楊文濤,謝寶剛,徐顏美,劉亞蘭,鄒書(shū)兵
(1.南昌大學(xué)第二附屬醫(yī)院器官移植科,江西南昌 330006;2.南昌大學(xué)藥學(xué)院,江西南昌33006;3.南昌大學(xué)第二附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科,江西南昌 330006;4.南昌大學(xué)第二附屬醫(yī)院肝膽外科,江西南昌 330006)
原發(fā)性肝細(xì)胞癌(HCC)是最常見(jiàn)的原發(fā)性惡性腫瘤之一,全球每年超過(guò)65萬(wàn)人死于HCC,且其發(fā)病率仍在逐年增加[1-2]。HCC患者早期無(wú)明顯臨床癥狀,發(fā)生隱匿,易發(fā)生轉(zhuǎn)移,往往在發(fā)現(xiàn)時(shí)已為肝癌晚期,因此,盡早發(fā)現(xiàn)和治療是提高HCC患者生存率的關(guān)鍵。當(dāng)前肝癌診斷方法有臨床癥狀、病理檢查、血清甲胎蛋白、影像學(xué)超聲和CT檢查等,但這些方法存在創(chuàng)傷性、靈敏度不高和病癥確定困難等缺點(diǎn)[3-4]。因此,尋找與肝癌發(fā)生、發(fā)展緊密相關(guān)的特征代謝物,有望為肝癌盡早診斷提供可靠、安全和靈敏的生物學(xué)指標(biāo)具有重要的臨床價(jià)值。核磁共振氫譜(1H NMR)是代謝組學(xué)研究最常使用的檢測(cè)方法,是一種高通量生物代謝物指紋檢測(cè)技術(shù),基于原子的自旋特性通過(guò)磁場(chǎng)和射頻脈沖而作用于原子核,氫原子普遍存在于代謝物中[5-6]。1H NMR具有對(duì)樣品非破壞性、檢測(cè)物質(zhì)多樣性和準(zhǔn)確、分辨率高等優(yōu)點(diǎn)[7]。本研究應(yīng)用1H NMR方法研究了HCC患者血清的代謝組特征,旨在篩選出可靠的標(biāo)志性代謝物。
1.1標(biāo)本來(lái)源 收集南昌大學(xué)第二附屬醫(yī)院感染性疾病科及肝膽外科收治的肝炎及HCC患者血清作為病例組,診斷標(biāo)準(zhǔn)參照《乙型病毒性肝炎診斷標(biāo)準(zhǔn)》(WS299-2008)[8]。同期收集各項(xiàng)體檢指標(biāo)正常的健康體檢者血清作為對(duì)照組。所有研究對(duì)象均簽署知情同意書(shū),于清晨空腹采取靜脈血3 mL,3 000 r/min離心10 min,獲得血清標(biāo)本,置于-80 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2樣品預(yù)處理 室溫解凍保存的血清樣品,每管吸取200 μL,加入800 μL甲醇沉淀蛋白,充分漩渦振蕩后靜置10 min,12 000 r/min離心5 min,再取上清液850 μL于干凈的1.5 mL EP管中,使用高速真空旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀烘干。烘干后加入460 μL蒸餾水將濃縮物復(fù)溶,渦旋振蕩,超聲至溶解,取上清液445 μL至EP管中,依次加入磷酸緩沖液50 μL,TSP重水溶液50 μL,渦旋振蕩混勻,12 000 r/min離心10 min,取上清液500 μL裝入5 mm核磁管中,進(jìn)行1H NMR檢測(cè)。
1.31H NNR試驗(yàn) 采用AvanceⅡ-600MHz核磁共振儀(Bruker公司)檢測(cè)。打開(kāi)氣源開(kāi)關(guān),待輸出氣壓平穩(wěn),按啟動(dòng)程序按鈕,將樣品放入核磁共振儀中,打開(kāi)聯(lián)機(jī)電腦上Topspin軟件,輸入edc對(duì)核磁樣品進(jìn)行命名區(qū)分,輸入Lock選用實(shí)驗(yàn)樣品所用的氘代試劑比例90%H2O+10%D2O鎖場(chǎng);輸入Atma命令進(jìn)行自動(dòng)調(diào)諧以獲得最佳靈敏度;輸入topshim使樣品處于一個(gè)均勻的磁場(chǎng)中,勻場(chǎng)完全后輸入zg進(jìn)行采樣使重新掃描產(chǎn)生結(jié)果,掃描采樣結(jié)束后在命令行輸入tr保存已采集的數(shù)據(jù)點(diǎn)。再直接輸入fp及apk相位轉(zhuǎn)換處理得完整1H NMR譜圖。
1.41H NMR譜的數(shù)據(jù)預(yù)處理和聚類分析 采用Topspin軟件將所有樣品1H NMR譜進(jìn)行自動(dòng)積分,手動(dòng)進(jìn)行相位校正和基線校準(zhǔn)。應(yīng)用Matlab軟件對(duì)不同指紋圖譜進(jìn)行處理,將所有樣本指紋圖譜達(dá)到較高擬合度。為減少樣品濃度誤差帶來(lái)的干擾,將處理好的1H NMR全譜數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化,根據(jù)不同組別樣品進(jìn)行分組編號(hào),觀察樣品的聚離程度,刪除異常點(diǎn),再輸入SIMCA-P+分析軟件進(jìn)行多元統(tǒng)計(jì)模式識(shí)別分析,包括主成分分析(PCA)、偏最小二乘法判別分析(PLS-DA)和正交校正偏最小二乘法-判別分析(OPLS-DA),所有類聚分析scale均采用UV及CTR中心化處理算法,以分辨所有樣品不同代謝狀態(tài)。通過(guò)PLS-DA模型和OPLS-DA模型的變量分析獲得重要影響值(VIP,其值越大提示該變量越重要)及Loadings值繪制得到VIP荷載圖,以顏色對(duì)核磁峰的VIP值進(jìn)行編碼,顏色越紅表示該代謝物差異越顯著,顏色越藍(lán)表示該代謝物差異越不明顯。將候選特征峰VIP值>1.5的差異變量所在區(qū)間找出來(lái),結(jié)合核磁峰的化學(xué)位移和峰形分裂特征,利用2維全相關(guān)譜(TCOSY)、網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.bmrb.wisc.ed,http://mdl.imv.liu.se,http://www.hmdb.ca)及借助標(biāo)準(zhǔn)品對(duì)照鑒定和確證特征代謝物。根據(jù)1H NMR圖譜選擇峰形干擾較小部分進(jìn)行積分,得差異代謝物積分值將其進(jìn)行對(duì)數(shù)加5變換,再采用SPSS19.0統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)4組數(shù)據(jù)進(jìn)行方差分析,篩選與肝癌發(fā)生、發(fā)展相關(guān)的血清特征代謝物組。
1.5統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS19.0統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,對(duì)乙型肝炎、HCC、健康體檢組血清代謝物的歸一化面積值進(jìn)行方差分析,以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1各組研究對(duì)象血清1H NMR譜代謝物成分及比較 健康對(duì)照組、肝炎DNA陰性組、肝炎DNA陽(yáng)性、肝癌研究對(duì)象血清1H NMR圖譜中化學(xué)位移從δ為0.5~2.3的區(qū)域,放大后可明顯看出4組之間相同輪廓的相對(duì)峰高存在差異。見(jiàn)圖1。
圖1 各組研究對(duì)象血清1H NMR譜代謝物成分及比較
2.2各組研究對(duì)象組血清1H NMR圖譜聚類分析
2.2.1PCA 健康對(duì)照組和乙型肝炎組代謝物聚集在左下區(qū)域,而肝癌組代謝物聚集在右上區(qū)域,提示乙型肝炎組與健康者代謝特征存在相似性,并能較好地與肝癌組區(qū)分開(kāi)。見(jiàn)圖2。
2.2.2PLS-DA 健康對(duì)照組和乙型肝炎組代謝物聚集在右側(cè)區(qū)域,而肝癌組代謝物聚集在左側(cè)區(qū)域。見(jiàn)圖3。
注:A組為健康對(duì)照組;B組為乙型肝炎DNA陰性組;C組為乙型肝炎DNA陽(yáng)性組;D組為肝癌組
圖2各組研究對(duì)象血清樣品1H NMR檢測(cè)結(jié)果PCA得分圖
2.2.3OPLS-DA 各組樣品聚類明顯,且左邊肝癌組與其他組能顯著區(qū)分。見(jiàn)圖4。
注:A組為健康對(duì)照組;B組為乙型肝炎DNA陰性組;C組為乙型肝炎DNA陽(yáng)性組;D組為肝癌組
圖3各組研究對(duì)象血清樣品1H NMR檢測(cè)結(jié)果PLS-DA得分圖
2.3健康對(duì)照組、乙型肝炎組、HCC組研究對(duì)象血清聚類差異獲得候選特征峰 各組研究對(duì)象VIP荷載圖結(jié)果見(jiàn)圖5。
注:A組為健康對(duì)照組;B組為乙型肝炎DNA陰性組;C組為乙型肝炎DNA陽(yáng)性組;D組為肝癌組
圖4各組研究對(duì)象血清樣品1H NMR檢測(cè)結(jié)果OPLS-DA得分圖
注:1為脂質(zhì);2為亮氨酸;3為異亮氨酸;4為纈氨酸;5為丙氨酸;6為醋酸;7為琥珀酸;8為?;撬?/p>
圖5各組研究對(duì)象血清1H NMR圖譜VIP荷載圖
2.4與肝癌發(fā)生、發(fā)展相關(guān)的血清特征代謝物組的篩選 各組研究對(duì)象相關(guān)特征峰信息見(jiàn)表1。
表1 各組研究對(duì)象相關(guān)特征峰信息
續(xù)表1 各組研究對(duì)象相關(guān)特征峰信息
注:δ1H表示代謝化合物氫的位移;s、d、t、m、q分別表示代謝產(chǎn)物的峰型為單重峰、雙重峰、三重峰、多重峰、四重峰;與健康對(duì)照組比較,*P<0.05;與肝炎DNA陰性組比較,#P<0.05;與肝癌組比較,△P<0.05
代謝異常是腫瘤發(fā)生的又一重要原因,肝臟是人體重要的物質(zhì)代謝器官,肝癌的代謝物研究備受關(guān)注。核磁共振技術(shù)在代謝組學(xué)研究中最為常用,其優(yōu)點(diǎn)在于不破壞樣本的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)、對(duì)化合物檢測(cè)無(wú)偏倚、實(shí)驗(yàn)方法靈活、預(yù)處理簡(jiǎn)單、可設(shè)計(jì)多種編輯手段、并可在接近生理?xiàng)l件下進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。
目前,已有部分文獻(xiàn)報(bào)道,利用代謝組學(xué)技術(shù)尋找肝癌特征生物指標(biāo)物[9-10]。早在2003年ROONEY等[11]成功利用NMR技術(shù)對(duì)乳酸誘導(dǎo)下發(fā)生脂肪變的小鼠肝臟組織進(jìn)行了代謝組學(xué)檢測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn),實(shí)驗(yàn)組小鼠葡萄糖、甜菜堿和三甲胺N-氧化物水平均存在顯著差異,提示該技術(shù)可行。隨后YIN等[12]應(yīng)用高效液相色譜-電噴霧質(zhì)譜(HPLC-MS)聯(lián)合技術(shù)分析慢性乙型肝炎、急性肝衰竭患者血清代謝組學(xué),結(jié)果發(fā)現(xiàn),4種溶血卵磷脂和1種膽汁酸可作為診斷肝衰竭的潛在血清標(biāo)記物。CAO等[13]采用UPLC-MS技術(shù)發(fā)現(xiàn),LC與HCC患者排泄物中的原溶血卵磷脂、尿膽素、鵝去氧膽酸二聚體差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),提示膽酸合成與分泌及溶血卵磷脂的吸收障礙在LC和HCC發(fā)展過(guò)程中具有重要因素。我國(guó)學(xué)者WANG等[14]同樣應(yīng)用HPLC-MS技術(shù)發(fā)現(xiàn)了13種潛在生物標(biāo)記物顯著干擾肝癌的關(guān)鍵代謝途徑,如有機(jī)酸、脂肪酸、膽汁酸、磷脂類和腸道菌群等的代謝。TAN等[15]應(yīng)用HPLC-MS分析比較了肝癌和肝硬化患者血清代謝變化,結(jié)果發(fā)現(xiàn),二氫神經(jīng)鞘氨醇和植物鞘氨醇在HCC下降明顯,可能作為HCC的腫瘤標(biāo)志物,并表明代謝組學(xué)研究中許多脂類代謝產(chǎn)物在肝癌患者血清與健康者血清中存在較大差異。
為進(jìn)一步探索乙型肝炎、肝癌患者有顯著差異的代謝物標(biāo)志物,本研究基于1H NMR技術(shù)對(duì)健康者、乙型肝炎DNA陰性者、乙型肝炎DNA陽(yáng)性者和HCC患者血清代謝物進(jìn)行了分析。與對(duì)照組比較,乙型肝炎DNA陰性組患者血清中有12種代謝物質(zhì),如乳酸、丙氨酸、磷酸膽堿等顯著降低;乙型肝炎DNA陽(yáng)性組患者血清中有15種代謝物質(zhì)差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),其中5種物質(zhì),如亮氨酸、?;撬岬人较陆?,9種代謝物質(zhì),如醋酸、膽堿等水平上升。與乙型肝炎DNA陽(yáng)性患者比較,乙型肝炎DNA陰性患者血清中有14種代謝物質(zhì)具有顯著差異,其中4種代謝物,如谷氨酰胺、甲酸水平下降,10種代謝物,如亮氨酸、乳酸水平上升。乙型肝炎DNA陰性組、乙型肝炎DNA陽(yáng)性組與健康對(duì)照組之間均存在水平有差異的代謝物,提示在乙型肝炎期某些代謝物水平已出現(xiàn)明顯紊亂,也為尋找肝癌發(fā)生、發(fā)展相關(guān)特征代謝物提供了證據(jù)。此外,本研究還篩選出21種與HCC發(fā)生、發(fā)展相關(guān)的代謝物標(biāo)志物,其中僅有苯乙尿酸水平上升,其他代謝物,如異亮氨酸、膽堿、纈氨酸等均下降。
苯乙尿酸是嘌呤代謝產(chǎn)物,其水平增多,可能與肝臟病變時(shí)代謝障礙所致。飲酒是高尿酸血癥的相關(guān)危險(xiǎn)因素,也是肝臟損傷的直接危險(xiǎn)因素,但苯乙尿酸代謝增多與肝癌發(fā)生、發(fā)展的機(jī)制仍需進(jìn)一步研究探討。
本研究通過(guò)1H NMR有效篩查出乙型肝炎、肝癌患者之間21種具有顯著差異的血清代謝物,在無(wú)創(chuàng)診斷HCC方面具有廣闊應(yīng)用前景。但由于存在種族、地域等差異,該結(jié)果仍需進(jìn)一步的多中心實(shí)驗(yàn)證實(shí)。