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某市區(qū)嬰幼兒腹瀉A組輪狀病毒感染狀況及基因分析*

2018-08-29 06:39劉愛玲劉愛勝
中國醫(yī)學(xué)裝備 2018年8期
關(guān)鍵詞:血清型感染率分型

劉愛玲 劉愛勝 吳 敏

輪狀病毒(rotavirus,RV)是1973年首次由澳大利亞Bishop等科學(xué)家所發(fā)現(xiàn),是引起嬰幼兒腹瀉的主要病原體[1]。RV感染具有普遍性、易感性、易變異及RV血清型多等特點(diǎn),且不同地區(qū)、不同年份RV流行特征明顯不同,即使同一地區(qū)不同季節(jié)、不同年份RV感染和血清型流行情況也不一樣,甚至同一地區(qū)同一種型別也可能存在多種毒株同時(shí)流行[2]。因此,不同地區(qū)、不同年份加強(qiáng)對(duì)RV感染和血清型流行特征進(jìn)行不定時(shí)監(jiān)測,對(duì)防治RV感染性嬰幼兒腹瀉具有重要意義。本研究對(duì)深圳市龍華區(qū)門診腹瀉嬰幼兒的A組RV感染和G血清型、P血清分型情況進(jìn)行了調(diào)查分析,為防治RV性腹瀉提供科學(xué)依據(jù)。

1 資料與方法

1.1 一般資料

收集2016年1月至2017年3月在深圳市龍華區(qū)人民醫(yī)院門診就診的1033例腹瀉嬰幼兒的1033份糞便標(biāo)本,其中男性438例,女性595例;年齡0~5歲,平均年齡(2±2.18)歲。按年齡將其分為<0.5歲組(125例)、0.5~1歲組(492例)、1~3歲組(305例)和>3歲組(111例)4組。門診嬰幼兒腹瀉診斷標(biāo)準(zhǔn):每日大便次數(shù)增加(≥3次)或大便性狀發(fā)生明顯改變(包括稀水樣、蛋花樣、黏液樣或稀糊樣等)[2-3]。該研究經(jīng)醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)后實(shí)施,并經(jīng)嬰幼兒家長知情同意并簽定知情同意書。

1.2 儀器與試劑

CEQ8800型測序儀及配套試劑由美國Beckman公司提供;瓊脂糖凝膠電泳儀及配套試劑由美國Bio-Rad公司提供;核酸提取試劑盒由美國Qiagen公司提供;RT-聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)試劑盒由美國Invitrogen公司提供;RV抗原檢測試劑盒由艾博生物醫(yī)藥(杭州)有限公司提供。

1.3 檢測方法

(1)標(biāo)本采集。采集門診腹瀉嬰幼兒急性期糞便,置于無菌容器內(nèi),立即送至檢驗(yàn)科用膠體金免疫層析法進(jìn)行RV抗原檢查,對(duì)A組RV陽性的糞便標(biāo)本用生理鹽水混勻,制成10%的懸液,于-80℃保存,為進(jìn)行RV的G血清型和P血清型分型備用。

(2)RV抗原檢測。采用膠體金免疫層析法對(duì)腹瀉標(biāo)本中RV抗原進(jìn)行檢測,操作按試劑盒說明書進(jìn)行。

(3)RV分型。①RV病毒核酸提取,RV病毒核酸提取嚴(yán)格按照試劑盒說明書進(jìn)行,在提取的80 μl核酸標(biāo)本中加入RNA酶抑制劑1.5 μl(40 U/μl),于-80 ℃保存?zhèn)溆茫虎谝镞x擇,采用套式PCR對(duì)RV病毒進(jìn)行G血清型和P血清型分型。

(4)G血清型分型。一次放大采用編碼VP7基因兩端的保守序列設(shè)計(jì)引物(正鏈引物9Con1,負(fù)鏈引物9Con2),放大基因的全長序列,二次放大正鏈引物選擇基因的不同血清型的特征設(shè)計(jì)一組分型引物(9T1、9T2、9T3、9T4、9T9B),正鏈引物為基因5’端保守序列的公用引物(9Con1)。這樣從放大產(chǎn)物的特征分子量大小即可區(qū)別RV樣品的不同血清型[4]。

(5)P血清型分型。引物設(shè)計(jì)原理與G血清型分型類似,一次放大引物(4Con3和4Con2)選擇在VP4基因的高保守序列,二次放大負(fù)鏈引物選擇一次放大基因區(qū)段內(nèi)不同血清型的特征序列,設(shè)計(jì)一組分型引物(1T1、2T1、3T1、4T1、5T1),正鏈引物仍采用5’端的公用引物(4Con3),引物由美國Invitrogen公司合成[5]。引物序列見表1。

(6)巢式PCR。采用RT-PCR法對(duì)提取的核酸進(jìn)行擴(kuò)增。反應(yīng)體系為模板RNA 1 μl,2×Reaction Mix(containing 0.4 mmol/L of each dNTP,3.2 mM MgSO)5 μl,引物0.15 μmol/L,SurperScriptTMⅢ RT/Platium Taq Mix 0.4 μ l, RNase inhibitor0.05 μl,總體積10 μl。

(7)RT-PCR反應(yīng)。RT-PCR反應(yīng)條件為50 ℃30 min→94 ℃ 10 min,然后94 ℃ 30 s→56 ℃ 30 s→68 ℃2 min,反復(fù)循環(huán)35次后于68 ℃延伸5 min。將RTPCR產(chǎn)物稀釋100~10 000倍后進(jìn)行PCR。PCR反應(yīng)條件:94 ℃ 5 min,然后94 ℃ 30 s→58 ℃ 30 s→68 ℃90 s,反復(fù)運(yùn)行25個(gè)循環(huán)后于68 ℃延伸7 min。

1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

采用SPSS 20.0統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)檢測結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,計(jì)數(shù)資料采用率(%)表示,組間比較采用x2檢驗(yàn),以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 A組RV感染情況

在1033份門診嬰幼兒腹瀉標(biāo)本中共檢出A組RV抗原436份,陽性率為42.21%(436/1033),其中男性為44.06%(193/438),女性為40.84%(243/595),男性略高于女性,但差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=1.032,P>0.05)。

2.2 不同年齡嬰幼兒A組RV感染情況

0.5~1 歲組嬰幼兒A組RV感染率最高,陽性率為61.18%,明顯高于其他年齡組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=9.762,P<0.05),其次為1~3歲組,陽性率為33.11%,見表2。

表1 A組輪狀病毒G和P分型引物序列情況

表2 不同年齡腹泄嬰幼兒A組RV感染情況

表3 腹泄嬰幼兒A組RV感染季節(jié)分布情況

2.3 A組RV感染季節(jié)分布情況

每年第4季度A組RV感染率最高,陽性率為53.54%,略高于1季度的47.99%,但差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=1.032,P>0.05),但明顯高于其他兩個(gè)季度,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=4.135,x2=5.415;P<0.05),見表3。

2.4 A組RV的G血清型分布情況

4 3 6 例R V陽性標(biāo)本中G 3血清型檢出率最高,為53.21%(232/436),明顯高于G1血清型的31.42%(137/436)、G2血清型的2.75%(12/436)、G4血清型的2.06%(9/436)和G9血清型的1.61%(7/436),其差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=3.854,x2=6.751,x2=11.582,x2=19.192;P<0.05)。不同G血清型混合感染率為4.59%(20/436),且以混合感染G3G1血清型為主,占55.0%(11/20)。不能確定G血清型有19例,占4.36%。

2.5 A組RV的P血清型分布情況

436例RV陽性標(biāo)本P[8]血清型檢出率最高,陽性率為79.82%(348/436)株,明顯高于P[1]血清型的5.28%(23/436)、P[4]血清型的2.52%(11/436)、P[9]血清型的1.83%(8/436)及P[6]血清型的1.61%(7/436),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=27.025,x2=31.635,x2=40.924,x2=49.516;P<0.05)。不同P血清型混合感染率3.90%(17/436)。未知P血清型22株,占5.05%(22/436)。

2.6 A組RV的G血清和P血清型混合感染情況

RV的G和P血清型混合感染主要見于G3P[8]和G1P[8]血清型,陽性率分別為43.58%(190/436)和28.90%(126/436),其次為G2P[8]血清型和G3G1P[8]血清型。此外,還檢測到其他較少見的混合感染株,見表4。

表4 腹泄嬰幼兒不同RV的G和P血清型混合感染情況

2.7 凝膠電泳分析

取3~8 μl的PCR產(chǎn)物,采用1.2%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(60 min/120 V),并采用凝膠成像分析系統(tǒng)分析電泳結(jié)果,如圖1、圖2所示。

圖1 輪狀病毒RT-PCR特異性產(chǎn)物電泳圖

圖2 RV PCR陽性產(chǎn)物測序圖

3 討論

隨著抗生素的廣泛應(yīng)用,以及人們生活水平的提高及衛(wèi)生習(xí)慣的改善,細(xì)菌性腹瀉得到了有效控制,而病毒性感染成為全球嬰幼兒急性腹瀉的重要原因[6]。RV感染性腹瀉是嬰幼兒常見疾病之一,臨床主要表現(xiàn)為腹瀉和嘔吐,各個(gè)年齡段均有發(fā)生,主要易發(fā)于兒童、老年人、旅游者及免疫受抑制者, 尤其是嬰幼兒,不僅發(fā)病率高,而且是嬰幼兒死亡的主要原因之一,僅次于肺炎排在第2位[7]。2008年據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)統(tǒng)計(jì),RV感染造成約45萬幼嬰兒死亡,其中大約90%RV感染死亡病例發(fā)生在亞洲和非洲,我國每年約4萬嬰幼兒死于RV感染性腹瀉[8-9]。目前,尚無治療RV感染性嬰幼兒腹瀉的特效方法,主要采用對(duì)癥治療,糾正脫水和維持電解質(zhì)平衡。因此,監(jiān)控和預(yù)防RV感染具有重要意義[10]。

不同地區(qū)和不同年份A組RV感染率差別相差很大,國內(nèi)外大多數(shù)文獻(xiàn)報(bào)導(dǎo)A組RV感染率處于31%~68%之間,且不同性別嬰幼兒之間感染率差異不大。本研究結(jié)果顯示,2016年1月至2017年3月深圳龍華區(qū)門診腹瀉嬰幼兒A組RV感染率為42.21%,明顯低于王瓊等[11]報(bào)導(dǎo)2007-2009年深圳地區(qū)的52.5%,而明顯高于徐丹等[12]報(bào)導(dǎo)2010-2013年深圳南山區(qū)的30.35%和盧麗娟等[13]報(bào)導(dǎo)2008-2011年上海地區(qū)的36.0%,這可能與不同地區(qū)和年份研究嬰幼兒年齡大小、檢測方法、生活水平、接種疫苗、預(yù)防知識(shí)宣傳及標(biāo)本收集的季節(jié)性等原因存在很大差異有關(guān)。且不同性別嬰幼兒RV感染率之間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,這可能與該年齡的嬰幼兒免疫力、生活方式及基礎(chǔ)生理等因素相差不大有關(guān)。

本研究結(jié)果顯示,A組RV好發(fā)0.5~1歲組,其感染率明顯高于其他年齡組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,與國內(nèi)外大部分研究結(jié)果相一致[4-14]。這可能與此時(shí)嬰幼兒從母體獲得被動(dòng)免疫能力逐漸消耗完,而自體主動(dòng)免疫尚未完全成熟,對(duì)各種病原感染的特異性IgM抗體產(chǎn)生不足等有關(guān)外,還與該年齡段嬰幼兒已經(jīng)添加輔食,人工喂養(yǎng),腸道局部分泌型IgA(sIgA)減少,較易感染各類病原體等有關(guān)。<6個(gè)月的嬰幼兒感染率較低,這可能與該年齡段的嬰兒大多處于母乳喂養(yǎng)期,乳汁中大量sIgA可以起到保護(hù)其腸道黏膜的作用及從母體獲得被動(dòng)免疫能力尚在等因素有關(guān)。2歲以上的嬰幼兒RV感染率逐漸下降,這可能與嬰幼兒自身sIgA增高、自體主動(dòng)免疫逐漸成熟及抵抗力逐漸增強(qiáng)等因素有關(guān)。因此,加強(qiáng)飲食和環(huán)境衛(wèi)生、切斷傳播途徑、提高兒童主動(dòng)免疫水平是預(yù)防RV感染性嬰幼兒腹瀉重要環(huán)節(jié)。

目前,全球全年均可發(fā)生RV感染,但發(fā)病高峰多為溫帶地區(qū)的秋冬季節(jié),具有明顯的季節(jié)性,與溫度變化有密切關(guān)系[15]。本研究結(jié)果顯示,A組RV好發(fā)于每年的第4季度和第1季度,明顯高于其他兩個(gè)季度,與國內(nèi)外大部分文獻(xiàn)報(bào)導(dǎo)相一致[15-16]。這可能與第4季度和第1季度天氣寒冷、溫差大、嬰幼兒容易著涼及寒冷干燥天氣有利于A組RV生長繁殖等因素有關(guān)。

A組RV的外衣殼蛋白VP4和VP7基因,具有型特異性抗原決定簇,可誘導(dǎo)機(jī)體發(fā)生免疫應(yīng)答產(chǎn)生特異性中和抗體,同時(shí)也作為RV血清基因型的分型依據(jù)。根據(jù)A組RV的VP7和VP4核酸序列差異可分為27種G基因型和35種P基因型,且G和P血清型可自由組合形成混合感染[11]。因此,不同地區(qū)、不同年份A組RV的G和P型別及組合均可能不一致,形成RV復(fù)雜多變的分子流行特征。本研究結(jié)果顯示,2016年1月至2017年3月A組RV的G血清型以G3和G1感染為主,陽性率分別為53.21%和31.42%,而P血清型以P[8]感染為主,陽性率為79.82%,其次為P[1]型,陽性率為5.28%,與有關(guān)文獻(xiàn)報(bào)導(dǎo)相一致[11-16]。但混合感染類型較上述文獻(xiàn)報(bào)導(dǎo)的要復(fù)雜一些,產(chǎn)生了3種甚至4種血清型混合感染,主要以G3P[8]和G1P[8]為主,陽性率分別為43.58%和28.90%,其次為G2P[8]和G3G1P[8],這可能與A組RV治療藥物和口服疫苗的不斷使用,導(dǎo)致A組RV不斷發(fā)生變異有關(guān)。

A組RV是門診嬰幼兒腹瀉主要病原體之一,好發(fā)于每年第4季度和第1季度的0.5~1歲嬰幼兒,且血清型混合感染類型越來越復(fù)雜。目前缺乏針對(duì)RV感染的特效藥物,接種RV疫苗是預(yù)防RV感染最有效方法,但不同血清型之間缺乏有效的交叉保護(hù)作用,不同地區(qū)、不同年份A組RV感染率及血清型流行具有很大差異性,并不斷出現(xiàn)一些新流行毒株,在一定程度地妨礙了接種RV疫苗的效果[17]。因此,不同地區(qū)或同一地區(qū)不同年份對(duì)A組RV感染和血清型流行情況進(jìn)行不定時(shí)監(jiān)測,對(duì)防治RV感染及疫苗的改進(jìn)和推廣具有重要的意義。

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