侯榆青, 魏紅娜, 易黃建, 張 旭, 賀小偉
(西北大學(xué) 信息科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,陜西 西安 710127)
熒光分子斷層成像能在體實(shí)現(xiàn)生物組織內(nèi)部熒光標(biāo)記物(熒光探針或者熒光蛋白)的三維定位和定量分析,目前廣泛應(yīng)用于小動(dòng)物研究[1].熒光分子斷層成像主要應(yīng)用于腫瘤的早期檢測(cè)和藥物分布監(jiān)測(cè)等生物醫(yī)學(xué)研究方面,具有成本低、靈敏度高、可用的分子探針?lè)N類多等特點(diǎn),有較廣的應(yīng)用前景[2].常用的熒光分子斷層成像系統(tǒng)可用近紅外光照射熒光探針,并使用電荷耦合器件(Charge-Coupled Device,CCD)相機(jī)來(lái)獲得生物組織表面的熒光強(qiáng)度的分布,利用光傳輸模型和反演算法重建生物組織中熒光探針的分布[3].
熒光分子斷層成像系統(tǒng)經(jīng)過(guò)十幾年的研究和發(fā)展,大致經(jīng)歷了3大階段:第1階段是光纖接觸式成像系統(tǒng),其需要將小動(dòng)物放入成像腔中,加入匹配液,并用光纖發(fā)射和接收信號(hào).但是此系統(tǒng)約束了小動(dòng)物的體積,以及因光纖的限制只能獲得較少的測(cè)量數(shù)據(jù)[4].第2階段是半接觸式成像系統(tǒng),在接觸式成像系統(tǒng)的基礎(chǔ)上使用了電荷耦合器件相機(jī)直接接收熒光信號(hào).相比第1階段,實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)單,但是由于投影角度的減少,導(dǎo)致重建精度比較低[5].第3階段是目前常采用的系統(tǒng),為完全非接觸、全角度的成像系統(tǒng),可以實(shí)現(xiàn)360°全視覺(jué)掃描,獲得更多的測(cè)量數(shù)據(jù),提高重建的準(zhǔn)確性[6].通常為了使得熒光探針受激發(fā)完全,當(dāng)前全角度的成像系統(tǒng)多采用多點(diǎn)激發(fā)、多角度測(cè)量的方式獲得測(cè)量數(shù)據(jù),由此帶來(lái)的數(shù)據(jù)采集時(shí)間隨著激發(fā)次數(shù)和采集數(shù)據(jù)角度的增加而增加,不利于實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)測(cè)量.
圖1 熒光分子斷層成像系統(tǒng)示意圖
筆者提出一種螺旋式激發(fā)的成像方式,使得熒光目標(biāo)受激發(fā)完全.相比于圓周式激發(fā),螺旋式激發(fā)的激發(fā)點(diǎn)通過(guò)一個(gè)螺旋式結(jié)構(gòu)分布在成像目標(biāo)的一周,形狀類似螺旋樓梯.此激發(fā)方式可在未知熒光目標(biāo)具體位置的情況下,通過(guò)有限次數(shù)的激發(fā)使熒光目標(biāo)受激發(fā)完全而獲得測(cè)量數(shù)據(jù),進(jìn)一步提高了重建結(jié)果的質(zhì)量.
實(shí)驗(yàn)采用的是非接觸、360°幾何投影自由空間熒光分子斷層成像系統(tǒng),工作模式為連續(xù)波模式,并用計(jì)算機(jī)控制一系列信號(hào)的傳遞.系統(tǒng)示意圖如圖1所示,將樣本放置到旋轉(zhuǎn)臺(tái)上,設(shè)置好激發(fā)點(diǎn),發(fā)射器發(fā)射的激發(fā)光經(jīng)過(guò)濾波片照射到樣本上,經(jīng)360°旋轉(zhuǎn)產(chǎn)生樣本表面光強(qiáng)信息,使得電荷耦合器件相機(jī)通過(guò)發(fā)射濾波片收集激發(fā)光源的信號(hào)[7].電荷耦合器件相機(jī)可以采集更多的數(shù)據(jù)信息,使得熒光分子斷層成像的重建質(zhì)量增加,并降低了重建問(wèn)題的不適定性[8].
圖2 激發(fā)方式示意圖
現(xiàn)有的激發(fā)方式多為完全非接觸、全角度的點(diǎn)光源激發(fā)成像系統(tǒng),其激發(fā)方式多為多點(diǎn)激發(fā)、多角度測(cè)量,如圖2(a)所示;或多點(diǎn)激發(fā)、單角度測(cè)量,如圖2(b)所示.分別將其命名為圓周式激發(fā)和陣列式激發(fā).圓周式激發(fā)一般激發(fā)點(diǎn)等間隔位于同一高度,截面圖如圖2(d)中所示;而陣列式激發(fā)的激發(fā)點(diǎn)多為陣列式排列,截面圖如圖2(e)所示.如果對(duì)重建的熒光目標(biāo)預(yù)先未知其大概的位置,若用圓周式激發(fā)方式,則會(huì)使得激發(fā)點(diǎn)照射熒光目標(biāo)不完全,有可能獲得的熒光數(shù)據(jù)不準(zhǔn)確,進(jìn)一步影響重建誤差,如圖2(a)中的圓柱1代表熒光目標(biāo),激發(fā)點(diǎn)所在高度與其相差較大.若用陣列式激發(fā),則需要激發(fā)的點(diǎn)數(shù)較多,采集數(shù)據(jù)時(shí)間過(guò)長(zhǎng).為了解決上述問(wèn)題,筆者提出一種基于螺旋式激發(fā)的方式,如圖2(c)所示.無(wú)論熒光目標(biāo)是圓柱1還是圓柱2,螺旋式激發(fā)方式中總會(huì)有激發(fā)點(diǎn)與其位于相當(dāng)高度.而在系統(tǒng)搭建上,螺旋式激發(fā)方式的實(shí)現(xiàn)也較為方便.將小動(dòng)物放置到可進(jìn)行360°旋轉(zhuǎn)的旋轉(zhuǎn)臺(tái)上,用激發(fā)光照射小動(dòng)物體內(nèi)的熒光分子探針.隨著旋轉(zhuǎn)臺(tái)旋轉(zhuǎn)到一定的角度,激光器從上到下改變一定的高度,在規(guī)定的高度內(nèi)正好完成待成像物360°的旋轉(zhuǎn),形成螺旋式激發(fā).
基于多點(diǎn)激發(fā)方式的熒光分子斷層成像,具有高散射、低吸收的特點(diǎn).光的傳輸過(guò)程可以由激發(fā)過(guò)程和發(fā)射過(guò)程組成,分別為[9]
(1)
其中,下標(biāo)x和m分別表示激發(fā)光和發(fā)射光;Dx,Dm表示擴(kuò)散系數(shù);Φx,Φm表示光子通量密度;μax,μam表示吸收系數(shù);ημaf表示熒光產(chǎn)額;Θ表示激發(fā)光源強(qiáng)度;Ω表示成像物體所占據(jù)的三維空間.
基于有限元方法,對(duì)未知熒光目標(biāo)和光強(qiáng)分布的測(cè)量值建立線性關(guān)系[10]:
Φ=AX,
(2)
圖3 激發(fā)點(diǎn)設(shè)置示意圖
其中,Φ是物體表面熒光光強(qiáng)分布,A是系統(tǒng)矩陣,X表示未知的熒光產(chǎn)額.所有的重建都采用不完全變量截?cái)喙曹椞荻确╗11].
為了驗(yàn)證筆者所提方法的有效性,將螺旋式激發(fā)
方式、圓周式激發(fā)方式和陣列式激發(fā)方式分別進(jìn)行比較.實(shí)驗(yàn)中采用的圓周式激發(fā)方式激發(fā)點(diǎn)個(gè)數(shù)為10個(gè),如圖3(a)所示;高度相同,每個(gè)激發(fā)點(diǎn)間隔36°,均勻地分布在成像目標(biāo)一周,俯視圖如圖3(d)所示.陣列式激發(fā)方式的激發(fā)點(diǎn)采用 4×3 的方式,如圖3(b);每行4個(gè)激發(fā)點(diǎn),每個(gè)激發(fā)點(diǎn)間隔為30°,位于x軸正方向,行間距為 3 mm,俯視圖如圖3(e)所示.螺旋式激發(fā)方式激發(fā)點(diǎn)同樣采用10個(gè)激發(fā)點(diǎn),俯視圖與圓周式激發(fā)點(diǎn)相同,如圖3(f)所示;但其高度每個(gè)相差 1 mm,激發(fā)點(diǎn)最低高度為 -5 mm,依次向上增加,如圖3(c)所示.
圖4 仿真示意圖
為了驗(yàn)證螺旋式激發(fā)方式的可行性,用非勻質(zhì)圓柱形仿體進(jìn)行仿真實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證.圓柱模型如圖4(a)所示,圓柱半徑為 10 mm,高為 30 mm,中心位置設(shè)為 (0 mm,0 mm,0 mm),內(nèi)部設(shè)有5個(gè)幾何體,分別代表心臟、肝臟、骨骼以及兩個(gè)腎臟,各個(gè)器官的光學(xué)參數(shù)如表1所示[12].熒光目標(biāo)為半徑 0.5 mm、高 1.4 mm 的圓柱形仿體.將熒光目標(biāo)放置在4個(gè)不同的位置,中心坐標(biāo)分別為 (6 mm,0 mm,0 mm),(-6 mm,0 mm,0 mm),(0 mm,6 mm,0 mm),(0 mm,-6 mm,0 mm),其截面圖如圖4(b)~(e)所示.對(duì)比圓周式激發(fā)、陣列式激發(fā)和螺旋式激發(fā)3種激發(fā)方式下的重建結(jié)果.其中圓周式激發(fā)的激發(fā)點(diǎn)分別位于Z= -5 mm,Z= 1 mm,Z= 5 mm 處.
表1 非勻質(zhì)仿體的光學(xué)參數(shù)
為了評(píng)價(jià)重建結(jié)果,設(shè)計(jì)了標(biāo)準(zhǔn)均方根誤差(norm Root Mean Square Error,nRMSE)和位置誤差(LE)來(lái)精確對(duì)比上述實(shí)驗(yàn)結(jié)果.標(biāo)準(zhǔn)均方根誤差定義為[13]
(3)
其中,fnRMSE是標(biāo)準(zhǔn)均方根誤差;Xr和Xo分別表示重建的熒光產(chǎn)額值和真實(shí)熒光產(chǎn)額值.標(biāo)準(zhǔn)均方根誤差的值越接近于零,表明重建的結(jié)果越精確.
位置誤差表示的是重建的熒光目標(biāo)中心位置和真實(shí)的熒光目標(biāo)中心位置之間的誤差,其表達(dá)式為[14]
(4)
其中,fLE是位置誤差;L=[X,Y,Z],表示點(diǎn)的坐標(biāo)向量;Lr和Lo分別表示重建目標(biāo)的中心位置和真實(shí)熒光目標(biāo)的中心位置.
當(dāng)熒光目標(biāo)中心坐標(biāo)為 (6 mm,0 mm,0 mm) 時(shí),其重建結(jié)果如圖5第1行所示,其中(a1)、(a2)、(a3)為圓周式激發(fā)點(diǎn)分別位于Z= -5 mm,Z= 1 mm,Z= 5 mm 時(shí)的結(jié)果;圖5(a4)是陣列式激發(fā)的重建結(jié)果;圖5(a5)是螺旋式激發(fā)的重建結(jié)果.圖中,黑色的小圓圈表示熒光目標(biāo)的真實(shí)位置.改變熒光目標(biāo)的位置為 (-6 mm,0 mm,0 mm),(0 mm,6 mm,0 mm),(0 mm,-6 mm,0 mm),其重建結(jié)果分別為圖5的第2行到第4行.
圖5 單光源重建結(jié)果X-Y截圖面
激發(fā)方式中心坐標(biāo)(6mm,0mm,0mm)nRMESLE/mm(-6mm,0mm,0mm)nRMESLE/mm(0mm,6mm,0mm)nRMESLE/mm(0mm,-6mm,0mm)nRMESLE/mm圓周式Z=-5mm0.661.020.710.741.360.780.450.68圓周式Z=1mm0.130.480.540.490.700.580.400.21圓周式Z=5mm0.520.871.080.930.900.770.540.85陣列式激發(fā)0.220.463.901.612.463.340.370.45螺旋式激發(fā)0.130.330.530.650.670.640.300.49
表2是4組重建結(jié)果的定量分析.從實(shí)驗(yàn)結(jié)果展示圖5和表2可以看到,當(dāng)激發(fā)點(diǎn)遠(yuǎn)離熒光目標(biāo)(即圓周式Z= -5 mm 及Z= 5 mm) 時(shí),重建結(jié)果較差,位置誤差在 1 mm 左右; 陣列式激發(fā)只能獲取到熒光目標(biāo)一側(cè)的信息,且距離激發(fā)點(diǎn)較近時(shí),獲得的數(shù)據(jù)較好,而遠(yuǎn)離熒光目標(biāo)時(shí),則獲得的數(shù)據(jù)不夠全面,位置誤差大于 1.5 mm,均方根誤差大于 2 mm,重建結(jié)果十分不理想;而用螺旋式激發(fā)方式激發(fā)熒光目標(biāo)可以得到較好的結(jié)果,位置誤差和均方根誤差均在 0.5 mm 左右.由此說(shuō)明螺旋式激發(fā)方式不僅提高了重建精度,而且魯棒性較好.同時(shí)表2也顯示出當(dāng)激發(fā)點(diǎn)接近熒光目標(biāo)時(shí),重建結(jié)果比較理想.但是,在現(xiàn)實(shí)狀況下,熒光目標(biāo)的位置是未知的,利用螺旋式激發(fā)方式比遠(yuǎn)離熒光目標(biāo)的圓周式激發(fā)方式要有優(yōu)勢(shì),可以獲得比其更精確的重建結(jié)果.
圖6 雙光源非勻質(zhì)圓柱體仿真模型
為了進(jìn)一步評(píng)估螺旋式激發(fā)成像系統(tǒng)的性能,在相同數(shù)目的投影數(shù)據(jù)下,開(kāi)展雙目標(biāo)重建實(shí)驗(yàn).仿體模型如圖6所示.兩個(gè)熒光目標(biāo)是半徑為 0.5 mm、高度為 1.4 mm 的圓柱形,目標(biāo)1中心為 (6 mm,0 mm,3 mm),目標(biāo)2中心為 (6 mm,0 mm,-3 mm).圓周式激發(fā)中激發(fā)光源分別位于Z= -3 mm,Z= 0 mm,Z= 3 mm 處.圖7是重建結(jié)果,其中圓周式激發(fā)點(diǎn)高度分別位于Z= -3 mm,Z= 0 mm 和Z= 3 mm 處.重建結(jié)果如圖7(a)~(c)所示,分別展示了圓周式激發(fā)方式的X-Z橫截面的熒光產(chǎn)額值;圖7(d)是陣列式激發(fā)的重建結(jié)果,展示了陣列式激發(fā)方式的橫截面積的熒光產(chǎn)額值;圖7(e)是螺旋式激發(fā)的重建結(jié)果,展示了螺旋式激發(fā)方式的橫截面積的熒光產(chǎn)額值.圖中,黑色的長(zhǎng)方形表示熒光目標(biāo)的真實(shí)位置.
圖7 雙光源重建結(jié)果
表3為雙光源重建結(jié)果的定量分析.從圖7可以看出,圓周式激發(fā)點(diǎn)高度分別為Z= -3 mm,Z= 0 mm,Z= 3 mm 時(shí),針對(duì)較遠(yuǎn)的熒光目標(biāo)采集的信息相對(duì)較少,位置誤差大于 4 mm,重建結(jié)果并不理想; 對(duì)于陣列式激發(fā)方式,對(duì)每個(gè)熒光目標(biāo)只能進(jìn)行單面激發(fā),重建結(jié)果仍無(wú)法取得滿意的結(jié)果,位置誤差大于 1 mm; 而螺旋式激發(fā)方式,可以收集到兩個(gè)熒光目標(biāo)的信息,重建的兩個(gè)熒光目標(biāo)的位置誤差都小于 1 mm,重建結(jié)果相對(duì)較好.由此可得,圓周式激發(fā)方式針對(duì)不同高度的多目標(biāo)重建結(jié)果較差;螺旋式激發(fā)方式可以擴(kuò)大激發(fā)范圍,獲得較多的熒光目標(biāo)信息,對(duì)不同高度的熒光目標(biāo)重建可以更加準(zhǔn)確,得到令人滿意的結(jié)果.
表3 雙光源重建結(jié)果
熒光分子斷層成像通過(guò)近紅外光激發(fā)熒光探針,根據(jù)生物表面的熒光信號(hào)并結(jié)合數(shù)學(xué)模型,可通過(guò)重建算法獲得熒光探針的三維空間分布.在實(shí)際應(yīng)用中,多數(shù)情況下對(duì)熒光探針的位置是未知的,這就使得外部光激發(fā)熒光探針時(shí),若采用同一高度的圓周式激發(fā)方式,可能出現(xiàn)熒光探針激發(fā)不完全的情況,由此獲得的表面數(shù)據(jù)會(huì)不準(zhǔn)確而影響后續(xù)的重建.為了克服這個(gè)缺點(diǎn),筆者提出了一種螺旋式激發(fā)的熒光數(shù)據(jù)采集系統(tǒng).通過(guò)仿真實(shí)驗(yàn)可以看出,在相同投影數(shù)據(jù)個(gè)數(shù)的情況下,相對(duì)于遠(yuǎn)離熒光目標(biāo)的圓周式激發(fā)方式,螺旋式激發(fā)方式重建結(jié)果的標(biāo)準(zhǔn)均方根誤差和位置誤差值均相對(duì)較小,因此其重建結(jié)果較好.
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