10.3971/j.issn.1000-8578.2019.04.0001
近日,一套適用于中國人群的腫瘤大數(shù)據(jù)精準(zhǔn)診療模型由西安交通大學(xué)計算機科學(xué)與技術(shù)系生物信息計算團隊提出,該研究首創(chuàng)了基于復(fù)雜克隆模式下分子演化時序路徑的預(yù)測模型,實現(xiàn)了預(yù)測腫瘤免疫微環(huán)境、患者生存期、臨床預(yù)后等的預(yù)測。研究成果以《腫瘤克隆結(jié)構(gòu)預(yù)測腎透明細(xì)胞癌臨床預(yù)后》為題發(fā)表于3月18日的《自然-通訊》雜志。
據(jù)介紹,該研究突破了多組學(xué)數(shù)據(jù)融合的技術(shù)難點和多靶標(biāo)聯(lián)合分型的計算瓶頸,在克隆結(jié)構(gòu)相對復(fù)雜的腎癌大數(shù)據(jù)中成功應(yīng)用,首次繪制出腎癌細(xì)胞演化的分子特征數(shù)據(jù)畫像,復(fù)現(xiàn)出腫瘤細(xì)胞演化中內(nèi)源性、外源性因素交互作用的歷史痕跡。
需要特別指出的是,該研究集中整理了公開數(shù)據(jù)庫中的大隊列海量數(shù)據(jù),系統(tǒng)地分析比較了中國人、日本人與歐美人的體細(xì)胞突變特征圖譜,深入挖掘了體細(xì)胞突變特征與遺傳風(fēng)險圖譜的交互作用,首次在大數(shù)據(jù)中觀測到不同人群在腫瘤演化的不同階段可能也受到不同內(nèi)源性因素推動的關(guān)鍵證據(jù)。研究提示,中國人群呈現(xiàn)出特有的腫瘤克隆結(jié)構(gòu)和演化模式,不宜在臨床診療實踐盲從基于歐美人大數(shù)據(jù)獲得的決策標(biāo)準(zhǔn)。(來源:中國教育新聞網(wǎng))