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大腸桿菌質(zhì)粒DNA提取方法的研究

2018-07-09 11:39:28
資源節(jié)約與環(huán)保 2018年6期
關(guān)鍵詞:凝膠電泳瓊脂糖離心管

李 恒

(宿州市環(huán)境監(jiān)測(cè)站 安徽宿州 234000)

1 引言

目前常見的DNA的提取方法主要有煮沸法、堿裂解法等,并且通過(guò)去除蛋白質(zhì)和RNA以達(dá)到純化質(zhì)粒DNA的目的,傳統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)室的方法是堿裂解法。

2 方法

2.1 煮沸法提取大腸桿菌質(zhì)粒DNA

2.1.1 DNA提取方法

(1)在適當(dāng)?shù)暮股兀ū热纾郝让顾氐龋┑?0mL LB培養(yǎng)基中接種單一的大腸桿菌菌落,振蕩培養(yǎng)至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)晚期以250r/min培養(yǎng)12-16 h;(2)將10mL大腸桿菌培養(yǎng)液置入微量離心管中于4℃下以12000r/min離心9min,將未分離的菌液保存;(3)離心后的溶液棄去上清夜,倒置于吸水紙上,并用吸管除去培養(yǎng)液滴;(4)用 350μlSTET 重懸大腸桿菌沉淀;(5)加入 25μl新配制的溶菌酶溶液,蓋上離心管蓋,輕輕渦懸3s后,并置于沸水浴40s;(6)在室溫下用微量離心機(jī)以12000r/min離心15 min,將上清夜倒于滅菌潔凈試管中;(7)在上清液中加入40ul 2.5mol/L的乙酸鈉(pH5.2)和420ul異丙醇,以沉淀核酸,振蕩混勻溶液,并在室溫下放置5min,在4℃下以10000r/min離心10min,回收沉淀的核酸;(8)倒置于紙巾上使其液體流盡,并用吸管除去液滴,之后用1ml 70%的乙醇漂洗核酸沉淀,離心除去上清液,并除去所有的乙醇液滴,敞口放置在室溫下直到乙醇全部揮發(fā),用50 μl含RNAseA的TE(pH8.0)溶解核酸,輕輕渦旋混勻。

2.1.2 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)

上述的溶液與EB混合染色進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳,電泳后在紫外分析儀下觀察,并且進(jìn)行拍照檢測(cè)。

2.2 堿裂解法提取大腸桿菌質(zhì)粒DNA

2.2.1 DNA提取方法

(1)在適當(dāng)?shù)暮股氐?5mL LB培養(yǎng)基中接種單一的大腸桿菌菌落,振蕩培養(yǎng)至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)晚期以250r/min培養(yǎng)12-16 h;(2)取4.5mL大腸桿菌菌液以12000r/min離心 9min,棄去上清夜,盡量棄去干凈,可以用小的槍頭移去;(3)再加入100 μl冰預(yù)冷溶液Ⅰ,利用渦懸振蕩器振蕩,從而使菌體充分,室溫放置2min;(4)加入200μl新配置的溶液Ⅱ,輕輕將離心管上下顛倒5~7 次,混勻,室溫放置下 2min;(5)加入 150 μl冰預(yù)冷的溶液Ⅲ,輕輕將離心管上下顛倒5~7次,直至白色的沉淀充分形成,冰上放置3分鐘,以12000r/min離心5min;(6)轉(zhuǎn)移上清,并加入兩倍體積的95%乙醇,室溫放置5min后,以12000r/min離心5min;棄去上清;用200μlTE溶解沉淀,加入150 μl 6mol/L NH4Ac(pH8.0),充分混勻后冰上放置3分鐘,以12000r/min離心5min;(7)棄去上清,并加入兩倍體積的95%乙醇,室溫放置5min后,以12000r/min離心5min;(8)棄去上清,沉淀用70%的無(wú)水乙醇洗滌;(9)離心除去上清液,并除去所有的乙醇液滴,敞口放置在室溫下直到乙醇全部揮發(fā),用50 μl含RNAseA的TE(pH8.0)溶解核酸,輕輕渦旋混勻。

2.2.2 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)

上述的溶液與EB混合染色進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,電泳后在紫外分析儀下觀察,并且進(jìn)行拍照,檢測(cè)。

3 結(jié)果與討論

3.1 煮沸法提取的大腸桿菌質(zhì)粒DNA電泳結(jié)果

此圖是煮沸法提取的大腸桿菌質(zhì)粒DNA瓊脂糖凝膠電泳圖,這張圖沒(méi)有經(jīng)過(guò)RNA酶的處理,從圖中我們可以明顯看出電泳結(jié)果條帶太暗,也由此說(shuō)明質(zhì)粒DNA提取的濃度很低,煮沸法提取質(zhì)粒DNA效果并不是很好,因?yàn)樵谥蠓械倪^(guò)程中限制酶并不會(huì)完全消失,質(zhì)粒DNA會(huì)降解。

3.2 堿裂解法提取大腸桿菌質(zhì)粒DNA

此圖是堿裂解法提取大腸桿菌質(zhì)粒DNA瓊脂糖凝膠電泳圖,這張圖未經(jīng)過(guò)RNA酶的處理,這張圖我們可以明顯的看到電泳結(jié)果條帶比較亮,條帶也很清晰,此法提取質(zhì)粒DNA的效果比較好。在裂解過(guò)程中,大腸桿菌的蛋白質(zhì)、破裂的細(xì)胞壁和變性的染色體會(huì)纏繞成比較大的復(fù)合物,此后被十二烷基硫酸鹽包蓋,鉀離子取代鈉離子復(fù)合物沉淀,能夠?qū)崿F(xiàn)很好的分離。

圖3-1 煮沸法提取大腸桿菌質(zhì)粒DNA瓊脂糖凝膠電泳圖

圖3-2 堿裂解法提取大腸桿菌質(zhì)粒DNA瓊脂糖凝膠電泳圖

結(jié)語(yǔ)

通過(guò)以上煮沸法,堿裂解法兩種方法對(duì)大腸桿菌提取質(zhì)粒DNA,進(jìn)行跑電泳的結(jié)果看來(lái)堿裂解法提取大腸桿菌質(zhì)粒DNA的亮帶最為清晰,而煮沸法提取大腸桿菌質(zhì)粒DNA的條帶最暗。

[1]皺湘輝,莊東紅,鐘名其等.大腸桿菌質(zhì)粒DNA不同提取方法的比較 [J].汕頭大學(xué)學(xué)報(bào),2003.5,18(2):20-21.

[2]朱玉賢,李毅.現(xiàn)代分子生物學(xué).北京:高等教育出版社[M],1997.

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