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教師科研項目在實驗教學改革中的應用

2018-12-13 01:22:12李文芬顏亨梅
生物學雜志 2018年6期
關鍵詞:獵物蜘蛛定量

汪 波, 李文芬, 顏亨梅

(北京師范大學珠海分校 工程技術學院, 珠海 519085)

作為理論教學配套的教學方式,實驗教學注重的是學生親自體驗和觀察,是培養(yǎng)學生動手能力和創(chuàng)新思維的主要環(huán)節(jié)[1]。目前,教學實驗的種類主要包括基礎驗證性實驗和綜合設計、探究性實驗[2]。相比較而言,由于設計、探究性實驗在培養(yǎng)學生綜合素質、提高科研創(chuàng)新能力方面的獨特優(yōu)勢[3],在教學內容的設置上,各高校正逐漸加大其比例,為培養(yǎng)應用型、創(chuàng)新型人才打基礎[4]。

我院生物技術專業(yè)作為省級戰(zhàn)略新興產業(yè)特色專業(yè)建設對象,尤為重視培養(yǎng)學生發(fā)現問題、解決問題的能力,對實驗教學內容、教學方法、考核方式進行多方面改革嘗試,通過對大三學生開設生物技術綜合技能訓練實驗課程,在其前期掌握的知識與技能上,進行研究性實驗的設計、開展與總結,培養(yǎng)學生獨立思考的能力?;诖四康?,實驗內容的選擇與設置成為關鍵。教師是教學改革的主體[5],通過帶動學生參與科研項目,既可以讓學生了解學科發(fā)展前沿[6],也可以幫助教師完成實驗項目內容。因此,我們對此進行了探索和嘗試,并將完成過程記錄如下。

1 實驗項目的選擇和設置

生物技術綜合技能訓練實驗課程安排在大三第二學期,學生已經完成動物生物學、生物化學、分子生物學、生物統(tǒng)計學等課程的理論學習,初步掌握了相關實驗技能。如何通過該課程的訓練,促使學生掌握基本的實驗設計、項目執(zhí)行與開展、數據總結等科研技能,解決實際問題[7],是實驗項目設置需要考慮的首要原則。

主持的國家自然科學基金項目“基于分子生物技術的蜘蛛攝食生態(tài)學分析及控蟲效能評價”主要通過定性、定量研究蜘蛛捕食獵物的種類和消化速率。定性研究方面,利用形態(tài)學觀察和DNA條形碼技術研究蜘蛛消化道內獵物的種類;定量研究方面,利用常規(guī)PCR技術和實時熒光定量PCR技術分析蜘蛛捕食不同數量獵物后的消化速率,詳細實驗內容如下。

1)定性實驗:DNA條形碼與物種鑒定。

室內觀察擬環(huán)紋豹蛛捕食昆蟲的種類,分為果蠅組、蚜蟲組、稻飛虱組等,將捕食獵物后的擬環(huán)紋豹蛛處死,在顯微鏡下解剖取消化道備用,提取DNA,鑒定DNA質量,設計CO-Ⅰ基因引物,設置退火溫度、時間梯度,鎂離子濃度梯度等,PCR擴增,凝膠電泳檢測基因擴增情況,回收、測序,BLAST,分析擬環(huán)紋豹蛛消化道內獵物種類。具體實驗內容和要求見表1。

2)定量實驗:qPCR技術測定蜘蛛捕食獵物后消化速率。

通過設置進食不同數量獵物的蜘蛛組、消化獵物不同時間的蜘蛛組、不同溫度下消化的蜘蛛組,要求學生前期查閱文獻和預實驗,設置單因子梯度,進行普通PCR實驗,利用Gel-Proanalyzer軟件對比marker和擴增產物條帶亮度,估算基因含量,繪制蜘蛛體內獵物DNA含量和捕食獵物數量、消化時間的關系曲線,選擇條件合適的實驗組進行實時熒光定量PCR,具體實驗內容和要求見表2。

表1 DNA條形碼技術鑒定捕食獵物種類實驗安排

表2 PCR測定蜘蛛捕食獵物后消化速率實驗安排

2 實驗項目的實施過程

第1周進行實驗分組(按照狼蛛捕食獵物種類分為果蠅組、蚜蟲組、葉蟬組、稻飛虱組等,每組5~6人)和教學計劃的講解,要求學生掌握整個學期的大體實驗思路與實驗流程,安排學生查閱DNA條形碼原理和技術、食性分析方法、實時熒光定量PCR原理和技術等方面的文獻,并做出讀書筆記。

實驗項目按照先易后難的原則進行安排,第2至第9周先進行定性分析實驗,要求學生熟練掌握動物顯微解剖、DNA提取、引物設計和評價、PCR擴增、BLAST等理論知識和實驗技術,確認能利用DNA條形碼技術分辨蜘蛛體內液態(tài)獵物后再進行定量分析實驗。

同樣,第11至第13周引導學生進行實驗梯度設計,利用常規(guī)PCR和電泳凝膠定量法分析蜘蛛消化獵物的速率,通過半定量技術鑒定體內獵物DNA模板量差異顯著的蜘蛛組作為后續(xù)實驗樣品,要求學生查閱文獻,掌握實時熒光定量PCR技術原理,第14至第16周再進行實時熒光定量PCR擴增,保證實驗的可行性。

由于課堂教學時間的限制,部分耗時較長的、操作簡便的教學內容,被安排在課外執(zhí)行,作為省級實驗教學示范中心,我院一直實行開放實驗室制度,這有力地保障了實驗教學進度的正常進行。具體實驗教學計劃見表3。

表3 實驗教學計劃Table 3 Experimental teaching plan

3 實驗教學過程中的質量控制

實驗考核方案的合理性嚴重制約教學質量[8],為了更好地培養(yǎng)學生創(chuàng)新思維和科研技能,采取了注重實驗參與過程和實驗總結的多元化考核方式,主要從以下幾個方面對學生進行綜合評價。

3.1 學生學習主動性考察

蜘蛛捕食獵物種類、蜘蛛可捕食獵物最大數量、蜘蛛消化獵物所需最長時間,PCR擴增條件設置等實驗方案均需學生自行設計,在正式實驗開始前,要求學生課外先完成預實驗,以保證實驗梯度設計的合理性。實驗報告能有效記錄學生完成實驗的全過程,要求學生課前完成實驗設計、課中培訓實驗技能、課后分析實驗數據,重點是對實驗過程中遇到的問題、以及解決方法進行梳理,培養(yǎng)學生解決實際問題的能力。例如學生在進行DNA條形碼鑒定蜘蛛體內獵物種類實驗時,之前接觸的常規(guī)PCR擴增普遍是驗證性實驗,引物設計、PCR擴增條件設定都是按照實驗步驟進行,按部就班的實驗未能使學生完全理解各項實驗條件設置的內涵[9],對引物設計原則理解也不透徹,導致電泳檢測擴增產物時發(fā)現多次出現100 bp的非目標條帶,查閱文獻后猜測其為引物二聚體,于是通過重新設計引物、提高退火溫度,降低Mg溶度,降低非特異擴增概率,最終成功解決問題。

3.2 實驗技能和科研素質的考察

實驗教學基本教學目的是培養(yǎng)學生掌握相關的實驗技能,更深一步的是培養(yǎng)學生具備觀察問題、分析問題、解決問題的科學素養(yǎng),其中最關鍵的是促使學生養(yǎng)成實事求是的科研態(tài)度,基于此目的,學生必須記錄原始數據、圖片等,并于實驗結束后立刻提交,類似于凝膠成像系統(tǒng)、實施熒光定量PCR儀等設備中記錄的內容要求以“小組+日期+記錄人”命名,保留原始數據備案,一來有利于學生在實驗受阻后分析問題根源,二來方便教師檢查學生實驗進展。

3.3 團隊協(xié)作能力的考察

實驗項目都是綜合設計性實驗,任務量大,部分實驗內容還需要課外完成,因此實驗內容主要以小組形式完成,這就要求團隊成員之間通力合作,通過組員之間互相監(jiān)督、評價,提高學生參與度;同時PPT匯報時候,小組匯報人由指導教師隨機抽取或者組員自己抽簽確定,避免個別不主動學生影響全組學習積極性[10],能夠較好地保證每個學生對實驗方案設計、實驗內容執(zhí)行、實驗數據總結全過程的掌握。

表4 考核方案

4 實驗教學改革執(zhí)行后的教學效果評價

4.1 培養(yǎng)學生掌握基本的實驗技能

生物技術綜合技能訓練實驗課程充當著完成生物技術專業(yè)大實驗的功能,將前期所學的基礎驗證性實驗串聯(lián)成完整的實驗體系[11],幫助學生鞏固掌握基本的實驗技能,如動物顯微解剖技術、DNA提取和檢測、BLAST、實時熒光定量PCR技術等,在此基礎上,培養(yǎng)學生具備完整實驗設計的能力,從整體教學過程來看,基本達到了教學目的。例如定性檢測實驗過程中,學生沒有意識到對照實驗的重要性,擴增CO-Ⅰ基因后,無法分析測序結果,分析實驗過程發(fā)現只考慮不加模板情況,未設置陰性對照組,導致假陽性結果(擴增產物為獵物CO-Ⅰ基因和蜘蛛CO-Ⅰ基因混合物)的出現, 最終通過提高引物特異性解決問題。

4.2 提高學生科研素質和創(chuàng)新思維

實驗教學不單要完成教學目的和要求,鍛煉學生掌握基本的實驗技能,更重要的是培養(yǎng)學生主動分析問題和解決問題的科研素質,激發(fā)學生創(chuàng)新思維。通過實驗項目的訓練,絕大部分學生基本能夠掌握文獻檢索、資料收集、資料分類和篩選能力;根據實驗目的進行初步實驗設計;自行合理安排課內、外時間完成實驗;對實驗數據進行統(tǒng)計、分析;實驗受阻時候能夠主動分析問題,查閱資料,提出解決方案;項目式的實驗內容要求學生合作完成,鍛煉了學生的協(xié)作能力[12],更重要的是,提前引導學生進行科研訓練,在一定程度上有助于改善學院教學與科研脫節(jié)的狀況,激發(fā)學生的創(chuàng)新思維[13]。例如:半定量的實驗方法就是學生在DNA電泳檢測時候,觀察到Marker條帶的亮度和提取的DNA樣品亮度不同,Marker濃度是固定的,因此聯(lián)想到條帶灰度不同是否代表DNA濃度不同,查閱文獻和資料,發(fā)現確實有軟件可以根據光密度進行線性分析,估算樣品的上樣量。

近年來,教學團隊指導的學生科研成果提升明顯,共獲大學生創(chuàng)新訓練項目國家級1項、省級4項,省科技攀登計劃資金項目2項,學生發(fā)表論文5篇,較大程度上激發(fā)了學生參與科研的興趣。

4.3 改善了教師的教學和科研水平

將教師科研項目與實驗教學相結合,引入學科發(fā)展前沿動態(tài),不僅提高了學生的參與度,而且促使學生融會貫通所學知識,提升了教學效果[14],課程教學質量評價結果顯示,學生評教為優(yōu)秀,但同時,也對教師提出了更高的要求,教師需要根據專業(yè)培養(yǎng)計劃的要求,對實驗內容進行適當調整,增加學科前沿知識與技術比例,激發(fā)學生興趣,以項目制教學方式改善教師教學水平;另一方面,也督促教師關注學科發(fā)展動態(tài),提升教師科研水平。

5 教學改革方案推廣的可行性建議

實踐證明,通過將教師科研項目引入實驗教學內容,達到了較好的“教學相長”的教學效果,既有助于提高學生綜合素質和科學素養(yǎng),也加強了教師的教學科研水平。從整體流程中可以看出,教學改革方案的關鍵在于實驗項目的選取和設計,既要滿足學科經典知識點和實驗技能的掌握,同時也要引導學生追蹤學科前沿[15],這也是教師科研項目研究的出發(fā)點,因此如何把握這兩者之間的過渡與銜接關系到教學改革的成敗,這個就需要教師與學生之間具有良好的溝通,及時根據實驗過程中的反饋進行及時調整與更新,以保障實驗教學的順利進行。

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