宿主細(xì)胞過(guò)程。過(guò)表達(dá) ASFVE183L基因,可促進(jìn) caspase-3蛋白表達(dá)及核斷裂,進(jìn)而促進(jìn)其介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡。p54包含一個(gè)含有13個(gè)氨基酸的結(jié)構(gòu)域,通過(guò)與胞質(zhì)動(dòng)力蛋白輕鏈相互作用,實(shí)現(xiàn)病毒在細(xì)胞質(zhì)內(nèi)進(jìn)行轉(zhuǎn)運(yùn);這些氨基酸序列與僅表達(dá)BH3的促凋亡蛋白的Bim結(jié)構(gòu)域具有一定相似性,缺失該結(jié)構(gòu)域后,p54便失去誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡的能力。
CD2v是ASFV晚期表達(dá)蛋白,在ASFV感染的細(xì)胞中,CD2v具有三種表達(dá)形式,分別為89kD的全長(zhǎng)糖基化蛋白,及通過(guò)蛋白水解作用產(chǎn)生的大小約為63kD的N-末端糖基化片段和大小約為26 kD的C-末端非糖基化片段。ASFVCD2v與 T細(xì)胞和NK細(xì)胞表達(dá)的CD2結(jié)構(gòu)與功能類似。CD2v蛋白能夠?qū)е录t細(xì)胞吸附于病毒感染細(xì)胞表面,有助于其在宿主體內(nèi)的擴(kuò)散。此外CD2v具有抑制有絲分裂原刺激淋巴細(xì)胞增殖的作用,具體機(jī)制可能是通過(guò)CD2v細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域與淋巴細(xì)胞表面配體的直接相互作用,或通過(guò)CD2v細(xì)胞質(zhì)中結(jié)構(gòu)域與胞質(zhì)蛋白相互作用而介導(dǎo)。EP153R與CD2v為相鄰基因,缺失EP153R后病毒在細(xì)胞中的增殖不受到影響,但ASFV感染細(xì)胞所導(dǎo)致的血細(xì)胞吸附現(xiàn)象基本消失。缺失CD2v后的BA71毒株接種家豬后無(wú)明顯臨床感染癥狀,可以保護(hù)接種豬免受母本病毒的攻擊,還可以提供針對(duì)E75(基因I型)以及 Georgia2007/1(基因 II型)強(qiáng)毒的攻毒保護(hù)。
L83L為ASFV早期表達(dá)蛋白,含有一個(gè)保守的異戊烯化基序,是病毒在巨噬細(xì)胞復(fù)制的非必需蛋白。L83L能夠特異性結(jié)合IL-1β,抑制其抗病毒反應(yīng)。Georgia 2007/1毒株缺失L83L基因后在巨噬細(xì)胞中的復(fù)制能力無(wú)明顯變化,且基因缺失毒株具有與親本 Georgia 2007/1相似的致病力。
針對(duì)入侵病原,機(jī)體進(jìn)化出一系列高度復(fù)雜的免疫機(jī)制以預(yù)防和清除病原體。非洲豬瘟病毒(ASFV)是大DNA病毒,在巨噬細(xì)胞內(nèi)快速增殖,進(jìn)而擴(kuò)散至全身,導(dǎo)致家豬在感染后 2~10 d內(nèi)發(fā)病死亡。ASFV通過(guò)自身蛋白采用多種免疫逃逸機(jī)制以確保病毒的繁殖與擴(kuò)散,從 ASFV毒株中缺失相關(guān)基因后,有助于構(gòu)建具有良好免疫原性和保護(hù)力的多基因工程缺失疫苗。抑制 I型 IFN的產(chǎn)生及其抗病毒效應(yīng)對(duì)于促進(jìn)ASFV增殖至關(guān)重要,不同基因型的ASFV毒株缺失部分MGF360/505基因后,病毒毒力顯著減弱。目前,對(duì)于多基因家族蛋白的作用機(jī)制及是否存在其他病毒蛋白抑制 I型 IFN信號(hào)通路仍是ASFV免疫逃逸機(jī)制研究的熱點(diǎn)。
ASFV的p54結(jié)構(gòu)蛋白是重要的促凋亡因子,在感染細(xì)胞早期即可促進(jìn)細(xì)胞凋亡,但不利于病毒增殖,因此 ASFV感染初期表達(dá)多種抑制凋亡蛋白,如A179L、A224L、EP153R和DP71L等。延長(zhǎng)感染巨噬細(xì)胞的存活及促進(jìn)臨近淋巴細(xì)胞的凋亡是ASFV完成增殖及免疫逃逸的重要機(jī)制,但ASFV如何調(diào)控自身蛋白表達(dá),如何維持促進(jìn)細(xì)胞凋亡與抗凋亡的平衡以完成病毒復(fù)制,以及如何在感染后期引起大量未感染淋巴細(xì)胞及非淋巴組織細(xì)胞的凋亡是今后研究中的重點(diǎn)。
ASFV具有復(fù)雜的基因結(jié)構(gòu),編碼表達(dá)大量病毒復(fù)制非必需蛋白,這些蛋白的功能是什么?有些病毒蛋白具有相似功能,它們對(duì)病毒免疫逃逸和致病力有哪些影響?哪些細(xì)胞受體和宿主蛋白與病毒蛋白產(chǎn)生相互作用?這些問(wèn)題仍有待進(jìn)一步研究。深入研究ASFV病毒免疫逃逸機(jī)制必將有助于了解ASFV的致病機(jī)理,并對(duì)疫苗開(kāi)發(fā)和疾病防控提供指導(dǎo)作用。
(摘自《病毒學(xué)報(bào)》2018年第6期)